KEGG   Apis florea (little honeybee): 100872638
Entry
100872638         CDS       T09140                                 
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: probable ATP-dependent RNA helicase DHX34
  KO
K20101  ATP-dependent RNA helicase DHX34 [EC:5.6.2.6]
Organism
aflr  Apis florea (little honeybee)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:aflr00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:aflr03019]
    100872638
Enzymes [BR:aflr01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.6  RNA 3'-5' helicase
     100872638
Messenger RNA biogenesis [BR:aflr03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   Surveillance factors
    Other surveillance factors
     100872638
SSDB
Motif
Pfam: zf-C2H2_DHX34 Helicase_C OB_NTP_bind DEAD HA2_C AAA_22 ATPase HA2_N nSTAND3 AAA_19 RsgA_GTPase
Other DBs
NCBI-GeneID: 100872638
NCBI-ProteinID: XP_012340047
LinkDB
Position
Unknown
AA seq 1157 aa
MNSRYEVDNKYKHKYQYNNERKYDLKFTNNTNYDKKDTVNKKNDGSQEIFDKNYKDFYFS
KHKHELNKVFSGNLNIIQDIDDFWKFVNKYETVQKKLKISNILPKCLLNTIGVPELYHKL
HCINFKLSYNFNELFTHVLSIETLTEKCLLKFQTIIILYLDFKQKEKFIKLKKLRDSQAN
LPVYQYKHEIIQSIKQERVVIIAGDTGCGKSTQVPQYLYSAGFQKIACTQPRRIACISLA
KRVAFETLTENYNDVGYQIRFEKQKNQNTKITXITEGLLLRQLSGEFELLFYDVIVLDEV
HERHLHGDFLLGIMKCIINQRFDLKLILMSATINIELFSDYFAKENVKIIQVPGRLYPIQ
LLYKPITIEDIRYKNDRFNPSPYIQIMQMIDQKYSADEKGDLLIFLSGMSEISTVVDAAK
EYSXKKNNWIILPLHSTLAISEQDKVFDYAPEGIRKCIVSTNIAETSITIDGIRFVADSG
KVKEMSYNPSCKMQQLKEFWISKASAEQRKGRAGRTGPGVCYRLYSETEYLNLEKYSTPE
LQRVPLDSLLLQMIAMGLPDARKFPFIEPPSPESIENSIISLKEHGALTDNEKITCIGRT
LARLPVDITIGKMLIMGSIFHQVEPVLSLAAALSIQTPFTNKAYRDSECEISRKKLESDH
GDPITLLNAFREWLEIKQQNSQESRSTRNNSRKWCKRRGLEEQRFYEMTKLRAQFKELLQ
DCGLLKNFSEPNSSMSSAERALRHGELKLLKSLKRIYKQNEPRKRKQLKLESFDIQLEDN
DHEDGEIDIKDIEFRMKNDSNQVQNLLTASTACNYKDLTMLKLILCSGLYPQFAVADEFN
YCKTTNEQLFHTKAKPYIALHPISFFGHHPQVLQLEEVDVVSIPGFKNKTPVSPKHTILT
YLSLLETTKPYLVNTLRMPAAQTLLLFAREIDTNSTFSIIVCDSWLELKFPIPDTGQTLL
MKATKLRHKWDFLLNQRLQDSNIGNDIQDFSQFEDILIQKLIEYMHTTVPYTLKRLLPAD
LKIIYVGNGKNNILVDPNPFQSDFIITPNSVKGGIRVSNIITYNCIRETEWSEQLSIQIL
KTEWHCQNCNMQAILTSIEKLQHQHSCIKEKNIKDIKKHCNNIKHKSNAQAYECPNCLQI
LYLTPIEILKHKKSHVK
NT seq 3474 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaattcacgatatgaggttgataataaatataaacacaaatatcaatacaataatgaa
cgaaaatacgatttaaaatttacaaataatacgaattatgataaaaaagatactgtaaat
aaaaaaaatgatggttctcaagaaatttttgataaaaattacaaagacttttatttcagt
aaacataaacatgaattgaataaagtattctcgggaaatttaaacataatccaagatatt
gatgatttttggaaatttgttaataaatatgaaactgtacaaaaaaaattaaaaatttct
aatattttacctaagtgtttattaaataccattggtgtaccagaattataccataaatta
cattgtataaatttcaaactgagttataattttaatgaattgtttacacatgtattatca
attgaaacattaacagaaaaatgcttattaaaatttcaaactataatcattttatattta
gacttcaaacaaaaagaaaagtttattaaattaaaaaaacttagagattcacaagcaaat
ttaccagtttatcaatataaacatgaaattattcaaagtataaaacaagaacgggtagtt
ataattgctggtgatactggttgtggaaaatctactcaagtacctcaatatctatactca
