KEGG   Agarivorans sp. OAG1: OAG1_01650
Entry
OAG1_01650        CDS       T09980                                 
Name
(GenBank) type IV secretion protein Rhs
Organism
agar  Agarivorans sp. OAG1
SSDB
Motif
Pfam: RHS_repeat DUF6531 RHS TEN_YD-shell HNH
Other DBs
NCBI-ProteinID: BEU01365
LinkDB
Position
179257..183522
AA seq 1421 aa
MDGTQKEVVTGIDGFAYDFFTGKRNVGNKPAFSDAEKAAAFLANFAGAADSNGKGLRRLY
RLVTTTPAGDPHQKLITALTNGEVWFQRQAEKAIPQHSPASRPSWSSSVPNEPKAPGGRS
KTQQQGKNQNSSDDVTQAVDHPDTQTCGDPIVMSSGEEVLQLDDVCLQGHRELVWQRTYR
SSLSHQDVGLGLGWRSNFHYSLEQLQGEQAGWLFTDALGHQQHFPYVVVGAKSSQVKSGM
VLQHQLENIVISSANGKTLQFSKQQEQWLLTKISDGVDTHYRLSYSVAPRLTHVEINHSQ
QLFLRYDLEGRLVELLSSKAETAQSYASYTYDEQGHLSTAANRLGQQEQYRYQQGLLIQR
TRASGFSHYFSWDGCEQNARCIEQWGDNEHYHYRFEYELEQGLSRSFDSYGNCWTYWHNA
QGQILKKVSPDGACWLFEYDELQRKISETDPNGATTRYHYNAQGQLDAELAPNQNLTRYS
YNRLGFVTQVDYADGSSLKREYNSLGLLTTETDVQGVVTEYRYDAQSRLVSKIASNQPNQ
QFWWNEQGLLSAKQVGEALIRYSYNAIGECNGEVDGKGWVGQYKRDERGNIIEVLSYHQD
SPEQCQRRAYRYDEAGRVTKVTDSLGRSTSYEYQGLSQPAKQINPDGSWLAFCYDKERNL
TAISRSDEQVYQLEYDSCERVSKTIGFDGREQHYQYNLAGQLTQVAENSERLIQLKRNSL
GQVTEQRSTANGITLINDFTYDLQGKLSQANNAARKLRFSYFANGQLQENWQDNWQSIYQ
LNSQGLRSHTQLPDGNALTYRYDEQGRLSAIWFNQQPVISRSFNAVGEEVSRELSKRHQL
HHHYDAQGRLLSQQWQLEQPEQAPSIIERHYRFDAGDQLLGVSDSELGDNNYSYDALSQL
TKATSHNANNQQFELDSFANPKQADMLGDKLLGDEQCSYRYDRYGNQVLASQSKVRQQRV
FNGLNQLVRLSQGRDNTVYHYDALGRRSCKITAQGQTDYLWEGNQLIGEHSQGQFTWYVY
EPDSHRPLVMIKQGQVYHYHLDHIGTPVRLSDEQGNIVWQAHYQAYGSIEQLSVKQIDNP
LRFQGQYFDEESGLHYNFHRYYCPHQGRYIQQDPIELLGGLNLYQYTPSPTNWVDPLGLC
KEDGNPLMNAAYFIGGITKFWGESTQAAIEAIVANPVEVAYDAAYTIVDTAYYPIDYVTR
PFGFTTGAVDRTIHRVNTGIDGIEQFADTVSVNWEQGDWEGLGASTAAVGMVLNPKSLVK
TAPGPSRVNRNISSEFTGKYKGKSVVLKNIEVRKIHYTRRSRESLAELRKKFDSSVRKNF
LKSIGNDAEKVNLMKAAGLSDAQIAKVAQGGVPKGYNVHHKIPIDDGGDNDFSNLVLIRN
NSEHYTITNAQKDLTSDIPYGSTAIVEFPIPPGFLYPMNVK
NT seq 4266 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggatggaacccaaaaagaagtagtcactggaattgacggctttgcttatgactttttt
actggcaaacgtaatgtgggcaacaagcctgcctttagtgatgccgaaaaagcagcggca
tttttagctaactttgcaggtgctgctgatagcaatggcaaaggtttacgccgtttatac
cgtttggtcactactacgccggctggcgatccgcatcagaaattaattaccgcgttaacg
aatggtgaggtgtggtttcagcgccaagctgaaaaagctattcctcaacattctccagct
tcgaggccctcttggagttcatccgtcccaaatgaacccaaagctccaggagggcgctcg
aagacccaacagcaaggtaaaaaccaaaatagcagtgatgacgtcactcaagctgttgac
catcccgatactcaaacttgcggtgatcccattgtaatgagcagcggtgaagaagtgctg
caattagacgatgtgtgcttgcaaggtcatcgtgaattagtttggcagcgcacttatcgc
tcaagtctttcgcatcaagatgtgggtttaggtttaggctggcgaagtaattttcattac
agtttggaacagttacagggtgagcaagcgggttggttgtttaccgatgcactagggcat
cagcagcattttccttatgtggtcgtcggcgctaaaagtagccaggttaagtcgggcatg
gtgttgcaacatcagcttgaaaacattgttattagcagtgccaatggcaaaactttgcag
ttttctaagcagcaagaacagtggctgcttaccaaaatcagtgatggtgtcgatacgcat
tatcgacttagttattctgttgctcctcgcttaacccatgttgaaatcaaccatagccaa
caactgttcctacgctatgacctagaaggtcggctggttgaattactcagctctaaagcc
gaaacagcgcaaagctatgcaagttatacctatgatgaacaggggcatttaagcactgcg
gccaaccgtttgggtcagcaagaacagtatcgttatcagcaaggtttattgattcaacga
acccgcgcttcggggttttctcactacttttcttgggatggctgtgagcaaaatgcgcgt
tgtatagagcaatggggcgataacgagcattatcactatcgatttgagtatgagctagag
caaggccttagccgcagctttgatagttacggaaactgttggacttactggcataacgca
