Agarivorans sp. OAG1: OAG1_33190
Help
Entry
OAG1_33190 CDS
T09980
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K01176
alpha-amylase [EC:
3.2.1.1
]
Organism
agar
Agarivorans sp. OAG1
Pathway
agar00500
Starch and sucrose metabolism
agar01100
Metabolic pathways
agar01110
Biosynthesis of secondary metabolites
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
agar00001
]
09100 Metabolism
09101 Carbohydrate metabolism
00500 Starch and sucrose metabolism
OAG1_33190
Enzymes [BR:
agar01000
]
3. Hydrolases
3.2 Glycosylases
3.2.1 Glycosidases, i.e. enzymes that hydrolyse O- and S-glycosyl compounds
3.2.1.1 alpha-amylase
OAG1_33190
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Alpha-amylase
CBM26
PKD_4
X25_BaPul_like
K319L-like_PKD
Fn3_assoc
DUF642
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BEU04519
LinkDB
All DBs
Position
3746660..3749986
Genome browser
AA seq
1108 aa
AA seq
DB search
MNKVVLLGLLTASLSAQAEWEFRGTPNGWQTTAMDQVSSTEFQTCQTFGNNDPRFKIDRW
GNWQEAYPNQDYRVSAGSHQITFYSDSKNIDVVSVANCDSNQAPTAVISPANAQTVDAGT
SITFSAGGSNDSDGSIASYSWSTGETTETISVTFTQSDTVTLQVTDNQGAVSNTASVDIT
VAGEEPPVWCFRGTPNGWGQTAMVRDAASGLYTLTQAFAGEESPARFKVAACSDNGSWGE
NYPNQDFQVEDNTNYNISFDASSKAITADIVIKETKPELTVSPNSSDFSTDTLAVTLSYK
GENVTDSTYQLSTTGGTQGVSFNNGDIINIGGELAVGESLELQVFVANAQGSVSQTYTYN
KIAAPETGFTVYLNAPAEWTPSIHHWDALPAGSEPDTGWPGDAMTALGENWHEFKFENSD
SSKLIFSNQGNSQTEDLFRDKDGCYTISTQSWTDTCDLPSNDANVSIDPAVSTFWTNEVS
ITLGATGDDVTGGLYTTDGSDPVNGIAYSNGETISVGSNLAIGESLQLCLYAENANSNAN
KCFTITKVEQPTASDFTWDNANVYFVITDRFNDGNSSNNNSYGRPSVDATGKNIGTFHGG
DIAGLTAKLDEGYFTDLGINAIWLTAPYEQAHGFVGGGSDGDFAHYAYHGYYVQDYTNLD
ANMGTPAEFKAFVDKAHSQGIRVVMDVVMNHAGYNTLKDMDEFNYGSDTAGPNWTPSNGQ
NWFGYHDFINYDGDENLWLNWWGKDWIRVGLPGYDGCGGDDLTKCLAFLPDFKTESTQQV
GIPPFLANKSTFGQGYLSNYQAQGTKRVRDWITEWLVQYVRDYGIDGFRVDTAKHVTNDH
WAYLISESKAALSEWRANNPDAPGADWNDEFWATAEVFGHGFNQSNYHTDGGFDSVINFS
FKNTVNGMISSTDTMLSEFANYASQVNSSSDWNSLSYISSHDTGAVFYNGDDNRQKRAGT
ALLLLPGGVQVFYGDELGRVNGDGGSDADQGSRSSIDWSKAGNSVHQHWQKVGQFRRDNP
AVGAGQHIAVSQSNGKAFARTWTNPVSGESNNVVVVVDGSGTVSVNVAGYFDNGSSVRNA
YTGSIATVSNGTVSFDAGSEGLILIEAI
NT seq
3327 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacaaggtagtactccttggtttgttaacggcctccctttctgctcaagcagaatgg
gagttccgtggcacgccaaatggctggcaaaccaccgccatggatcaggtatctagtaca
gaatttcaaacctgccaaacctttggcaataacgacccacgttttaaaattgaccgttgg
ggcaattggcaagaagcctaccctaaccaagactaccgcgtatcggccggtagccatcag
attactttttacagcgacagcaaaaatatcgacgtagtatcggtagcaaactgtgatagt
aaccaagcgccaactgctgttatctcaccagcaaatgcgcaaactgtagatgctggcact
agcatcaccttctcggccggtggctctaacgacagcgatggaagcattgctagctactcg
tggagcactggtgaaaccactgaaacgattagtgttacctttactcaaagcgacaccgtt
accttacaagtaaccgacaaccaaggtgcagtgagcaataccgccagtgtagacattacc
gttgcgggcgaagaaccgccggtatggtgtttccgcggcacaccaaatggttggggccaa
acagcaatggtacgcgacgcggccagcggcttatacacactgactcaagcctttgcagga
