Aphidius gifuensis: 122848695
Help
Entry
122848695 CDS
T07796
Name
(RefSeq) slit homolog 1 protein-like
KO
K06839
slit 2
Organism
agif
Aphidius gifuensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
agif00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
agif00536
]
122848695
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
agif00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Axon guidance molecules
122848695
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_8
LRR_5
LRR_4
LRR_1
LRR_14
LRR_9
LRR_Zer-1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122848695
NCBI-ProteinID:
XP_044002878
LinkDB
All DBs
Position
LG2:complement(6277162..6281667)
Genome browser
AA seq
998 aa
AA seq
DB search
MNLLVGVILILAFIFKSVESKCSLAPVDIERYGERTIAYVCINGDLDDLADVPNEADWIE
FTVVKFNIIPADEFLRFKNLRKLTFYNCEIRELDTDAFRGLDKLEWFVFSNTKLNVARQS
MFKYMSNLKMLTLDNTGLIYIEPEVLNILSKRLEVLSLKNNDLDCLPIDNLKKMQRLKTM
RIDENPWMCDCRKSLKVFFEERKIDQGLSSSSVNDIYHGRRKRWQNYYYKNSSYSLTQKS
THRVYDCMAVLEYPSLPPSQNSNYDYSNHKKIEWREATASSISYLDRLPDEIGWIELFDI
RIPTIRRYSFFRFGNSLRSITLKNCGIENIEPEAFAGLHKLQRLVIIGAKMPIINNYLFR
DLSRLNDLVLEKCFIQKFEYNALQNLKNLRQLDLSSNRLTCLPEETFQGLQSLERIVTSG
NPWLCSCRRDLESYLTDKRIAYDISNSRADGPGCFEKGGLPIIIQNTDTQDFYNYTTTGR
VRWSWGYETPVPRPRPPPIQTTPRPPIIVETTAPPAALHGGCQTVPAQKYHHHHRYNHLR
GHTYVCSQASLIDIKSLPSTIETIIFSKSQIETINSYVFQKFNGYLKRLEFRDCSIQDIE
HRAFDGLVNLESLVIRDNDIQVVRSEWFGDVRNIRHLDLSRNNIGRIDNGIFDQLPYLEN
IDISENLMNCIGIENLEKLRYLRELSVAGNPWTCLCARRLARIIEDRNIYCAGKCLNDVL
YGNGESNWSTCQSSVILKPNVSIPLQPTPPPTTTAITSTPYLDIPIPLTNISGSCFSTHE
HTHYHCSNGDKFILSNVPSNVRSIEIYDSYLPHLPAITFARFQNLTELILRNCSLRDIDS
RAFWGLHKLEKLVIKDNRFTIIQNEWFKECENLNWLDLSHNNLMEIETGALDDLKMLQYL
NLEDNMFQCIYTSTFVNLPRIDTLEFGRNPLKWRCWQDLKQFLEVRAIGYTYYKCPHDSR
EIVQNLQNYKKSSVNTAAYNFININLTIVLTVIMFLMC
NT seq
2997 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatttattagttggagtgattttaattttagcatttatatttaaaagtgttgagtca
aaatgcagtttggcaccagttgatattgagagatatggcgaacgtacaattgcatatgtt
tgtattaatggtgaccttgatgatttagcagatgtgccaaatgaagctgattggattgaa
tttactgttgttaaatttaatattataccggctgatgaatttttacgttttaaaaattta
cgtaaattaacattttataattgtgaaatacgtgaattagatacagatgcttttagaggt
cttgataaattagaatggtttgtattttcaaatacaaaattaaatgttgcacgacaatca
atgtttaaatatatgtcaaatttaaaaatgcttacacttgataatactggattaatttat
attgagccagaagtattaaatatattaagtaaacgtcttgaagtacttagtttaaaaaat
aatgatcttgattgtcttccaattgataatttaaaaaaaatgcaaagacttaaaacaatg
agaattgatgaaaatccatggatgtgtgattgtagaaaatcacttaaggtattttttgaa
gaacgtaaaattgatcaaggtttatcatcatcaagtgttaatgatatttatcatggacgt
