Aphidius gifuensis: 122860990
Help
Entry
122860990 CDS
T07796
Name
(RefSeq) E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3-like
KO
K15691
E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3 [EC:
2.3.2.27
]
Organism
agif
Aphidius gifuensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
agif00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04121 Ubiquitin system [BR:
agif04121
]
122860990
Enzymes [BR:
agif01000
]
2. Transferases
2.3 Acyltransferases
2.3.2 Aminoacyltransferases
2.3.2.27 RING-type E3 ubiquitin transferase
122860990
Ubiquitin system [BR:
agif04121
]
Ubiquitin ligases (E3)
Single Ring-finger type E3
Other single Ring-finger type E3
122860990
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ANAPC4_WD40
zf-RING_2
zf-RING_UBOX
WD40
zf-C3HC4
zf-rbx1
zf-C3HC4_2
zf-RING_5
ATP_bind_2
zf-ANAPC11
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122860990
NCBI-ProteinID:
XP_044021043
LinkDB
All DBs
Position
LG1:3318476..3321579
Genome browser
AA seq
640 aa
AA seq
DB search
MERPARAASPEYPEELPNDNEVIEIDNSDVDNSQVSPHLQEYNIISRNIQVIQDIIDQNV
ELMNHHNEDESVQNENRQNEDVNRGNVLPEEDSDNETIEVVRRNARRILSVDSSDSQIDA
IEEQKEEKEEESARKRPRLDDEKISTDKEDESWCQICMEAWTSSGVHRLCCLSCGHLFGQ
ECVVRWLKECTVATRRCPTCNVKADLKDVRVLYANKLIAIDNSEVNRLKIDNETLNSKNK
ILELQLSTSELRNRVFNEQVQGLMRKINELENQLKENIVLMKEKYNDTTTITDLCYQKNK
KFHMEKSIEIDPSNGCRVFDFNKKTGHLAISQKTSTRFSMFAGYGIKLFDVNLMNSVTFI
PVHQDAIRDLSFHSSHQSLVLSVGFDKTAKLVDVNTKSVVHNFPVGLKAWSCCWAGDDPN
NFLVGCEQGKIVYFDIRQTSGAVDTLSNTGVRSPVISLASVPPTSSCGIPRGGFLACTLN
SCYAYEQKNNIYTPKQMFKNGSYFCVKYDENCAHGLISCRGKNTKDSTFSDQQSKHSIFS
IERGQNDSVDCQIVHTFEAGDKQTNITRPCFINVDDDTLIAAYQESTKSIPLRSLSTGKL
IYSIPANDPVIDICSFKANNKLCLATLTSSHLRLYHYSNY
NT seq
1923 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaacgtccagcacgtgcagcttcacctgaatatccagaagaattaccaaacgacaat
gaagtaattgaaattgataattctgatgttgacaatagtcaagtttcacctcatcttcaa
gagtacaatattatatcacgaaatatacaggttatacaggatattattgatcagaatgta
gaattaatgaatcatcataatgaagatgaaagtgttcaaaacgaaaatcgacaaaatgaa
gatgtaaatcgtggtaatgttttaccagaagaagatagtgataatgaaactattgaagtt
gtacgtcgtaatgctcgtcgtattcttagtgtagatagttctgatagtcaaattgatgca
atagaagaacaaaaagaagaaaaagaagaagagtcagctcgtaaacgtcctcgtcttgat
gatgaaaaaatatcaacagataaagaagatgaatcatggtgtcaaatatgcatggaagca
tggacaagttctggtgtacatagattatgttgtctttcatgtggtcatctttttggtcaa
gaatgtgttgtacgttggttaaaagaatgtacagtagcaacacgtcgttgtccaacatgt
aatgtaaaagctgatttaaaagatgtacgtgtattatatgccaacaaattaatagccatt
gataattcagaagtaaatcgtcttaaaattgataatgaaacattaaattctaaaaataaa
atacttgaattacaattatcaacatcagaattaagaaatcgagtatttaatgaacaagta
caaggtttaatgcgtaaaataaatgaattagaaaatcaattaaaagaaaatattgtatta
atgaaagaaaaatataatgatacaacaacaataacagatttatgttatcaaaaaaataaa
aaatttcatatggaaaaatcaattgaaattgatccatcaaatggctgtagagtatttgat
tttaataaaaaaacaggacatcttgcaatatcacaaaaaacatcaacaagattttcaatg
tttgctggttatggtattaaattatttgatgttaatttaatgaattcagtaacatttata
ccagtacatcaagatgcaatacgtgatttatcatttcattcatctcatcaatcacttgta
ttgagtgttggttttgataaaacagcaaaattagttgatgttaatacaaaatcagttgta
cataattttccagttggtttaaaagcatggagttgttgttgggctggtgatgatccaaat
aattttttggttggttgtgaacaaggtaaaattgtttattttgatattagacaaacatct
ggtgctgttgatacacttagtaatactggtgttagatcaccagtaatatcacttgcatca
gtaccaccaacatcatcatgtggtattccacgtggtggttttttagcatgtacacttaat
tcatgttatgcatatgaacaaaaaaataatatatatacaccaaaacaaatgtttaaaaat
ggatcatatttttgtgttaaatatgatgaaaattgtgcacatggattaatttcatgtcgt
ggtaaaaatacaaaagattcaacattttctgatcagcaatctaaacattcaattttttca
attgaaagaggacaaaatgattcagttgattgtcaaattgtacatacatttgaagctggt
gataaacaaacaaatataacacgaccttgttttataaatgttgatgatgatacactcatt
gcagcatatcaagaatcaacaaaatctataccactacgatcattgtcaactggtaaatta
atttactcaatacctgcaaatgatcctgttattgatatttgctcattcaaagctaacaat
aaactttgtttggctacattaaccagttcacatcttcgactttatcattattctaattat
taa
DBGET
integrated database retrieval system
