Aphidius gifuensis: 122852945
Help
Entry
122852945 CDS
T07796
Name
(RefSeq) E3 SUMO-protein ligase RanBP2-like
KO
K12172
E3 SUMO-protein ligase RanBP2 [EC:2.3.2.-]
Organism
agif
Aphidius gifuensis
Pathway
agif03013
Nucleocytoplasmic transport
agif03250
Viral life cycle - HIV-1
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
agif00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03013 Nucleocytoplasmic transport
122852945
09125 Information processing in viruses
03250 Viral life cycle - HIV-1
122852945
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
agif03019
]
122852945
03110 Chaperones and folding catalysts [BR:
agif03110
]
122852945
04121 Ubiquitin system [BR:
agif04121
]
122852945
Messenger RNA biogenesis [BR:
agif03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Nuclear pore complex
122852945
Chaperones and folding catalysts [BR:
agif03110
]
Protein folding catalysts
Peptidyl prolyl isomerase
Cyclophilin
122852945
Ubiquitin system [BR:
agif04121
]
Ubiquitin ligases (E3)
UBL E3 ligases
122852945
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Ran_BP1
Zn_ribbon_RanBP
WH1
TPR_2
DUF7129
TPR_1
TPR_16
ARM_TT21_C
TPR_12
IR1-M
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122852945
NCBI-ProteinID:
XP_044009025
LinkDB
All DBs
Position
LG3:23151776..23160429
Genome browser
AA seq
2698 aa
AA seq
DB search
MFRNKVAVDRHVQEQFRKVTDEKERNLRCYNIAKLYYSVQDYDSARHYVSSYLEVKSESA
PAHKLLGEIFEALGQKQKALVQYKQSLELEGRQDDLVLKVCELLTDTDVSVDVNSVKYWT
ERASDKFPNHSIIFRLKERMLISEKTDVTNEDLEALIISELSARPSDIELRVKLIKYYQS
KKRLDDAFQHAIDIESKFSHRDSLIWYETLCALLTQYKDTKQQKWSFWILYLSCLERYAA
LSIKEQGIQIPKSIEDAIQAVSNFDQALTESKQHNIDNNTKFTEQMYCHMFAQLNYHLAC
LIIRRTKREQGSWTEAGRLCAPLLLTAMHSSPIDTVAPLSANIKAQSNQAQVDIWHREGA
YRCSQAAHVLQDYIRNDVKRLTDKIEKFCIGSWRERLYQRIFTSKKYSTIMSKSYFANDT
TKNSPMRLLSSTELAEYDEISEQVFPASLHHHVWLGIVNKPKPLKSQNLQSKSINSVPIK
NQQCHVFKNLQISAHNLNQASPDSLSQLDIDAFLNATILCSSVIVEDHKKSGFLNPDRFP
TLPADLTNTLCTSVQEKWWLSAYKMYNNQDGNNIGGDIGELRQELQFGLEIVRCIGNHGL
HPTIIVQLARIFQYRAKLLRENENSDETLNYLERRYELYWSTVIPLLERLLNNQSIRFII
TKVFDYQGGDMNNLELSNALEEGRLTLAEIMVKEKKYEEAVASLQILKCPESSCLQGDVY
KILADESSISYEKNNITSPLRSDHIIMLTKAKNCYYLTLDRLRSPGMNPNHPLNAELGNK
ILSIENELKKIDPDYVNHHTNRNNDDNCASDESYSSAHSDEQHSIFYASNSVLHGTPRVN
KVRTTPKQSSTPRISQQERLFNDSTRSRVHFEARPSPERLDAQIRQLIHSKDSMISTVVE
QYKIILESNKTLVESNKNMKDMLEELRREFNEFRKDSAQKRDLRQSNINHTNNDTGSYGF
EDDVYDNLTDHTQNLSLQQQQQRPRYAPVPFGYKTPIVSHMQSPAMPPNMFATPRAPFSP
HDYSQANPLSNDYYNTMQPFLQQNYNDPYNQAMGPTIYGTPSRPIYPPQVFSRTPSVDQS
PIGGIPPQVLPGQTPASFMMPRMMAPLSQETHLPQNVALAQMQQMIDLTRQGMSDTSITS