gaagaaagcccagcacgctttaaagttgccgcttgttcagataacggtagctggggtgag
aactaccctaaccaagatttccaagtagaagacaatactaactataacatcagttttgat
gcttcaagcaaagccattaccgctgacatagtgattaaagaaactaagccggagttaacg
gtaagccctaacagcagcgattttagcaccgacacactagcggtaacattaagctacaaa
ggtgaaaacgttactgatagcacctaccaactaagcactactggtggcacccaaggtgtg
agctttaacaatggcgacatcatcaatattggtggcgagctggctgtaggtgaatccctt
gagttacaagtatttgtagccaatgctcaaggttcggttagtcaaacttatacctacaac
aagattgcagcgcctgaaactggctttactgtttatctaaacgcgccagcagaatggacg
ccgtctattcaccactgggatgcacttccagctggttctgagcccgatactggctggcct
ggtgatgcaatgactgctctaggtgaaaactggcatgagtttaagtttgagaacagcgat
tcaagcaaactaatctttagcaaccaaggcaatagccaaacggaagatctattccgcgat
aaagatggctgttacaccattagcactcagagttggacagatacctgtgacttaccaagc
aatgatgccaacgtaagcatagatcctgcagtaagcactttctggactaacgaagtaagc
attaccttaggtgctactggtgatgacgttaccggtggtttatacactaccgatggtagc
gatccggtaaacggtattgcgtatagcaatggcgaaaccatttcggttggcagcaactta
gccattggtgagtctctacaactatgtttatatgcagagaacgctaacagcaacgctaac
aaatgtttcaccattaccaaagttgagcagcctacagcatctgatttcacatgggacaac
gccaacgtttacttcgttatcaccgaccgttttaacgatggtaactcaagcaataacaac
tcttatggtcgcccaagtgttgatgctacaggcaaaaacattggtactttccatggtggt
gatattgctggcttaaccgctaaattggatgaaggctacttcaccgatcttggtattaac
gccatttggttaactgcaccttacgaacaagctcatggctttgtaggcggcggcagcgac
ggtgactttgctcactacgcttaccacggttactacgtgcaagattacaccaaccttgat
gccaacatgggcacacctgcagagtttaaagcctttgtagataaagcgcatagccaaggc
attcgtgttgttatggatgtggtaatgaaccacgcaggttacaacaccctaaaagacatg
gatgagtttaactacggctctgatactgccggtccaaattggacaccaagcaatggtcaa
aactggttcggctaccatgatttcatcaactacgatggcgatgagaacctatggttgaac
tggtggggtaaagattggatacgtgtaggtttacctggctacgatggttgtggcggtgac
gacttaactaagtgtttagccttcttgccagactttaaaaccgagtcaactcaacaagtg
ggtattcctccgttcttagccaacaaatctacctttggtcaaggctacctaagtaactac
caagcccaaggtactaagcgtgttcgcgattggattactgagtggttagtgcaatatgta
cgtgactacggtattgatggtttccgagtagataccgctaaacacgtaaccaacgaccac
tgggcttacttaatcagcgagtcaaaagctgcattaagcgagtggcgtgctaacaaccca
gatgcaccgggtgcagattggaacgatgagttttgggcaactgctgaagtatttggccat
ggctttaaccagtctaactaccataccgatggtggcttcgattctgtgattaactttagt
ttcaaaaacacagttaatggcatgatttctagcaccgacaccatgctaagtgagtttgca
aactacgctagtcaagttaacagctctagcgattggaactcactaagctacatctctagc
cacgatactggcgcggtgttctacaacggtgacgacaaccgtcaaaaacgtgcgggaact
gcattgttgctactaccaggtggtgtgcaagtgttctacggtgatgaacttggccgggta
aatggcgatggtggttcagatgccgaccaaggcagccgttcaagtattgattggagcaaa
gcaggtaacagcgttcaccaacactggcaaaaagtgggtcaattccgtcgtgacaaccca
gcagtaggcgccggccaacacattgctgttagccagtctaacggcaaagcttttgcacgt
acttggacgaacccagtatcgggtgaaagcaacaatgttgttgtagtggtagatggctca
ggcacagtgtctgtaaatgttgctggctacttcgacaacggcagcagcgtgcgcaacgct
tacactggctctattgccaccgtaagcaatggcactgttagctttgatgcgggcagcgaa
gggctgatcttaatcgaagcaatataa
DBGET
integrated database retrieval system