Aphidius gifuensis: 122851148
Help
Entry
122851148 CDS
T07796
Name
(RefSeq) protein SMG5
KO
K11125
protein SMG5
Organism
agif
Aphidius gifuensis
Pathway
agif03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
agif00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
122851148
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
agif03019
]
122851148
03032 DNA replication proteins [BR:
agif03032
]
122851148
Messenger RNA biogenesis [BR:
agif03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Surveillance factors
Other surveillance factors
122851148
mRNA cycle factors
Common to processing body (P body) and stress granule
122851148
DNA replication proteins [BR:
agif03032
]
Eukaryotic type
DNA Replication Termination Factors
Telomerase complex (animals)
122851148
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EST1_DNA_bind
EST1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122851148
NCBI-ProteinID:
XP_044006134
LinkDB
All DBs
Position
LG3:complement(4757..8377)
Genome browser
AA seq
966 aa
AA seq
DB search
MKKLNKTSDANVEFLESTRRLYRGATEIAKKLDEKKNSVSSILDIFTIENEVLRGKLKDY
CERLLFKDPIGHAKKIEELLWRRGFYDAVSTAKKIVKTNEWSKIEKSLLLTHLSVGVGFY
HHLILRIHLENKLDLAGFIDFAYPQNDCYYVKDIKKQNQQQQQDDEQLKECLMKIVHRSL
VCLGDLARYKLEFDANWDPMIAMRYYKMAITIEPNYGMPHNQLGTLAANKNYGIDAVYYY
LRSTLCTLPFEGAEGNLNRIINTNNNNNNNKLPLAPSKICANLLFNLIKKWYNNDTPTTS
KNYIVDTNTNDTCQILLDNIENLLKIDKLNNDNDNLSEQTTSIDKFLKNLKSQDLPYLSD
NVVFKIVSICLMLISKLKKNNSSQLNQVIAFMLSVLSKLLQVAVCRLEMSIDKLSSSSSS
STTTSDVLINSNHEKLIIKNDKSINDNENLIINKTNNKNGHVKNRVKSKSLLSKLRRPKK
RVNSLDSDSSDIDEFDDDDDDDEIINNDNTSSDEYNSEKDVNSDESEQEIDESSQDDDSN
DSTDSTDNDDDDDDDDNNNIENNCVANDEITINNKILMILTNEGLLQSIKICFNWLQDNQ
DIIKLAFKGSQLLLKRITIFFNIINININKIMKNKNIFNDESMIFSNNQDDVLNNYIKII
PLPEDIDLQGLNILNASHNNIDWKILKILNINNQEESLLRCLKIINFANYLCTIDESGLK
YNDTNGYFYNDDLNKPNDNDNDKCSTSKSTAIVNDNDDDLIINNNSKGKLMRHMGELWLK
AEVKALENRLKSKLMSAYLVPDHDALAKYTPLLKRLVYTKKFIIVIPSIVVSALDELKRT
SGHAREATRWLEGQLKKGSRFLRAQRPQENLPLAYIKGPRPKDKEAWVFFQIIECCHYLQ
KQTKIDNDSNEPPVVTLLTGITRKSSPSSSSSLSFSPDGLAQNAGINLEHIESFHTKWKT
SSKSHG
NT seq
2901 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaattaaataaaacttcagatgccaatgttgaatttctcgagtcaacacgtcgt
ttatacagaggagcaacggaaattgctaaaaaattagatgaaaaaaaaaatagtgtttca
tcaatattagacatatttacaattgaaaatgaggttttacgaggaaaacttaaagattat
tgtgaaagattattatttaaagatccaattggtcatgctaaaaaaattgaagaattatta
tggcgacgtggattttatgatgctgtatcaacagctaaaaaaattgtcaagacaaatgaa
tggagtaaaattgaaaaatcattattgttgactcatttgtctgttggtgttggattttat
catcatttaatattacgtatacatttagaaaataaacttgatcttgctggtttcattgat
