Apis florea (little honeybee): 100870559
Help
Entry
100870559 CDS
T09140
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12
KO
K18409
ATP-dependent RNA helicase TDRD12 [EC:
5.6.2.5
]
Organism
aflr
Apis florea (little honeybee)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
aflr00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
aflr03036
]
100870559
Enzymes [BR:
aflr01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.5 RNA 5'-3' helicase
100870559
Chromosome and associated proteins [BR:
aflr03036
]
Eukaryotic type
Gene silencing
piRNA pathway
100870559
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Helicase_C
DEAD
TUDOR
SNase
Toprim
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
100870559
NCBI-ProteinID:
XP_031775082
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
812 aa
AA seq
DB search
MLPPTVTVIKVTNVLTPYIIRICEIKHYNEKLNSINKKLFKKKEIFKTVKKYNEPKIGDA
VIVYNKLHTTCDFPGWLSRGHICNIGNLKDIYNIFLSDHGICVVLKKEDFVICSTDIITE
EYLSFTAGLYNVLPADVKYDFSMHNETLTILDEWSTSAIEYTKKLISASDTIYFDYLVSD
QYGRYYGEFYLNIKNNIICLSEILVLNHYAVYLDKEFLQNYEKIRSIAAINGKSERSLVA
EMFNGCQILISTPRFLVRFMNRNEKLINFKNLQYLILDGGDIILNKYYDSVNHLFKKYNI
ISNRESKNKMLQIIITAAHWTPQLKKIAFIFMDNPCICIASFLEAAIFKSVHINIYVINS
KKKNEKLLDLLSNGYSYTRTIIICTNNDEAEELYNFLQKHIEILLAHGNMNFFQLQDIKQ
CWNVCISGSYPILICTDDILSDIDITNVTWLIHYSIPLHSKTQFNFRFSTLIENLQMENC
NCKVTIMMDENNDIQFLHVMKIMQRMNITIPQNILENIKFITNALEKKKKNYPICNNIKS
WGFCNXQISCAFRHKIISKIDKPLTNIQINDKVKFRVVSILDATHVSARIISYIKFDTLE
EIEFPNTQYMLISKSIQEYYSNAKNRKKCEIIDIGCICGLEEPVDTFKRVQILHIERENK
TGNPKYVNVKCIDNGVILNKVNVYNLLYMPKKLVKYPIQVFEVFLVGVVPHDDEYVWNNC
AIDAVYEWFKENVDNRSYVIGTVNLHLGNTIWVDTLNVGTKLIGYKDLIGSSIKTELLIK
DHAIKNDKHLNQMYQLCRDAGFLQINGYDLNL
NT seq
2439 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttgcctcctaccgtaacagtaattaaagtaacaaatgttttaacaccatatattata
agaatttgtgaaatcaaacattataatgaaaaattaaattctatcaataagaaattattt
aaaaaaaaagaaatttttaagactgttaaaaaatacaatgaaccaaaaataggagatgca
gttatagtatataataaattacatacaacatgtgattttcctggatggttatctagagga
catatttgtaatataggaaatttaaaagatatatataatatttttctatctgatcatggt
atttgtgttgtattaaaaaaagaagattttgttatttgttcaactgatataattacagaa
gaatatttgagctttacagctggtttatataatgttttacctgctgatgtaaaatatgat
ttctctatgcataatgaaactctaacaattttagacgaatggagcacatctgcaattgaa
tacacaaaaaaattaataagtgcatctgatacaatttattttgattatttagtatctgat
caatatggaagatattatggtgaattttaccttaatataaaaaacaatataatatgttta
agtgaaattttagttcttaatcattatgctgtttatttagataaagaattcttacaaaat
tatgaaaaaatacgatcaattgctgcaattaatggtaaatcagaaagatcattagtggct
gaaatgtttaatgggtgtcagatattaatttctacacctagatttttagtacgttttatg
aataggaatgaaaaattaataaattttaaaaatcttcaatatttaattttggatggtggt
gatattatcttgaataaatattatgattctgtaaatcatttatttaagaaatataatatt
atttctaatagagaatcaaaaaataaaatgttgcaaattataataactgcagcacattgg
acaccgcaattaaaaaaaattgcttttatttttatggataatccatgcatatgtatagca
tcttttttagaagctgcgatttttaaatctgtacatataaatatatatgtaataaattca
aaaaaaaaaaatgaaaaactcttagatttactaagtaatggatattcttatacaagaact
ataattatttgtacaaataatgatgaagctgaagaattatataactttttacaaaaacat
atagaaattcttttagctcatggaaatatgaatttttttcaattacaagatattaaacaa
tgttggaatgtttgtataagcggttcttatccaattttaatatgtacagatgatatatta
tctgatatagatattacaaatgtaacttggttaatacattattcaattcccttgcattct
aagactcaatttaattttcgattttcgacacttatagaaaatttacaaatggaaaattgc
aattgcaaagtaacaataatgatggatgaaaataatgatatacaatttttacatgtaatg
aaaattatgcaacgtatgaatattacaattcctcaaaatatattagaaaatattaagttt
ataacaaatgcattagaaaagaaaaaaaaaaattatcctatttgcaataatataaagtcc
tggggattttgtaatnaacaaatttcatgtgcatttagacataaaataatttcaaaaatt
gataaaccactcacaaatattcaaataaatgataaagtgaaattcagagtagtaagtata
cttgatgccacacatgtttctgctagaattatatcatatattaaatttgatacattagaa
gaaatagaatttcctaatacacaatatatgttaattagcaaaagtattcaagaatactat
tctaatgcaaaaaacaggaagaaatgtgaaataatagacattggatgtatatgtggttta
gaagaaccagtagatacttttaaaagagtacaaattttacatattgaaagagagaataag
acaggaaatccaaagtatgtaaatgtaaaatgtattgataatggagtcattttgaacaaa
gtaaatgtatataatttactatatatgccaaaaaaacttgtaaaatatcctatccaagta
tttgaagtatttttagttggtgtagttcctcatgatgatgaatatgtttggaataattgt
gcaattgatgctgtatatgaatggtttaaagaaaatgttgacaatagatcatatgtaatt
ggaacggtaaatttacatcttggaaatacaatatgggtagatactttaaacgttgggaca
aaattgattggatataaagacttaattggttcgtctataaaaacagaattattaataaaa
gatcatgctatcaaaaatgataagcatttaaatcaaatgtaccaactttgtagagatgct
ggatttttacaaatcaatggatatgatttgaatctttaa
DBGET
integrated database retrieval system