agaaaaagatggcaaaattattattataaaaattcaagttattcattaacacaaaaatca
actcatcgtgtttatgattgtatggctgtattggagtatccatcattaccaccttcacaa
aattcaaattacgattattcaaatcataaaaaaattgaatggagagaagcaactgcttct
agtatatcatatctcgatcgtttgccagatgaaattggctggattgaattgtttgacatt
agaattccaacaataagaagatatagtttttttagatttggtaatagcttgagaagtatt
acattaaaaaattgtggtattgaaaatattgaacctgaggcatttgctggacttcataaa
ttacaaagattagttataattggtgcaaaaatgcctattattaataattatttattcaga
gatttatcaagattaaatgatcttgttcttgaaaaatgttttattcaaaaatttgaatat
aatgcattacaaaatttaaaaaatctacgacaacttgatttatcatcaaatagattaact
tgtttacctgaagaaacttttcaaggtcttcaatcattggaacgtattgtaacatcagga
aatccatggttgtgttcatgtcgacgagatcttgagagttatttaacagataaaagaatt
gcctatgatattagtaatagccgagctgatggaccaggatgttttgaaaaaggcggatta
ccaattatcattcaaaacactgatactcaagatttttacaactacacaacaacaggaaga
gtgagatggagttggggatatgaaacaccagttccacgtccaagacctcctccaattcaa
acaaccccgagaccaccaataattgtcgaaacaacagcacctccagctgctttacacggt
ggttgtcaaacagtaccagcacaaaaatatcatcatcatcatcgttacaatcatctacgt
ggacatacatatgtttgttctcaagcatctttgattgacattaaatcacttccctcaact
atcgaaacaattattttttcaaaatctcaaattgaaacaataaattcatatgtctttcaa
aaatttaatggctatcttaaaagacttgaatttcgtgattgttcaattcaagatattgaa
catagagcatttgatggacttgtaaatcttgagagtcttgttattcgtgataatgacatt
caagttgttcgatcagaatggtttggtgatgttagaaatatacgtcatcttgatttatca
agaaataatattggtcgtattgataatggtatatttgatcaattaccatacttggaaaat
attgatatatcagaaaatttaatgaattgcattggaattgaaaatttagaaaaattacga
tatcttcgagagctcagtgttgcaggaaatccatggacttgtctatgtgcacgtagactt
gctcgaataattgaagatcgtaatatttattgtgctggaaaatgtttgaatgatgttttg
tatggcaatggtgaatcaaattggagtacatgtcaatcatctgttattcttaagccaaat
gtatcaataccacttcaaccaacaccaccaccaacaacaacagcaataacatccactcca
tatcttgatattcccatcccactaacaaatattagtggttcatgtttttcaacccatgaa
cacacccattatcactgcagtaatggagataaatttatactcagcaatgttccaagtaat
gttagatcaattgaaatttatgatagttatttaccccatttaccagcaattacctttgct
agattccaaaatttaactgaattaattttaagaaattgttcattgagggatattgattca
agagcattttggggattgcataaacttgaaaaacttgttattaaagataatcgttttaca
attatacaaaatgaatggtttaaagaatgtgaaaatttaaattggcttgatttaagtcac
aataatttaatggaaattgaaactggtgcattggatgacttgaaaatgttgcaatattta
aatttagaagataatatgtttcagtgtatttatacaagtacatttgttaatttaccgaga
attgatacacttgaatttggaagaaatccacttaaatggagatgctggcaggatcttaaa
caatttttagaagttcgagcaattggatatacatattacaagtgtccacatgatagtcgt
gaaattgtacaaaatttacaaaattataaaaaaagtagtgttaatactgctgcttataat
tttattaatattaatttgacaattgttttaactgtcatcatgttcttaatgtgttaa
DBGET
integrated database retrieval system