Aphidius gifuensis: 122858308
Help
Entry
122858308 CDS
T07796
Name
(RefSeq) putative elongator complex protein 1
KO
K11373
elongator complex protein 1
Organism
agif
Aphidius gifuensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
agif00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
agif03016
]
122858308
Transfer RNA biogenesis [BR:
agif03016
]
Eukaryotic type
tRNA modification factors
Elongator complex
122858308
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
A-sol_ELP1
Beta-prop_ELP1_1st
HB_ELP1
Beta-prop_ELP1_2nd
TPR_ELP1
Beta-prop_WDR19_1st
Dsh_C
TPR_GEMI5
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122858308
NCBI-ProteinID:
XP_044017057
LinkDB
All DBs
Position
LG5:complement(19514218..19518490)
Genome browser
AA seq
1296 aa
AA seq
DB search
MKNLSVLYHTNHSYDNDKSLENINNAICDSSTIYCYDPDNDCLFIHNSTKLLKIYKKTND
NLLSVDCHDIFGDVSGVCMWIDDGSIHLFDKSGIISKISGISGDDDDEPVVEILGSLDSH
PNCMEIGPDRGTFAIVDENWNVVTMTMDFDVLNKIQLEPCFIPRDDNTTTVDKSNKYNDS
KKASITWRGDGNFFAVILKNYDDNTRQFKVFNREGVFMFTSELSIGLEEFIAWKPSGNLI
ATSQRLPNKHVIALFEKNGLKHRELILPVDKDEIIIKKISWSPDSDILTIWAYNTTNNDE
FLQLWTENNYHWYLKQTINFTNDNPLIYFEWVDHLKIQKKLILLMKKTYMTYTFHWCIDH
SRGICDDDYDKSVVGVIDGNKLLLTGFKIGIVPPPMSHDTITSNQSINKCFFAPNWSVNY
PWKWLDSNALFCQLSNGDLSLYIHEKQELPLKYKYINTYTIEWNNFKNILTDNFSYLMHH
FVWLKPDIILSSISINSTNYLIVIEIKNINDNEDSLKNAILSVKETYIVDGNIHHIVAVQ
DVDIAFLVVDNSVVKFSTVDGGFLPAHQLPELCDQIEVVKIDNEYRVVTLGRKNTLCIDG
VQVAHNITSMSLHSDFLLLTTFQHALVCVKIDREGFNKLSKSDLTVKSWESECPEGDIVL
SMRRLERGSTLVITINHDSKTILQMPRGNLETIQPRSLSLNIIKKHLDNKNYYAAFDLMR
KQRINLNLIYDHNPNLFILNAVKFVDDIKSSSWLNIFISELQDQDVTKTIYKTCYSELEN
NIRNNELVTDDVDGKVERICKLLCDIFEKKISTRDLVQPILTCLVKNKQTKGLEGALCRV
KEFGKAKKTQEDIKNTTENALKYLLYLVDVNVLFDIALGMYDLEIAKVIGFMSQKDPKEF
IPYLNSLSELDDNSRKFQIDKDLKRWESCLIHISKCPERFNECIEIICTHNLYLQALKIF
NINTNEYMKISNLAGEYYMKNKKYREAGMMFQRSKNYKNALDAYKLCGSWQDVISVSTDM
NLSNVEMNELYQELVDIMTNDKRYRDAADICYVYLKQSEETVALLCEGKEWRDALRISKF
HKRPDLIETHVKPGVIEHAEFIKSRLINYKNDFLKYQSRLDVVRKLKAIRDSQNNFLNDD
ENCGDMSDLLSVTSFGGSTTSKASKSSRSSGRTYKSSKNRRKQERKVLSIKEGSAFEDLA
LIRALYDIITCVYELRQEVNNVNKMLMHFYMDQMAEMLQNLLIGILDICEKSKYKIWIKT
DTIEDDGEENLPNSLLETKYTFPPEAKSVNWKLEIL
NT seq
3891 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaatttatcagttttatatcatacaaatcattcttatgataatgataaatcattg
gaaaatataaacaatgcaatttgtgattcatcaacaatttattgttatgatccagataat
gattgtttatttattcataattcaacaaaattattaaaaatttataaaaaaacaaatgat
aatttattgagtgttgattgtcatgatatttttggtgatgtaagtggtgtttgtatgtgg
attgatgatggatcaattcatttgtttgataaatcaggaattattagtaaaatatctggt
attagtggtgatgatgatgatgagccagttgttgaaatacttggatcacttgatagtcat
ccaaattgtatggaaattggtccagacagaggaacctttgctattgttgatgaaaattgg
aatgttgttacaatgacaatggattttgatgtattaaacaagatacaattagagccttgt
ttcattcctcgtgatgacaatacaacaacagttgataaatcaaataaatataatgattct
aaaaaagcatcaataacttggcgtggtgatggtaatttttttgctgtaatactcaaaaat
tatgatgataatacacgacaatttaaagtatttaatcgtgaaggtgtatttatgtttaca
agtgaattatcaattggtcttgaagaatttatagcttggaaaccatctggtaatttaata
gcaacaagtcaaagactaccaaataaacatgtcattgcattatttgaaaaaaatggatta
aaacatcgtgaattaatattacccgttgataaagatgaaataattattaaaaaaatatca
tggtcaccagattcagatatattaacaatatgggcatacaatacaacaaataatgatgaa
