Aphidius gifuensis: 122856291
Help
Entry
122856291 CDS
T07796
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: helicase domino-like
KO
K11661
helicase SRCAP/SWR1 [EC:5.6.2.-]
Organism
agif
Aphidius gifuensis
Pathway
agif03082
ATP-dependent chromatin remodeling
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
agif00001
]
09120 Genetic Information Processing
09126 Chromosome
03082 ATP-dependent chromatin remodeling
122856291
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
agif03036
]
122856291
Chromosome and associated proteins [BR:
agif03036
]
Eukaryotic type
Chromatin remodeling factors
SRCAP complex
122856291
SWR1 complex
122856291
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
Helicase_C
HSA
Rieske_4
Myb_DNA-binding
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122856291
NCBI-ProteinID:
XP_044013920
LinkDB
All DBs
Position
LG5:6289830..6307195
Genome browser
AA seq
3064 aa
AA seq
DB search
MSDKQGAPTLPPLSGGGSNNNGGNPGNNNTQQTTLSIQQVLATGQGLNVITTSGQQFVIT
SQVPGLNQMITSSTTNAGIQQVGVTRIVNINNQTPRVVGVATSSGGTTSSTPNRINTTKV
VLSTSPKLIKTSIGNMFLTPTSVASLNTSSPPLKKLKLNDTNDKSTLNDDTICYRNRIMD
SKIHRMSSLRDKYIDNVTELYYLLNDGNMMDFQYWRKKLPTSDYLKFLKSQKLDANDNDE
DLLAPMTTVINNLLKNTNLLTNSNEVKVSGVGVTPIAVSTTLPAAVAQLSQQVGQLPGRP
QGGRHGMIFAIRTSIQPPTITVHPPPNTSTIAPTIIIGGTPTPSTLEPVKISSISQVPVS
STSTTTATTAAVTTATTTVTTTAVAPIVTKAVITTTTLTTAAPTATTTQSITSTTSTVKT
TTTASISTAITSASVSQPVVKLVKLPQQQVPSPTTSTSSSPSSSSLITNDCHNNQEQIVE
KAKQEAYVMQRINELQRDGLWSERRLPKIQEPTRTKAHWDYLLEEMVWLAADFAQERKWK
KAAAKKCARMVQKHFQEKAIQALKAEKLQELRLKKIAGFVAKEVKXTNVEKLVEIKQQTK
LEEKRKKALDQHLNFIVGQTEKYSTWLTEGLNKTDGNQSVPASINSSRISSPVPTSKTNS
DDEFEPNQCSDDDEETIAKAEEEMKSMNHKEEVELLKKESELPLEDLLKELPPNYLEERD
QELQINNEEEQGGEEEGEDNDDVVEGEEEDDDEEEKSQQDNENNADDEFHIASGESTDDD
EDTIMEQEKNESKIDHKQEIDDLNAENEMSIDELMAKYSGLNQQPMEVEDDSDDQDSEKE
SEKAVDDDEDDDKSSSECDSDDETTEKLQNQSDDETSIGLKSLFEDFDKSNVEQSSQSDT
HDEMDDVAALAESIQPKGNTLLTTSVVTKIPFLLKHSLREYQHIGLDWLVTMFDRKLNGI
LADEMGLGKTIQTIALLSHLACEKGNWGPHLIIVPTSVMLNWEMECKKWCPGFKILTYYG
TQKERKQKRTGWTKPNAFHICITSYKLVIQDHQSFRRKKWKYLILDEAQNIKNFKSQRWQ
LLLNFQTQRRLLLTGTPLQNNLMELWSLMHFLMPNVFQSHREFKEWFSNPVTGMIEGNNQ
FNENVIRRLHKVLRPFLLRRLKCEVEKQLPKKYEHVIMCRLSKRQRFLYDDFMSRAKTKE
TLASGNLLSVINVLMQLRKVCNHPNLFEVRPTVSPFRMEVLEYITASLVWNALDYNPMKH
VDLNYLNLNLINYEKTITAFASHRVRKCQVPRKLIEEIDTQPLPPPKCPSGKIKINVRLS
