Aphidius gifuensis: 122854884
Help
Entry
122854884 CDS
T07796
Name
(RefSeq) putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12
KO
K18409
ATP-dependent RNA helicase TDRD12 [EC:
5.6.2.5
]
Organism
agif
Aphidius gifuensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
agif00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
agif03036
]
122854884
Enzymes [BR:
agif01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.5 RNA 5'-3' helicase
122854884
Chromosome and associated proteins [BR:
agif03036
]
Eukaryotic type
Gene silencing
piRNA pathway
122854884
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DEAD
TUDOR
Helicase_C
ResIII
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122854884
NCBI-ProteinID:
XP_044011847
LinkDB
All DBs
Position
LG1:complement(23909314..23952935)
Genome browser
AA seq
1004 aa
AA seq
DB search
MPLKTGDPIIPATAVEMKVVKYLNPYQMIGYDVKEHKKILVQLSKILPKMVLTNRKHQTH
LDTLVENGTKVILRGRIEDWNDIPCWWCRGEIIGSCKDDENKLNYDVYLIDFGKIVKIDR
SEFTTVPSESFNDYPSMAINFGLYNILPAYERKKKIDKNSTELVIVKKWQEEAINLTLQL
LSASKITYFNQIAVDENKKKYGEIYLSIDDRICALRKILVYSCLATYVSPEIRTILTNIN
NGKNIKNEIIITNNVPYLEPFDTKNISDKSSNTKSSSSSSSETTKFAKNSNDYLIVSKVQ
VDGLPCLAEAKFPYDIHKNLSSMKITSLRNIQSLVWPAITKGLDVLAIGPTGCGKTLSYV
PPISSIIAKTRNERYDTYPMALVICANTNDVIDISNLFQGLLENYDKINIISAYNGRPDR
TISSLIINGCHIIVSTAPYLLRYLSKDESHCKILNLKYLRHIIVDRVDVILEKHKKPLTE
LFKKYTPIGRDKFRNMENTTIQFIAVAEKWSTNVGQFAGLFTNPYTCITSFPDAVICCGI
KPVLRLIHKIDKSDKIIQLLGDNWKTLKTVIVCTNKEEVNELKKSLSSTHDLIILDEDIL
NIEKNKQLWNISKCGTYSILICTDSLLSEIGIRDADWLIHYSVSTKTKSIFYNRFVTLMD
KLKNEKQKLVTIFIDETNDEQLRGVIDLIKRSGGKLLGKELQSIEKICANWDRKKKEYSL
CDNVKSLGTCTQIGKCPYRHFVLTNIDSPITPIVIGYKIKMIITWVHSATHFSARIFEYK
NMADKIYKLDESQHLMIPIKIQSYLSRQENREIPRIIEVGGIYGYDEGFKNYKRVQVIHI
ISRDKFNAPLYVAIRIIDTGMIVHKIRVSQLLKLSDDLINEPQNIMEIFIANILPYDDEE
EWSNAAGLSTKEWLKKHVVGDAFLQGKVLLHLGNTFWVDSLDITDNFPGRSEDVTIASLQ
KHLIKCRYGIYSERHMNELMKICPSEEIDNTPTSISSSNTVIGC
NT seq
3015 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccattaaaaactggtgatccaattattccagcaacagctgtcgagatgaaagttgta
aaatatctcaacccatatcaaatgattggatatgatgtgaaagaacacaaaaaaatatta
gtacaactcagtaaaattttgccaaaaatggttttaactaatcgcaagcatcaaacacac
ttggatactcttgttgaaaatggaactaaagttattttaagaggtcgtattgaagactgg
aatgatataccttgttggtggtgtcgtggagaaataattggatcatgtaaagatgatgaa
aataaattaaactatgatgtttatttaattgactttggaaaaatagttaaaatagataga
tcagaatttaccacagttccaagtgaatcatttaatgattatccatctatggcaattaat
tttggtctttataatattttaccagcttatgaacgtaaaaaaaaaattgacaaaaattca
acagaacttgttattgtaaaaaaatggcaagaagaagccattaatttaactctgcaatta
ttatcagcatcaaaaataacatattttaatcaaatagcagtcgatgaaaacaagaaaaaa
