Aphidius gifuensis: 122850229
Help
Entry
122850229 CDS
T07796
Name
(RefSeq) cadherin-23-like isoform X1
KO
K06813
cadherin 23
Organism
agif
Aphidius gifuensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
agif00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
03037 Cilium and associated proteins [BR:
agif03037
]
122850229
04515 Cell adhesion molecules [BR:
agif04515
]
122850229
Cilium and associated proteins [BR:
agif03037
]
Primary cilia and associated proteins
USH complex and associated proteins
122850229
Cell adhesion molecules [BR:
agif04515
]
Cadherins
Major cadherins
122850229
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Cadherin
Cadherin_CELSR2_9th
Cadherin_FAT4_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122850229
NCBI-ProteinID:
XP_044005259
LinkDB
All DBs
Position
LG2:complement(30009404..30014995)
Genome browser
AA seq
1671 aa
AA seq
DB search
MFSRGKFMLALEFIYFYLIVNCQAEWNTPPFFGPDPTTDDVQFKGYDHVSKRTRINLKEE
IEQPIIIASINYQGSATPQVGIVEDGKSNFMLGAKLIKNNSNIWNVWINEKQDYETPSMQ
NYRFSIIIEYETYVIALNIINIDDNAPVIQANERSCEIEENYSGKTNCTYTISDADGWIN
DVSIEFTSVPEEGVDNFKLTNGTQLSEYKKIARLEIIKQLDFEIIPVYMLMLTATDTAKN
KGTLMSVVQVIDMPDEPPSWTRITAAENIFEKTNHTFTVSAVDGDIQINAEINYKIIPEI
DNESHYFEIDAKSGIVKIHPIDRDTLKKEIFRFSIVAYEKLNTTSAIEANILIILEDKND
HKPQITPDVLKIDIKEETYMSLEFNESIIGINDPDLAENGQYSVKLTDSEYNWSSAFLIV
PNNGYQSGNFTITIIDASLLDYEDENWRNIEINIVATEVANPSHIDTRKIEINLINWNDE
MPIFNNTNVKVEIKEDVEINFIIAEIFATDRDIDDKVTHSIVGQKLLKINETTGVIKTAQ
NDALDYESIPVVIVQVLATDLANHVAYATLTIHVIDVNDVPPKLYLPKQIPSLLEEVENG
TRVDAIITASDPDTEAKLVFNIDWSKTTAHKRSVLVNESYYRQHLDIITEYPDKLNTREA
IGIIITKDRIDYEAFDVIFITIVVTDTTTVHNDNSTFASLTLNIIDCNDNFPIFNKFENM
SVSENQITDTLIGAVTATDADGPEFNKISYDIAPINNTESYLIKIDSTSGIIRVDTDKAI
DAEKYEYIYYSIVASDGENNTTMTLAIFVIDVNDEEPYLSPDKIFNSTIHIMEKTPNNTL
IYQIYSQDNDRTHPFNNVSYNLNANQSAAFHQYFNLDKFSGLLSVNLRDGYILDRDYGAS
SYTLNIKLRDNYLVDDITWNTNTFDTTMTIILDDINDQIPELPDLGDPAKVITENTKRDS
LILSIEASDHDDPETDNTKITYKLLEQYKIINNQDSPSDNQCNNNIDPFKLVNENLKRAH
IFANDDLKGCYGTWQIKVYAQDKGQNPGPLNDTKIYNIKISDYNYYDPVIVIPAQAGSGI
PLSQEQSLHTQLKTYDKQLLSNFKASDNDSGDSGKVTFTITSLTGDDDDDKYFDIINLGD
NEAQLQLKSWPSNIEENNKYKINLIASDHGDPPRNSTIQEHTIIFVSTQGPKFNDNQWMI
WIKENKTGLNYSQKIPEAFDDLNDNGNFVPIYYFIDDKAGDYEYFKIDMNTRLLTLVKEL
DREKKDTMWINIITTADANGPPRDPREQAILNITIIVLDENDNPPIFESKFYSGGVAVED
QVDRVIMTIKATDADLNDTLSYTIIPESMMTSDNSISAIKNPFLLDSISGELLLKFSVTS
EMIGFFKFNTTVVDAVDHSDTSIIQVYIVSQTNRVVFTFKNSPANVKEQRIFLKNIFTDS
FGYLCNIDDIKISVDNNNNVLDNVTTVTTHFINSNDNLPIESETIIRLSSDLQTVTSLKA
SLQAKSLYLIDVPTGSLTDTSDPQEKIYWFLVTLCVFFSFSTVVLLFIYFWRTKILRQRL
DKMALEWQSQDQNEKINKPVVTPGTNQFSIVGSNPIWKIDGDDDNNSKTNDNIIDNISQR
SGDSDLIGIEDNLNFSYLNDAFNLPKEFKPSQVNDNVPQTYINAKYYEDKC
NT seq
