Agarivorans sp. B2Z047: LQZ07_12230
Help
Entry
LQZ07_12230 CDS
T08685
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
Organism
agq
Agarivorans sp. B2Z047
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
SecD_SecF
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UQN45192
LinkDB
All DBs
Position
complement(2639261..2642368)
Genome browser
AA seq
1035 aa
AA seq
DB search
MLLSDISVKRPVVAIVLSLLLCVFGIASFSQLAVREMPDVENPVVTISTRYEGVSATIID
SQITSVIEDQLSGISGIDQIDSVSRNGMSRVTVTFLLGWPLTEGVSDVRDAVERAKRSLP
DDITDPVVSKDNGSGEASIYINLNSNKMDRTELTDYAERVLVDRFNLISGVSSVELTGAL
YKVMYVKLDPTLMAGRQVTPSDIVTALKSENLELPGGEIRNDTTVMSVRTERLYAEPEDF
DYLRIRTSEDGTHVYLKDVASVFVGAENENSTFKSDGILNLSLGIVTQLDANPLNVATMV
ANEVERLQRFVPEGTELKVDYDATVFIDQAIDEVYQTLMITGGLVVLVLYIFLGQARVTI
IPAITVPVSLIATFIAAQSFGFSINLITLMALILAIGLVVDDAIVVVENIYHHIEQGTPP
LLAAYRGTREVGFAVIATTLVLVMVFLPIAYMDGMVGKMFTEFSVLLSVAVIFSSFIALT
LTPVLSSKLLRHNAKPSRISKMMDAAFAKLIPAYQTLLNKIIATRTAGPTSIVLCVLGSV
AFMQAIPSQLAPVEDRGVVFIMIKGAEGTSYDRMTTNMDQVEQQIMPLVGNGVIKSFNMQ
TPAFGGRAGDNTAFIIVQLEDWAEREQNAGDVVNLLRKTLSNIADISIRPMQPGFRGKSN
DPIQFVLAGSSFEELNHWGQVVMQAAEAHPAISTVDINYSEKTPELIVKIDRQRAAELGV
SVSDISDTLEVMLGGRSETTFVDRGEEYDVYLRGGEEGFNSASDLSKIYLRAANGSLVTL
DSVTQLEEIASASRLSRLDKQRAVTVSGTLNQGHTLGEALDYLEQVAIEQLPSDISIAYS
GESKDYKENQSSTFIIFCLAILVAYLVLAAQFESFINPMVVMLTVPMGIFGGLAGMYFMG
ESLNIYSQIAMIMLIGMVTKNGILIVEYANQLRDRGIEFNQAIVQAASRRLRPITMTAFT
TVAGAIPLIVSTGAGAESRISVGTVVLFGMAFASIVSLLVIPAMYQLLARSTHSPGHVGE
QLNQQIAADKQATKV
NT seq
3108 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctgctgtctgacatttcggtaaaacgccctgttgttgccattgtattaagcttgttg
ctgtgtgtttttggtattgcttcgtttagccaattggctgtgcgagaaatgccagatgta
gaaaacccagttgttaccataagcacccgttacgaaggcgtgtctgccaccattatcgac
agccaaataacctcggtaattgaggaccaattatcgggcattagtggtattgatcaaatt
gattccgtgtctcgaaatggtatgtcgcgggtaaccgtaacctttttactgggttggccc
ttaaccgagggtgtgagcgatgtgcgtgacgccgttgagcgagcgaagcgtagtttgcca
gatgatattactgatccggtagtgtctaaagacaacggaagcggcgaagcttctatctat
atcaacctaaactctaataagatggatcgcaccgagctaaccgactacgcagagcgcgta
ttggtagatcgttttaaccttattagcggagtaagctcggtagaacttaccggtgcatta
tacaaagtaatgtatgtaaaactcgaccccaccttaatggccggtcgacaagttactcct
agcgacattgttactgcattaaaaagcgaaaacctcgagctacccggcggtgaaataaga
aacgataccacggtgatgtcggtacgcaccgagcgactctatgccgagccagaagatttt
gactacctgcgaattagaaccagtgaagacggcactcacgtttatctaaaagatgtggct
agcgtatttgttggtgccgagaacgaaaactccacctttaaaagtgatggcatcttaaac
