Aphidius gifuensis: 122860393
Help
Entry
122860393 CDS
T07796
Name
(RefSeq) methionine--tRNA ligase, cytoplasmic
KO
K01874
methionyl-tRNA synthetase [EC:
6.1.1.10
]
Organism
agif
Aphidius gifuensis
Pathway
agif00450
Selenocompound metabolism
agif00970
Aminoacyl-tRNA biosynthesis
agif01100
Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
agif00001
]
09100 Metabolism
09106 Metabolism of other amino acids
00450 Selenocompound metabolism
122860393
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
00970 Aminoacyl-tRNA biosynthesis
122860393
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01007 Amino acid related enzymes [BR:
agif01007
]
122860393
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
agif03016
]
122860393
Enzymes [BR:
agif01000
]
6. Ligases
6.1 Forming carbon-oxygen bonds
6.1.1 Ligases forming aminoacyl-tRNA and related compounds
6.1.1.10 methionine---tRNA ligase
122860393
Amino acid related enzymes [BR:
agif01007
]
Aminoacyl-tRNA synthetase
Class I (U)
122860393
Transfer RNA biogenesis [BR:
agif03016
]
Eukaryotic type
Aminoacyl-tRNA synthetases (AARSs)
Multi-aminoacyl-tRNA synthetase complex (MSC)
122860393
Prokaryotic type
Other AARSs
122860393
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
tRNA-synt_1g
WHEP-TRS
Anticodon_3
tRNA-synt_1
GST_N_5
GST_C_3
Arc1p_N_like
GST_C
GST_C_2
tRNA-synt_1e
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122860393
NCBI-ProteinID:
XP_044020122
LinkDB
All DBs
Position
LG1:30892010..30895778
Genome browser
AA seq
1027 aa
AA seq
DB search
MILSTNEGNPNALKLIIGAKLGDKNVNLSVVKTSDESLGRLPALKLPCGTTLFSSRAALE
YLFDNSIKDNCSVNKWLEWDSTQLQPALVSYGSSGSLDTSHKPRIWALLKDLNATLKNNK
YLINNDDLTSADVSIWTSLWSTIISTPVGKEITKDFPNVDRWITDIEQLPIVKKSLDEFK
IERGIKAISSIQAVSWFPMNSYTGGRKTNAPTTSCVTMDSPTEVSDLEIDNIKKNWIKPS
HPSIKAPQYPVLPKKGERNILVTSALPYVNNVPHLGNIIGCVLSADIFARYCRQRSYNTL
YISGTDEYGTATEAKALEENLSPQEICDKYFSIHNDIYRWFGIGFDHFGRTTTPEQTEIV
QDLFLRIKSQGYIITESVDQLLCENCDRFLADRFVEGTCPGCKYEDARGDQCDGCGHLVN
ATELIKPRCKVCSKTPIIKASTQFFIDLPKLEPKLREWASSVESGWSSVARAVTKPWLRD
GLKQRCITRDLKWGIPVPLDGYRDKVFYVWFDAPLGYVSITKRYTKDYEKWWKPDDTTDV
NLYQFMAKDNVPFHAIMFPATLIAANEKHILVKNIMATEYLNYEDTKFSKSRGTGVFGTD
ARETGIPADVWRFYLAYIRPESQDSNFNWVDLATKNNSELLNNFGNFVNRSLMFAGNNFN
STVPDMYLRDEDINVLALVQRELNGYLQSLEQAKLRDGLRHLLAISKHGNQYMQSQQPWV
KVKGNDDDKKIAGTIIGICCNLSCLLAALLGPFMPNTSRQLRTQLGLDSSLYGFIPETVS
ILLPAGHKLGKASPLFNKIEDSKIEELRKKYGGKQENGNSSSSTPSKAPKIDNATELEAA
ISKQGLLVRELKAKQDKTVWQPQVQILLQLKKQLADLAASSSSSSSAPSTPKVDNVNELE
AAILKQGLLVRELKAKEDKTVWQPQVQILLELKKKLADLTESSTKTVNSSTIGDKKNSPT
QNGVVDKAALEDKIAKQALVVRELKAKEDKSVWQPQVEILLKLKKELADAGGVIPTNPAD
KKSKKKK
NT seq
3084 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattctttcaacaaatgagggtaatccaaatgcccttaaattaattattggtgcaaaa
ttaggagataaaaatgttaatttaagtgttgttaagacaagtgacgagtcattaggacga
ttaccagcattaaaactaccatgtggtacaacattgtttagctctcgtgctgctttagaa
tatctttttgataattcaataaaagataattgttctgttaacaagtggcttgaatgggac
