Aphidius gifuensis: 122847533
Help
Entry
122847533 CDS
T07796
Name
(RefSeq) symplekin
KO
K06100
symplekin
Organism
agif
Aphidius gifuensis
Pathway
agif03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
agif00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
122847533
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
agif03021
]
122847533
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
agif03019
]
122847533
Transcription machinery [BR:
agif03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase II system
Other transcription-related factors
Transcription termination factor
122847533
Messenger RNA biogenesis [BR:
agif03019
]
Eukaryotic type
mRNA processing factors
3' end processing
Cleavage stimulation factor (CSTF) complex
122847533
U7-dependent histone pre-mRNA processing factors
122847533
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Symplekin_C
SYMPK_PTA1_N
HEAT_EZ
HEAT_2
INTS1_R4
PRD_Mga
DUF445
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122847533
NCBI-ProteinID:
XP_044001228
LinkDB
All DBs
Position
LG1:7848952..7852618
Genome browser
AA seq
1124 aa
AA seq
DB search
MEEPLIHEKMEQDTISDDTVVQWLNEASMSQCEKVKTNNLSKIQEVILNKDIEMLPDYID
EVLAFVVDKSAEVRKTICSFIEVAGDKQPDMIPKMLPSLLRLLSDDASAVVKRALRTSGR
ILRAALKWVASAVNVTPEIETAWGQISTLKVLILEMIGSDNDGIRTQAVKFLEGVVLLQT
YPDSETTKKQDDFSLEDIPLTLKIARRRKLEEEAHHVLDELIKFHGSVHVSSLNLMTCMG
SLATIAKFRPQFTSNVITALQSLQNDLPPTLTDSQVTSVTKHLKLTLLTLMKCPGSIEFA
STIAKQLAKLGAKEQEIMKAYPKAEDIRKMKRRQQEIAAATAAKRIKLETILPDDDDDTE
NIIMEPIKLPDLVELTETYIVEHLSVEVATDLVMDSMAWVPDTMTTIFQREYQPPGTSDI
NIQRQTVAKLLSAQIKQAIAKKFKKDIKDDDAVMEDLIKNPTITVAEAKRERKREKDREK
EKEAKATLEAEKTMNKSRARVKALKPIEVARPLTNDLKEKMFFMAINRILNAEKSAINSG
AGGIRIKLLSTMASTLNKSIQNSVLRYVTDDIKSRMELALSWLYEEYAIFQSFHRRTTLV
TQTHEAPCYSYNFILCTIISAIEEMQGKDRDIYLSRVYLESPLITEDAITALKSLSANES
RGFAPLYLLKEMVIRRPTKQLIFLNVLFQHCAHEKLIIRDAAIKIVVDLYNRNELKSSIE
AYAVLYLSFLQKSCPPELVFGEERGRPNIENHWTESTTKACLSLYLSLIEKHQDLIQELA
RVYPTMSPDVKRIVLRLVEAPVKSLGMSSPQLLGLVENCPKGSEVLVTRIIHILTDKTTP
SVELVTRVRELYQTRVSDVRFLIPVLNGLPKKEVLSALPKLIKLNPVVVKEVFNRLLGVH
NNDSGIPHTSPITPADLLIALHTIDLNKTELKTVMKATSLCFAEKQVYTHEVLGVVINNL
MEMNPLPTLLMRTVIQSLTLYPKIIGFVMNILQRLILKQVWKQPKVWEGFVKCCERTQPQ
SFSVILQLPPQQLSEALKMSPELKIPLISHVDGLADNQKAHISASIMDVLQGIQSIDMHD
DFDIAPPIQKITTTTATTAPTTITTITTTSDSGDISEPTPPGLE
NT seq
3375 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaggagcctcttattcatgaaaaaatggagcaagatacaatatctgatgatacggta
gtacaatggctcaatgaggcaagcatgagtcaatgtgaaaaagttaaaactaataattta
tcaaaaattcaagaagttatattaaacaaagatattgaaatgttacctgattatatagat
gaagtattggcatttgttgttgacaaaagtgctgaagtacgaaaaacaatttgtagtttt
attgaagtagctggtgataaacagccagatatgattccaaaaatgttgccatctttattg
agacttttatctgatgatgcatcagctgttgttaaacgtgcactaagaacatcaggaaga
atattacgtgctgctttaaaatgggttgcaagtgcagttaatgtaacaccagaaattgaa
acagcttggggtcaaatatcaacattaaaagtattaatattagaaatgattggatcagat
aatgatggtatacgtacacaagctgttaaatttttagaaggagttgttttattacaaaca
