Aphis gossypii (cotton aphid): 114121612
Help
Entry
114121612 CDS
T05869
Name
(RefSeq) GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1 isoform X2
KO
K27566
GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1
Organism
ags
Aphis gossypii (cotton aphid)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ags00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
ags04131
]
114121612
Membrane trafficking [BR:
ags04131
]
Endocytosis
Rab GTPases and associated proteins
Rab associated proteins
114121612
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RasGAP
VPS9
DUF5601
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
114121612
NCBI-ProteinID:
XP_027839822
LinkDB
All DBs
Position
1:28024210..28033980
Genome browser
AA seq
1450 aa
AA seq
DB search
MEDQTLLQDLMELATHMRQERLFTQYELNNLQTLNEQVTSVSNRLAQEAWITTQQRINLN
KLVLSNPDCTPADCCEIAQHLDDAHFVEVHESIGYDNAQGFGVLVQKLRTNPKLLASCLA
AGDRLFTNKMPEVVNCTLSGVFGSCLMAEDNVLILKLLRHLAVLQLIPADNPRRVLSHGS
CAFSRLYSAFHGSLFSAKLFLTAAFHDPIMELLKDEEKYLDIDPDKAQLRFSHLRICNRE
SSDYNLKLQNYRKSIVEQLVAIASKFINSLNENLYCFPSSVCWLVRQIHTLLTAGSTLTE
KQIYGICVNLVFTYFICPAIINPEPHGITDADITQIARYNLIQVANIIQMLAMYKYEPID
NKVQDLYQHFNKDCISSLMEALLKTSSRNSLNDDNLTVNSNVKLENLIRSVALFTEEELQ
TFVNFLNVVSNDGTLSELDKKELADLLMNMPIMWPDNNSNDKFQLPLEQKKLGILSKTAA
SSLGKVLPNTNILNFSNSEGFNDDDDKFKKDFDQKVLIVPFENTFNSGIGLLPEHKVLEI
EKSNLLEDGEQNNKLYEIVKKKEKPLHSVSHEGSIVDTGNTSDYLEVVSEAASNHSVPSS
VELDQDQNDNLSDMISANVSGRGTPNISGRDTPSSQVTENEDIVNGPPTPSARINPSAKQ
CKFDLDDKFGKFEIKSKMQGMGRDETTSSMVSDTWSMDVLASDNEILDQSDRSQISVQLP
PPPQLQTISNNQQILDINETASEAWSTDVFASDTDRLAEVDTDDTASVARSDDMLRYELE
SRGDMDGTDDSSNYHYSPNVFRPIVEVQQESNLRSENALSFNNRVQRRKVSDSSAESNTN
KFVGSPDDVPSTRTETGLNVSRSAFSMASTSSEQTPTGPPKLSHRPQPSSSQEASVDDGD
TNMGLHMSSCSLSSTTSSSGSSLGAKPKPMLMNGSVVTMKTNTNAVAINTKMGNNGNLIT
KSISFDKTAERGDREGYDDDSKNKRGFFKNFKISFKNRRGKWYRNDELGYDPLQGCSNSS
GNELILNNNLSENLLLDESSEDILAKYRKKPSNILNTNEKISSQKSGTAKNDEDSVLELN
QNIDFEKYSFDDAKKKLRLVLSTVDIQYVPWCNETESKPMLNTWRDKDNEIVGLLQYQLA
EATNLNDHFISARLHETIRCMKMFDTHSCQKLIGALKEDYKSRAPYITYLVKCRKTLLTS
IAQLNRLLEQIKCDREVCHQFLITKCVQIFLEQKNQLVLEFIDEFEQSKLADEKNQHLNR
FLSTLEIEMKRNNIWKNASFDQIDDAKLTIERAIISRVYTLAMYPNGDADFCRDQVLREH
MSNLSKNLVPTHNDLRIPKKFHFECPWPSAQAEISAISAYKTPKDKLQCVFRCTTTLLNL
MSMAGEHGNMHPAADDIVPVLVYVLIKANPPSLLSTVQYINSFYGDRLEGEEHYWWIQFC
AAIEFIKTMN
NT seq
4353 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaggatcaaacgttattgcaagatcttatggaactagccacgcacatgcgacaggaa
