Aphidius gifuensis: 122858057
Help
Entry
122858057 CDS
T07796
Name
(RefSeq) exosome RNA helicase MTR4
KO
K12598
ATP-dependent RNA helicase DOB1 [EC:
5.6.2.6
]
Organism
agif
Aphidius gifuensis
Pathway
agif03018
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
agif00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03018 RNA degradation
122858057
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
agif03019
]
122858057
03041 Spliceosome [BR:
agif03041
]
122858057
03009 Ribosome biogenesis [BR:
agif03009
]
122858057
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
agif03016
]
122858057
Enzymes [BR:
agif01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.6 RNA 3'-5' helicase
122858057
Messenger RNA biogenesis [BR:
agif03019
]
Eukaryotic type
mRNA degradation factors
3'-5' decay
TRAMP complex
122858057
Spliceosome [BR:
agif03041
]
Complex B
U4/U6.U5 tri-snRNP components
U4/U6.U5 tri-snRNP related factors
122858057
Complex C
U4/U6.U5 tri-SnRNP related factors
122858057
Ribosome biogenesis [BR:
agif03009
]
Eukaryotic type
Pre-60S particles
Helicases
122858057
Transfer RNA biogenesis [BR:
agif03016
]
Eukaryotic type
tRNA degradation factors
TRAMP complex
122858057
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DSHCT
MTR4_beta-barrel
DEAD
MTR4-like_stalk
DEXQc_Suv3
Helicase_C
Death_3
ATPase_2
DUF6145
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122858057
NCBI-ProteinID:
XP_044016652
LinkDB
All DBs
Position
LG5:complement(18113019..18116439)
Genome browser
AA seq
1025 aa
AA seq
DB search
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ASLYL
NT seq
3078 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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gcttcactttatttgtag
DBGET
integrated database retrieval system