TPPPPPPQQQQQQLQQIQIQQQQQQIQQQQQVQQQQQTPRSSILGQILQKNPLVNKAPPV
NVVITKSDTVPTTVPPVQPTMSVTIPPQHINSGNSINMQQNNYSLNNTVENIPHTYQMTM
PSHAIIPTTVIHPPLSATITNTIAAGAEKSKHNVSLLSTGSHNSSTDAAEVEHDPIPDFK
PIIPLPDEITVTTGEEDEEELYCARAKLFRYSDKEWKDRGVGNVKLLKNTEGKVRLLMRR
EQVLKICANHFLTADMELSPMMNSDRAWTWAANDFADQEVKLETLAIRFKLPAEAQSFKE
HFDKAKASLPLSPVKPVKKSQPPVTSTQTTTATPVTTSSSSSVVLGGFSFSTTPIIQQKT
SVDTKKNEETAKPSPFSGFSFTKTTDSPAAPVDFSFNQKSVIQNTKTTATAVASKPSLAE
MFKPEVGSWECKSCYTRNTSSNVKCLACEGPSPNAPAPIVKEAPIQNAKITSAAPPPPTT
TTTTGKPSLSEMFKPEVGSWECKSCYTRNKSSSVKCLACEGPSPNAPAASANDTTNKSSV
IASTPFTFGIPAAVQTNQNTLSTAKPLFNDIFKNKSETSVGATPAFSFGIPANKETSSFN
FKAPVIDDKNKIGESKSFEGFSTKPPSTDFNFSNQEAKNLPSKSPFSFGSPGKSFEFHLA
SKSPVKSSGGGGGDDASDDEVVESEDIYFAPVIPLPDKIDVKTGEEDEEVLYTHRSKLFR
YDSNTKEWKERGLGDIKILRHTVTKKLRLVMRRDRTLKLCLNQYVPRDLEITSKDEKTWL
WKASDFSEGEIEHVSLACRFKNSEIAELFKKAIDNAIAAIDINETPSSASTASPQDIQVL
FELSVTDEEKNAALKLKLPENFYSYKQKDDCKGCRGCQESDVSLFDDKKNKGTTSKTPSQ
VIKLDPPKLTPPTKTQFSATTTTTAAATTTTTTTNSNIFSFQKSPIQPTETKQLKHGTLA
SIINHPQDIKSGFSFGGTKNNNNNDSVVRNLFGGTPSICSPTTAPQTDSPFGKNVFGEKS
SIFGQQSLPTFASVGSTNIFGGATPVKTSEASSTTTTTAMPLFGGAPTFATAFGMTKNSE
TSNKTSENIFGSAAKDSSTSTLFSNGNNLFSANTTNNNETTSTPPVFGNTSSFGSNFSFG
GLATTTPSTTSIFGGKQPLTSTTDEKKETTVPSFLKTAENTVTFEALAAGTSKPAGFTTN
PNFSFAGAGQSVFGSKTPQSSTKKTPQKNEDNDKDADEENDDGQDGEYDPHYEPIIPLPD
AIEVKTGEEDEEALFCQRAKLYRYETETKEWKERGVGDMKILHHVEQGRYRLLLRREQVY
KVVCNMALTSDFDLQPLQTSDRAWVWGGTNYAEDTPSVEKLAVRFKNPELAMNFKDVVDR
AIEDLCTRPKNDSHQNHEGEEEDDEEEDDDVDDVDDDGGHNNEDTDEGDEGDDDDDEVSY
SFFKVANLLTLEENEFVPVCQNGIVKIYYDSEVFASRIVFENDHGEILCSVVTVWQLEVE
LDGNCCTWTAYDEFFEIPIRRTMKLEFQVESDAVEFYNNVRDNVEESGFSKVSEDMYY
NT seq
8097 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttccggaataaagttgcagtggatcgtcatgtccaagaacaatttagaaaagttact
gatgaaaaagagcgtaatcttcgttgttacaacatagccaagctctattattcagttcaa
gattatgattcagctcgtcattatgtatcaagttatttggaagtcaagagtgaatcagca
ccagcacataaacttcttggtgaaatatttgaagctcttggtcaaaaacaaaaagcatta
gttcaatataaacaatcacttgaactagaaggacgtcaagatgatttagttcttaaagta
tgtgaacttttaactgatactgatgtttctgttgatgttaacagtgtcaaatattggaca
gaacgtgctagtgataaatttccaaatcattcaataatatttagactcaaagaacgtatg
ttaatcagtgaaaaaactgatgttacaaatgaagatttagaagcattaattatttctgaa
ttatcagcaagaccaagtgatatagaactacgtgttaaacttataaaatattatcaatca
aaaaaacgtcttgatgatgcatttcaacatgcaattgatattgaatcaaaattttcacat
cgtgatagtttaatttggtatgaaacactttgtgcattattaacacaatacaaagatact
aaacaacaaaaatggtcattttggatattgtatttatcatgtttggaacgttatgctgca
ttgagtataaaagaacaaggtatacaaataccaaaatcaattgaagatgctattcaagct
