Aphidius gifuensis: 122860123 Help Entry 122860123         CDS       T07796                                  Name (RefSeq) collagen alpha-5(IV) chain   KO K06237   collagen type IV alpha Organism agif  Aphidius gifuensis Pathway agif04382   Cornified envelope formation agif04512   ECM-receptor interaction agif04518   Integrin signaling agif04820   Cytoskeleton in muscle cells Brite KEGG Orthology (KO) [BR:agif00001]  09130 Environmental Information Processing   09133 Signaling molecules and interaction    04512 ECM-receptor interaction     122860123    04518 Integrin signaling     122860123  09140 Cellular Processes   09142 Cell motility    04820 Cytoskeleton in muscle cells     122860123  09150 Organismal Systems   09158 Development and regeneration    04382 Cornified envelope formation     122860123  09180 Brite Hierarchies   09183 Protein families: signaling and cellular processes    04147 Exosome [BR:agif04147]     122860123    00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:agif00536]     122860123 Exosome [BR:agif04147]  Exosomal proteins   Exosomal proteins of other cancer cells    122860123 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:agif00536]  Heparan sulfate / Heparin   Extracellular matrix molecules    122860123 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGFIT Motif Pfam:  Collagen C4 Motif Other DBs NCBI-GeneID:  122860123 NCBI-ProteinID:  XP_044019724 LinkDB All DBs Position LG1:28646288..28663140 Genome browser AA seq 1840 aa AA seqDB search MWPGGGIVTSCGKQRYLTSGFTCIIGLILVVWCTPSTNAVICRDPLKCNCTGIKGTPGYP GIGGPQGPEGDPGEIGPDGPDGPKGEKGAGGEHGGTGEKGYRGEFGIQGFTGTSGLSGHP GNEGVRGPDGLDGCNGTDGRAGAPGLPGTYGPRGQVGADGDFGPTGEPGDGGINSVGVKG ERGVPGFDGPKGYDGGYGMRGEHGTPGSTGDIGYQGEPGLPGLKGDTGDDIHGDKGQVGE PGDRGEPGPNSEQYTKNEETIPVKGPQGPKGMRGDYGLRGRTGPIGDRGPIGRPGFLGIK GVKGEQGGDGQRGKQGINGPAGPAGEKGEKGAPGYAGLPGVDGLDGEIGEDGNTGPPGKQ GSAGEKGQYIPELDEIVSGPIGIQGDLGPPGAIGQSGIPGNPGLVGYIGPPGIPGPQGSP GLAGPKGTSVKGEQGDDGLPGPMGAQGPLGRPGLPGTIGAKGFPGMSITGPPGPDGKPGY DGFDGPLGDRGEPGDPGPKGFPGKGVRFQGPRGEDGLPGIPGTPGKSGWPGYTGLKGFKG LRGDDCGVCAPGLPGVKGERGDSGRDGYPGTPGFAGLPGPRGFKGKHGKPGITGSMGLDG EDGRPGTAGLQGPRGLPGQIIWPESSQKLQPLPGDIGDKGLPGIEGLRGPRGRPGQAGET GLVGPTGEKGDFGVPGISGQDGFPGLDGIPGEKGDAADIPIVFLRGDPGFNGKPGQKGIK GDPGAKGQEGESSAYNIDFSGDKGVKGQPGSEGAQGLKGQQGQIGDEGLPGPKGFQGLPG LSIQGPEGLKGYPGMPGNEGPRGLAGEPGKIGFTGKMGPLGQKGERGDIGTNLLYGEIGE PGYHGEKGDYGFEGPTGLRGRNGPDGPTGLKGGKGAPGFAGLSGLQGSKGVRGDSIQGPR GFPGLSGEPGFNGMFGDTGSIGPDGPPGFDGMKGLKGEIGFFGRRGIDGDIGPIGYPGRE GMQGLPGPYGEEGDVGEMGEPGPPGFQGLDGIDGPFGAKGEIGDDGYQGFPGITGPIGKQ GETGDPGYDGIPGERGENSFSGPQGDIGEPGLIGEDGLPGLPGFDGRPGLAGEPGRDTYG FDGSIGQKGEPGYNGRDGRIGIKGEIGDMGLDGEKGKQGDIGIKGYMGGPGYNGRPGEKG EIGPAGPIGYDGEKGKRGLYGEPGKIGRPGKPGDAGPRGFPGIPGVQGPKGESGEPGLAS YLDADKGDYGDAGFHGLPGKKGERGEVGRIGSRGRKGADGDFGYAGPDGFEGILGLPGLP GDQGPRGLPGIPGQFAERGEPGMAGLNGIPGQYGLHGAKGAPGEYGPNGPKGIEGDAGRS SRGPKGIQGDYGIRGFEGAPGKPGNPGMIGWPGQPGPKGFTGEPGYSAHAAKGIMGDVGY AGFDGRHGLKGERGNPGRDGVPGYRGLKGIRGDTGEPGLPGLTGPDGPQGPKGDRGRNPY PAFPRKGLRGDTGLPGAQGVIGAPGLMGMPGSDGLPGLEGEPGTDGFPGIGGPDGVDGPP