5016 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttttcacgaggcaaattcatgttggccttggaatttatttatttttacttaatcgta
aattgtcaagctgaatggaatacacctccattttttggaccagatccaacaacagatgat
gtacaatttaaaggatatgaccatgtttccaaaagaaccaggattaatctcaaagaagaa
attgaacaaccaatcatcattgcttctataaattatcaaggtagtgcaacacctcaagtt
ggaattgtcgaagatggaaaaagtaattttatgcttggtgccaaattaataaaaaataat
tcaaatatatggaatgtttggataaatgaaaaacaagattatgaaactccatcaatgcaa
aattacagattttcaataataattgaatatgaaacgtatgttattgcacttaatataata
aatattgatgataatgcaccagtcatccaggcaaatgaacgtagctgtgaaattgaagaa
aattattccggcaaaacaaattgtacatatacaataagtgatgctgatggttggatcaat
gatgtgtctattgaatttacatcagtaccagaagaaggtgtagataattttaaattaaca
aatggcactcaattgagtgagtataaaaaaatagcaagacttgaaattataaaacagctg
gatttcgaaataattcctgtatatatgctaatgttgactgcaacggatacagcaaaaaat
aaaggtacacttatgagtgttgtgcaagttattgatatgccagatgaaccaccaagttgg
acacgaataactgctgctgaaaatatatttgaaaaaacaaatcatacatttactgtgtct
gctgttgatggtgacattcaaataaatgctgaaattaattataaaattattcctgaaatt
gataatgaaagtcattattttgaaattgatgctaaaagtggaattgtcaaaattcatcca
attgatcgtgatacattgaaaaaagaaatttttagattttcaattgttgcatatgaaaag
ttaaatacaacatcagctattgaagcaaatattcttattattttagaggataaaaatgat
cataaaccacaaataacaccagatgtacttaaaattgatattaaagaagaaacttacatg
tcacttgaatttaatgaatcaattattggaatcaatgatcctgatttagctgaaaatggt
caatactctgttaaattaacagattcagagtacaattggagctcagcttttttaattgtt
ccaaataatggttatcaaagtggtaattttacaataacaattattgatgcatcactgctt
gattatgaagatgaaaattggagaaatattgaaataaatattgtagcaactgaagttgca
aatccaagtcacattgatacaagaaaaattgaaataaatttaataaattggaatgatgaa
atgccaatatttaataatacaaatgttaaagtagaaataaaagaagatgtagaaattaat
tttataattgctgaaatatttgcaactgatagagacattgatgacaaagtaacacattca
attgttggtcaaaaattattaaaaataaatgaaacaactggtgtcattaaaacagcacaa
aatgatgcattggattatgaatcaatacctgttgttattgttcaggtattggcaactgat
cttgcaaatcatgttgcatatgcaacactgacaattcacgttattgatgtcaatgatgta
ccaccaaaactttatcttccaaaacaaattccatcacttctagaagaagttgaaaatgga
actcgtgttgatgcaattataacagcatctgatccagatactgaggctaaacttgtattt
aatattgattggagtaaaacaacagctcataaaagaagtgttttagttaatgaaagttat
tatcgtcaacatcttgatattataacagaatatccagataaattaaatacacgagaagcc
attggaattattattacaaaagacagaattgattatgaagcatttgatgtaatatttata
acaattgtcgtgactgatacaacaactgttcacaatgataattcaacatttgcatcattg
acactaaatattattgattgcaatgataattttccaatatttaataaatttgaaaatatg
agtgtaagtgaaaatcaaataactgatacattaattggtgctgtcacagcaactgatgct
gatggaccagaatttaataaaatatcatatgacattgctccaataaataatactgaatca
tatttaattaaaattgattcaacaagtggaattattagagttgacactgacaaagcaatt
gatgctgaaaaatacgaatatatttattatagcattgttgcatctgatggtgaaaataat
acaacaatgacattggcaatatttgtcattgatgttaatgatgaagaaccttatctatcg
ccagataaaatatttaattcaacaatacatattatggaaaagacaccaaataatacattg
