Aphidius gifuensis: 122860213
Help
Entry
122860213 CDS
T07796
Name
(RefSeq) GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1
KO
K27566
GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1
Organism
agif
Aphidius gifuensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
agif00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
agif04131
]
122860213
Membrane trafficking [BR:
agif04131
]
Endocytosis
Rab GTPases and associated proteins
Rab associated proteins
122860213
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RasGAP
VPS9
DUF5601
DUF7646
Pox_TAA1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122860213
NCBI-ProteinID:
XP_044019859
LinkDB
All DBs
Position
LG1:29277803..29285244
Genome browser
AA seq
1653 aa
AA seq
DB search
MSSINSADSLGTIQWDMLELAGHLRLERLFVNSEKQNLKELNRKVLYISSDLAQQAWITD
QQRVNLNRLIVARADCTPASCCQRANTLENCHFVDAYKHLRHQACSSYGEFLDNIRKSPE
LIASCLVEADRISPETVQNIIQSLSAGLYGSCLMPEDKLFVLKLLRQLMYLQIIPSDNPR
RLLRHGTCAFSRFYSVFHENLFSAKLYLTAALHNPITQLLMEDEKFLDIDPDKASIRFPP
SEKLKRFGKEGTQEYHNKLQKYRLWTINSLVRITQRFITSIRDNIHCFPTSICWIVRQMA
NLLSKNNNIEPKEIHAMCTDLVFTYFICPAIVNPEPYGITDAPISYIARFNLMQVGQILQ
MLSLMKYQTVDQKVIDLYKRFDKDSISSIIDAMLDGTNDEQLDDEPSIIDNTKLQGLCRS
AALLTENELNSLVNFFHVINNNNNDDDDANDNDDESNNDDASNDDDDDDDVDEQLDNNNN
LLNRKKLNELLSQLPAGSVSSNKIIINNNNSNSNNNTSPETPSKRGGLLRKVSRGRGSRV
SSSSSSSVPDGAEDNNNNINNSSSGSTGGTSCGNDDDFIDKKIPQDVLVIPFSPTIGESV
GLLSEQKVLCMDIKNNIDNSNQVTLTLPKNIQIINNQQQQDRQLIVNDRIETQEKRTRFS
LSHDEILFEGSIGNTSDNLEAVSEAASNHSVASSLELETEDQNDNLSDMVSANVSGRGSP
NISGRDTPSSQLTEGGDDNRVVVGGIDVRQHDLPTPTIAEKQSRSEIDDKFCKFEIKKLI
EGDETISLVSDTWSTDVLGSDSEFIEVQDRYQYSQPSVLQVVDINNCLIDINETASDAWS
TDVLASDSERLTEVDTDDTSSVARSDDTARSEIESRGEPEGSGASASGSGINCNNINYLQ
ETRNLPIGTIVDGAGMLFRTIREEPIGRSSIITIPSSPTASASSTSSANVTGRGGTRSDY
QRSTMEYVDNNSNGISDNTDYTNKKDAATGTSRATRVNDNNNVIDDGISNLIDKLQIDNN
NKSNFSNGNQLITTNTTTITTTTTTTNTTTATNLSLTNKNHTTTKNDDVDNANDVIVRLS
TASLTSSSSFGSDTKIKNTTTTSMTSTTPERQRPITNGSNDITNNSNNNNTILLSSSSST
TNKPSISSGAIPKSISFDMTATRGDKELLDDDQKNKRGFFSKFKMSLKNRRGKSPRGISD
DLIGNRCYDNNNNNDNNNDINRHRLRRIMSEDTTATSSSSTTSMNNFNDSTDDILAKYRR
KPSVTSDTASVESNQSRTKEAEDERLMIDQNNIELSFAFNDAKRKLRMVLSTADLQQIPW
FISNERNNIIQKDNELITFLQLQLSEAINLQDRPLIARLHETLRCVRLFNDEGCKKLFLS
LKDDYQKRSPYIAYLIRCKQGLLSTLAHLERLGERVKCDRDAVNSHLVALCVHVYLEKRE
NQILKFCDEFQKLEVSDEKQDFVDNFLLKINSDMEIDAIWQSASDGQLELARMVVERTVM
ARIYQYALYPNGDGDVNRDQLLYDHIKKLSKIVTPNHKDLKITKIYHYECPWPSAQAELA
VISAYKTPRDKLQCVFRCATTIMNLLSMASERRTPAADDLMPVLVYVIIKTNPPSLLSTV
QYVDSFYGNRLEGEEQYWWTQFYSAIEFIKTMD
NT seq
4962 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcgtcaataaacagtgctgattcacttggtacaatacaatgggacatgcttgaattg
