Agarivorans sp. QJM3NY_29: ACRRS0_06375
Help
Entry
ACRRS0_06375 CDS
T11369
Name
(GenBank) thrombospondin type 3 repeat-containing protein
Organism
agaq Agarivorans sp. QJM3NY_29
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XUY84635
LinkDB
All DBs
Position
202316..206668
Genome browser
AA seq
1450 aa
AA seq
DB search
MRISSLSSIAVAALFGLSIPAFAANDTYALDSGQLRFGTGTETSITASGVLKQPFYYDDA
NSTWYKLTYSSYPLSSAIGFGGDGSEIWNNNGTITQDPTLSNQTIDSSAFTLYDGVKGYG
TLTTNGSLALDGANLGYQASFTVEQDSPYVSITVSLSNLGTSNVENLRFWMGTRDDYVGT
DDSPTKTRGNLVDGVFTPISTSAEQAQGLQIESNNGSSTSGVLFYVKSDAAYLVQNNCCS
FTNVINQNPAISTVQASGDGSYAFYIRMKDLAPGETDSFTWYYAAGDSSELQALAQTIYD
AAQGKDVVENVPVAFEDEDFVDAQGNVVAKIRIASLPENGALTLNGATISEALEINSADY
NLISYAPDEDFVGTDQFTWQAWNSSNSEYSSDISTVTFTILSDSDGDGSADVADEDIDGD
GVLNEEDAFPEDPTEFVDTDGDGIGNNADTDDDGDGVADSTDAFPLDAAESVDTDGDGTG
NNADTDDDGDGVLDADDAFPLDTAESVDTDGDGTGNNADTDDDGDGVLDVDDAFPLDAAE
SVDTDGDGTGNNADTDDDGDGVADTGDAFPLDGSEIIDTDGDGTGNNADTDDDGDGVADS
TDAFPLDAGESTDTDGDGMGNNTDTDDDNDGVADSTDAFPLDAAETVDTDGDGIGNNADT
DDDGDGVADASDAFPLDAAETVDTDGDGIGNNADTDDDNDNVLDADDAFPLDAAESVDTD
GDGIGNNADTDDDGDGVLDADDVFPLDAGESVDSDGDGIGNNADTDDDGDGVLDGDDAFP
LDAAESVDTDGDGTGNNADTDDDGDGVLDADDVFPLDAAESVDTDGDGTGNNADTDDDGD
GVLDADDAFPLDAGESVDTDGDGTGNNADTDDDGDGMSDEWELANGLDPLDSADAALDSD
GDGESNLEEFTKGSDPLRDTVAPVITLDPELWFNATGLFTQLELTAVSATDHLDGEIAVE
MVAGQTLLEPGVHTLTYRASDAAGNIAEVNQTVNVRPLINFTKDQTIFEGDSVTVGVVLN
GESPVYPLTIPYVVSGTASNGLDYVLEDGNFVIESGKQAQISFDSLNDSIADDAETIELS
LLGDSAELNMGNRTSHLVTISEENIAPEAKFAIRQNEKLRAVIAQDQGMVSIQVQVSDAN
ATDTHTMVWDLSDSLTGLAPEGDTLSVDPSDLAAGVYTIAVVVTDSGSPSLSDSVQTSFT
VTSILPALSNSVDSDQDGLSDFEEGYQDTDQDGIYDYLDNQNLSSNVVGHLISEGSYNLL
ESDPGTSLRLGQGALQLGREGTLVEENDMYSDTQSLDSDVVTHVGGIFDFEVHNIPEHGQ
SVNVVIPQRAQIPENAVYRKWSPEGGWRTYVEDANNLISSAPGSEGYCPPPGDPAFEVGL
VSGYWCIQLTIEDGGPNDDDATANGSIVDPSGMATRQPITEGVSASGGGSFGGVAGLLLV
VLVMVRRRFS
NT seq
4353 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgcatatcaagtttatcctcaattgctgtagcagcattatttgggctatctattccg
gccttcgcggctaatgacacttatgccctcgatagtggccagctgcgttttggcactggt
acagaaacatcgatcactgcttctggtgtattaaaacaacctttttattatgacgatgcg
aatagcacatggtacaaattgacttattcgagctaccccctgagtagtgcgattgggttt
ggcggggatggctccgagatttggaataataatggcactattactcaagatcctacttta
agtaatcagaccatcgatagctcggcttttactttgtatgatggcgtgaagggttatgga
acccttactacaaatggctcgctcgccttggatggagctaatttgggctatcaggcgagc
tttaccgtcgagcaagactctccctatgtttcgattactgttagcctgagcaatttgggg
actagcaacgtcgaaaatcttcgtttctggatggggacgcgagatgattatgtggggacc
gatgatagccccactaaaacacgtggtaatttagtggatggtgtattcacgccaatttct
acgtcagcggagcaagcgcaaggcttacaaattgaaagtaataatggctccagcactagt
ggggtgttgttttatgtaaagtctgacgcagcctatctcgtgcagaataattgttgctct
tttactaatgtcattaatcaaaaccctgccatctcgactgtccaagccagcggagatggc
tcctatgctttttatattcgaatgaaggatcttgcgcccggcgagacggactcctttact
tggtattacgccgccggcgattcatctgaactgcaagctttggctcagaccatttatgac
gcggctcaggggaaagacgttgttgaaaatgtgccggtggctttcgaagatgaagacttt
gttgatgctcaaggaaatgttgttgctaaaattcgtatcgcttcattgccagaaaatggc
gcacttacattaaatggagccacgatcagtgaggcgttagagattaatagcgccgattat
aatctgattagctatgcccccgatgaagattttgtagggaccgaccaattcacctggcag
gcctggaatagttctaattcagaatacagttcggatattagcacggtgacatttactatt
ctcagcgattcagatggcgatggctcagcggatgtggcggatgaagatattgatggcgat
