Aphidius gifuensis: 122849396
Help
Entry
122849396 CDS
T07796
Name
(RefSeq) ATP-dependent RNA helicase DDX55
KO
K14809
ATP-dependent RNA helicase DDX55/SPB4 [EC:
5.6.2.7
]
Organism
agif
Aphidius gifuensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
agif00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
agif03009
]
122849396
Enzymes [BR:
agif01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.7 DEAD-box RNA helicase
122849396
Ribosome biogenesis [BR:
agif03009
]
Eukaryotic type
Pre-60S particles
Helicases
122849396
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DEAD
Helicase_C
DUF4217
AAA_22
Helicase_C_2
HTH_11
CTD4
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122849396
NCBI-ProteinID:
XP_044004028
LinkDB
All DBs
Position
LG2:complement(4248635..4250850)
Genome browser
AA seq
604 aa
AA seq
DB search
MSSIDKNPWNNLVIKNNKGETITNPILLSDPIKKTLKALKFKSPTPIQAACIPRLLHGQD
VAAEAVTGSGKTLAFIIPLLELMLKREDPWKETEIGGLIISPTRELATQISQVLENFLSR
IPSLKQVMLVGGTTVTDDIKKLKNKANIIVATPGRLGDIFENFEDTLRRSVKSLEFLVLD
EADRLLGLGFEDDLNKIFKKLPSQRRTGLFSATQTTELAEIFRAGLRNTVVISIKENSSL
STPLTLSNHYTIVDGDNKLASLISFIKTKDNNMKYMIFFSTCACVEYFSHVIDQLLPSIK
VLALHGKMKKKRQKIFDEFRCIKSGIMVCTDVMARGIDIPEVDWVLQYDPPSAASSFVHR
CGRTARIGNEGSALVFLLPNEDAYITFIKNNQKVELGEIKIDIDQQIIDKCSKIMKQIQK
KDRVYFDKANRAFVSYIQSYHKHDCSKYLIKIDELDFVKVAMGFGLLKMPRMPETKGRDL
TGFIEDDIDFNTISYKDKQREQKRLEKLSVYQTTGIWPSKNKKKAKQTESWSEAKQKKII
RQIKKGKKKEKIDKRVKAGGPAKPIKKKKVKNLQEDIDEIAKDIALIKKERRKITKEELY
EALG
NT seq
1815 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctagcattgataaaaatccttggaacaatttagttattaaaaataacaaaggtgaa
acaataactaatccaattttgctgagtgatccaattaaaaaaaccctaaaagctttaaaa
tttaaatcaccaaccccaattcaggctgcttgtataccaagattattacatggtcaagat
gttgctgctgaagctgttactggaagtggaaaaacactggcatttataataccacttttg
gaacttatgctgaaaagagaagatccttggaaagaaactgaaattggtggattaataata
tctccaactcgtgaattagcaactcaaataagtcaagttttagaaaatttcttatcaaga
ataccatcattaaaacaagttatgctagttggtggtacaacagtaacagatgatattaaa
aaattaaaaaataaagcaaatataattgttgcaacaccaggtagattaggtgatatattt
gaaaattttgaagacacactaagacgtagtgttaaatcacttgaatttttagtacttgat
gaagctgatagattacttggtcttggttttgaagatgatttaaataaaatatttaaaaaa
ttaccatctcaaagaagaactggtttattttcagcaacacaaacaactgaattagctgaa
atatttcgtgctggtttaagaaatacagttgtcataagtatcaaagaaaattcaagccta
tcaacaccattaacattgagtaatcattatacaattgttgatggtgataataaattagca
tcattaattagttttataaaaacaaaagataataatatgaaatatatgatatttttttca
acatgtgcatgtgttgaatattttagtcatgttattgatcaattattaccatcaataaaa
gtattagcattacatggtaaaatgaaaaaaaaacgtcaaaaaatatttgatgaatttcgt
tgtattaaatctggtataatggtatgtactgatgttatggctagaggtattgatatacca
gaagttgattgggtattacaatatgatccaccatcagcagcaagtagttttgttcatcgt
tgtggtagaacagctagaattggtaatgaaggtagtgcattagtatttttattaccaaat
gaagatgcatatataacatttattaaaaataatcaaaaagttgaacttggtgaaattaaa
attgatattgatcaacaaattattgataaatgtagtaaaataatgaaacaaatacaaaaa
aaagatagagtttattttgataaagcaaatcgtgcatttgtatcatatatacaatcatat
cataaacatgattgtagtaaatatttaattaaaattgatgaattagattttgttaaagtt
gctatgggttttggtttattaaaaatgccacgaatgccagaaacaaaaggacgtgattta
actggttttattgaggatgatattgattttaatacgatatcatataaagataaacaacgt
gaacaaaaaagattagaaaaattgagtgtttatcaaactactggtatttggccaagtaaa
aataagaaaaaagctaaacaaactgaatcttggtctgaggctaaacaaaaaaaaatcata
agacaaataaaaaaaggtaaaaaaaaagaaaaaattgataaacgtgttaaagctggtggt
ccagcaaaaccaattaaaaaaaagaaagttaaaaatttacaagaagatattgatgaaatt
gctaaggacattgcattgattaaaaaagaaagaagaaaaattacaaaagaagaactttat
gaagctctgggttaa
DBGET
integrated database retrieval system
