Aphidius gifuensis: 122848417
Help
Entry
122848417 CDS
T07796
Name
(RefSeq) serine--tRNA ligase, chloroplastic/mitochondrial
KO
K01875
seryl-tRNA synthetase [EC:
6.1.1.11
]
Organism
agif
Aphidius gifuensis
Pathway
agif00970
Aminoacyl-tRNA biosynthesis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
agif00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
00970 Aminoacyl-tRNA biosynthesis
122848417
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01007 Amino acid related enzymes [BR:
agif01007
]
122848417
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
agif03016
]
122848417
Enzymes [BR:
agif01000
]
6. Ligases
6.1 Forming carbon-oxygen bonds
6.1.1 Ligases forming aminoacyl-tRNA and related compounds
6.1.1.11 serine---tRNA ligase
122848417
Amino acid related enzymes [BR:
agif01007
]
Aminoacyl-tRNA synthetase
Class II (C/G)
122848417
Transfer RNA biogenesis [BR:
agif03016
]
Eukaryotic type
Aminoacyl-tRNA synthetases (AARSs)
Other AARSs
122848417
Prokaryotic type
122848417
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
tRNA-synt_2b
Nucleocap_ssRNA
tRNA-synt_2d
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122848417
NCBI-ProteinID:
XP_044002421
LinkDB
All DBs
Position
LG2:complement(4128437..4130264)
Genome browser
AA seq
428 aa
AA seq
DB search
MNKIIRQLANQRYFCSKAQFQINEINKKIINTKLKIPEAEFNTEFICNPANRDIINHNIV
KRKGVGNIDRVLELSKNANDENSVKELHKEISKIPNTTDPKVFDYPDEGKIIKSCNVPGD
FDFEPKTFDELSKSLKLVRMDELGPVAGDKSYILIGDLAQLEEALIQYTISRLMKFGFQL
ISVPDILPTKVIERCGLNISGERNFIYSLTDNYGDDLSLSGTAEMSLASKLIDSIIPHEE
LPLKLAAVSRCFRAEISNNIDEPSIYRVHQFTKVEMFICTDEKNSCDMLDNLVEIQENLF
KDLGLSFNIIDMASHELGAPANRKFDIEGWYSGKKGFGELSSTSNCTDYQSRRLNIKYKN
DNELKFVHTLNGTACAVPRMLMAICETYQTKEGNIKIPQLLIPFMNGKSEITKQNIADMR
IYKSKSKK
NT seq
1287 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaaataattcggcaattggctaatcaacgttatttttgttcaaaagcacaattt
cagataaatgaaataaataaaaaaataattaatactaaattaaaaataccagaagctgaa
tttaatactgaatttatttgtaatcctgcaaatcgtgatattattaatcataacattgtc
aagagaaaaggtgttggtaatattgacagagtattggagttatcaaaaaatgcaaatgat
gaaaattcagtaaaagaattgcataaagaaatttctaaaattccaaatacaactgatcca
aaagtatttgattatccagatgaaggaaaaattattaaatcatgtaatgtaccaggtgat
tttgattttgagccaaaaacatttgatgaattatcaaaaagtttaaagttagttagaatg
gatgaactgggaccagttgctggtgacaaaagttacatactaattggtgatttggctcaa
cttgaagaggcactaattcaatatacaattagtagattaatgaaatttggttttcaatta
atatctgtacctgatattttaccaacaaaagtcattgaaagatgtggattaaatataagt
ggagaaagaaattttatttattcattaactgataattatggtgatgatttgagtctatca
ggaacagctgaaatgtcgttggcatcaaaacttattgattcaataataccacatgaagaa
ttaccacttaaacttgctgctgttagtagatgttttagagctgaaatatcaaataatatt
gatgaaccaagtatttatagagttcatcaatttactaaagttgaaatgtttatatgtaca
gatgaaaaaaattcatgtgatatgttagataatttagttgaaatacaagaaaatttattc
aaagatttaggattgagttttaacataattgacatggcatcacatgaacttggtgcacca
gcaaatcgtaaatttgatattgaaggatggtattctggtaaaaaaggctttggtgaatta
tcaagtactagtaattgtactgattatcaatcaagaagattaaatattaaatataaaaat
gataatgaattaaaatttgttcatactttaaatggtactgcttgtgctgtacccagaatg
ttgatggctatttgtgaaacatatcaaaccaaggaaggaaatattaaaataccacagcta
ttaattccatttatgaatggaaaaagtgaaataactaaacaaaatattgctgatatgagg
atatataaatcaaagtctaaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system