tatggtgaaatttatctgtcaattgatgatcgtatatgtgcactgagaaaaatacttgta
tactcatgtttggcaacatatgtaagccccgaaatacgtacaatactgacaaatattaat
aatggtaaaaatattaaaaatgaaataattatcacaaataatgtaccatacttggagcca
tttgatacaaaaaatatatctgataaatcatccaatacaaaatcatcatcatcatcatca
agtgaaacaacaaaatttgctaaaaatagtaatgattatttgattgtcagtaaagtacaa
gttgatggattgccatgtttagctgaagcaaaatttccatatgatatacataaaaattta
tcatcaatgaaaataacaagtttacgtaatatacaatcacttgtttggccagcaataaca
aagggtcttgatgtattggcaattggtccaactggttgtggtaaaacattatcatatgta
ccaccaatttcaagtattattgctaaaacaagaaatgaaagatatgatacatatccaatg
gcacttgttatttgtgcaaatacaaatgacgttattgacatcagtaatttatttcaagga
ttacttgaaaattatgataaaataaatattatatctgcatacaatggtcgtccagataga
acaatatcaagtctcattataaatggttgtcatattattgtatcaacagcaccatattta
ttgagatatttatcaaaagatgaaagtcattgtaaaatattaaatttaaaatatttacga
catattattgttgatcgtgttgatgttatattggaaaaacacaagaaaccattaactgaa
ttatttaaaaaatatacaccaattggaagagataaatttcgtaatatggaaaatacaaca
atacaatttattgctgttgctgaaaaatggtcaacaaatgttggacaatttgctggttta
tttacaaatccatatacatgtataacatcatttcctgatgctgttatatgttgtggtatt
aaaccagtattacgtttaattcataaaattgataaatcagataaaattattcaattactt
ggtgataattggaaaacattaaaaaccgttattgtttgtactaataaagaagaagttaat
gaactaaaaaaatcattatcaagtactcatgatttaataatactagatgaagatatatta
aatattgaaaaaaataaacaattatggaatatcagtaaatgtggaacatattcaatatta
atatgtactgattcattattatcagaaattggtataagagatgctgattggttaatacat
tattctgtatcaacaaaaacaaaatcaattttttacaatagatttgtaacacttatggat
aaattaaaaaatgaaaaacaaaaattagttacaatatttattgatgaaacaaatgatgaa
caattaagaggtgttattgatttaataaaaagatctggtggtaaattattaggtaaagaa
ttacaaagtattgaaaaaatatgtgcaaattgggatagaaaaaaaaaagaatattcttta
tgtgataatgttaaatcacttggtacatgtacacaaattggtaaatgtccatatcgtcat
tttgtattaacaaatattgattcaccaataacaccaattgtcattggttataaaattaaa
atgattataacttgggttcacagtgcaacacatttttcagcaagaatatttgaatataaa
aatatggctgataaaatttataaacttgatgaatcacaacatttaatgataccaattaaa
attcaaagttatttatcacgtcaagaaaatcgtgaaataccaagaataattgaagttggt
ggtatttatggatatgatgaaggttttaaaaattataaaagagtacaagttattcatatt
ataagtagagataaatttaatgcaccactttatgttgcaattagaattattgatacagga
atgattgtacataaaataagagtatcacaattactcaaattaagtgatgatttaataaat
gaaccacaaaatattatggaaatatttatagcaaatatcctaccttatgatgatgaagaa
gaatggagtaatgctgctggtttatcaacaaaagaatggcttaaaaaacatgttgttggt
gatgcatttttacaaggaaaagtattacttcatttgggaaatacattttgggttgattca
cttgatataactgataattttcctggtcgatcagaagatgttactattgcttcattgcaa
aaacatttaattaaatgtcgttatggcatttacagtgaacgtcatatgaatgaattgatg
aaaatttgtccatctgaagaaattgataatacaccaacatcaatatcatcttcaaatact
gtgataggttgttga
DBGET
integrated database retrieval system