tcaacccaattgcagccagcattagtgtcttatggaagttctggatctttggacacttcg
cataagcctagaatatgggcattgttgaaagacttgaatgcaactttaaaaaacaacaaa
tacttgatcaacaatgatgatttgacatcagctgatgtatcaatttggacgagtctttgg
tcgacaattatttcaacaccagttggaaaagaaataacaaaagattttccaaatgttgat
cgatggattacagatatcgagcaattaccaattgttaaaaaatcacttgatgagtttaaa
attgaaagaggcatcaaagctatttccagtatccaagctgtttcttggtttcctatgaat
tcctatacaggaggtcgtaaaacaaatgctccaacaacgtcttgtgttacaatggatagt
ccaacagaagtgagtgatttagaaatcgataatattaaaaaaaattggataaaaccatct
catccatctattaaagctccacaatatcctgtactaccaaaaaaaggtgaacgtaatatt
ttagtaacatcagcattaccatatgtcaacaatgttccacatttaggaaatattattggt
tgtgttctatcagctgatatttttgctcgatactgtcgtcagcgtagttacaatacactt
tacataagtggtactgatgaatatggaacagcaactgaagcaaaagcacttgaagaaaat
ttatcaccacaagaaatatgtgataaatattttagcattcacaatgatatatatcgttgg
tttggcattggttttgatcattttggtcgtacaacaacaccagaacaaactgaaattgta
caagatttatttttacgtattaaatcacaaggttatattataactgaatcagttgatcaa
ttattatgtgaaaattgtgatcgttttttggctgatagatttgttgagggtacatgtcct
ggttgtaaatatgaagatgcacgtggtgatcaatgtgatggttgtggtcatttagttaat
gcaactgaattaataaaaccaagatgtaaagtatgtagtaaaacaccaataataaaagca
tcaacacaatttttcattgatttaccaaaactagagccaaagctacgtgaatgggcatca
agtgttgaaagtggctggtcatctgttgcaagagctgttactaaaccatggctacgtgat
ggattaaaacaacgttgtataacacgtgatttaaaatggggaataccagtaccacttgat
ggttatcgtgataaagttttttatgtatggtttgatgcaccacttggctatgttagtatt
acaaaaagatatacaaaagattatgaaaaatggtggaaaccagatgatacaactgatgtt
aatctttatcaatttatggctaaagataatgtaccatttcatgcaattatgtttcctgca
acattaattgctgctaatgaaaaacatatattagttaaaaatattatggcaacagaatat
cttaattatgaagatactaaattttcaaaatcacgtggtactggtgtatttggtactgat
gctagagaaactggtataccagctgatgtttggagattttatcttgcttatattagacca
gaaagtcaagattcaaatttcaattgggttgatttagcaactaaaaataacagtgaatta
ttaaataattttggtaattttgttaatcgatcacttatgtttgctggtaataattttaat
tcaactgtaccagatatgtatttacgtgatgaagatattaatgttcttgctcttgtacaa
cgtgaattaaatggatatttacaatcattggaacaagctaaattacgtgatggtttaaga
catttacttgccatttcaaaacatggaaatcaatatatgcaatcacaacaaccatgggtc
aaagttaagggtaatgatgatgataaaaaaattgccggtacaattattggtatttgttgt
aatttaagttgtctattggctgccctacttggtccatttatgccaaatacatcacgtcaa
ttgagaactcaacttggtcttgattcttcattgtatggttttataccagaaactgtatca
atattattaccagctggtcataagcttggtaaagcatcaccattatttaataaaattgaa
gattcaaagattgaagaattgagaaaaaaatatggtggtaaacaagaaaatggtaattca
tcatcatcaacaccatcaaaagcaccaaaaattgataatgccactgaattagaagctgca
atatcgaaacaaggtctattggttagagagctcaaggccaaacaagacaaaacagtttgg
caaccacaagttcaaatattattgcaattaaaaaaacaattagctgatttagctgcatca
tcatcatcatcatcatcagcaccatcgacaccaaaagttgataatgtcaatgaattagaa
gctgcaattttgaaacaaggtctattggttagagaactcaaagccaaagaggacaaaaca
gtttggcaaccacaagttcaaatattattggagttaaaaaaaaaattggctgatttaact
gaatcatcaacaaaaacagtcaattcatcaacaattggagataaaaaaaattcacctact
caaaatggtgttgttgataaagcagccctcgaagataaaattgccaaacaggcacttgtt
gttagagaactcaaagcaaaagaagacaaaagtgtatggcaaccacaagttgaaattctt
ttaaaattaaaaaaagaattggctgatgctggtggtgtgattccaacaaatccagctgat
aaaaagtctaaaaaaaagaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
