KEGG   Agarivorans sp. B2Z047: LQZ07_04725
Entry
LQZ07_04725       CDS       T08685                                 
Name
(GenBank) EAL domain-containing protein
  KO
K18765  RNase E specificity factor CsrD
Organism
agq  Agarivorans sp. B2Z047
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:agq00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:agq03019]
    LQZ07_04725
Messenger RNA biogenesis [BR:agq03019]
 Prokaryotic type
  Bacterial mRNA degradation factors
   Other RNA degradation factors
    Others
     LQZ07_04725
SSDB
Motif
Pfam: EAL GGDEF GAPES4 PriA_3primeBD
Other DBs
NCBI-ProteinID: UQN43777
LinkDB
Position
1016360..1018252
AA seq 630 aa
MKFSSRIIVFTISCVVVAVLLVLLGGALTFRQLAFNQQQHQLRSVVEVIDGQLSVQPETP
EFAQWLPNWLRAHNIQVLEVANRGGVIYTFRELNYTGNSNNLIPYRYPLAAHPDFFIQIW
VEQPFKQLTYEPEAMLGIGGGVLIVALGLIAVFRWLKSIMYGAELLQTRGNQILAGRLRD
VQQGSGKEWPNAASKAIEQLITQLIEARQERSRFDCIIRNNAFVDELTQLSNRTHFLNQL
EAEIGDADAHTGAVLLVYLRGMDDVNYQYARNEGDAILQQSSEALKQYTRRNIDVNLARY
SGDAFALLMPLSTLDEAEDTAAGILKLLERIPLPEVAEADDFFYIGIAGYEYGDNAQLVI
EQAEDALRVAQMQRHNGWYAVPRELSSTQTGKGSVRWRTLLQHVLSNEALHYYQQEVFDE
DGRVCYKELLARITDYQGEVINAGVFLPWAEKSGLQADFDQHALKFAMQQVKYSRQPISI
NLNIATVIKQSVMRDLLQWVFSVPFKECQKLVLEFPETQLSQLNDTEMLRLKALNKKGIK
LAVERAGQRVVSTQYISELKLEYLKLHTSLVRDIQVRQVNQLAVSSLVASCAGRVQVMAV
GVERNEEWRVLQRLGVHHAQGFLFSKPEPI
NT seq 1893 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaattttccagtcggatcatagtatttaccattagctgcgtagtggtggcagtgcta
ttggtattgcttgggggtgcgcttaccttccgtcagttggcatttaatcagcagcaacac
cagttgcgttcggtcgttgaagtgatcgatggacagctgagtgttcaaccagaaacgcca
gaatttgctcaatggttaccaaattggctgcgtgctcataatattcaagtgctagaggta
gctaatcgcggcggggttatttatacctttcgtgagcttaattacactggcaatagcaat
aacttaattccttatcgttaccccttagcggctcatcctgacttttttattcaaatttgg
gtagaacaaccctttaaacagctcacctatgaaccggaagcgatgttaggtattggtggt
ggtgtgctgattgttgccttaggcttaatcgctgtatttcgctggctaaaaagcattatg
tacggtgctgaattgctgcaaactcgcggcaatcaaattctcgcaggtcgcctgcgcgat
gtgcagcaaggcagtggcaaagagtggcccaatgctgcgagtaaggcgattgagcagttg
atcactcaacttattgaagctcgccaagagcgtagccgctttgattgtattattcgcaat
aatgcctttgttgatgaacttactcagctatcaaatcgcactcactttctaaatcagctg
gaagcggagattggcgatgctgatgcgcacaccggcgcggtattgttggtatatctgcgt
ggcatggacgatgttaactaccaatatgctcgtaacgaaggcgatgcaattttgcagcaa
agctctgaggctttaaagcagtacacccgtcgtaatattgatgtgaacctagcacgctac
agcggcgatgcctttgctttactaatgccgctatctaccttggatgaagctgaagatacc
gcagcaggtatcttaaaattactcgagcgcattcccctgcctgaagtggccgaggccgat
gacttcttctacatcggtatcgcgggttatgaatatggtgataacgcgcagttggttatt
gagcaagctgaggatgccttaagagttgcgcagatgcagcgacataatggttggtatgcg
gtccctcgtgagttgagttctacccaaaccggcaaggggtcggtgcgttggcgtacttta
ctgcagcatgtgcttagtaacgaggcgctgcactattatcaacaagaagtttttgatgag
gatggacgcgtttgttacaaagagctgcttgcgcgtattaccgactaccaaggtgaagtg
attaacgcgggtgtatttttaccttgggctgaaaaaagtggtttgcaggctgattttgat
cagcatgccttaaaatttgcgatgcaacaggttaaatactctcgccagcccattagtatt
aacttaaacatagcgactgtgattaagcagtcggtaatgcgtgatttactacaatgggta
ttttctgttccatttaaagaatgccaaaagctggtgctggagtttcctgaaacgcagcta
tcgcaactcaacgatactgaaatgctacgcttaaaagccttaaataaaaaaggtattaag
ctagctgttgagcgcgctggtcagcgtgttgttagtactcaatacattagtgagcttaag
ttggaatacttaaagctgcacactagtttggttcgagatattcaagtgcggcaagttaat
cagttagccgtgagctcattggtagccagttgtgcaggtcgggtgcaagtgatggcagta
ggtgttgaacgtaatgaagagtggcgagttttgcagcgtttaggcgttcatcatgctcag
ggctttttgtttagtaaacccgagcctatttaa

DBGET integrated database retrieval system