Aphidius gifuensis: 122855243
Help
Entry
122855243 CDS
T07796
Name
(RefSeq) transcription elongation factor SPT6
KO
K11292
transcription elongation factor SPT6
Organism
agif
Aphidius gifuensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
agif00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
agif03021
]
122855243
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
agif03036
]
122855243
Transcription machinery [BR:
agif03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase II system
Other transcription-related factors
Transcription elongation factors
122855243
Chromosome and associated proteins [BR:
agif03036
]
Eukaryotic type
Nucleosome assembly factors
Histone chaperones
Other Histone chaperones and regulators
122855243
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SH2_2
HHH_7
YqgF
HTH_44
SPT6_acidic
S1
SH2
HHH_3
HHH_9
Spt6_S1
Tex_central_region
Tex_N
Tex_YqgF
OB_RRP5_4th
S1_RRP5
HTH_10
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122855243
NCBI-ProteinID:
XP_044012392
LinkDB
All DBs
Position
LG4:complement(16037975..16044269)
Genome browser
AA seq
1743 aa
AA seq
DB search
MDFVDHEAEESEDEHEFNSKKIKKSKIMDESEEEEDDDEDKIREELKDLIDDAPIDESEG
DDSDASDGSKKRKKSDDDDDEDDDRLEDDDYDLLEENLGFTVERKRFKRLKKMQNRESDD
EEEAHNGDDRDAIANELFDGDEDERQSVRSHRQEPEVFDEDGSEGDYSDADDFIVDDEGR
PIAERRKKKKAIFADAALQEAQDIFGVDFDFDEFDKYGEDDYDEEADEEEEDEYIEEDGE
HERVRRPKKQPKKKSSRKSIFDVYEPSDLKRGHFTDLDNEIRMKDVPERMQLRSMPVTKV
DEDSDELELESEWIYKQAFEKPTISNQDSHLNIEAKDRDRKGPQIIGKIKTALDFMRNQD
FEVPFISFYRKEYVTDLNINDLWKIYKYDAKWCQLRQRKENLTRLFEKMRDYQLDQMMKN
PDAPLPDNIRVIKDDDIERLKNVQTNEELNDVHQHFMLYYSHDIPAMQESVRQKEKEQKK
QEKIQKRQQAILEAEENGEEPPPEDPLDADDNEEQGETLKQAIRTGPYILCRKAGLDSFA
KKFGLTPEHFAENLRDNYQRHEVDQEPIEPLIVAQDYLGPAFSNPEEVLKAVQLMVAIQL
AREPLVRKNVREMYMERAKISVKPTKIGLKMIDEAHPIYTMKYLRDKPVRDLTGDQFLKL
SVAEEDKLITITLSDIIDGLTSNNYVNEIKQLYIRDEFSKNVQDWNNLRVGSVEKALNEM
VIPSLKKELKTTLIAEAKDSVMKACCRKLYNWIKIAPYTCECPDLDDDEWDTSKGLRIMA
ISYVPDYTQAAFMCIISPDGECTDYLRLPNLLKRENSFRKDEKKLKEADLLSIRNFMSNK
KPHGVVIGGESREALMIAADITKCIATLAEDEGFPPIKVEICDNHLAKVYANSNKGMTEF
RDYPELLREAISLARRLQDPLVEFSQLCTPDEEILCLRYHPLQNYLAKEELLENLYLEFV
NRVNEVGVDINKAVQQSYSGNLLQFVCGLGPRKAAAFIKMLKQSNHRLENRTQLVTFCHM
GPKLFINCAGFIKIDTNSLGDSTEAYVEVLDGSRVHPETYEWARKMAVDALEYNDEDAAG
ALEEILNAPKRLKDLDLDAFAEELERQGFGNKCVTLYDIRSELNCRYKDLRTPYQSPSPE
KLFDILTKETPETFYIGKRIEAVVIGISRRRPQGEQLDETTPVKNDNTGLWQCPFCLKKD
FSELSDVWNHFDNGSCPGKAIGIKLKLDNGISGFIHIKNLSDKHVTDPEERVRIGQTVHC
RIIKIEVDRFSVDCTSKSNDLMDVNHEWRPQKDPFYDNEQEQKDLAYDENGKKKKNTQTY
LTRVITNSYFKNIDYSEAEKIMKHEDTKQGDAIIRPSRKGTDHLTVTWKVTDGIFQHIDV
KEEDKPNDFSLGKRLYIKSIQFDDLDEIIANYINPMASNVMEILDYKYYKPDVLGDKLKA
EEILKIQKHDNPNSIPYIVSASKKAPGNFLLSYLPRVQVKHEYIQVTPADFQYRFKKFKS
FNALINWFKLNFREAIPGQATPSTSRTPYHTTPGMPSGMNHQEEAIHRVAQNLPHHMLHS
LSQVANHTPHHYPPHTPSAVTGASGYGNAYPPTTPYTPSGQTPFMTPYQTPHHAQPTPRY