ggtgtccttaatgaggaggatgctttccccgaagacccgaccgaatttgtcgataccgat
ggcgatggcatcggtaacaatgccgacaccgacgatgatggtgatggcgtagccgatagc
actgatgccttcccgcttgacgcagcggaatctgttgataccgatggcgatggcaccggt
aacaatgctgacaccgacgacgatggcgatggcgtgttagatgcggatgatgctttccca
ctcgatacagctgaatcagtcgataccgatggtgatggtaccggtaacaatgccgatacc
gatgatgatggcgatggtgtgttagatgttgatgatgctttcccacttgatgctgcggaa
tctgtcgatactgatggtgatggtaccggtaacaatgccgataccgatgatgatggcgat
ggggttgccgatactggtgatgcctttccattggatggtagtgaaattattgatactgat
ggtgacggcaccggtaacaatgccgacaccgatgatgatggtgatggcgtagccgatagc
accgatgctttcccacttgatgctggggaatctaccgatactgatggtgatggcatgggt
aataataccgacaccgacgatgataatgatggcgtagccgatagcaccgacgccttcccc
ttagatgctgccgaaaccgtcgataccgatggcgatggcattggtaacaatgctgatacc
gatgatgatggtgatggggtcgccgatgccagcgatgccttccccttagatgctgctgaa
accgtcgataccgatggtgatggtatcggcaacaatgccgataccgatgatgataatgat
aatgtgctagatgcagatgatgccttccctcttgacgcagcggaatccgtcgataccgat
ggtgatggtatcggtaacaatgctgataccgacgacgatggcgatggcgtattagatgcg
gatgatgttttcccacttgacgctggggaatctgtcgatagcgatggcgatggtattggt
aacaatgccgacaccgacgatgatggggatggcgtattagatggtgatgatgctttccca
cttgacgctgcggaatctgtcgatactgatggcgacggtaccggtaataatgccgacacc
gacgacgatggtgatggcgtattagatgctgatgatgttttcccacttgacgctgcggag
tctgtcgataccgatggtgatggcacgggtaacaatgctgataccgacgatgatggtgat
ggcgtattagatgcggacgatgctttcccacttgatgctggggaatctgtcgatactgat
ggcgacggtaccggtaataatgccgacaccgatgacgatggcgatggcatgagtgatgaa
tgggagcttgctaatggtcttgatcctctcgatagtgctgatgctgctttagattctgat
ggtgacggtgagagtaacctggaagaatttaccaagggcagtgatccgctccgcgatacc
gtggcgcctgtaataacgcttgatcctgaactttggtttaatgccacaggcttatttact
cagcttgaattgactgctgtttcagccaccgatcatttagatggtgaaattgcagttgag
atggtcgccggacaaaccttactggagccaggggtacatacgttgacttatcgcgccagt
gatgcggcgggtaatatcgcagaagttaatcaaactgtgaatgtgagacccttgataaac
tttacgaaggaccaaaccatttttgaaggggattcggtaacggtaggcgttgtgttaaat
ggcgaatcgccggtttatccactcacgattccttatgttgtgtctggtacggcgagcaat
ggattggattatgtgctagaggatggcaactttgttattgaatcaggcaaacaagcgcaa
attagctttgatagtttaaacgattcgattgccgatgacgccgaaactatcgaactaagc
ttgcttggtgatagcgctgaattgaatatgggaaatagaacttcccacctggtgacaatt
agtgaagagaatatcgcgcccgaagcgaaatttgcgatccgtcaaaatgagaaattacgg
gcagtgatcgcacaagatcaaggcatggtcagcattcaagtacaggtgagtgatgcaaat
gcaacggatactcatactatggtgtgggatttatccgacagcctaacgggactagcacct
gagggcgatactttgagtgttgatccaagtgacttagccgctggtgtttatacgatcgcg
gtggtggtgacggattcaggttcgccttcgttaagtgacagcgtgcagactagctttact
gtcacttcgatcctgccagccttgtcgaatagtgtcgatagtgaccaagatggtttgtcc
gactttgaagagggttaccaggatacagaccaagacggtatttatgattacttagataat
caaaatttatcgtctaatgttgtcggtcatctcatttcggaaggcagttataacttactt
gaatcagatcccggaaccagtttacggctgggtcaaggtgcgctgcagctcggtcgtgaa
ggcaccttagtggaagaaaatgacatgtatagtgatactcaatcgcttgacagtgatgtg
gttacacatgttggagggatctttgattttgaagttcacaatattcctgagcatgggcaa
tcggtgaatgtggtgatccctcagcgtgctcagatcccggaaaatgcggtttatcgtaaa
tggtctccggagggtggctggcgtacttatgtggaagatgctaacaatctgatttcgtca
gccccaggctcagaaggttattgtcccccccctggagatcctgcgtttgaagttggcttg
gtgagcgggtattggtgtatacagctaacgatcgaagatggaggtcccaatgatgatgat
gcgacagccaatggaagcattgtcgatccaagtggtatggcgactcgtcagccaattacc
gaaggggtgagtgcttctggtggcggctcatttggtggcgtggcgggtttgctattggtt
gtgctggtgatggttcgccgtcgtttttcgtaa
DBGET
integrated database retrieval system
