Aphidius gifuensis: 122854877
Help
Entry
122854877 CDS
T07796
Name
(RefSeq) leucine-rich repeat protein soc-2 homolog
KO
K19613
leucine-rich repeat protein SHOC2
Organism
agif
Aphidius gifuensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_8
LRR_14
LRR_4
LRR_1
LRR_R13L1-DRL21
LRR_LRWD1
LRR_13
LRR_5
LRR_Zer-1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122854877
NCBI-ProteinID:
XP_044011835
LinkDB
All DBs
Position
LG4:5963943..5966510
Genome browser
AA seq
612 aa
AA seq
DB search
MKKLNRHRTGVGNISSICLSEAKTDSPMPQDSLQGYYVKDQQDIPEYLEGCGLSSCSAVN
DMPEVVVEVLPKEHHQKEKKLSTASISSGDTKKTVTVKHPESNKPKPTAKKCKPIQADLD
VSKEFIRCRDECLARLDLSKSSITNLPNTVRDLINLQEFYLYGNKLVTLPSEIGCLTNLK
TLALSENSLTSLPDSLENLRHLKVLDLRHNKLNEIPDVVYKLTSLTTLFLRFNRVKFVSD
NIKYLTNLTMLSLRENKIKSLPGGIGKLINLITFDVSHNHLEHLPEEIGNCIQLSTLDLQ
HNELLDIPETIGNLIAVTRLGLRYNRLSCIPKSLSNCKFMDEFSVEGNQVSQLPDGLLTS
LSDLTTITLSRNCFTSYPSGGPLQFTNVDSLNMEHNQIDKIPYGIFSRAKNLTKLNMKEN
QLSALPLDIGTWINMVELNLGTNQLSKIPDDIERLENLEILILSNNLLRKIPTSIKNLKK
LRILDLEENKIEILPNEIGFLRDLQKLILQSNQVTTLPRAIGHLQNLTYLSIGENNLNYL
PEEIGTLENLDTLYINDNINLHNLPFELALCTNLSIMSIENCPLSKIPGEIVSGGPSFVI
QFLKMQGPYRSM
NT seq
1839 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaattgaatagacatcgtacgggtgtgggtaatatatcatcaatttgtctgtct
gaggcaaaaacagatagtccaatgcctcaggacagtcttcaaggttactatgtaaaagat
caacaagacataccagaatatcttgagggttgtggtttatcaagttgttcagcagttaac
gatatgccggaagttgttgttgaagtacttccaaaagaacatcatcaaaaagaaaaaaag
ctatcaacagcatcaatatcaagtggtgatactaaaaaaacagttacagttaaacatcct
gaatcaaataaaccaaaaccaacagctaaaaaatgtaaaccaatacaagctgatttagat
gtatcaaaagaatttataagatgtcgtgatgaatgtttagcacgtcttgatttatcaaaa
tcaagtattacaaatttaccaaatacagtacgtgatttaataaatttacaagaattttat
ttatatggtaataaacttgtaacattaccatctgaaattggttgtttaacaaatttaaaa
acacttgcattgagtgaaaattcattaacaagtttaccagatagtcttgaaaatttaaga
catttaaaagtattggatttgaggcataataaattaaatgaaataccagatgttgtttat
aagctaacatcattaacaacattatttttacgttttaatcgtgttaaatttgtcagtgat
aatataaaatatttgacaaatttaacaatgcttagtttacgtgaaaataaaattaaatca
ttacctggtggtattgggaaattaattaatttaataacatttgatgtatcacataatcat
cttgaacatttaccagaagaaattggtaattgtatacaattatcaacactagatttacaa
cataatgagttactagatataccagaaacaattggtaatttaatagctgttacaagactt
ggattaagatataatcgtttatcttgtataccaaaatcattatcaaattgtaaatttatg
gatgaatttagtgttgaaggtaatcaagtatcacaattaccagatggtttattaacaagt
ttatcggatttaacaacaataacattatcaagaaattgttttacatcatatccatctggt
ggtccattacaatttacaaatgttgattcacttaatatggaacataatcaaattgataaa
attccatatggtatattttcacgtgctaaaaatttaacaaaattaaatatgaaagaaaat
caacttagtgccttgccacttgatattggaacttggataaatatggttgaattaaatctt
ggaacaaatcaattatctaaaattccagatgacattgaacgcttagaaaatcttgaaatt
ttaatattatcaaataatttattacgtaaaataccaacaagtattaaaaatcttaaaaaa
ttacgtatactagatcttgaagaaaataaaattgaaatattaccaaatgaaattggtttt
cttcgtgatttacaaaaattgatattacaatcaaatcaagttacaacattaccacgtgct
attggacatttacaaaatttaacatatttatcaattggtgaaaataatttaaattattta
ccagaagaaattggtacacttgaaaatttagatacactttatattaatgataatattaat
ttacataatttaccatttgaattggcattatgtacaaatttaagtataatgtctattgaa
aattgtccattatcaaaaatacctggtgaaattgtatcaggtggtccatcatttgtcata
caatttttaaaaatgcaaggaccttacagatccatgtaa
DBGET
integrated database retrieval system