ctaagcctaggcattgttacgcaattagatgctaacccacttaatgtagccaccatggtt
gcaaacgaggttgagcgtttacaacgtttcgtacccgaaggcaccgagctaaaagtagat
tacgatgccacggtgttcatcgaccaagccatcgacgaggtctaccaaaccttaatgatc
accggtggcttagttgtgttagtgctatatattttcctaggccaagcgcgagtaacgatt
attcctgcgattaccgtaccggtatcgctaattgccacctttatcgccgcacaaagcttt
ggcttttccatcaacctaattaccttaatggcgcttattcttgccattggcttagtagtg
gatgatgccattgtggtagtagaaaatatttaccaccacatcgaacaaggcaccccgccc
ttgctagcagcctatcgcggtacccgtgaagttggttttgccgttattgctaccactctg
gttttggttatggtgtttttgcccattgcctacatggacggcatggtaggtaaaatgttt
accgagttttcggtattgctatcggtagccgttattttctcttcgtttattgcactaact
cttaccccggtgctcagcagtaaactgttgcgtcacaatgctaaacctagccgtataagc
aaaatgatggatgcagcgttcgcaaaattgatccctgcttatcaaactctgctaaacaaa
attatcgcgactcgcactgcggggcctacctccattgtactgtgtgtgcttggcagtgtt
gcgtttatgcaagctatcccctcacaacttgcgccggttgaagacagaggcgtggtattc
atcatgatcaagggtgccgaaggtactagctacgaccgtatgaccaccaacatggaccaa
gtagagcagcaaattatgcccttggttggcaatggcgtgattaagtcatttaacatgcaa
accccagcatttggtggccgcgccggcgacaacaccgcctttattattgttcaactagaa
gactgggcagaacgcgaacaaaatgccggtgatgtggttaacctgctgcgtaaaacactg
tctaacatcgctgacatttctattcgacccatgcagccaggctttagaggaaaatcaaac
gaccctattcaatttgtattggcgggttcaagctttgaagagctaaaccattggggccaa
gtagttatgcaagccgccgaagcacaccctgcgattagtacggtagatattaactactct
gaaaaaaccccagagcttattgtaaaaattgaccgccaacgcgccgccgagttaggcgta
agtgttagcgacatttccgacacattagaggtaatgttaggaggccgcagcgaaactacc
tttgtagacagaggcgaagaatacgacgtttacctgcgtggaggcgaagaaggctttaac
agcgccagcgatttaagcaaaatttacctacgtgcagcaaacggtagcttggtaacccta
gatagcgtaacccaactagaagaaatagcctctgccagccgactaagccgcttagacaaa
cagcgagcggtgactgtttcgggtacgcttaatcaaggccacaccctaggcgaagcacta
gactacctagaacaggttgccattgagcaactgcctagcgacatatctattgcctacagc
ggagaatctaaagactacaaagaaaatcaaagtagtacctttattattttctgcttagcc
atattagttgcctatttagtgcttgccgcccaatttgaaagcttcatcaacccaatggtg
gtaatgcttaccgtaccgatgggaatatttggtggcctagctggcatgtatttcatgggc
gaaagcctcaatatttacagccaaattgccatgatcatgctcattggcatggttaccaaa
aatggcattctcattgttgagtacgccaaccaacttcgtgaccgaggcattgagtttaac
caagcaattgtgcaagccgcatcaaggcgcttacgcccaattaccatgacagcctttacc
acggtagctggtgcaatccccttaattgtctctactggagcgggagcagaaagccgaata
tcagtaggtacagtggtattgttcggaatggcctttgcttcgattgtaagcttactggtg
ataccagcaatgtatcagctattagcacgctcaactcattcacccggccatgttggcgag
caacttaatcagcaaatcgctgccgacaaacaagccactaaggtttaa
DBGET
integrated database retrieval system