NQVKAPPTIPQMNQQKIKNISSLLPSSSSNTSITNKSGNNGQGVTLRVASGQQLQGYAVQ
IVQHQCNVKAIPVAHTSQVSTSLATTTTTTTTTSSTSLTTLTTTPSTSNTSRITVSNPTM
RDVIPRLTFKSGENLQRINVPSFAQFVHTPTGRQIILTSSQSNTSSTVSFPVMTTTSGQR
LTVLSPKIMGLSSAVTGRPVMRVPPLSVTTTQSSPTTLSSSSSSSSSLSSSSSSTSGQLR
CGIVTKNIQKDCNNQQQKLRALKEAPKSEFYIQDIDNERRKKRINKLQTIANINSQRCSV
CPLYGDDLFMALRIDKPSNCCKWNSGWLHIKNTKKSLRTRNEYFSTTNTLNNTIKTTDKI
VDDLKVIFDKYLCYVPAVTAPMPRIHVSHPSQHKYNSEKYYKTIFEKKLVKKIDILHPII
SSMMTQFPDPRLIQYDCGKLQSLDNLLRKLKTDYHRVLLFTQMTRMLDVLEAFLNYHGYI
YLRLDGTTKIDQRQILMERFNNDKRIFCFILSTRSGGVGVNLTGADTVIFYDSDWNPTMD
AQAQDRCHRIGQTRDVHIYRLISEKTIEENILKKANQKRMLGEMAIENGNFTTAYFKSST
IQDLFNVDNDGDATTRMADVVQLNKEREKNRNNKIDNAIASGSGGSGGGQQEEKIAMGAL
ESALAAVEEDLDVQAAKIAKAEAVADLAEFDENIPLDDYDKDDQQISKAELEVQTIISQL
KPIERYAMHFVEETEDCFSAAQLAAAEAQLEQQKRDWEIDRLRALREEEDRRMRMTEDDD
KSLTYTREDAQNQIWLSDNTMEAMPMWCPSTPPTSDDDVYVDFSMDFLYDSTPIPECDLP
PVYIKKELKRPRVETTTNQTTTTTTTTSISASTNDRDNRKVQKRHKDDSVHAPRSLFDRP
SAALVKMRRYKNHKNIVVNNNGSNSNQRPSITLPVAGTAGGVSASGGGGSTGGVKTSTSI
VKINDYDFILEWLIHEDIAILQTIQGYQNLSLGLVIISPGHTPNWDLVSDYVNNTSRIYR
SPKQCRSRYDSVIVPREEGKLLYDTLPKKQKKQKGIYKNQFEQQQQQQQQQNQQQQQTAK
ANRPMRTSQLFNQDKNLNFTTLLCARFDMIKTVSNKRTPAAKSIITNSTGKNSKHASVLA
DWGIKYDTPLTPTEVALKRAERIAKEKLKNTTTDQQQLAVQRLAQQQAAAVQAAAVQAAA
AAQAAAAAAAASLAHQAQPVVAAAQSQTSRISTPPPAVTAAIAGTTTPTTNQLPQINTLV
AQKSQVPMNVAISTPQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQHHHQQQSTVVTTPKIRQASS
IATQETNRSPATIVPVGNIQQQQQTGGQRLTTTPTNIVASQNQSVVTPKGVLNVTVAPGV
NNKSLTHGQLQFQLNRQQQQRQSLMNQQKILLHNQQSGQKVVAVGNQHSRAALMKQATAA
VNQGIIDKQQRSQFPEFAAILQKKGLTQAQQKAAIGQLQLTSSGQNIVSTINSATQAHIF
AQAGLQQAGASSSSSSSSPSTTTGSNNSNNNNNNLSTLVKASMQNIRTGTPSSIRSLSVP
AQTLARGNKTSGQQKMTQLTQQLPGKSGVQKLLVHPQQQQQQQQQQQQQQQQQLNTNVSV
QMVKFPSNVQQQFAHVSTGQTVTQSGQVVLSKSPMQARVIPVSVGSNTSLKQTMQVVGSN
AQLRHVTGKPIVTTPRGSPGHGQQIRIHQSLQQAQQQVQQQLQQQGQQQGQQQQQQQQQG
DLQK
NT seq
9195 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtgataaacagggcgcgcctactttgccgcccctgtctgggggtggaagtaataat
aatggtggtaatccaggtaataataatacccaacaaacaactcttagtatccagcaagta
ttggctactggacaaggactcaatgtcatcacaacaagtggacaacaatttgtcattaca
tcacaagtacctggacttaatcagatgataacgagttcaacaacaaatgctggtattcag
caagttggtgttaccaggatagtcaatataaataatcaaacaccacgtgttgttggtgtt
gcaacttctagtggtggtacaacatcatcaacaccaaatcgtataaatacaacaaaagtt