tttgcatatcctcaaaatgattgttattatgttaaagatattaaaaaacaaaatcaacaa
caacaacaagatgatgaacaattaaaagaatgtttaatgaaaattgttcatcgtagttta
gtttgtttgggtgatttggcacgttataaacttgaatttgatgcaaattgggatccaatg
attgcaatgagatattataaaatggcaataacaattgaaccaaattatggtatgcctcat
aatcaacttggcacattggctgccaataaaaattatggtattgatgctgtttattattat
ttacgttcaacattgtgtactctaccatttgagggtgcagaaggtaatttaaatagaatt
ataaatacaaataataataataataataataaattaccattagcaccatctaaaatatgt
gcaaatttattatttaatttaattaaaaaatggtacaacaacgatactccaactacaagt
aaaaattacattgttgatacaaatacaaatgatacttgtcaaatattacttgataatatt
gaaaatttattaaaaattgataaattaaataatgataatgataacttatctgaacaaact
acaagtattgataaatttttaaaaaatttaaaaagtcaagatttaccatatttaagtgat
aatgttgtatttaaaattgtttcaatttgtttaatgttaatatcaaaattgaaaaaaaat
aattcatcacaattaaatcaagttattgcatttatgctgtctgtattatcaaaattactt
caagttgcagtttgtcgtcttgaaatgtcaattgataaattatcatcatcatcatcatca
tcaacaacaacaagtgatgttttgattaatagtaatcatgaaaaattaataatcaaaaac
gataaatctattaatgacaatgaaaatttaattattaacaaaacaaataataaaaatggt
catgtgaaaaatcgagtaaaatccaaaagtttattaagtaaattacgaagacctaaaaaa
cgagtaaacagtttggattcagattcaagtgatatcgatgaatttgatgatgatgatgat
gatgatgaaataattaataatgataatacatcaagtgatgaatacaattcagaaaaagat
gtcaattcggatgagagtgaacaagaaattgatgaatctagtcaagatgatgattcaaat
gattcaactgattcaactgataatgatgatgatgatgatgatgatgataataataatatt
gaaaataattgtgttgctaatgatgagataacaataaataataaaatattaatgatatta
acaaatgagggattacttcagtcaattaaaatttgtttcaactggttgcaagataatcaa
gatattattaaattagcatttaaaggctcacaattattattgaaacgaataacaatattt
tttaatataattaatattaatataaataaaattatgaaaaataaaaatatatttaatgat
gaatcaatgatattttcaaataatcaagatgatgtattaaataattatataaaaattatt
ccattacctgaagacattgatttgcaaggtttaaatatattaaatgcttctcataataat
attgattggaaaatattgaaaattttaaatattaataatcaagaagaaagtctattgaga
tgcttgaaaattattaattttgcaaattatttatgtacaattgatgagtctggcctaaaa
tacaatgatacaaatggctatttttataatgatgatttaaataagccaaatgataatgat
aatgataaatgttcaacatcaaaatcaacagcaattgttaatgacaatgatgatgattta
ataataaataataattcaaaaggtaaacttatgagacatatgggtgaactttggctaaag
gctgaggttaaagctcttgaaaatcgtttaaaatcaaaattaatgtcagcatatttagta
ccagatcatgatgcacttgctaaatatacaccacttttaaaacgtcttgtttatactaaa
aaatttatcattgttattccatcaattgttgtatcagctttggatgaattaaaacgtaca
agtggtcatgcacgtgaagcaacaagatggcttgaaggacaattaaaaaaaggctcaaga
tttttacgtgcacaacgtcctcaagaaaatttaccacttgcatatattaaaggaccacgt
ccaaaagataaagaagcttgggtattttttcaaattattgaatgttgtcattatctacaa
aaacaaactaaaattgataatgattcaaatgagccaccagttgttacactattaactggt
ataacaagaaaatcatcaccatcatcatcatcatcattgagttttagtccagatggattg
gctcaaaatgctggtattaatttggagcacattgagtcatttcataccaaatggaaaact
tcaagtaaaagtcatggttga
DBGET
integrated database retrieval system