GQQTPNNHSFAHPPAPSHRRSSHHHGKSSSSNDQDNTDWEKAAVAWASQVSAPRGSNTTP
RYEESRKTPRSYHEFSSGRQTPRSSGPSARTPAYKSPRGTPHTNSSPRSMSLSGDGTPLY
DES
NT seq
5232 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattttgtagatcatgaagctgaagagagtgaggatgaacacgaatttaattctaaa
aaaattaaaaaatcaaaaataatggatgaaagtgaagaagaggaagatgatgatgaggat
aaaattcgagaagaattaaaagatttaattgatgatgcaccaattgatgagagtgaagga
gatgacagtgatgcttctgatggttcaaaaaaaagaaaaaagagtgatgatgatgatgat
gaggatgatgatagacttgaagatgatgattatgatcttcttgaagaaaatttaggcttt
acagttgaaaggaaaagatttaagcgtttgaaaaaaatgcaaaatcgtgaatctgatgat
gaagaagaagctcataatggtgatgatcgtgatgcaattgcaaatgagctttttgatggt
gatgaagatgaacgtcaaagtgtacgtagtcatcgacaagaaccagaagtatttgatgaa
gatggaagtgaaggagattattcagatgctgatgattttattgttgatgatgagggaaga
ccaatagctgaaagaagaaagaaaaaaaaagcaatatttgctgatgcagcattacaagaa
gctcaagatatatttggtgttgattttgattttgatgaatttgacaaatatggtgaagat
gattatgacgaagaagctgatgaagaagaagaggatgaatatattgaagaagatggtgaa
catgaacgtgttagacgtcctaaaaaacaaccgaaaaaaaaatcatcacgtaaaagtata
tttgatgtttatgaaccaagtgatttaaaaagaggacattttactgatttagataatgaa
atacgtatgaaagatgtaccagaacgtatgcaattacgttcaatgcctgtaacaaaagtt
gacgaagattcagatgaattagaattagaatctgaatggatatataaacaagcatttgaa
aaaccaacaatatcaaatcaagattcacatttaaatattgaagctaaagatagagatcgt
aaaggtccacaaataattggtaaaattaaaacagcacttgattttatgagaaatcaagat
tttgaagtaccatttatttcattttatagaaaagaatatgttactgatttaaatataaat
gatctttggaaaatttataaatacgatgcaaaatggtgtcagttacgtcaaagaaaagaa
aatttaacaagattatttgaaaaaatgagagattatcaacttgatcaaatgatgaaaaat
cctgatgctccattaccagataatattagagttataaaagatgatgatattgaacgttta
aaaaatgttcaaacaaatgaagaattaaatgatgttcatcaacattttatgttgtattat
agtcatgatattccagcaatgcaagaatcagtaagacaaaaagaaaaagaacaaaaaaaa
caagaaaaaatacaaaaaagacaacaagcaatattagaagctgaagaaaatggtgaagaa
ccaccaccagaagatcctcttgatgctgatgataatgaagaacaaggtgaaacattaaaa
caagcaattcgtactggaccatatatattatgtagaaaagctggtcttgattcatttgct
aaaaaatttggtttaacaccagaacattttgctgaaaatttacgtgataattatcaacgt
catgaagttgatcaagaaccaattgagccacttattgttgctcaagattatcttggtcca
gcatttagtaatccagaagaagttcttaaagctgtacaacttatggttgcaatacaatta
gctcgtgagccacttgtaagaaaaaatgttagagaaatgtatatggaacgtgctaaaata
tctgttaaaccaacaaaaattggattaaaaatgattgatgaagcacatccaatatataca
atgaaatatcttagagataaaccagtacgtgatttaactggtgatcaatttttaaaatta
tctgttgctgaagaagataaattaataacaataacattaagtgatattattgatggttta
acaagtaataattatgttaatgaaataaaacaattatatattagagatgaatttagtaaa
aatgtacaagattggaataatttaagagttggaagtgttgaaaaagctttaaatgaaatg
gttattccaagtttaaaaaaagaattaaaaacaacattaattgctgaagcaaaagattca
gttatgaaagcttgttgtagaaaattatataattggattaaaatagcaccatatacatgt
gaatgtcctgatttagatgatgatgaatgggatacaagtaaaggtttaagaataatggct
atttcatatgtaccagattatacacaagcagcatttatgtgtattatatcaccagatggt
gaatgtacagattatttaagacttccaaatttattaaaaagagaaaatagctttagaaaa
gatgaaaaaaaattaaaagaagctgatcttttatcaattagaaattttatgtcaaataaa