gtattatcaacatcaccaaaattaataaaaacatcaattggtaatatgtttttaacacca
acatcagttgcatcattaaatacatcatcaccaccattaaaaaaattaaaattaaatgat
acaaatgataaatcaacacttaatgatgatacaatatgttatcgtaatcgtattatggat
agtaaaattcatagaatgagttcattacgtgataaatatattgataatgtaactgaatta
tattatttattaaatgatggtaatatgatggattttcaatattggagaaaaaaattacca
acatctgattatttaaaatttttaaaatcacaaaaacttgatgcaaatgataatgatgaa
gatttattagcaccaatgacaacagttattaataatttattaaaaaatacaaatttatta
acaaattcaaatgaagttaaagtaagtggtgttggtgttacaccaattgctgtatcaaca
acattaccagcagctgtagcacaactaagtcaacaagtaggtcaattaccaggtagaccc
caaggtggtcgtcatggcatgatttttgctataaggacgtctatacaaccaccaacaatc
acagttcaccctccacctaatacttctactattgcacctaccataattataggtggaaca
ccaacaccatcaactctagagccagtaaaaatatcatcaatatcacaagtgccagtgtca
tcaacatcaacaacaacagcaacaacagctgcagtaacgacagcaacaacaacagtaaca
acaacagcagtagctccaattgttacgaaagcagtaataacaacaacaacactaacgact
gcagcaccaacagcaacaacaactcaatcaataacatcaacaacatcaacagttaaaaca
acaacaacagcatcaatatcaacagctataacatcagcaagtgtatcacaaccagttgtt
aaattagttaaattaccacaacaacaagtaccatcaccaacaacatcaacatcttcatca
ccgtcatcatcatcattaattacaaatgattgtcataataatcaagaacaaattgttgaa
aaagctaaacaagaagcatatgttatgcaaagaataaatgaattacaacgtgatggttta
tggtcagaaagaagattacctaaaattcaagaaccaacacgtacaaaagcacattgggat
tatttacttgaagaaatggtatggcttgctgctgattttgcacaagaaagaaaatggaaa
aaagctgctgctaaaaaatgtgctagaatggtacaaaaacattttcaagaaaaagcaata
caagcacttaaagctgaaaaattacaagaacttagacttaaaaaaattgctggttttgtt
gctaaagaagttaaanngacaaatgttgaaaagctagttgaaattaaacaacaaacaaaa
cttgaagaaaaacgtaaaaaagcacttgatcaacatcttaattttattgttggtcaaact
gaaaaatattcaacatggttaacagagggtcttaataaaacagatggtaatcaaagtgta
ccagcatcaataaatagttcacgtatatcatcaccagtaccaacaagtaaaacaaattca
gatgatgaatttgaaccaaatcaatgttcagatgatgatgaagaaacaattgcaaaagct
gaagaagaaatgaaatcaatgaatcataaagaagaagttgaattattaaaaaaagaatct
gaattaccattagaagatttacttaaagaattaccaccaaattatttagaagaaagagat
caagaattacaaataaataatgaagaagaacaaggtggtgaagaagaaggtgaagataat
gatgatgtagtagaaggagaagaagaagatgatgatgaagaagaaaaaagtcaacaagat
aatgaaaataatgctgatgatgaatttcatatagctagtggtgaatcaactgatgatgat
gaagatacaattatggaacaagaaaaaaatgaaagtaaaattgatcataaacaagaaatt
gatgatttaaatgctgaaaatgaaatgtctattgatgaattaatggctaaatacagtggt
ttaaatcagcaaccaatggaagttgaagatgacagtgatgatcaagattctgaaaaagaa
tcagaaaaagctgttgatgatgatgaagatgatgataaatcatcaagtgaatgtgacagt
