Agarivorans sp. Z349TD_7: ACRRSZ_14360
Help
Entry
ACRRSZ_14360 CDS
T11368
Symbol
ligA
Name
(GenBank) NAD-dependent DNA ligase LigA
Organism
agaz Agarivorans sp. Z349TD_7
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XUY86258
LinkDB
All DBs
Position
complement(3500974..3502983)
Genome browser
AA seq
669 aa
AA seq
DB search
MDKPEQQIKQLISLLEQYNYHYYVLDQPLVPDAEYDRIFRQLQGLEKNHPELLSKDSPTQ
RVSGVPLSVFEQVQHEMPMLSLDNVFSEAELSAFNKRISERLQRTEAIEYCVEPKLDGLA
ISLLYVDGMLVQAATRGDGSTGENVTENVKTIRSIPLRLRGEQWPARLEVRGEVFMLKQG
FERLNLLAKEKGEKGFANPRNAAAGSLRQLDSKITATRPLAFYAYSLGVVSEPLSQSHYQ
NLQKLKDFGLPVCPEVRTVSGHQACFDYYQEIGERRNALAYEIDGVVYKVDALALQQQLG
FVARAPRWATAHKYPAQEEITVLRDVEFQVGRTGAITPVARLEPVFVGGVTVSNATLHNA
DEIERLAVKIGDSVVVRRAGDVIPQIAGVLLERRPEDAKEIVFPMTCPVCDSEIERIEGE
AVARCVAGLRCGAQRKEALKHFVSRKALDIDGIGDKLVEQLVDAQLLETPLDLFHLADKQ
DALMGLERMGEKSVNKLLEGIDAARNTSLPRFIYSLGIREVGEATANNLALHFKQLDAII
AASLEQLQDVPDVGEIVAKHLRFFFTQQQNALLVEALANELTWPAIESVVVEDLVLGGKV
VVLTGTLSQLGRSEAKQALQGLGAKVTGSVSKKTDIVIAGEAAGSKLIKAQDLGIEIWDE
QQLVDLLQS
NT seq
2010 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggacaagccagaacaacaaattaagcaactgatctccctgcttgagcaatataattac
cattactacgtgcttgaccagcctttggttcccgatgccgagtatgaccgaatatttcgt
cagctacagggtttagaaaaaaaccatcctgagctgctaagcaaggattctccgactcaa
cgagtcagcggagtgcctttgtcggtatttgagcaggttcagcatgaaatgccgatgttg
tctctcgataatgtgtttagcgaagctgaattaagcgcatttaacaagcgaatctcagag
cgtttacagcgcactgaagccattgaatattgtgtagaacccaagctcgatggcttagcg
ataagtttattgtatgtggatggtatgttggtgcaagcggcaacgcgtggtgatgggagt
actggcgaaaatgtgaccgagaacgtcaaaaccattcgttcgatccctttgcggttgcgt
ggagagcaatggccggctcgtttagaggttcggggtgaagtgttcatgctgaaacaaggt
tttgagcggctcaatttactcgctaaagaaaagggtgaaaaaggtttcgctaacccacgt
aatgctgccgctggaagtttacgccagctcgattcgaaaattaccgccacccgtccatta
gccttttatgcttattcgcttggtgtggtgagtgagcctttgagtcagagtcattaccag
aatttgcagaaattaaaagattttgggctgccagtttgtcctgaggttcgaacggtgagt
ggccatcaagcttgctttgattattatcaggaaatcggcgaacgtcgtaatgctttagct
tatgaaatcgacggtgtggtgtataaagttgacgcgctcgctttacagcaacaactgggg
tttgttgcgcgagcaccgcgttgggcgacggctcataaatatcctgcacaagaagagatc
acggtgctgcgagatgtcgagtttcaggttgggcgtactggtgcgattactcccgtagct
cggcttgagccagtatttgtggggggggtgacggtaagtaatgcaaccttacacaatgcg
gatgaaatcgagcgattggcggtaaaaattggcgatagtgtggtggtacgccgcgctggt
gatgtgatccctcaaattgcaggggtattgttagagcgccgtccagaagatgctaaagag
atcgtcttcccgatgacttgtccagtatgcgatagcgaaattgaacgtatcgaaggggaa
gcagtggctcgttgtgttgcaggcttacgttgcggcgcacaacgtaaagaagctttaaag
cactttgtctcacgtaaggccttagatattgatggtattggcgataagttggtggaacag
ctggtcgatgcgcaattgctagaaacaccactcgatttgttccatctcgcggataagcaa
gacgcgctcatgggattggagcgaatgggtgaaaagtcggtgaataaactgctggagggg
atcgatgctgcgagaaataccagtttgccacgttttatctattctttggggatccgcgaa
gtgggtgaagcgaccgctaataatctagctttacattttaagcaactggacgcgattatt
gccgccagcctagagcagctacaagacgtgccagatgtcggtgagattgttgcaaaacat
cttcgattctttttcacccagcagcaaaatgctttattagttgaagctttagccaatgaa
ttgacttggcctgcaattgagtctgttgttgtcgaagatctggtcttaggcggtaaggtg
gtggtactgactggtaccctcagtcagttggggcgcagtgaagcgaaacaggccttacaa
ggtttgggagctaaggttacggggagtgtttccaagaaaaccgatatcgtgattgccggg
gaagccgcagggtctaagctgattaaggctcaagacttaggcatcgaaatttgggatgag
cagcagttagtggatttactgcaaagttga
DBGET
integrated database retrieval system