aaaccacatggtgttgttattggtggtgaatcaagagaagcacttatgattgctgctgat
ataacaaaatgtattgcaacacttgctgaagatgaaggttttccaccaattaaagttgaa
atatgtgataatcatcttgctaaagtatatgctaatagtaataaaggaatgacggaattt
cgtgattatccagaattattacgtgaagcaatatcacttgcacgacgtttacaagatcca
cttgttgaattttcacaactttgtacacctgatgaagaaattttatgtttacgttatcat
cctttacaaaattatttagcaaaagaagagttgttagaaaatttatatcttgaatttgta
aatcgtgttaatgaagttggtgttgatattaacaaagctgtacaacaatcatattctggt
aatttattacaatttgtatgtggtttaggaccaagaaaagctgcagcatttattaaaatg
cttaaacaatcaaatcatcgtcttgaaaatcgtacacagttagttacattttgtcatatg
ggtccaaaattatttataaattgtgctggttttattaaaattgatacaaatagtcttggt
gatagtacagaggcatatgttgaagtattagatggttcacgtgtacatcctgaaacttat
gaatgggcaagaaaaatggctgttgatgcacttgaatataatgatgaagatgcagctggt
gcattagaagaaatattaaatgcaccaaaaagactaaaagatcttgatcttgatgcattt
gctgaagaattagaacgtcaaggttttggtaataaatgtgttacactttatgatattaga
tctgaattaaattgtcgttataaagatcttcgtacaccatatcaatcaccaagtccagaa
aaattatttgatatattaacaaaagaaacaccagaaacattttacattggtaaaagaatt
gaggctgttgttattggtattagtagaagaagaccacaaggtgaacaattagatgaaaca
acaccagttaaaaatgataatactggtctttggcaatgtccattttgtcttaaaaaagat
ttttctgaattatctgatgtatggaatcattttgataatggttcatgtccaggaaaagct
attggtataaagcttaaattagataatggtatatctggttttatacatattaaaaattta
tcagataaacatgttactgatccagaagaacgtgttagaattggacaaacagtacattgt
cgtattattaaaattgaagttgatagatttagtgttgattgtacaagtaaaagtaatgat
cttatggatgttaatcatgaatggcgtccacaaaaagatccattttatgataatgaacaa
gaacaaaaagatttagcatatgatgaaaatggaaaaaagaaaaaaaatacacaaacttat
cttacaagagttataacaaatagttattttaaaaatattgattattcagaagctgaaaaa
attatgaaacatgaagatacaaaacaaggtgatgctattatacgtccaagtcgtaaaggt
actgatcatttaacagtaacatggaaagtaactgatggaatatttcaacatattgatgtt
aaagaagaagataaaccaaatgatttttcattaggtaaaagattgtatattaaatcaatt
caatttgatgatcttgatgaaattattgcaaattatattaatccaatggcatcaaatgtt
atggaaatacttgattataaatattataaaccagatgtacttggtgataaattaaaagct
gaagaaatattaaaaattcaaaaacatgataatccaaatagtataccatacattgtatca
gcatcaaaaaaagcacctggtaattttttattatcatatttaccacgtgtacaagttaaa
catgaatatatacaagtaacaccagctgattttcagtatcgttttaaaaaatttaaatca
tttaatgcattaattaattggtttaaattaaatttccgtgaagcaatacctggtcaagca
acaccaagtacatcaagaacaccatatcatacaacaccaggtatgccaagtggtatgaat
catcaagaagaagctattcatcgtgttgcacaaaatttaccacatcatatgttacattca
ttatcacaagttgctaatcatacaccacatcattatccaccacatacacctagtgctgta
actggtgctagtggttatggtaatgcatatccaccaacaacaccatatacaccatctggt
caaacaccatttatgacaccttatcaaacaccacatcatgctcaaccaacaccacgttat
ggtcaacaaacaccaaataatcattcatttgcacatccacctgcacctagtcatcgtcgt
agttcacatcatcatggtaaatcatcatcttccaatgatcaagataatacagactgggaa
aaagctgcagttgcatgggcaagtcaagtatcagcaccacgtggatcaaatacaacaccg
cgttatgaagaatcaagaaaaacaccaagaagttatcatgaatttagtagtggtagacaa
acaccaagaagctctggtccatctgcacgtacaccagcttataaatcaccaagaggtaca
cctcatactaattcaagtcctcgaagtatgtcattgtctggtgatggtacaccattgtac
gatgaaagttga
DBGET
integrated database retrieval system