atttatcaaatttacagtcaagacaatgacagaacacatccatttaataatgtgtcatat
aatttaaatgcaaatcaatcagctgcatttcatcagtattttaatctcgataaattttct
ggtttattgagtgttaatttacgtgatggttatatacttgatagagattatggtgcatct
tcatatacacttaacatcaaactaagagataattatcttgttgatgatataacatggaat
acaaatacttttgatacaacaatgacaataatattagatgacattaatgatcaaatacca
gaattaccagatcttggtgatccagctaaagtaattactgaaaatacaaaaagagatagt
ttaatattgtcaattgaagcatcagatcatgatgatccagagacagataatactaaaata
acatacaagctacttgaacaatataaaataataaataatcaagattcaccatcagataat
cagtgtaataataatattgatccatttaaacttgttaatgaaaatttaaaacgtgctcat
atatttgcaaatgatgatttaaaaggttgttatggtacgtggcaaattaaagtatatgca
caagacaaaggacaaaatccaggacctctgaatgacacaaaaatatataatattaaaata
agtgattataattattatgatccagttattgttattccagctcaagcaggaagtggcatt
ccattgagtcaagaacaatctttgcatacacaattaaaaacttatgataaacagttgtta
tcaaatttcaaagctagtgacaatgacagtggtgacagtggaaaagttacatttacaata
acaagtcttactggtgatgatgatgatgataaatattttgatattattaatcttggtgat
aatgaggctcaacttcaattaaaaagttggccatcaaatattgaagaaaataataaatat
aaaataaatttaatagcaagtgatcatggtgatccaccaagaaattcaacaattcaagaa
catacaataatatttgtctcaacacaaggaccaaaatttaatgataatcaatggatgatt
tggataaaagaaaataaaactggtcttaattattcacaaaaaataccagaagcatttgat
gatttgaatgataatggtaattttgtgccaatatattatttcattgatgataaagctggt
gattatgaatattttaaaattgatatgaatacaagattattaacacttgttaaagaattg
gatagagaaaaaaaagacaccatgtggattaatattataacaactgctgatgcaaatggt
ccaccaagagatccacgagaacaagcaattttaaatataacaattattgttcttgatgaa
aatgataatccaccaatatttgaaagtaaattttattctggtggtgttgctgtggaggat
caagttgacagagttatcatgacaataaaagcaactgatgctgatttaaatgacacattg
agttatacaataataccagaaagtatgatgacatcagacaattcaatttcagctattaaa
aatccatttttacttgattcaataagtggtgaattattattaaaattttcagtaacaagt
gagatgattggtttttttaaattcaatacaacagttgttgatgcagttgatcacagtgat
acatcaataatacaagtttatattgtatcacaaacaaatcgtgttgtatttacatttaaa
aatagtccagcaaatgtcaaagaacaacgtatatttttgaaaaatatatttaccgattca
tttggttatttatgcaatattgatgatattaaaataagtgttgacaataataataatgta
cttgacaatgttacaactgttacaactcattttattaattcaaatgataatttaccaatt
gaatcagaaacaattattcgtttgtcaagtgatttacaaactgttacaagcctcaaagca
tcattgcaagcaaaaagtttatatttgattgatgtaccaactggtagcttgacagacaca
tcagatccacaagaaaaaatatactggtttttagtaacactttgtgtattttttagtttt
agtactgttgtacttttattcatttatttttggagaacaaaaattcttagacaaagactt
gataaaatggcacttgaatggcagtcacaagatcaaaatgaaaaaataaataaacctgtt
gttacaccaggaacaaatcaattttcaattgtcggttcaaatccaatttggaaaatagat
ggtgatgatgataataatagtaagacaaatgataatatcattgataatattagtcaaaga
agtggtgattctgatctgattggaattgaagataatttaaattttagctatttaaatgat
gcatttaatttaccgaaagaatttaaaccaagtcaagtgaatgacaatgtaccacagacg
tatatcaacgcaaaatattatgaagacaaatgttaa
DBGET
integrated database retrieval system