Aphidius gifuensis: 122851675
Help
Entry
122851675 CDS
T07796
Name
(RefSeq) chondroitin sulfate proteoglycan 4
KO
K08115
chondroitin sulfate proteoglycan 4
Organism
agif
Aphidius gifuensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
agif00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00535 Proteoglycans [BR:
agif00535
]
122851675
04091 Lectins [BR:
agif04091
]
122851675
Proteoglycans [BR:
agif00535
]
Cell surface proteoglycans
Others
122851675
Lectins [BR:
agif04091
]
C-Type lectins
Others
122851675
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Cadherin_3
Laminin_G_2
Laminin_G_1
BAMBI
Cadherin_C_2
Cadherin_4
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122851675
NCBI-ProteinID:
XP_044006976
LinkDB
All DBs
Position
LG3:6024851..6051798
Genome browser
AA seq
2354 aa
AA seq
DB search
MGLLMLLAATAVLLGYCQTDEKVSLFGASYIHFPVQEAKGSTDISFRFRTHLADAILILA
AGKTDYCLIKLEAGRLKVHINLGAGESEIAGPKGLTLNDLNWHEINLTRREANMTLKIDV
IHTTRILLPGRFFVLNILYGVYIGGRGDFNELFLGHTEYMRGCMADILYNGANVIEYTKL
RKVNSEATSVTWGCSGEFDATEKSEISFIEEGAFISIPKQIPRSGSRWEFELKTISESGL
LLYNAGQASHADYLGIELIDSKIRLLMNKGNGATEILHKMYVSDGKWHKIIIEFNPNFIG
ITIDENSEKLNLPSGGNRYLDLADILYIGGTELNKRARAIGKGLKSGDHSFIGCIKNMLL
DNNEIGLPNVKISQGIVVGCIWTYPCYNIKPCIETSTCTQLGVHSFQCICDQPHCVKTGY
VEPSNINVSLALNLEIVAVKSIVVPEGEHTLVTTNNIAMVLDIAKYGMNENGVIFTMVEQ
PKHGKITLDSTTTTTSSFTLHDIYSNKVQYIHDGSENEEDFMILEVKLTVEIGFTLPEYL
QSRLRFPLSVNVTPVNDPPILEIPTTKVLRLAQGTRKILNKELVWTVDPDTSNDMLIYTV
LRADTDAGHVEKLNHSSSRIEKFTQAELSQGLISYVHHGSAKPNAMLGLQVNDGNENSKK
TFLRITAYPLQIKLKHNTGIVVVHRSFSYLTPFNLSFATNSDDTSILILYTIIVQPQYGI
LEVLNSSTNTWSSVEQFTNHNIELKQIKYLHTIGSPTNDIFKFQASVRELKTQQIFDFKI
SFIDMELKEINNKKIEFTNTNEIIITNDNIKYQTNPLLTSTNMIEYKMLNNPKYGIIYNK
NKILNNNDILTQHDIDNGSIKYRLYKRAYSKIDDEINFLINAPQCQSLTATLTIEYLTGK
NTRVILDTIESLEVDEGSKVPLNIAKINPKDFQVNDVIYNITELPKHGWFILQSNNNKTT
TTFTYNELMNKSIYYIHDDSETTNDTFSYVGISNDNSNNDFMYVGKFNITINLKNDNPPI
RSGITIFDVVINGERIITNNELNYIDHDTGTNTNDIIYTVSHITNGNIYNNLNEKIDKFT
QKDINERKIIFKHNGDVNGQFEFDISDGLFKHNDFLEIHASKPYIKFHESNATIVQFNNT
VILNINDFNIDTNIDINYNDIIYNITSQPKQGKIIMKNNNECYTFTRNDLLNKLILYKHL
GGSLTKDEFRIRININGIYSETRIMIKVYPKCYWETLIIKNNNIIFVEEATSVLINKRSL
EILHPKISPTEITYLIRELPKNGYLEMQNINDGHNINNNEEIKDDYEINQIRHFDQSVIN
EGRLYYVQSVANQTNDNFIIDVTNGITWIRGIVINFIIIPDKLYIESDNISVIEGNSILL
NRKKFHVITTYYNDKLSDYKIIEKPKHGYIIDVNKNNNNIKKFTQKQLDNNCIMYKHNGD
EFLYDFMKIIAIAGDKSSQPIDIWINIQQINDELPVIIKNNNIKVWQGGNVVITNDNLLA
IDNDTLPNDLLYNISIIKNGYLSLKKFPSIEIYNFTQKQINDLSIIFTHTNGTDAVIFFT
LYDGIHTITGNNITIDTIPIKLKIIENNLLNIFPLTRKIIVDKILLTTCTDNSRNVFYII
RRSPNLGKIIMETNEGTWHEVDRFTQKDLNESKVTYEHTKQFMDLSTNDSFVFDVETYFA
ETIKNQIFRIDVSVSSGGLGRYIVSSPIHVEEGGSTEISMNISGIIGYLRTKTGIENPSV
ITTLTNQPKHGHVMLMPDLNITKFSQSQIEDKKIAYYHDHSDSIDDHIDLSLYLIPGYIM
