Aphidius gifuensis: 122859451
Help
Entry
122859451 CDS
T07796
Name
(RefSeq) sterol regulatory element-binding protein 1 isoform X1
KO
K07197
sterol regulatory element-binding transcription factor 1
Organism
agif
Aphidius gifuensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
agif00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03000 Transcription factors [BR:
agif03000
]
122859451
04131 Membrane trafficking [BR:
agif04131
]
122859451
Transcription factors [BR:
agif03000
]
Eukaryotic type
Basic helix-loop-helix/leucine zipper (bHLH-ZIP)
Ubiquitous bHLH-ZIP factors
122859451
Membrane trafficking [BR:
agif04131
]
Endoplasmic reticulum (ER) - Golgi transport
Others
Others
122859451
Autophagy
Mitophagy
Other mitophagy associated proteins
122859451
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HLH
bHLH_IRO3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122859451
NCBI-ProteinID:
XP_044018987
LinkDB
All DBs
Position
LG6:complement(10693912..10699174)
Genome browser
AA seq
1039 aa
AA seq
DB search
MEGFHSFTDDDDLNLDDVSGFDVTEILRCSDELLHGDLNDDSYFSVLSEPINDDLPLLNI
SNGMEIDNFDTIPTSELHKQSQSPQHQQQQQQLQQQEHQPQHQYKQKQKQKKVIDIQSES
EQLNCQQNQRVSVAQPIPTNVFNSQYTTIPQNVNFNVQSPVVTLAPVTAHQRQLLLPAQL
IKSESLVYPGATQATTTTSVSHQIHTFVNTANGTVLATGIPVVLETDKVQINRLNTTNTQ
ICVPKPREGKRTAHNAIERRYRTSINDKIIELKNMIVGTDAKLNKSAILRKTIDYIRFLQ
NQNSKLKTENMALKMTSKHQKLHNLLSCGELTPPSSDSSEPSLSPGPIAPLSPASPVFIK
EENEKSPSPSKIISNNQNNISGLRDHTRLTLCAFLLVCLAFNPLGMALNNVDMFSSNNYE
EHVEHGRTILTHSDTNDEIQDNYLSSSMKFWKNDIIIWFINGLLLAGGLCRLLLYGDSVI
PIESKNFLELVRWRRQAEFNMSINEYEKAYSDLANCLRYFGRSLPSSRFDIWLATLWQIV
RQVLHKLLIGKWVLFIGKWIAEKNDKYEKEVSAAELAICYGRLLSLKLSEGSTDGLLFLT
LSSINYAEAAGDNIQKVSLIEIYINAALSFKKSLLPFVHKYYLAKAKSILLITGVNVPQK
YRWILTEEGTKFLLSGKWNYGIHMDDSNDKFSLTSQKSKTDPLSYASRAYREHLITQAIK
LISGTATTTGDSYASKTLEISKSIISSSNVESCFPGSNSDHDNESKGYEDVIGLWWGGVF
LAASSWRLGEEDPTAWNIVETKFPYDKFNNETNSNNSPLSHAVLSVIQAAKKSKCKSSIR
LIDQAGKLLEQSMVFYNCKQQSSQNVQLIQLWVCDWLLELRTILWQELCGCDKGNDHAVT
NFFLAGFQRDLAKLRQLSQHISSVLPRIFLYEATARIMAGAAPMKTQILLDRSLHHKNLK
TSMICGKDRSLENTSGEREHAAALCLACRHLPTLLLASPGERAGMLSEAAKTLEKIGDRQ
KLQECYELMKQLSPAISVN
NT seq
3120 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaggatttcacagttttacagacgatgatgatttaaatttagatgatgtctctgga
tttgatgttacagaaatattgcgttgttctgacgagttgcttcatggagatctcaatgat
gactcatattttagtgttttaagtgaaccaattaatgatgatcttccattactcaacata
tctaacggaatggaaattgataattttgatacaataccgacatctgaattacataaacaa
tctcaatctccacaacatcagcaacaacaacaacaattacagcaacaagaacatcaacca
caacatcaatataaacaaaaacaaaagcaaaaaaaagtaatcgatatacaatctgaatca
gagcaattaaattgtcaacaaaatcaacgagtgtcagttgcacaaccaattccaacaaat
gttttcaattcacaatatacaactataccacaaaatgttaacttcaatgtacaatcacca
gttgttacattggcacctgtcacagcgcatcaaagacaattacttttaccagcgcaatta
