Aphidius gifuensis: 122849539
Help
Entry
122849539 CDS
T07796
Name
(RefSeq) vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog
KO
K20178
vacuolar protein sorting-associated protein 8
Organism
agif
Aphidius gifuensis
Pathway
agif04148
Efferocytosis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
agif00001
]
09140 Cellular Processes
09141 Transport and catabolism
04148 Efferocytosis
122849539
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
agif04131
]
122849539
Membrane trafficking [BR:
agif04131
]
Endosome - Lysosome transport
Tethering complex
CORVET complex
122849539
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Beta-prop_VPS8
TPR_Vps8
VPS8_N
WD40_CDC20-Fz
zf_RING_Vps8
ANAPC4_WD40
Beta-prop_EML_2
Beta-prop_WDR36-Utp21_1st
Beta-prop_THOC3
zf_RING_Vps8_fungal
Beta-prop_WDR5
WDR55
Beta-prop_WDR90_POC16_2nd
TPR_VPS8_2
PQQ_2
Prok-RING_1
Rcat_RNF216
Beta-prop_WDR3_1st
zf-RING_5
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122849539
NCBI-ProteinID:
XP_044004200
LinkDB
All DBs
Position
LG2:23991031..23995597
Genome browser
AA seq
1306 aa
AA seq
DB search
MADNGFESDVSSLDNLNIEGLNLDIEELDDVEYSIPAVDELPTLESILTEQDTGELSGPD
IDIIGQSSSELIDGSETTSVGSLLSLNSLTRQSTKNSELPLSGIILKHAIMRGITSQINS
ANEKVNAGLASSISAGGDMIVIGTSHGLLLSFDTKQTLKWCNQDIKNQGAVSSLGINNDG
TRLLAGYARGNILMIDCTNGKVLRLLTDVHSPGTAVLHVKFTDSSKLALCSDSGGSVFEL
SFTRTMGVRGCDSKCLFSGSRGEVCTIEPLLLNSLPRHPLKNYTIIALATLSRVLVICIR
PRMRIILTHPLTGPAKTSPQISWQLVVIQTSDSNKIIDPVLAIARDKIIHFYQVCSEAGS
RVRLLPLRRMTLSYTICNLRWLNTRSIIVFDNNECLHLIDVRTQEDLEIIDMNSVGISYA
SSYFKGLTTGGNVSKAMAATGEYACYNTIITYGNQLLLLGTRKLHVVFIRTWSERLKYLT
LQKRYQDALSLGLSFYHDKGKAVVGLSSMKKVRKRLTFIKTSEILLQYINEFIKTPNDYQ
NNNNDDIISICVDYAVQLDNTHLLFGTMWDIINHIPQLKISYLHSLEVPLLDGSLPPRLP
PIIAQQFVELYDNENRLDALQSIIVLLDVDCLDIHQVTNICKKKNLWDALIHLQTCTLND
YSAPIHQLIPILDNSMKTNINNVNNNDIIKLGNALLVYTSCCLAGRGFPRGDLTKQQSQR
SKAEVQRALLSQHTSLAEDNERQYPYLRTLLRFDTRGFIDVISMAFQEYEFKTEIGLRQR
QRFVDIMLIIVMPTTPLTPNNHDYIDCDKKIIVLLFICNEIINNNITIEPLILNRIVEFI
CNDNNTKIKYDDKLIRENTILELINKKKLNSITDNTLLKLSNKANFYRVAELIYTAKDDW
ISVCHCIISDTYRKYEVWQWLDKLNINSFKLVLLSHIEKLIDIDTDQVSSLISSRTPNDI
DQIINKLNNNNYEYKLLASLYNISQFKDDDDDDDDDDCKFTLTTELLERYLLLMCQIEPN
NVVNHIANGLHGCRLDEALKIVKNYQQNNAEALMLEQMGNYQDAFDILLINLDNSLSIYN
DSNDDSDVVKSTIQISNLCRRSAGNLDWMPLVETVLKSNNNCELLRGKLLKIVLESLSGT
DALSNVLEKILKHPLATSGTIGDIRQLLTGVLTHSKYEQVLVETTVRLVSLELHEALKKT
LGNSKKACASVSLTCPSCRISLIKTKDYNVFFSCGHGYHLNCLNDKKHCYKCLNDKGWTP
SVKNFNIPDEKLPIRPDIIPPEFMRKRDLTLKLAAPTVIPDLDDIL
NT seq
3921 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctgataatggatttgagtctgatgtaagttctctggacaatttaaatatcgaagga
ttaaatcttgacatagaagagctagatgatgttgagtattcaatcccagctgttgatgaa
ttgccaacattggagagtatattaactgaacaagataccggtgaattatcaggaccagat
attgatattattggtcaatcatcatcagaactaattgatggaagtgaaacaacaagtgtt
ggttcattgttgtcattaaattcattaacacgtcaatcaacaaaaaattcagagctacca
ttatctggtataatattaaaacatgctataatgcgtggtataacatcacaaataaattca
gcaaatgaaaaagttaatgctggtcttgcaagttcaatatcagctggtggtgatatgatt
gtcattggtacaagtcatggtttattattatcatttgatacaaaacaaacattaaaatgg
tgtaatcaagatattaaaaatcaaggtgctgtatcatcacttggtattaataatgatggt
acacgtttacttgctggttatgcacgtggtaatatattaatgattgattgtacaaatggt
aaagtactaagactattaacagatgtacattcaccaggtactgctgtgttacatgttaaa
tttacagattcatcaaaactagcattatgtagtgatagtggtggttctgtatttgaatta
tcatttacacgtacaatgggtgtacgtggttgtgatagtaaatgtttatttagtggttca