GPRGFQGDTGYQGAPGLTGPRGDDAAPGPAPKSRGFHFARHSQTEMIPQCPRGTVKMWDG FSLLHIMGNSHPWAQDLGSAGSCLQKFSVMPFLFCNLNNVCDYAQRNDYSYWLSSTEPMP MMMTPIPAPEAGRYISRCSVCEAPTRMIAVHSQSMSIPECPGGWEEAWIGYSFLMHRDAG AAGGGQSLVSPGSCLEEFRTRPFIECRGLGTCNYFSTAISYWLATINDYEMFRKPQSQTL KADHTSRISRCAVCRRRQIIEDNNNNNNNSRFKQFTSNTARYVPPQPQPPPVNPLPLQYP SDRQRHEQRNRNRGPNQGRVPNRRRQRIYKPEEANQVLDQ NT seq 5523 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgtggcccgggggtggtattgtcacctcttgcggcaagcaacgatacctgacgtctggg tttacctgtatcattgggttgattcttgttgtttggtgcacaccctcaacaaatgcagtg atatgtcgtgatcctctaaaatgcaattgcacaggaataaaaggaacaccaggttatcca ggaataggtggaccacaaggaccagaaggtgatcctggtgaaattggtccagatggtcca gatggtccaaagggtgaaaaaggtgctggtggtgaacatggtggtaccggtgaaaaaggc tatcgaggagaatttggtatccaaggtttcactggaacttcaggtttatctggacatcca ggtaatgagggagttcgaggaccagatggtttagatggttgtaatggaactgatggaaga gctggagcaccaggtttacctggtacatatggaccaagaggtcaagttggtgctgatggt gattttggtccaactggtgaacctggtgatggaggaattaattcagttggagttaaagga gaaagaggagttcctggttttgatggaccaaaaggatacgatggcggttatggaatgcga ggagaacatggtactccaggttcaactggtgatattggatatcaaggtgaaccaggtcta ccaggtcttaagggagatactggtgatgatattcatggtgacaaaggacaagttggtgag ccgggtgatcgaggtgaacctggaccaaacagtgaacagtatacaaaaaacgaagaaaca attccagttaaaggacctcaaggacctaaaggaatgcgtggtgattatggtcttagagga agaactggacctattggagatcgaggaccaattggaagacctggttttttgggcataaaa ggtgtcaaaggtgaacagggtggtgatggacaaagaggtaaacaaggtatcaatggtcca gctggaccagctggtgaaaaaggagaaaaaggagcacctggatatgctggtcttcctgga gttgatggactagatggtgaaattggagaagatggaaacactggtccacctggaaaacaa ggttcagctggtgaaaaaggacaatatataccggaacttgatgaaattgttagtggacca attggaattcaaggagatcttggtccaccgggtgcaattggacaatctggaattcctgga aatcctggtttagttggatacattggacctccaggaatacctggtcctcaaggatcacct ggtttagctggaccaaaaggaacatcagttaaaggagaacaaggtgatgatggattacct ggtccaatgggagcacaaggtcctttaggtcgacctggtttacctggaacaattggagct aaaggttttcctggtatgtcaataactggaccaccaggacctgatggaaaaccaggatat gatggatttgatggacctcttggtgatcgtggagaacctggtgaccctggtccaaagggt tttccgggtaaaggagtacgttttcaaggacctcgtggtgaagatggtcttccaggaata cctggtactcccggtaagagtggatggcctggatacaccgggctaaaaggttttaaaggt ttacgtggtgacgactgtggagtttgcgctccaggcttaccaggagtcaaaggagaacga ggtgattcaggcagagatggatatccaggtacaccaggatttgctggtttacctgggcca agaggttttaaaggtaaacacggaaagccaggtattactggctctatgggtcttgatggt gaagatggtagaccgggaacagctggattacaaggaccaagaggtttacctggtcaaatt atttggccagaatcatcacaaaaattacaaccattacctggtgatattggtgacaagggt ttaccaggtattgaaggtttacgtggaccacgtggaagacctggtcaagctggtgaaaca ggattagtgggaccaactggagaaaaaggtgatttcggagttcctggtatatctggacaa gatggttttccaggtttagatggtatacctggtgaaaaaggagatgctgctgatattcct attgtatttttacgtggtgaccctggttttaatggtaaaccaggtcaaaaaggtatcaag ggagatcctggtgcaaaaggtcaagaaggagagtcttctgcttataacattgactttagt ggtgataaaggtgttaaaggacagcctggatctgaaggtgcccaaggattgaaaggtcag caaggtcaaattggtgacgagggtctgccaggtcctaagggttttcaaggactacctgga ttatcaattcaaggaccagaaggcttgaaaggatatcctggaatgcctggtaatgagggt ccacgtggactcgctggtgaacctggtaaaataggatttacaggaaaaatgggaccattg ggacaaaaaggagaaagaggtgatatcggaactaatttattgtatggtgaaattggagag ccaggataccatggtgaaaaaggtgattacggtttcgaaggacctactggtcttcgcgga