ataaaatctgaatctcttgtatatcctggagctacacaagcaacaacaacaacatctgtt
tctcatcaaattcatacatttgtaaatactgcaaatggaaccgtattagctacaggtatt
ccagttgttcttgaaactgataaagtacaaataaatcgtttaaatacaacaaatacacaa
atttgtgtaccaaaaccacgtgaaggtaaaagaactgcacacaatgcaattgaacgacgt
tatcgtacatcaataaatgataaaataattgaattaaaaaatatgattgttggtactgat
gcaaaattaaataaatcagcaatattaagaaaaacaattgattacataagatttttacaa
aatcaaaattcgaaattaaaaacagaaaatatggcattaaaaatgacatcaaaacatcaa
aaattacataatttattgtcatgtggtgaattaacaccaccaagttcagattcaagtgaa
ccatcattatcaccaggaccaatagcaccattatcaccagcatcaccagtttttataaaa
gaagaaaatgaaaaatcaccatcaccatcaaaaataatatcaaataatcaaaataatata
tctggattacgtgatcatacaagattaacactttgtgcatttttattggtttgtcttgct
tttaatccacttggtatggcactcaataatgttgatatgttttcaagtaataattatgaa
gaacatgttgaacatggtcgtacaatattaacacattcagatacaaatgatgaaattcaa
gataattatttatcatcatctatgaaattttggaaaaatgatataataatatggtttatc
aatggattattattagctggtggattgtgtcgtttattattatatggtgattcagttata
ccaattgaaagtaaaaattttttggaactagtacgttggagacgacaagctgaatttaat
atgtcaattaatgaatatgaaaaagcatattcagatttggcaaattgtttacgttacttt
ggtcgttcattgccatcatcacgtttcgatatttggcttgcaacattgtggcaaattgta
cgtcaagtacttcataaattattaattggtaaatgggttttatttattggtaaatggatt
gctgaaaaaaatgataaatatgaaaaagaagtatcagctgcagaacttgctatttgttat
ggaagattattgagtttaaaattatctgaaggttcaactgacggattgttatttttaaca
ttatcatcaattaattatgctgaagctgctggtgataatatacaaaaagtgtcattaatt
gaaatttatattaacgcagcattgtcatttaaaaaatcattattaccatttgttcataaa
tattatttggctaaagcaaaaagtattttattaataactggtgttaatgtaccacaaaaa
tatcgttggatattaacagaagaaggtacaaaatttttattatctggaaaatggaattat
ggaatacatatggatgattcaaatgataaattttctttaacttcacaaaaaagtaaaact
gatccactttcatatgcatcaagagcatacagagaacatttaataactcaagcaatcaaa
ttaatatctggtacagcaacaacaactggtgattcttatgcttcaaaaacattagaaatt
tcaaaatcaattatatcatcatcaaatgttgaaagttgctttcctggctcaaattctgat
catgataatgaatcgaaaggatatgaagatgttattggtctttggtggggtggtgttttt
ctagctgcttcatcatggagacttggtgaagaagatccaacagcctggaatattgttgaa
acaaaatttccatatgacaagtttaacaatgaaacaaattcaaataattcaccattatct
catgctgttttgagtgttattcaagctgctaaaaaatctaaatgtaaatcatcaatcaga
ctcattgaccaagctggaaaacttttggaacaatctatggttttttataattgtaaacaa
caatcatcacaaaatgttcagttgattcaactttgggtttgtgattggttacttgaactt
agaacaatattgtggcaagagctatgtggatgtgataaaggaaatgatcatgctgttaca
aatttcttccttgctggttttcaacgagatttagccaaacttagacaactcagtcaacat
atttcatctgtattacccaggatttttttgtatgaggcaacagcaagaataatggcaggt
gcagctccaatgaagacacaaattttacttgatcgtagtttacatcataaaaatttaaaa
acatcaatgatttgtggaaaagatcgttcacttgaaaataccagtggagagcgcgagcat
gcagctgcactttgtcttgcttgtcgacatttaccaacattattactggcatcacctggt
gaacgtgctggtatgttatctgaagctgctaaaacattagagaaaattggagatcgtcaa
aaactacaagaatgctatgaacttatgaaacaacttagtcctgcaatttctgttaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