gcaggttttcaaaaaattgcttgtacacaaccaagacgaatagcttgtatatctttagca
aaacgtgttgcttttgagacattaacagaaaattataatgatgttggttaccaaattcgt
tttgaaaaacaaaaaaatcaaaataccaaaattaccnttataacagaaggtcttttatta
agacagttatctggagaatttgaattgttattttatgatgtaattgttttggatgaagtg
catgaacgtcatttacatggagattttcttcttggcattatgaaatgcattattaatcaa
agatttgatttaaaattaatacttatgtctgcaactataaatattgaactttttagtgat
tattttgccaaagaaaatgttaaaataatacaggttcctggaagattgtatcctattcaa
ttattatacaaacctattaccatagaagatattcgatataaaaatgataggttcaatcca
agtccttatatacaaataatgcaaatgattgatcaaaaatattcagctgatgaaaaagga
gatttattaatatttttaagtggaatgagtgaaattagtacagttgtagatgcagcaaag
gaatatagtncaaaaaaaaataattggattatcttaccacttcatagcactttagccatc
agtgaacaagataaagtatttgattatgctcctgaaggaataagaaaatgtattgtatct
actaacattgctgaaacttctattactatagatggaattagatttgttgctgatagtgga
aaagtaaaggaaatgagttataatccatcatgcaaaatgcaacaacttaaagaattttgg
attagcaaagctagtgcagaacaaagaaaaggaagagctggtaggactggacctggagta
tgttatagattatattctgaaacagaatatttaaatttagaaaaatattcaactccagaa
ttacaacgtgtacctctagattctttacttttacaaatgattgcaatgggacttccagat
gcacgaaaatttccatttatagaaccaccttcacctgaaagcatagaaaattctataata
tctttaaaagagcatggtgcattaacagataatgaaaaaataacatgtattggaagaaca
ctcgcacgtttaccagttgatataacgataggaaaaatgttaataatgggttctattttt
catcaagtagaaccagttttatcattagctgctgccttgagcatacaaacaccatttaca
aataaagcatatagagattcagaatgtgagatatctagaaagaaattggaatctgatcat
ggtgatccaataacattactaaatgcatttagagaatggttagaaataaaacaacagaat
tctcaagaatctagatctacaagaaataatagtagaaaatggtgtaaaagaagaggttta
gaggaacaaagattttacgaaatgacgaaattaagagctcagtttaaagaattacttcag
gattgtggattactaaaaaatttttcggaaccaaattcttctatgtctagtgcagaacgt
gcattaagacatggggaacttaaacttttaaaatccttaaaacgaatttataagcaaaat
gaacctagaaaaagaaaacaattaaagctagaatcctttgacatacaattagaagataat
gatcatgaagatggtgaaattgatataaaagatatcgaatttcgaatgaaaaatgattca
aatcaagtacaaaatttattaacagcaagtactgcatgtaattataaagatttaactatg
ttgaaattaatattgtgcagtggtttatatccacaatttgcagttgctgatgaatttaat
tattgtaagacaacgaatgaacaattatttcacacaaaagcaaagccatacattgcttta
catccaataagtttctttggacatcatcctcaggtattacaattagaagaagttgatgtt
gtatcaataccaggttttaaaaataaaactcctgttagtccaaaacatacaatattaaca
tatttatctcttttggaaactacaaagccttatttagtgaatacacttagaatgccagct
gcacaaacattacttttatttgcacgtgaaatcgatacaaatagtacattttcaataata
gtatgtgattcgtggttagaattaaaatttcctatacctgatactggtcaaactttacta
atgaaagctaccaaattacgacataaatgggattttttattaaatcaacgattacaagat
tcaaatattggtaatgatatacaagattttagtcaatttgaggatatacttattcaaaaa
ttaattgaatatatgcatactactgttccatatacactaaaacgacttttaccagctgat
cttaaaataatatatgtggggaatggtaaaaataatatactggtagatccaaatcctttt
caatcagattttataataactcctaattcagtaaaaggaggaattcgtgtatcaaacatt
attacatataattgtatacgagaaactgaatggagtgaacaactttccatacaaatttta
aaaacagaatggcattgtcaaaattgtaacatgcaagcaattttaacaagcatagaaaaa
ttacaacaccaacattcttgcattaaagaaaaaaatataaaagatattaaaaaacattgt
aacaatattaaacataaatctaatgcacaagcatatgaatgtcctaattgtctacaaata
ttgtacttgacaccaattgaaattcttaaacacaaaaaatctcacgttaaataa

DBGET integrated database retrieval system