agaaatggtcctgatggaccaacaggattaaagggtggtaaaggagctccaggatttgca ggtctatctggtcttcagggatctaaaggtgtcagaggtgatagtatccaaggccctcgt ggttttccaggtctttctggtgaacctggttttaatggaatgtttggtgacactggttca attggaccagatggtccaccaggttttgatggtatgaaaggtttaaaaggtgaaattggt ttctttggtcgtcgtggtattgatggagatattggaccaattggttatcctggtagagaa ggaatgcaaggtctaccaggaccatatggagaagaaggtgatgttggagaaatgggtgaa cctggcccacctggttttcaaggtcttgatggtattgatggaccatttggagctaaagga gaaattggtgatgatggatatcaaggatttccaggtataactggaccaattggaaaacaa ggtgaaactggtgatcctggttatgatggtatacctggtgaacgtggtgaaaattcattc agtggaccacaaggagatattggagagcctggtttaattggagaagatggattacctggt ttacctggttttgatggtcgtcctggtcttgctggtgaacctggacgtgatacatatgga tttgatggttctattggacaaaaaggtgaaccaggttacaatggacgtgatggaagaatt ggcatcaagggagaaattggtgatatgggtcttgatggtgaaaaaggaaaacaaggtgat attggtataaaaggttatatgggtggaccaggatacaatggaagacctggtgaaaaaggt gaaattggacctgctggtccaattggttatgatggtgaaaaaggaaaacgtggattatac ggtgagcctggtaaaattggtcgtcctggaaaacctggtgatgctggtccacgaggtttt ccaggtatacctggtgttcaaggaccaaagggtgaatctggtgaacctggtttggcttca tatcttgatgctgataagggtgattatggtgatgctggattccatggtttaccaggtaaa aaaggagaacgaggtgaagttggtagaattggttcacgtggacgtaagggagctgatggt gactttggatatgctggaccagatggatttgaaggtatattaggtctacctggacttcct ggtgatcaaggacctcgtggtttgcctggtatacctggtcaatttgctgaacgtggtgaa ccaggaatggctggtttgaatggaattccaggacaatatggtttacatggagcaaaaggt gcacctggtgaatatggaccaaatggaccaaaaggtattgaaggagatgctggaagaagt tctcgtggtcccaaaggaattcaaggagattatggtattcgaggttttgaaggtgcacct ggtaaacctggaaatccaggtatgataggttggccaggacaacctggaccaaaaggtttt actggtgagccaggttattcagcgcatgctgcaaaaggtataatgggtgatgttggatat gctggttttgacggcagacatggactcaaaggtgaaagaggaaatcccggaagagatggt gtacctggttatcgtggtttaaaaggtatacgaggtgatactggtgaaccaggtttacct ggtcttactggacctgatggaccacaaggacctaaaggagatcgtggtagaaatccttat cctgcttttccaagaaaaggattaagaggtgacactggattacctggagctcaaggtgtt attggtgcacctggattaatgggaatgcctggaagtgatggtttacctggtcttgagggt gaaccaggaacagatggttttccaggtattggtggaccagatggagtagatggtccacca ggtccacgtggttttcaaggagatactggttatcaaggtgctccaggtttaactggacct cgtggtgatgatgctgcacctggaccagcaccaaaaagtcgtggttttcattttgctaga cattcacaaactgaaatgattcctcaatgtccaagaggaacagttaaaatgtgggatggt ttttctttacttcatattatgggaaatagtcatccatgggctcaagatcttggttcagct ggaagttgtctacaaaaattctcagttatgccatttttattttgtaatttaaataatgtt tgtgattatgcacaaagaaatgattacagttattggttaagttcaactgaaccaatgcca atgatgatgacaccaataccagcaccagaagctggaagatatatatcaagatgttctgtt tgtgaagcaccaacaagaatgattgctgtacacagtcaatcaatgtcaataccagagtgt cctggtggttgggaagaagcatggattggttatagtttcttgatgcatcgtgatgctggt gcagctggtggaggacaatcactcgtttcaccaggttcatgtcttgaagaatttcgtaca cgtccatttattgaatgtcgtggtcttggtacttgtaattatttttcaacagcaatatca tattggcttgcaacaataaatgattatgaaatgttccgtaaaccacaatcacaaacactc aaagctgatcatacatcacgtataagtagatgtgctgtttgtcgacgtcgtcaaattatt gaagataataataataataataacaacagtagatttaaacaatttacttcaaatacagca cgttatgttccaccacaaccacaaccaccaccagttaatcctttacctttacaatatcca tcagatagacaacgtcatgaacaacgaaatagaaatagaggacccaatcagggacgagta ccaaatcgtagaagacaaagaatttataagcctgaagaagctaatcaagtcttggatcaa taa

DBGET integrated database retrieval system