LCNTSIQIIISPINDQPFKLVTKSPFITVVQNQSQTITRNDLLTIDPDTTPDELIYDMIS
GTTAGHLLLLSIEQNSSEVRQVNKFSQLDVDSNRLIYEHSGSSQAASFYFRVSDGRFTPV
YTLFNVHVIPIKLNVTTPSSLTLQQGINMAILTEDNIKLDTNARQEHVIYTLTKLPKYGT
LYVKNLEATTFKHTDLLSKIVVYVQTDMSSSNDSLILSSRISDYIINDIKIIIKVIPLML
IRQMTVFSGEKNQLNLKYMDATPLAEATSSNPIYYITTKSRYCKIKRILRNSGEKRSTRE
REISRFSHSEIITGVIFIVCKRIPINDIDGLNDNFEFNLSGSIYQPANGIFNIKIKIDPD
INNNTLEGPMDPVGHEGEMSIAPNMSQDYIILLSMLFGLFILSILVVITIKCRRKKYKNT
TTNNNINNNNNNMLNKQNEMTPTIGVIPLPRPPDHLMPTTPHLKRFVNDHMDMTSSTPLP
THSTMTTSTLPQCKVIPLNQIESVASSDADVSARYPYGVADNDDWSSFDTADLPCSQNTV
RRTNPLLRRNQYWV
NT seq
7065 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggactgttgatgttgctggctgcaacggccgttctcttgggttactgccagacggat
gaaaaagtgtcattatttggagcaagctacatacattttccagtacaagaagccaaaggc
agtaccgatataagttttagatttcgaacacatcttgccgatgcaattctcatattggca
gctggaaaaactgactattgtttaataaagctcgaggctggcagactaaaggtacatatt
aatttaggtgctggtgagagtgaaattgctggaccaaaaggattgacacttaatgattta
aattggcatgaaattaatttaacaagaagagaagcaaatatgacattgaaaattgatgtt
atacatacaacaagaatattattaccaggaagattttttgttctcaacatattgtatggt
gtctatattggtggaagaggtgatttcaacgagctatttttaggtcacactgaatatatg
agaggttgtatggctgatatattgtacaatggtgcaaatgttattgaatatactaaattg
agaaaagttaattcagaagcaacatcagtaacttggggttgttctggtgaatttgatgca
actgaaaaatccgaaataagttttattgaagaaggagcatttatatcaataccaaaacaa
attccacgttctggatcaagatgggaatttgaattaaaaacaatatcagaaagtggttta
ttattatacaatgctggacaagcatcacatgctgattacttgggtattgaattgattgac
agtaaaatacgtttattaatgaataaaggtaatggtgcaactgaaatattacataaaatg
tatgtatctgatggtaaatggcacaaaattataattgaatttaatccaaattttattggt
ataacaattgatgaaaatagtgaaaaattaaatctaccatctggtggtaatcgttatctt
gatttagctgatatattatatattggtggtactgaattaaataaacgtgcacgtgctatt
ggtaaaggtttaaaatctggtgatcatagttttattggttgtattaaaaatatgttactt
gataataatgaaattggtttaccaaatgtcaagataagccaaggtattgttgttggttgt
atatggacatatccatgttataatattaaaccatgtattgaaacatcaacatgtacacaa
cttggtgtacattcatttcaatgtatttgtgatcaaccacattgtgtcaagaccggttat
gttgaaccatcaaatattaacgttagtcttgcattaaatcttgagattgtagcagtgaaa
agcattgtagtgccagaaggtgaacacacgttggtcaccactaacaatattgcaatggta
ctggacattgccaagtatggaatgaacgagaacggggtcattttcactatggtagaacag
ccaaaacatggtaaaatcaccttggattcaaccacaactaccacatcttcatttactcta
cacgacatttacagtaacaaggtccagtatattcatgatggtagtgaaaatgaagaagat
tttatgatattggaggtaaagctgacagttgaaattggcttcacgcttcctgaatatcta
cagagtcgtctgagatttcccctcagtgtcaacgttacgccggtgaacgacccgcctatt
ctagaaataccaacaaccaaagtcctcaggcttgcacaaggaacgagaaaaatacttaac
aaagaattggtatggactgtggatccagatacatcaaatgacatgttgatttatactgtt
ttacgtgctgatactgatgctggacatgttgaaaaactcaatcattcatcaagtagaatt
gaaaaatttacacaagctgaactttcacagggtcttatatcttatgttcatcatggaagt