gtgtcaaattttgatcaagcattaactgaatcaaaacaacacaatattgataataataca
aaatttacagaacaaatgtattgtcatatgtttgcacagttaaattatcatctagcttgt
ttaataatacgtcgtacaaaacgtgaacaaggcagttggactgaagctggaagactttgt
gctccattattattaacagcaatgcattcgtcaccaattgatacagttgcaccattatca
gcaaatattaaagctcaatcaaatcaagcacaagttgatatttggcatcgtgaaggtgca
tatcgttgtagtcaagctgctcatgtacttcaagattacatacgtaatgatgtcaaacgt
ttaactgataaaattgaaaaattttgcattggatcatggagagaacgtttgtatcaacgt
atttttacatcaaaaaaatattcaactatcatgtctaaatcttattttgctaatgataca
actaaaaattcacctatgagattattatcatctactgaacttgctgaatatgatgaaata
agtgaacaagtatttccagcctcattacatcatcatgtttggcttggtattgtcaataaa
ccaaaaccattaaaaagtcaaaatttacaatctaaaagtattaattcagtaccaattaaa
aatcaacagtgtcatgtgtttaaaaatttacaaatatctgctcataatttaaatcaagca
tcaccagatagtctaagtcaattagatattgatgcatttttaaatgcaacaattttatgt
tcatctgttattgttgaagatcataaaaaaagtggatttttaaatcccgatagatttcca
acattaccagctgatttaacaaatacactttgtacatctgtacaagaaaaatggtggtta
tcagcatataaaatgtataataatcaagatggtaataatattggtggtgatattggtgaa
ttacgtcaagaattacaatttggtcttgaaattgtacgttgtattggtaatcatggttta
catccaacaattattgttcaattagcaagaatatttcagtatcgtgctaaattattacgt
gaaaatgaaaattcagatgagacattgaattatcttgagcgtcgatatgaattatattgg
tcaactgtaatacctttacttgaaagattattaaataatcaatcaataagattcatcata
acaaaagtatttgattatcaaggtggtgatatgaataatttagaattgagcaatgcactt
gaggaaggtcgtttaacattagctgaaataatggtcaaagaaaaaaaatatgaagaagct
gttgcaagtcttcaaatattaaaatgtccagaatcatcatgtcttcaaggtgatgtatac
aaaatacttgctgatgaatcatctatttcatatgaaaaaaataatattacatcaccatta
agatcagatcatattattatgttaacaaaagctaaaaactgttattacttaacacttgat
cgtttgagaagtcctggaatgaatccaaatcatccattaaatgctgaacttggtaataaa
atattatcaattgaaaatgaattaaaaaaaattgatcctgattatgtaaatcatcatacc
aacagaaataatgatgataattgtgcgtctgatgaaagttattcatcagctcatagtgat
gaacaacattcaattttttatgcatcaaattcagttcttcatggtacaccacgtgttaat
aaagtacgtacaacaccaaaacaatcaagtacaccacgtatatcacaacaagaaagatta
tttaatgattcaacaagatcaagagtacattttgaagctcgtccaagtcctgaaagactt
gatgcacaaatacgtcaattaattcattcaaaagattcaatgatttcaactgttgttgag
caatataaaattattcttgagtcaaataaaacacttgttgaatcaaataaaaatatgaaa
gacatgcttgaagaattgcgtcgtgaatttaatgaatttagaaaagattcagcacaaaaa
cgtgatttaagacaatcaaatattaatcatacaaataatgatactggctcatatggtttt
gaagatgatgtatatgataatttaacagatcatacacaaaatttatctttacaacaacaa
caacaacgtccacgttatgctcctgtaccatttggatataaaacaccgattgtatctcat
atgcaaagtccagcaatgcctccaaatatgtttgctacaccaagagctccattttcacca
catgattattcacaagcaaatccactttcaaatgattattacaatacaatgcaaccattt
cttcaacaaaattataatgatccatacaatcaagcaatgggaccaacaatttatggtaca
ccatcaagaccaatttatcctccacaagtattttcacgtacaccatctgttgatcaatca