gctggtcatttaagactggagcgtctttttgttaattcagaaaaacaaaatcttaaagaa
ctaaatagaaaggtgctgtatatatcatcagatttagcacaacaagcatggataactgat
caacaacgtgttaatttaaatcgtttaattgttgcacgtgcagattgtacaccagcatca
tgttgtcaacgtgcaaatacacttgaaaattgtcattttgttgatgcatataaacattta
cgacatcaagcatgtagttcatacggtgaatttcttgataatatacgtaaatcaccagaa
ttaatagcatcatgtcttgttgaagctgatagaatatcaccagaaacagtacaaaatata
atacaatcattatcagctggtctttatggtagttgtttaatgccagaagataaattattt
gtattaaaattattacgacaattgatgtatttacaaataataccatcagataatccacgt
cgtttattacgacatggtacatgtgcattttcacgtttttattctgtatttcatgaaaat
ttattctcagcaaaattatatttaacagcagcattacataatccaataacacaattacta
atggaagatgaaaaatttttggatattgatccagataaagcatcaattagatttccacca
tctgaaaaattgaaacgttttggtaaagaaggaacacaagaatatcataataaactacaa
aaatatcgtttatggacaattaattcattagtaagaataacacaaagatttatcacaagt
atacgtgataatatacattgttttccaacaagtatatgttggattgtacgacaaatggca
aatttattaagtaaaaataataacattgaacctaaagaaatacatgcaatgtgtactgat
cttgtatttacatattttatatgtccagcaattgttaatccagaaccatatggtataact
gatgcaccaataagttatattgcaagatttaatttaatgcaagttggacaaatattacaa
atgttatcattaatgaaatatcaaacagttgatcaaaaagttattgatttatataaaaga
tttgataaagattcaatatcatcaattattgatgcaatgcttgatggaacaaatgatgaa
caacttgatgatgaaccaagtattattgataatacaaagttacaaggtttatgtagatct
gctgcattattaactgaaaatgaattaaattcattagttaatttttttcatgttattaat
aataataataatgacgatgatgatgctaatgataacgatgatgaaagtaataatgatgat
gcaagtaatgatgatgacgatgacgatgatgttgatgaacaattagataataataataat
ttattaaatcgtaaaaaattaaatgaattattatcacaattaccagctggttctgtgagt
tcaaataaaattattattaataataataatagtaatagtaataataatacatcaccagaa
acaccaagtaaacgtggtggattattacgtaaagttagtcgtggacgtggtagtagagta
tcatcatcatcatcatcaagtgtaccagatggagctgaagataataataataatattaat
aatagtagtagtggatcaactggtggtacatcttgtggtaatgatgatgattttattgat
aaaaaaatacctcaagatgtacttgtaataccattttcaccgacaattggtgaatcagtt
ggtttattgagtgaacaaaaagtactatgtatggatattaaaaataatattgataattca
aatcaagttacattaacattaccaaaaaatatacaaattattaataatcaacaacaacaa
gatagacaattaattgttaatgatagaattgaaacacaagaaaaacgtacacgtttttca
ttatcacatgatgaaatattatttgaaggttcaattggtaatacatctgataatttagaa
gctgtttctgaggcagcatcaaatcatagtgttgcatcatcacttgaacttgaaacagaa
gatcaaaatgataatttatctgatatggtatcagcaaatgtatctggtagaggttcacca
aatatatctggacgtgatacaccatcatcacaattaactgaaggtggtgatgataatcgt
gttgttgttggtggtattgatgtacgtcaacatgatttaccaacaccaacaattgctgaa
aaacaatcacgctctgaaattgatgataaattttgtaaatttgaaattaaaaaattaatt
gaaggtgatgaaacaatatcacttgtatcagatacatggtcaacagatgtattaggttct
gatagtgaatttattgaagtacaagatagatatcaatattcacaaccatctgtattacaa
gttgttgatattaataattgtttaattgatattaatgaaacagcatctgatgcatggagt