gcaaagccaaatgcaatgctgggacttcaggtgaatgatggaaatgaaaatagtaaaaaa
acatttttacgaataacagcatatccattacaaataaaattaaaacacaatactggtatt
gttgttgttcatcgttcattttcatatttaacaccatttaatttatcatttgcaacaaat
tctgatgatacaagtatattaatactatacacaataattgtacaaccacaatatggcata
ttagaagttctaaattcatcaacaaacacatggtcaagtgttgaacaatttacaaatcat
aatattgaattaaaacaaattaaatatttacatacaattggtagtccaacaaatgatata
tttaaatttcaagcatcagtacgtgaacttaaaactcaacaaatttttgattttaaaata
tcatttattgatatggaacttaaagaaataaataataaaaaaattgaatttacaaataca
aatgaaataataataacaaatgacaatataaaatatcaaacaaatccattattaacatca
acaaatatgattgaatataaaatgctaaataatccaaaatacggtattatttataacaaa
aataaaatattgaataacaatgatatattaacacaacatgacattgacaatggatcaata
aaatatcgtttatacaaacgtgcatattcaaaaattgatgatgaaattaattttttaata
aatgcaccacaatgtcaatcattaacagcaacattaacaattgaatatttaactggtaaa
aatacacgagtaatacttgatacaattgaatcacttgaagttgatgaaggctcaaaagta
cctttaaatattgcaaaaataaatccaaaagattttcaagttaatgatgtaatttataat
ataactgaattaccaaaacatggctggtttattttacaatcaaataataataaaacaaca
acaacatttacatataatgaattaatgaataaatcaatatattatattcatgatgatagt
gaaacaacaaatgatacatttagctatgttggaatatcaaatgataatagtaataatgat
tttatgtatgttggaaaatttaatataacaattaatttaaaaaatgataatccaccaatt
agatcaggtataacaatatttgatgttgttattaatggtgaaagaataataacaaataac
gaacttaattatattgatcatgatactggcacaaatacaaatgacataatatatactgta
tcacatataacaaatggtaatatttataataatttaaatgaaaaaattgacaaatttaca
caaaaagatattaatgaacgtaaaattatcttcaaacataatggtgatgttaatggacag
tttgaatttgatattagtgatggtctgtttaaacataatgatttcttagaaatacatgct
agtaaaccatatattaaatttcatgaaagtaatgcaacaattgtacaatttaataataca
gttattctaaatataaatgattttaatattgatacaaatattgatattaattataatgat
attatatataacataacaagtcaaccaaaacaaggaaaaataattatgaaaaataataat
gaatgttatacatttacacgtaatgatttgttaaataaattaatattatataaacattta
ggtggttcattaacaaaagatgaatttcgtattagaataaatataaatggtatttatagt
gaaacacgtattatgattaaagtatatccaaaatgttattgggaaacattaattattaaa
aataataatataatatttgttgaagaagcaacaagtgtacttattaataaaagaagctta
gaaatattacatccaaaaatatcaccaactgaaataacatatttaatacgtgaattacca
aaaaatggttatcttgaaatgcaaaatattaatgatggacataatattaataataatgaa
gaaataaaagatgattatgaaataaatcaaatacgtcattttgatcaaagtgttattaat
gaaggacgtttgtattatgtacaatcagttgctaatcaaacaaatgataattttataatt
gacgttacaaatggtataacatggattcgtggtattgtcattaattttattataatacca
gataaattatatattgaaagtgataatataagtgttattgaaggtaatagtatattatta
aatagaaaaaaatttcatgttataacaacatattacaatgataaattaagtgattataaa
attattgaaaaaccaaaacatggttatattattgatgtcaataaaaataataataatatt
aaaaaatttacacaaaaacaattggataataattgtattatgtataaacataatggtgat
gaatttttatatgatttcatgaaaataattgcaattgctggtgataaatcaagtcaacca
attgatatatggataaatatacaacaaattaatgatgagttaccagttattattaaaaat
aataatattaaagtatggcaaggtggtaatgttgtaataacaaatgataatttattagca