gatgatgaaacaactgaaaaattacaaaatcaaagtgatgatgaaacaagtattggtctt
aaatcattatttgaagattttgataaaagtaatgttgaacaatcatcacaatcagataca
catgatgaaatggatgatgttgctgcacttgctgaaagtatacaaccaaaaggaaataca
ttattaacaacaagtgttgtaacgaaaattccatttttattgaaacattcacttcgtgaa
tatcagcatattggattggactggttggtgacaatgtttgatagaaaattaaatggtata
ttagctgatgaaatgggtcttggtaaaacaattcaaacaatagcattattatcacattta
gcatgtgaaaaaggtaattggggaccacatttaataatagtaccaacatcagttatgctt
aattgggaaatggaatgtaaaaaatggtgtcctggttttaaaatattaacatattatggt
acacaaaaagaacgtaaacaaaaaagaactggatggacaaaaccaaatgcatttcatatt
tgtataacatcatacaaattagtcattcaagatcatcaaagttttcgtagaaaaaaatgg
aaatatttaattcttgatgaagcacaaaatattaaaaatttcaaatcacaaagatggcaa
ctactgcttaattttcaaactcaaagacgattattattgactggtactccgttacaaaat
aatttaatggaattatggtctttgatgcattttttaatgccaaatgtatttcaatcacat
cgagaatttaaagaatggttcagcaatccagtgactggaatgattgaaggaaacaatcaa
ttcaacgaaaatgttattcgtcgtcttcacaaggttttacgtccatttttattacgaaga
ttaaagtgtgaagttgaaaaacaattgccaaaaaaatatgaacacgttataatgtgtaga
ttatcaaaacgtcaaagatttttgtatgatgattttatgtcacgtgctaaaacaaaagaa
acacttgcaagtggtaatttattaagtgtaataaatgtactgatgcagctacgtaaagta
tgtaatcatccaaatttatttgaagtacgtccaacagtatcaccatttcgtatggaagta
ttagaatacataacagcatcattagtatggaatgcacttgattataatccaatgaaacat
gttgatttaaattatttaaatttaaatcttataaattatgaaaaaacaataacagcattt
gcatcacatcgtgtacgtaaatgtcaagtaccacgtaaattaattgaagaaattgataca
caaccattaccaccaccaaaatgtccatctggtaaaattaaaataaatgttagattatca
aatcaagttaaagcaccaccaacaataccacaaatgaatcaacaaaaaattaaaaatata
tcaagtttattaccatcatcatcaagtaatacatcaattacaaataaaagtggtaataat
ggacagggtgttacattgagagttgctagtggacaacaattacaaggctatgcagtacaa
attgtacaacatcaatgcaatgtaaaagcaattccagttgctcatacatcacaagtatca
acatcattagccacaacaacgacgacaacaacaacaacatcatcaacatcattaacaaca
ttaacaacaacaccatcaacatcaaatacatccagaataacagtatcaaatccaactatg
cgtgatgttataccacgtttaacttttaaatcgggtgaaaatttacaacgtattaatgta
ccaagttttgctcaatttgtacacacaccaactggtagacaaataatattaacatcaagt
caatcaaatacatcatcaacagtatcatttccagtaatgacaacaacaagtggtcaaaga
ttaacagtattatcaccaaaaataatgggtttatcatcagcagttactggacgtccagtt
atgcgtgtaccaccattaagtgttacaacaacacaatcatcaccaacaacattatcatca
tcgtcatcttcttcttcttcattatcatcgtcatcttcttcaacaagtggacaattacgt
tgtggtattgttacaaaaaatatacaaaaagattgtaataatcaacaacaaaaattacgt
gcattaaaagaagcaccaaaatctgaattttatatacaagatattgataatgaaagacgt