cgtggtgaagtatgtacaattgaaccattattgctaaattcattaccacgacatccatta
aaaaattatacaataatagcattagcaacattatcacgtgtattagttatatgtattaga
ccaagaatgagaataatattaacacatccattaactggaccagcaaaaacatcaccacaa
atatcatggcaacttgttgttatacaaacatctgattcaaataaaataattgatccagta
ttagcaatagcacgtgataaaataatacatttttatcaggtatgttcagaggctggttca
cgtgtacgtttattaccattaagaagaatgacattatcatatacaatatgtaatttgcga
tggttaaatacacgttcaataattgtatttgataataatgaatgtttacatttaattgat
gttagaacacaagaagatttagaaataattgatatgaattcagttggtatatcatatgca
tcaagttattttaaaggtttaacaactggtggtaatgtatcaaaagcaatggcagcaact
ggtgaatatgcatgttataatacaataataacatatggcaatcaattattattacttggt
acaagaaaattacatgttgtatttataagaacatggtcagaaagattaaaatatttaaca
ttacaaaaacgttatcaagatgcattatcattgggtttatcattttatcatgataaaggt
aaagctgttgttggtttaagtagtatgaaaaaagtacgtaaaagattaacatttattaaa
acaagtgaaatattattacaatatattaatgaatttataaaaacaccaaatgattatcaa
aataataataatgatgatataatatcaatatgtgttgattatgctgtacaacttgataat
acacatttattatttggtacaatgtgggatattattaatcatataccacaattaaaaatt
agctatttacattcacttgaagtaccattacttgatggtagtttaccaccacgtttacca
ccaattattgcacaacaatttgttgaactatatgataatgaaaatcgtcttgatgcatta
caatcaattattgttttacttgatgttgattgtcttgatatacatcaagttacaaatata
tgtaaaaaaaaaaatttatgggatgcattaatacatttacaaacatgtacattaaatgat
tattcagcaccaatacatcaattaattccaatacttgataattcaatgaaaacaaatata
aataatgttaataataatgatattattaaacttggtaatgcattattagtttatactagt
tgttgtttagctggtagaggttttccacgtggtgatttaacaaaacaacaatcacaacgt
tcaaaagctgaagtacaacgtgcattattatcacaacatactagtttagctgaagataat
gaacgtcaatatccatatttacgtacattattacgttttgatacacgtggttttattgat
gttatatcaatggcatttcaagaatatgaatttaaaactgaaattggattacgacaaaga
caaagatttgttgatattatgctaataattgtcatgccaacaacaccattaacaccaaat
aatcatgattatattgattgtgataaaaaaataattgtattattatttatttgtaatgaa
attataaataataatataacaattgaaccattaatattaaatcgtattgttgaatttata
tgtaatgataataatacaaaaataaaatatgatgataagctaatacgtgaaaatacaata
ttagaattaataaataaaaaaaaattaaattcaataacagataatacattattaaaatta
tcaaataaagcaaatttttatagagttgctgaattaatatatacagctaaagatgattgg
atatctgtttgtcattgtattatatctgatacatatagaaaatatgaagtatggcaatgg
cttgataaattaaatataaattcatttaaattagttttattatcacatattgaaaaactc
attgacattgatactgatcaagtatcaagtttaatatctagtcgtacacctaatgatatt
gatcaaattattaataaattaaataataataattatgaatataaattattagcatcattg
tataatattagtcaatttaaagatgatgatgatgatgatgacgatgatgattgtaaattt
acattaacaactgaattattagaaagatatttattattaatgtgccaaattgaaccaaat
aatgttgttaatcatattgctaatggtttacatggttgtcgtcttgatgaagcattaaaa
attgttaaaaattatcaacaaaataatgctgaagcattgatgcttgaacaaatgggaaat
tatcaagatgcatttgatattttattaattaatttagataattcattaagtatttataat
gatagtaatgatgacagtgatgttgttaaatcaacaatacaaatatcaaatttatgtaga
agatcagctggtaatcttgattggatgccacttgttgaaactgtattaaaatcaaataat
aattgtgaattattacgtggtaaattattaaaaatcgtacttgaatcattaagtggtact
gatgcattatcaaatgtacttgaaaaaatattaaaacatccacttgcaacatctggtact
attggtgatatacgacaattgctaactggtgtattaacacattcaaaatatgaacaagta
ctagttgaaacaactgttagattggtcagtctagaattacatgaagcacttaaaaaaaca
cttggtaactctaaaaaagcatgtgcaagtgtatcattgacatgtccatcatgtcgtatt
tcattgattaaaacaaaagactacaatgttttttttagctgtggacatggttatcattta
aattgtctaaatgataaaaaacattgttacaaatgtctcaatgataaaggctggacacca
agtgttaaaaattttaatatacctgatgaaaaattaccaattagaccagacattattcca
ccagaatttatgagaaagcgagatttaacacttaagcttgcagctccaacagtcattcca
gatttagatgatattttataa
DBGET
integrated database retrieval system