acagatgtacttgctagtgattcagaacgtttaactgaagttgatactgatgatacatca
agtgttgctagatcagatgatactgctagatcagaaattgaaagtcgtggtgaaccagaa
ggtagtggtgctagtgctagtggtagtggtattaattgtaataatattaattatttacaa
gaaacaagaaatttaccaattggtacaattgttgatggtgctggtatgttatttcgtaca
atacgtgaagaaccaattggacgttcatcaataataacaataccatcatcaccaacagca
tcagcatcatcaacatcatcagcaaatgttactggacgtggtggtacaagatcagattat
caaagaagtacaatggaatatgttgacaacaattcaaatggcatttctgacaatacagat
tataccaataaaaaagatgctgctactggtacaagtagagctacaagagtcaatgataat
aacaatgttattgatgatggtatatcaaatttaattgataaattacaaattgataataat
aataaatcaaatttcagtaatggtaatcaattaattaccacaaataccactacaattact
actaccaccaccaccactaacacaaccactgctacaaatttatcattgactaataaaaat
catactacaactaaaaatgatgatgttgataatgcaaatgatgttattgtacgtttaagt
acagcaagtttaacatcaagcagtagttttggttcagatactaaaattaaaaatacaaca
actacatcaatgacatcaacaacaccagaacgtcaacgtccaattacaaatggctcaaat
gatatcactaataatagtaataataataatacaattttattatcatcttcatcatcaaca
acaaataaaccaagtatatcaagtggtgcaataccaaaaagcataagttttgatatgaca
gcaacacgtggtgataaagaattactggatgatgatcaaaaaaataaaagaggttttttt
agtaaatttaaaatgtcattaaaaaatagaagaggtaaatcaccaagaggtataagtgat
gatttaattggtaatcgttgttatgataataataataataatgataataataatgatatt
aatagacatagattacgtagaataatgtctgaagatacaacagcaacatcatcatcatca
acaacatcaatgaataattttaatgacagtactgatgatatattagcaaaatatcgtaga
aaaccaagtgtaacaagtgatacagcatctgttgaaagtaatcaatcacgtacaaaagaa
gctgaagatgaaagattaatgattgatcaaaataatattgaattatcatttgcatttaat
gatgctaaaagaaaattacgtatggtattaagtactgctgatttacaacaaataccatgg
tttatatcaaatgaaagaaataatattatacaaaaagataatgagctaataacattttta
caattacaattatctgaagcaattaatttacaagatcgtccattaattgcacgtttacat
gaaacattaagatgtgttagattatttaatgatgaaggatgtaaaaaattatttttatca
ttaaaagatgattatcaaaaaagatcaccatatattgcatatttaataagatgtaaacaa
ggattattatcaacattagcacatttagaaagacttggtgaacgtgttaaatgtgatcgt
gatgctgttaatagtcatttagttgcattatgtgtacatgtttatcttgaaaaacgtgaa
aatcaaatattaaaattttgtgatgaatttcaaaaacttgaagtatctgatgaaaaacaa
gattttgttgataattttttacttaaaattaattctgatatggaaattgatgcaatatgg
caatcagcaagtgatggacaacttgaattagctagaatggttgttgaaagaacagttatg
gctagaatatatcaatatgcattatatccaaatggtgatggtgatgttaatagagatcaa
ttattatatgatcatattaaaaaattatctaaaatagtaacaccaaatcataaagattta
aaaataacaaaaatttatcattatgagtgtccatggccatcagcacaagctgaacttgct
gttatatcagcatataaaacaccaagagataaattacaatgtgtttttcgttgtgcaaca
acaattatgaatttattatcaatggcatctgaaagaagaacaccagctgctgatgattta
atgcctgtccttgtgtatgtcatcattaagacaaatccaccatcgctattgtcaactgtt
caatacgttgacagtttctatggaaatcgtcttgaaggagaagaacaatattggtggacc
caattttactcagcaattgaattcatcaagacaatggattaa
DBGET
integrated database retrieval system