caaggtcaaatccttaaaaaagtttcgcccgacggcgcttgttggttatttgaatacgat
gaactacagcgcaaaattagtgaaacagacccaaatggcgcgactactcgttaccattac
aatgcgcagggccagttagacgctgagctagcgccaaatcaaaatcttactcgttatagc
tataatcgcttgggttttgttacacaggttgactatgccgacggctcatcgcttaagcgt
gagtacaacagccttggtttgttaaccacagaaaccgatgtacaaggtgtggtgaccgaa
taccgctacgatgcgcaaagccgtttggtgagtaaaattgccagtaaccagcctaatcaa
caattttggtggaatgagcaaggcttgttgagcgccaaacaagtaggtgaagcgttaatt
cgctatagctataacgctattggtgagtgcaatggtgaagtagatggaaaaggctgggtt
ggccaatacaaacgcgatgaacgtggcaacattattgaggtcttgtcttatcatcaggat
tcgccagagcaatgtcagcgtagggcctatcgctatgatgaagcagggcgagtgactaaa
gtgaccgactcgctagggcgtagtacaagctacgaatatcaaggcttgtcgcagccagct
aaacagattaaccccgacggttcatggttggctttttgttacgataaagaacgtaatctt
accgccatttcacgcagcgacgagcaggtttatcaactggaatacgacagttgcgaacgt
gttagcaaaaccattggttttgatggccgcgagcagcattaccaatacaacctagcgggt
cagcttactcaagttgcagaaaatagtgagcggctgattcagctaaaacgcaattctcta
ggtcaggtaaccgagcagcgcagcaccgctaatggcattaccctgattaacgattttacc
tatgacttacaaggtaagttgagccaagccaacaatgctgcgcgcaaactacgttttagc
tacttcgctaatggccagttgcaagaaaactggcaagacaattggcaatctatttatcaa
ttgaactcacaaggattgcgcagccatactcaacttcccgacggcaatgccttaacttat
cgctacgatgaacaagggcgtttatctgcgatatggtttaaccagcagcctgtgataagt
cgcagctttaacgctgttggtgaagaagtaagccgcgagctaagcaagcgccaccaattg
catcatcactatgatgcacaaggccgcttgttaagccagcaatggcagttagaacaacct
gaacaagcgccaagcattattgagcgtcattaccgttttgatgcgggcgatcaactttta
ggcgtgagtgacagcgagctgggcgacaataactacagttatgatgcgcttagccaactc
accaaggctactagtcacaatgctaataaccagcaatttgagctggatagttttgccaac
cccaaacaagccgacatgttgggtgacaaactgctgggtgatgagcagtgtagctaccgt
tatgatcgctacggtaaccaagtactcgccagccaaagtaaggtgcgtcagcaacgcgta
tttaacggcttaaaccaattagttaggcttagccaaggccgcgacaacaccgtttatcac
tacgatgccctaggccgtcgcagctgcaaaattaccgcccaagggcaaaccgattaccta
tgggaaggtaatcaactaattggtgaacatagccaaggccaatttacctggtatgtctac
gagcccgatagccaccgccctttagtaatgattaaacagggtcaggtttatcattaccac
ctcgaccatattggtacgcctgttcgcttaagcgacgagcaaggcaatatagtatggcaa
gcccattaccaagcctatggttcgatagaacaactaagcgttaagcaaatagacaacccg
ctgcgctttcaaggtcaatacttcgatgaagagagcggcctgcactataactttcaccgc
tactactgcccgcatcagggcaggtacatacaacaagacccaattgaattactcggtggc
ttaaacctttatcaatacaccccaagtccaactaactgggtagaccccttagggttatgt
aaagaagatggtaacccattaatgaatgcagcctatttcattggtggtatcacaaagttt
tggggagagagcactcaagccgcaatagaggcaatagtcgcgaaccctgttgaggtggct
tatgatgccgcttataccattgttgatacagcatattatcctattgattatgtgacccgc
ccatttggttttacaaccggtgcagtggatagaacaatacatcgtgttaatacaggcatt
gatggaatagaacagtttgctgatactgtgtctgtgaattgggagcagggtgattgggaa
gggcttggtgccagtaccgctgccgttgggatggttttaaaccctaagtcactagttaaa
actgcacctggtccttcgagggtaaatcggaatattagttcagaatttactggaaagtat
aaaggtaagtcagttgtcttgaaaaatattgaagttcgaaaaatccactatacccgtcga
agtagagaatcattggctgagttgaggaaaaaatttgactcttctgttagaaagaacttc
ttaaagtcgataggcaatgatgctgagaaagttaaccttatgaaagcagcaggcttaagc
gatgctcaaattgcaaaagttgcacaaggaggcgttccaaaggggtacaacgtacaccat
aagatacctattgacgacggtggagataatgacttctcaaatctagtattaattagaaat
aactctgagcactatactataactaatgctcagaaggatttaacgagcgatattccatat
ggtagtacagcaatagttgagtttccgattccccccggttttctttacccgatgaacgta
aaatag

DBGET integrated database retrieval system