tttttacaattatggactgaaaataattatcattggtacttgaaacaaacaattaatttt
acaaatgataatccattgatttattttgaatgggttgatcatttaaaaatacaaaagaag
cttatactgttgatgaaaaaaacatatatgacatatacatttcattggtgtattgatcat
tcaagaggcatatgtgatgatgattatgataaatctgttgttggtgttattgatggtaat
aaattactattgactggttttaaaattggcattgtaccaccaccaatgtcacatgataca
ataacatcaaatcaatcaattaataaatgtttttttgctccaaattggagtgtaaattat
ccatggaaatggcttgattcaaatgctttattttgtcaattatcaaatggtgatttatca
ttgtatattcatgaaaaacaagaactaccattgaaatataaatacatcaatacatataca
attgaatggaataattttaaaaatatacttacagataatttttcatatttaatgcatcat
tttgtatggttaaaaccagatattattttgtcttcaatttcaataaattcaacaaattat
ttaattgttattgaaattaaaaatattaatgataatgaagatagtttaaaaaatgcaata
ctatctgttaaagagacatatattgttgatggtaacatacatcatattgtagctgttcaa
gatgttgatatagcttttttggttgttgataattcggtagttaaatttagcactgtggat
ggtggttttttaccagctcatcaactaccagaattatgtgatcaaattgaagttgttaaa
attgacaatgagtatagagttgtaacacttggtagaaaaaatacattgtgtattgatgga
gtacaagttgcacataatataacaagtatgtcattacattcagactttttattgttgaca
acatttcaacatgcacttgtttgtgttaaaattgatagagaaggttttaataaattatca
aaatcagatttaactgttaaatcatgggaaagtgaatgtccagagggtgatattgtattg
agcatgagaagattagaaagaggatcaactcttgttataacaattaatcatgattcaaaa
acaattctacaaatgccacgtggtaatcttgaaacaattcaaccacgttcattatcactt
aatattattaaaaaacatcttgataataaaaattattatgcagcatttgatctcatgaga
aaacaaagaattaatttaaatttaatatacgatcataatccaaatttatttattttaaat
gctgttaaatttgttgatgatattaaaagttcatcttggttaaatatatttatatcggaa
cttcaagatcaagatgttactaaaacaatttataaaacttgttacagtgagcttgaaaat
aatatacgtaataatgaattagtaacagatgatgttgatggaaaagttgaaagaatatgt
aaattattatgtgatatatttgaaaaaaaaatatcaacaagagatttagttcagccaata
ttaacatgtcttgttaaaaataaacaaactaaaggactagagggtgcactttgtcgagtc
aaagaatttggaaaagctaaaaaaacccaagaagatattaaaaatacaactgaaaatgct
ctaaaatatttactatatcttgttgatgttaatgtattatttgacattgcacttggaatg
tatgatcttgaaattgcaaaagtaattggtttcatgtcacaaaaagatccaaaagaattt
attccatatttaaattctctatcagaacttgatgataattcaagaaaatttcaaattgat
aaagatttaaaacgttgggaatcatgcttgattcatatttcaaaatgtccagaaagattt
aatgaatgtattgaaataatatgtacacataatttatatcttcaagcattaaaaatattt
aacatcaacacaaatgaatacatgaaaatttcaaatcttgctggtgaatattatatgaaa
aataaaaaatatcgtgaagctggaatgatgtttcaaagaagtaaaaattataaaaatgca
cttgatgcatataaattatgtggtagttggcaagatgttatatctgtatcaactgatatg
aatttaagtaatgttgaaatgaatgaattgtatcaagagcttgttgatattatgacaaat
gataaaagatatcgtgatgctgctgatatttgttatgtttatttgaaacaatcagaagaa
acagttgcattactttgtgaaggtaaagaatggagagatgcattgagaatatcaaaattc
cataaaagaccagatcttattgagactcatgttaaaccaggtgtcattgaacatgctgaa
tttattaaaagtcgattgataaattataaaaatgattttttaaaatatcaatcaagattg
gatgttgttagaaaattaaaagcaattcgtgattcacaaaataatttcttaaatgatgat
gaaaattgtggtgacatgagtgatttattgagtgtaactagttttggaggttcaacaaca
agtaaagcatcaaaaagttcacggagttctggtagaacatataaatcaagtaaaaatcgt
agaaaacaagagagaaaagtattgagtatcaaggagggaagtgcatttgaagatcttgca
ttgatacgtgcactttatgatattataacttgtgtttatgaattgagacaagaagttaat
aatgttaataaaatgttgatgcatttttacatggatcaaatggctgaaatgttacaaaat
ttgttaattggaatattggatatttgtgaaaaaagtaaatataaaatttggatcaaaaca
gatacaattgaggatgatggtgaggaaaatttaccaaatagtcttcttgaaacaaaatat
acttttccacctgaagctaaatctgtcaattggaaacttgaaattttgtaa
DBGET
integrated database retrieval system