tatcctgattctgaaacaactaaaaaacaagatgatttttcattagaagatattccatta
acattaaaaatagcacgtagaagaaaacttgaagaagaagcacatcatgtacttgatgag
ttaataaaatttcatggttctgttcatgttagtagtttaaatttaatgacatgtatggga
agtttagcaacaattgcaaaatttcgtccacaatttacatcaaatgttataacagcatta
caaagtttacaaaatgatttaccaccaacattaactgattcacaagtaacaagtgtaaca
aaacatttaaaattaacactacttactttaatgaaatgtccaggtagtattgaatttgca
tcaacaatagcaaaacaacttgcaaaattaggtgctaaagaacaagaaataatgaaagca
tatccaaaagctgaagatattagaaaaatgaaaagacgtcaacaagaaatagcagcagca
acagctgctaaaagaataaaattagaaacaatattaccagatgatgatgatgatacagaa
aatataattatggaaccaattaaattacctgatttagttgaattaacagaaacatatatt
gttgaacatttatctgttgaagttgcaacagatcttgttatggatagtatggcatgggta
ccagatacaatgacaacaatatttcaacgtgaatatcaaccaccaggtacatcagatata
aatatacaacgacaaacagttgctaaattattatcagcacaaataaaacaagcaattgct
aaaaaatttaaaaaagatattaaagatgatgatgctgttatggaagatttaattaaaaat
ccaacaataactgttgctgaagctaaacgtgaaagaaaacgtgaaaaagatagagaaaaa
gaaaaagaagctaaagcaacacttgaagctgaaaaaacaatgaataaatcacgtgcacgt
gttaaagcattaaaaccaattgaagtagcaagaccattaacaaatgatcttaaagaaaaa
atgttttttatggctattaatagaatattaaatgctgaaaaaagtgcaattaatagtggt
gctggaggaataagaattaaattattatcaacaatggcatcaacattaaataaatcaata
caaaattctgtattacgttatgttactgatgatattaaatcaagaatggaattagcatta
tcatggttatatgaagaatatgctatatttcaaagttttcatagacgtacaacacttgtt
acacaaacacatgaagcaccatgttattcatataattttatattatgtacaataatatca
gcaattgaagaaatgcaaggtaaagatagagatatttatttatcaagagtatatcttgaa
tcaccattaataactgaagatgcaataacagcattaaaatcattatcagcaaatgaatca
cgtggttttgcaccattatatttattaaaagaaatggttattagaagaccaacaaaacag
cttatatttttaaatgtattatttcaacattgtgcacatgaaaaattaataatacgtgat
gcagcaattaaaattgttgttgatctttataatcgtaatgaattaaaatcatcaattgaa
gcatatgctgtactttatttaagttttttacaaaaatcatgtccaccagaattggtattt
ggtgaagaacgtggccggccaaatattgaaaatcattggactgaatcaacaacaaaagca
tgtctaagtctttatttatcattaattgaaaaacatcaagatcttatacaagaacttgca
cgtgtttatccaacaatgtcaccagatgttaaaagaattgtattacgtcttgttgaagca
ccagttaaatcattgggtatgtcaagtccacagttattaggacttgttgaaaattgtcca
aaaggttcagaagttttagtaacacgtattattcatatacttactgataaaacaacacca
agtgttgaacttgtaacaagagtacgtgaactttatcaaacacgtgtatctgatgttaga
tttttaataccagtattaaatggtttacctaaaaaagaagttttatcagcattaccaaaa
ttaattaaattaaatccagtagttgttaaagaagtatttaatcgtttacttggtgtacat
aataatgacagtggtataccacatacatcaccaataacaccagctgatttattaatagca
cttcatacaattgatttaaataaaactgaacttaaaactgttatgaaagcaacatcatta
tgttttgctgaaaaacaagtatacacacatgaagtacttggtgttgttattaataattta
atggaaatgaatcctctaccaacattattaatgcgtactgttatacaaagtttaacatta
tatccaaaaataattggttttgttatgaatatattacaacgtttaatattaaaacaagta
tggaaacagccaaaagtatgggaaggttttgttaaatgttgtgaacgtacacaaccacaa
agtttttctgttattttacaattaccaccacaacaactttctgaagctttaaaaatgtca
ccagaattaaaaataccattaatttcacatgttgatggacttgctgataatcaaaaagca
catatatcagcatcaattatggatgtacttcaaggtatacaatctattgatatgcatgat
gattttgatattgcaccaccaatacaaaaaataacaacaacaacagcaacaacagcacca
acaacaataacaacaataacaactactagcgatagtggtgatatatctgaaccaacacca
cctggattagagtga
DBGET
integrated database retrieval system