aaaaaacgtattaacaaattacaaacaattgcaaatataaattcacaaagatgttcagta
tgtccattatatggtgatgatttatttatggcattaagaattgataaaccatcaaattgt
tgtaaatggaattctggttggttacatattaaaaatacaaaaaaatcattaagaacaaga
aatgaatattttagtacaacaaatacacttaataatacaattaaaacaactgataaaatt
gttgatgatttaaaggtaatatttgataaatatttatgttatgtaccagcagttacagca
ccaatgccacgtatacatgtatcacatccatcacaacataaatataattctgaaaaatat
tataaaacaatatttgaaaaaaaattagttaaaaaaattgatatattacatccaataata
tcatcaatgatgacacaatttcctgatccacgtttaatacaatatgattgtggtaaatta
caatcattagataatttattaagaaaattaaagactgattatcatcgtgtattattattt
acacaaatgacaagaatgcttgatgtattagaagcatttttaaattatcatggttatatt
tatttacgtttagatggtacaacaaaaattgatcaacgacaaatactaatggaaagattt
aataatgataaaagaattttttgttttatattatcaacaagatctggtggtgttggtgtt
aatttaactggtgctgatactgttatattttatgatagtgattggaatccaacaatggat
gcacaagcacaagatcgttgtcatcgtattggacaaacacgtgatgtacatatttatcgt
ttaatatctgaaaaaacaattgaagaaaatatattaaaaaaagctaatcaaaaaagaatg
cttggtgaaatggctattgaaaatggtaattttacaacagcatattttaaatcatcaaca
atacaagatttatttaatgttgataatgatggtgatgcaacaacaagaatggctgatgtt
gtacaattaaataaagaacgtgaaaaaaatagaaataataaaattgataatgcaattgca
agtggtagcggtggtagtggtggtggacaacaagaagaaaaaattgcaatgggtgcatta
gaatcagcacttgctgctgttgaagaagatcttgatgtacaagctgctaaaattgctaaa
gctgaagctgttgctgatcttgctgaatttgatgaaaatataccacttgatgattatgac
aaagatgatcaacaaatatcaaaagctgaattggaagttcaaactattatttcacagtta
aaaccaattgaacgttatgcaatgcattttgttgaagaaacagaagattgtttttcagca
gctcaattggcagcagctgaagctcaacttgaacaacaaaaacgtgattgggaaattgat
cgtttacgtgcattacgtgaagaagaagatagacgcatgagaatgactgaggatgatgat
aaatcattaacatatactcgtgaggatgcacaaaatcagatatggctgtcggataataca
atggaagcaatgcctatgtggtgtccgtcaactcctccaacatcagatgatgatgtttat
gttgatttttcaatggattttctttatgatagtacaccaatacctgaatgtgatttacca
ccagtatatattaaaaaagaattaaaacgtccacgtgttgaaacaacaacaaatcaaaca
acaaccacaacaacaacaacatcaatatcagcatcaacaaatgatcgtgataatcgtaaa
gtacaaaaacgtcataaagatgattcagtacatgcaccacgttcattatttgatcgtcca
tcagcagcattagtaaaaatgcgtagatataaaaatcacaaaaacatcgtggtaaataat
aatggtagtaatagtaatcaaagaccatcaataacattgcctgttgctggtactgctggt
ggtgttagtgccagtggtggtggtggtagtactggtggtgttaaaacatcaacatcaatt
gttaaaataaatgattatgattttatattagaatggttaatacatgaagacatagcaata
ttacaaacaatacaaggttatcaaaatttatcacttggtcttgttataatatcaccaggt
catacaccaaattgggatcttgtttctgattatgttaataatacaagtagaatatataga
