Agarivorans sp. QJM3NY_29: ACRRS0_06480
Help
Entry
ACRRS0_06480 CDS
T11369
Name
(GenBank) RHS repeat-associated core domain-containing protein
Organism
agaq Agarivorans sp. QJM3NY_29
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RHS_repeat
TEN_YD-shell
RHS
YwqJ-deaminase
DUF6531
OCRE
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XUY84653
LinkDB
All DBs
Position
181891..186288
Genome browser
AA seq
1465 aa
AA seq
DB search
MDGTQKQVVTANDGFAYEFFKGIKKNTSTSISFTDVASVELFLTKFNGAVNAAGKGLHTV
YLLLPLNKRKQPRQQLVNALLSGEIWCYQQRVKQLPISSPASTPSRSSSVQNEPKAPGGR
SKTQVQTQDQYASEPVAQSIDHQDTVLCGDPVAMSSGEEVLQLVDVHLQGHVALCWQRIY
RSSCSHLDLGLGLGWRSNFHYSLEEDFGEQPCWQFTDALGQVFRFPYVAVGAKSIQVKSG
MVLRHQSDDITISHADGKTLYFSKTQQAWLLTKLSEGVDRAFLLSYSAAHRLIGVAVNRS
QRIYLRYDLKGHLLEVCSSRAQDAQIYANYGYDDKRRLIRASNRFAQQEHYRYQQGLLIQ
RTRASGFRHYFRWDGSDQRARCVEQWGDNQHYHYRFEYQPEQGISRSFDSYNNCWTYLHN
AQGQLLKKNAPDGATWRFEYDEFQRKISQTEPNGTTTCFHYNSAGQLVAELHPNQSLTCY
SYNRLGFVNQIDYADGSSLKREYNSLGLLTQEIDVQGVVTQYRYDAHSRLINKSAGNQPA
QLFWWNEQGLLSAKQVGDALTRYSYNAIGECNGEVNAYGWVSQYVRNAQGQLIEVVHYHQ
DQPQQTRCQRYAYDQAGRLSARTNPLGHTTNFEYQGLSQPSKQINPDGSWLAFSYDKERN
LTAIERSDGQRYQLEYDSCERIRQTIGFDGREQAYQYNLAGQLIQLVENSERLVQLKRNS
LGQVIEQRSTANGMTLINDFAYNLQGKLSQANNSARKIRFNYFANGQLQEHWQDDWHIRH
QLNQQGLRSQTRLPDSSMLRYRYDEHGRLSELTLNGQALISRQFNASGSELNRELSASHQ
QHNHYDPQGRLLKQEWQGDTLNLARDYRFDDGDQLLGVNDSELGAQNYSYDPLSQLTKAT
SHSGDNQAFSFDSFANPKQGELVGDKLLMLNERSYRYDRYGNQVLASQSKVRQQRVFNGL
NQLVRLSEGGKHAEYHYDALGRRSRKITSSGTTDYLWEGQQLIGEHCQGQFTWYVYEPNS
HRPLVMIKQGQVYHYHLDHIGTPIRLSDEQGNIVWQAHYQAYGAIEQLSVKQIDNPLRFQ
GQYFDDESGLHYNHHRYYCPQQGRYIQQDPIELLGGLNLYQYTPSPTNWVDPLGLCKEDG
APLVAGLPLLAPAAQPLASTGSQVLGQYATRQAANQAVYAVAERSLLASLIPKTPWALLF
YSGEVGAGSDDVAGFIQQQAQQDELGHRTWLANGGDGSIEEWKSRGKPSELVANVTEETG
LADEFKLSDGQKNDIVSIRKIFGDNLNSRVEIEANALIAAGRTDGVALSCAGIAEQGIVG
ETFQNIPFSMKKGRTFPGTERFGENNGFIRITDQAAYLDEVTRLYAKTGNDLNPVIRDQI
KAHVRQGAEFGLRDEKGLKGMPGLHAEIQSANYVLNQVKAKPGFDISNVQVSTYKLQNSP
GQGGPFTACNHCSGILQGFDILTGH
NT seq
4398 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatggaacccaaaaacaagttgtaaccgctaacgatggttttgcttatgagtttttt
aaaggcattaaaaaaaatacctcaacatcaatttcttttactgatgtcgcgagcgttgag
ctgtttttaacgaagtttaatggggccgtcaatgctgctggaaaagggctgcatacggtt
tatcttttgttgcctttaaacaagcgaaagcagccgcggcaacagcttgtaaatgcttta
ctctctggcgaaatttggtgttatcagcagcgggtaaaacagttgccgatttcatctcct
gcttcgactccctctcggagttcatccgtccaaaatgaacccaaagctccgggagggcgt
tcgaagactcaagtacaaactcaagaccagtacgcaagtgagcctgttgcacaatcgatt
gatcatcaagataccgtattgtgcggcgatcctgttgcgatgagtagtggtgaggaagtc
cttcagttggtagatgttcatctacaggggcatgtagcactgtgctggcagcgtatttat
cgttctagttgctcccaccttgatctgggactgggtctgggttggcgtagtaattttcat
tatagcttagaggaagatttcggcgaacagccgtgctggcaatttaccgacgcattgggt
caagtattccgctttccatatgttgccgtcggagccaaaagcattcaagttaaatccggt
atggtgctgcggcatcaaagtgatgatattaccatcagtcacgcggatggcaaaacactg
tactttagtaaaacgcagcaagcttggttactgaccaaattaagtgaaggagtggatcgt
gcattcttgttgagctattcagctgcgcatcgactgattggtgtcgcggtgaatcgtagt
caacggatctatttacgttacgacctaaagggccatttacttgaggtgtgctctagtaga
gctcaagatgcgcaaatttatgcgaattatggttacgatgacaagcgtcggttgattcgc
gcaagcaatcgctttgctcagcaagagcactaccgttatcagcaaggtttgttgatccaa
agaacacgcgcttcgggatttcgtcactatttccgatgggatggtagtgaccaacgcgct
cggtgtgttgagcagtggggcgataatcagcactatcattatcgttttgagtatcagccg
gaacaagggattagccgtagtttcgatagttataataactgttggacttacttgcataat