attgataatgatacattgccaaatgatttgttgtataatattagtattattaaaaatggt
tatttatcattaaaaaaatttccaagtattgaaatatataattttacacaaaaacaaatt
aatgatttatcaattatttttactcatacaaatggtactgatgctgttattttttttaca
ttgtatgatggtatacatacaattactggaaataatataactattgatacaataccaatt
aaattgaaaattattgaaaataatttacttaatatatttccattaacaagaaaaattatt
gttgataaaatattattaacaacatgtacggataatagtagaaatgtattttatattata
cgtcgttcaccaaatcttggaaagataattatggaaactaatgagggcacttggcatgaa
gttgacagatttacgcagaaagatttgaatgagagtaaagttacttatgaacacaccaag
cagtttatggacttgtctactaatgattcattcgtatttgatgttgaaacatattttgct
gaaactatcaagaatcagattttccgaatagatgtgtcagtatcaagtggtggacttgga
agatatattgtatcatctccaattcatgttgaggaaggtggttcaactgagatatcaatg
aatattagtggtataattggatatttacgtacaaaaacaggaattgaaaatccttcagta
ataacaacattaacaaatcaaccaaaacatggtcatgttatgttaatgcctgatttaaat
ataacaaaattttcacaatcacaaattgaagataaaaaaatagcctattatcatgatcat
tcagatagtattgatgatcatattgatttatcattatacctaataccaggttatattatg
ttatgtaatacaagtatacaaataataatatcaccaataaatgatcaaccatttaaactt
gttacaaaatcaccatttataactgttgtacaaaatcaaagtcaaacaataacaagaaat
gatttattaacaattgatccagatacaacaccagatgaattaatatatgatatgatatct
ggtacaactgctggacatttattactattatcaattgaacaaaattcatcagaagtacga
caagttaataaatttagtcaacttgatgttgattcaaatagattaatatatgaacatagt
ggttcatcacaagcagcatcattttattttcgtgtatctgatggacgttttacaccagta
tatacactatttaatgtacatgttataccaattaaattaaatgtaacaacacccagttca
ttgacattacaacaaggtattaatatggcaatattaactgaagataatattaaacttgat
acaaatgctagacaagaacatgttatatatacattaactaaattaccaaaatatggtaca
ttatatgttaaaaatttagaagcaacaacatttaaacatactgatttattatcaaaaatt
gttgtttatgtacaaactgatatgtcatcatcaaatgatagtttaattttatcatcacgt
attagtgattatattataaatgatattaaaattataattaaagttataccattaatgtta
atacgtcaaatgactgtattttctggtgaaaaaaatcaacttaatttaaaatatatggat
gcaacaccactagctgaagcaacaagcagtaatccaatatattatattacaacaaaatca
cgttattgtaaaattaaacgtattttacgtaattctggtgaaaaacgtagtacacgtgaa
cgtgaaatatcacgtttttcacatagtgaaataataactggtgttatatttattgtatgt
aaacgtataccaataaatgacattgatggtttaaatgataattttgaatttaatttatct
ggttcaatttatcagccagcaaatggtatatttaatattaaaattaaaattgatccagat
attaataataatacattagaaggaccaatggatccagttggtcatgaaggtgaaatgtca
attgctccaaatatgtcacaagattatattatattattaagtatgttatttggtttattt
atattaagtatattagttgttattacaattaaatgtcgacgtaaaaaatataaaaataca
acaacaaataataatataaataataataataataatatgttaaataaacaaaatgaaatg
acaccgacaattggtgttataccattaccaagaccaccagatcatttaatgccaacaaca
ccacatttaaaaagatttgttaatgatcatatggatatgacatcaagtacaccattacca
acacattcaacaatgacaacatcaacattaccacaatgtaaagttataccattaaatcaa
attgaaagtgttgctagttcagatgctgatgtatcagcaagatatccatatggtgttgct
gataatgatgattggagtagttttgatactgctgatttaccatgttcacaaaatactgtt
agacgaacaaatccattattaagaagaaatcaatattgggtctag
DBGET
integrated database retrieval system