tcaccaaaacaatgtagatcaagatatgacagtgttattgtaccacgtgaagagggtaaa
ttattatatgatacattacctaaaaaacaaaaaaaacaaaaaggtatttataaaaatcaa
tttgaacaacaacaacaacaacaacagcaacagaatcaacaacaacaacaaacagctaaa
gcaaatagaccaatgcgtacatcacaattatttaatcaagataaaaatttaaattttaca
acattattatgtgcacgttttgatatgattaaaacagtatcaaataaacgtacaccagca
gcaaaatcaattataacaaattcaactggtaaaaattcaaaacatgctagtgtattagct
gattggggtattaaatatgatacaccattgacaccaactgaagttgcattaaaacgtgct
gaacgtattgccaaagaaaaattaaaaaatacgacgacagatcaacaacaattggctgtt
caaagacttgctcaacaacaagcagcagcagtacaagcagcagcagtacaagcagcagct
gcagcacaagccgctgccgctgctgctgctgcatcattagctcatcaagctcaaccagtt
gtagctgcagcacaatcacaaacatctcgaatatcaacaccaccgccagcagtaacagca
gcaattgcaggaacaacaacaccaacaacaaatcaattaccacaaataaatacattggta
gctcaaaaatctcaagttccaatgaatgtagcaatatcaacacctcagcaacagcaacaa
caacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacagcagcaa
catcatcatcaacaacagtcaacagttgtaacaacaccaaaaatacgtcaagcatcatca
attgcaacacaagaaacaaatcgttcaccagcaacaattgtaccagttggtaatatacaa
caacaacaacaaactggtggacaacgtttaacaacaacaccaacaaatattgtagcatca
caaaatcaatcagttgttacaccaaaaggtgttcttaatgtaacagtggcaccaggtgtt
aataataaatcattaacacatggacaattacaatttcaattaaatcgacaacagcaacaa
cgtcaaagtttaatgaatcaacaaaaaatattattacataatcaacaaagtggacaaaaa
gttgttgcagttggtaatcaacattcacgtgctgcacttatgaaacaagcaacagcagct
gttaatcagggtattattgataaacaacaaagatcacaatttcctgaatttgcagcaata
ttacaaaaaaaaggcttaacacaagcacaacaaaaagcagccattggacaattacaatta
acaagtagtggacaaaatattgttagtacaattaattcagcaacacaagcccatatattt
gcacaagctggtttacaacaagctggtgcatcatcatcatcatcatcatcatcaccatca
acaacaactggtagtaataatagtaataataataacaataatttatcaacacttgttaaa
gcaagtatgcaaaatataagaacaggtacaccatcatcaatacgttcattatcagtacca
gcacaaacgttagcacgtggtaataaaacaagtggacaacaaaaaatgactcaattaaca
caacaattacctggtaaaagtggtgtacaaaaattgctagtacatccacaacaacaacaa
caacaacaacaacaacaacaacaacaacaacagcaacaattaaatacaaatgtttctgta
caaatggttaaatttccatcaaatgtacaacaacaatttgctcatgtatcaactggacaa
acagtaacacaaagtggacaagttgtattatcaaaatcaccaatgcaagcacgtgttata
ccagttagtgttggtagtaatacttctttaaaacaaacaatgcaagttgttggatcaaat
gcacaattaagacatgttactggtaaaccaattgtaacaactccaagaggtagtcctgga
catggacaacaaattcgaatacatcagtctttacaacaggcacagcaacaggtgcaacaa
caattacaacaacaaggacaacaacaaggtcaacaacaacaacaacaacaacaacaagga
gatttacaaaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