ccaattggtggtataccaccacaagtattacctggacaaacaccagcctcttttatgatg
ccaagaatgatggctccattgtcacaagaaacacatttaccacaaaatgttgctttggca
caaatgcaacagatgattgatttaacacgacaaggaatgtctgatacttcaataacatca
actccaccaccaccaccaccgcaacaacaacagcaacaattacaacaaatacaaatacaa
caacaacaacaacaaattcaacaacagcaacaagtacaacaacagcaacaaacaccacgc
tcaagtatacttggtcaaatattacaaaaaaatcctttagttaataaagcaccacctgtt
aatgttgtcattactaaatcagatacagttcctacaacagtaccacctgttcaaccaaca
atgagtgttacaataccaccacaacatattaacagtggtaatagtattaatatgcaacaa
aataattattcattaaataatactgttgaaaacattccacatacttatcaaatgacaatg
ccatcacatgcaataataccaacaacagttattcatccaccattatcagcaacaataaca
aatacaattgctgctggtgctgaaaaatcaaaacataatgttagtttgttatcaacgggt
tcacataattcatcaactgatgcagctgaagttgaacatgatccaataccagatttcaag
ccaattattcctttaccagatgaaattactgttacaactggtgaagaagatgaagaagag
ttatactgtgcaagagcaaaattattcagatactctgataaagaatggaaagatcgaggt
gttggtaatgttaaattattaaaaaatacagaaggcaaagtgagattactcatgagaaga
gaacaagtattgaagatatgtgccaatcactttttaacagcagacatggagttgagtcca
atgatgaattcagatagagcatggacatgggctgctaatgattttgctgatcaagaagtt
aaacttgaaacacttgctattagatttaaattaccagcagaagcacaatcatttaaagaa
cattttgacaaagcaaaagcatcattaccattgagtccagttaaaccagttaaaaaaagt
caaccaccagttacatcaactcaaacaacaacagctacaccagtcacaacttcatcatca
tcatctgttgttcttggtggattttcattcagcacaacaccaattattcaacaaaaaaca
tcagttgatactaaaaaaaatgaagaaacagcaaaaccaagtccattttctggtttttca
tttacaaaaacaactgattcaccagctgcacctgttgacttttcattcaatcaaaagtca
gtaatacaaaatacaaaaacaacagcaacagcagtagcaagcaagccgtcattggcagag
atgtttaaacctgaagtaggttcatgggaatgtaaaagttgttatacaagaaatacgtca
tcaaatgttaaatgtcttgcttgtgaaggaccatcaccaaatgcaccagctccaattgtc
aaagaagcaccaatacaaaatgcaaaaataacatcagcagcaccaccaccaccaacaaca
acaacaacaacaggtaaaccatcattatcagagatgtttaagccagaagttggctcatgg
gaatgtaaaagttgttacacaagaaataaatcatcaagtgttaagtgtcttgcttgtgaa
ggtccatcaccaaatgctccagcagcatcggcaaatgatacaacaaacaaatcaagtgtc
atagcttctacaccatttacatttggaataccagcagcagtacaaaccaatcaaaataca
ctttcaactgctaaacctctttttaatgatatatttaaaaataaaagtgaaacaagtgtt
ggagcaacaccagctttttcatttggcataccagctaataaagaaacatcaagttttaat
tttaaagcaccagttattgatgataaaaacaaaattggtgaatcaaaaagttttgaaggt
ttttcaacaaaaccaccttcaactgattttaattttagtaatcaagaagctaaaaattta
ccatcaaaatcaccattttcatttggatcacctggtaaatcatttgaatttcatttagca
tcaaaatcaccagttaaatcatctggtggtggtggtggtgatgatgcaagtgatgatgaa
gttgttgaaagtgaagatatttattttgcaccagtaataccacttccagataaaattgat
gttaaaactggtgaagaagatgaagaggtactttatacacatcgttcaaaattatttaga
tatgattcaaatacaaaagaatggaaagaacgtggtcttggtgatattaaaattttaaga
catacagttactaaaaaattgagacttgttatgagaagagatcgtacattaaaattgtgc