gcgcagggtcaattgcttaaaaaaaatgcgcccgatggtgccacttggcgatttgaatat
gatgagttccagcgaaaaattagccaaactgaaccaaatgggacaactacgtgtttccat
tataatagtgcaggccagttagttgccgagctccatcctaaccaaagcttgacttgttat
tcctataatcgtttaggttttgtgaatcagattgactatgccgatggttcatcactcaaa
cgggaatacaacagcttaggtttacttacccaagaaatcgacgttcaaggtgtggtcact
caatatcgctacgatgcgcacagtcgtttaatcaacaagtctgccggtaatcagcctgca
cagttattttggtggaatgaacaaggtctgctgagcgccaagcaagtgggcgatgccctg
acgcgctacagctataacgctattggggaatgtaatggtgaagtgaatgcctacggttgg
gttagtcagtatgttcgtaatgcccaagggcagctgattgaggtagttcattatcaccaa
gaccagccacagcaaacccggtgccagcgatacgcctatgaccaagctggacggctcagc
gcccgaaccaacccgcttggtcataccaccaactttgaatatcaaggattatcgcagcct
agtaaacagattaaccccgatggttcatggcttgcttttagctacgataaggagcgcaac
ctaacagccattgagcgtagcgacggtcagcgttatcaattggaatacgacagttgtgag
cgtatacgtcaaaccatcggttttgatgggcgcgagcaagcctatcaatacaacctggct
ggtcaactaatacagttagtggaaaacagcgagcgtttggtgcagctgaagcgaaatagc
ttaggccaagtgattgagcagcgtagcaccgccaatggcatgactttaattaacgacttt
gcttacaacttacaaggcaaactaagccaagccaataatagcgctcgtaaaattcgtttt
aattactttgccaatggtcagttacaggaacactggcaagacgactggcatatccgccat
cagcttaatcagcaaggcttgcgcagccaaacccgcttacctgacagcagtatgcttcgt
tatcgctacgatgaacacggtcgcttaagtgaactaacattgaatggccaagcactgata
tcccgccagtttaatgccagcggcagcgagctaaaccgcgagctcagtgctagtcatcaa
cagcataatcattacgaccctcaagggcgtttgctgaagcaagagtggcagggcgacaca
ttaaatctggcgcgtgactaccgttttgatgatggcgaccaattgctgggggtcaacgat
agtgagctgggcgcacaaaattacagctacgacccgcttagccaactcaccaaggccacc
tctcacagcggtgacaatcaagcctttagtttcgacagttttgctaaccccaaacaaggc
gagttggtcggcgataaactgctgatgctcaacgagcgcagttaccgctacgaccgctac
ggcaatcaagtactcgctagccaaagtaaggtgcgtcagcagcgggtatttaatggtttg
aaccaactggtccggctgagtgaggggggaaaacatgctgaatatcattacgatgctctt
gggcgtcgtagccgtaaaatcacctccagtggcaccactgactatctctgggagggccaa
cagctaatcggtgaacactgccaagggcaatttacctggtatgtgtacgagcctaatagt
caccgcccactggtcatgattaaacaagggcaggtttaccactaccatttagaccatatt
ggcacgcctattcgtttaagtgatgagcaaggcaacatcgtatggcaagcccactatcag
gcctacggcgcaatagagcaactaagcgttaagcaaatagacaacccgctgcgttttcaa
ggccaatactttgatgatgaaagcggcctgcattataaccatcaccgttactactgccca
cagcaagggcgctacatccagcaagacccgattgaactactcggtggcttaaacctctac
caatacactccaagcccgactaactgggtagatcctttgggtttgtgtaaagaggatggt
gcccctttggttgctggactccctctattggctccggctgctcagcccttagcatcaaca
ggctcgcaagtattaggacaatacgctacgcggcaagccgccaaccaagcggtttatgct
gttgcggaaaggtctttattggcgtcattgatacccaaaacaccatgggcactgctgttt
tattcgggtgaagtcggagcgggttcagatgatgtagccggttttattcagcaacaagct
cagcaagatgagctggggcatcgaacgtggttggctaatggtggtgatggtagtattgag
gagtggaagtctcggggtaagccctctgagttggtggctaatgttactgaggaaactggc
ttggcagatgaatttaagctgagcgatgggcagaaaaatgatatagtttctatcagaaaa
atatttggagataatttaaattctagagttgaaattgaagctaatgcattaattgcagca
ggtagaacggatggggtagcactttcttgtgctggtatagctgagcaaggcattgtgggt
gaaacctttcaaaatattcctttctctatgaaaaaaggaagaactttcccgggcactgag
aggtttggggaaaataatggtttcatcagaataacagaccaagcggcttacttggatgaa
gtaacaaggctgtatgcgaaaactggtaatgatttaaatcctgtgataagggaccaaatc
aaagcgcatgtgaggcaaggtgccgagtttggacttcgtgatgaaaaagggttgaagggt
atgccagggcttcatgcggaaatacagtctgcaaattatgtgttgaatcaagtgaaagca
aagccaggttttgatattagtaacgtacaagtttcaacctataagcttcagaacagccct
ggtcaaggtgggccatttacagcttgtaatcattgtagtggtattttacagggttttgat
atattgactggtcattga
DBGET
integrated database retrieval system