ttgaatcaatatgtcccacgtgatttagaaataacatcaaaagatgaaaaaacatggtta
tggaaagcaagtgattttagtgaaggagaaattgaacatgttagtcttgcatgtcgtttt
aaaaattctgaaattgctgaattatttaaaaaagcaattgacaatgcaattgcagctatc
gatattaatgaaacaccatcatcagcatcaacagcatcaccacaagatattcaagtatta
tttgaattaagtgttactgatgaagaaaaaaatgcagcattaaaacttaaattaccagaa
aatttctattcatacaaacaaaaagatgattgtaaaggttgtcgaggttgccaagaatca
gatgtttcactttttgatgataaaaaaaataaaggaacaacttcaaaaacaccatcacaa
gttatcaaattagatccaccaaaattaactccaccaacaaaaacacaattttcagctaca
acaacaacaactgcagcagcaacaacaacaacaaccacaacaaattcgaatattttctcg
ttccaaaaatcacctattcaaccaacagaaacaaaacaactaaaacatggaactcttgct
tcaattattaatcatccacaagatataaaatcaggtttttcatttggtggtacgaaaaat
aataataataatgacagtgttgttagaaatttatttggaggtactccaagtatatgcagt
ccaactacagcaccacaaactgattcaccatttggaaaaaatgtatttggagagaaatca
agtatttttggtcaacaatcactcccaacttttgcatcagttggatcaacaaatatattt
ggtggtgcaacaccagttaaaacatcagaagcatcatcaacaacaacaacaacagctatg
ccactttttggaggagcaccaacatttgcaacagcttttggtatgactaaaaattcagaa
acaagcaataaaacatctgaaaatatatttggatcagctgccaaagattcatctacatct
acgctattttcaaatggcaataatttatttagtgctaatacaacaaataataatgaaaca
acatcaacaccaccagtttttggtaatacatcatcattcggtagtaatttttcatttgga
ggtttagcaacaacaacaccatcaacaacttcaatattcggtggtaaacagccattaaca
tcaacaactgatgaaaaaaaagaaacaacagtaccatcatttttaaaaacagctgagaat
actgttacatttgaagcacttgctgctggtacatcaaaaccagctggttttacaactaac
ccaaatttttcatttgctggagctggacaatcagtatttggatcaaaaacaccacaatca
tcaactaaaaaaacaccacaaaaaaatgaagataatgataaagatgcagatgaagaaaat
gatgatggacaagatggtgaatatgatccacattatgagccaataataccattaccagat
gcaattgaagttaaaactggtgaagaagatgaagaagcattattttgtcaacgtgctaaa
ttatatagatatgaaacagaaacaaaagaatggaaagaacgtggtgttggtgatatgaaa
attcttcatcatgttgaacaaggaagatatcgtttgttgttaagacgtgaacaagtttat
aaagttgtatgtaatatggcattaacatcagattttgatcttcagccacttcaaacatca
gatcgtgcttgggtatggggtggtacaaattatgctgaagatacaccatctgttgaaaaa
cttgctgttagatttaaaaatccagaacttgcaatgaattttaaagatgttgttgatcgt
gctattgaagatttatgtacaagaccaaaaaatgatagtcatcaaaatcatgaaggagaa
gaagaagatgatgaggaggaggatgatgatgttgatgatgttgatgatgatggtggtcat
aataatgaggatactgatgagggtgatgaaggtgatgatgatgacgatgaagtgtcatat
tcattttttaaagtagccaatctcttgactttggaagaaaatgaatttgtaccagtttgt
caaaatggaattgtcaaaatatattatgattctgaggtatttgcatcaagaattgttttt
gaaaatgaccatggagaaatattgtgttcagttgtcactgtatggcaacttgaagttgaa
cttgatggtaattgctgtacgtggacagcatatgatgagttctttgaaatacctatcaga
agaactatgaaacttgaatttcaagttgaatctgatgcagttgaattttataataatgtt
cgagataatgttgaagaatctggtttttccaaagtcagtgaggacatgtattactaa
DBGET
integrated database retrieval system