cgacttttcactcaatatgaattgaacaatttgcaaacattgaatgaacaggtgaccagt
gtatcaaatagattggcccaagaagcatggataacaactcaacaacgaattaatctcaac
aaattagttttgtctaatcctgattgtactcctgctgattgttgtgaaattgctcaacac
ttggatgatgcacactttgttgaagttcatgaatcaattggctatgataatgcacaaggg
tttggtgttcttgtgcaaaaattgcgtacaaatccaaaactactagcaagctgtttagct
gctggagatcgattatttactaacaaaatgccagaggttgttaattgcactttatctgga
gtgtttggatcttgtttgatggctgaagataatgttttaatattaaaattacttagacat
ttggctgtgctacaattaatacctgcagataaccctcgcagggtattaagtcacggatca
tgtgctttttcaagattgtattcagcattccacgggagtttattttctgcaaagttattt
ttgactgctgccttccatgatcccattatggagttgttaaaagatgaagaaaagtacctc
gacattgatccagataaagctcaactgagattttctcatcttagaatatgcaaccgtgaa
agttcagattataatttaaaactacaaaactatagaaaatctattgtagagcagttggta
gcaattgcttcaaaatttattaacagcctcaatgaaaatctttactgctttccgagttca
gtatgttggcttgtgagacaaattcatacattattaactgctggaagtactttgactgaa
aaacagatctatggcatttgtgtaaatctagtttttacatattttatttgtccagcaatc
ataaatcccgaaccacatggaattactgatgccgatattactcaaattgctcgttataat
cttattcaagtggccaatattattcaaatgttggctatgtacaaatatgaaccaattgat
aataaagttcaagatttgtatcagcactttaataaggattgcatttctagcttaatggaa
gccctattaaaaacatcatcacggaattctttaaacgatgacaatttaactgttaattct
aatgttaagttggaaaacttaattcgatccgttgcattatttactgaggaggaactccaa
acttttgtaaatttcctaaatgtggtttccaatgatggaacattgagtgagttggataaa
aaagaattggctgatttattgatgaatatgccaataatgtggcctgataataactcaaat
gataaatttcaattacctttagaacaaaaaaagttagggattcttagtaagactgctgct
tcatctcttggaaaagtattaccaaatacaaatattttaaatttttctaactctgaaggt
tttaatgatgatgatgacaaatttaaaaaagattttgatcaaaaagtcctaattgtacca
tttgagaatacatttaactctggaatcggtttattacctgagcataaggttttggaaatt
gaaaaatcaaacctcttagaagatggcgagcaaaacaataaactatatgaaattgtgaag
aaaaaagaaaaacctctgcattctgtatctcatgaaggatctattgtggacactggaaat
actagtgattatttagaagttgtctcagaggctgcatcaaaccatagtgttccgtcatct
gtggaacttgaccaggatcaaaatgataatttatcagacatgatttctgcaaatgtatca
ggacgaggaacaccaaatatatcagggcgtgatacaccatcatcacaagttacagaaaat
gaagatatagttaatggtcctccaacaccatctgctcgtataaatccatcagcaaaacaa
tgtaaattcgatctagatgataaatttggcaaatttgaaataaaatctaagatgcaaggg
atgggacgtgatgaaaccacgtcatccatggtatcggacacatggagtatggatgtttta
gcaagtgataatgaaatactcgatcagtctgatagatctcaaattagtgtacaacttcct
ccaccaccacaattacaaactatttctaataatcaacaaatattagacattaatgaaact
gcgtctgaagcctggagtacagatgtttttgcttctgacactgatagattggctgaagtt
gatacagatgatacagctagtgttgcaagatctgacgatatgttaagatatgaattagaa
agtagaggtgatatggatggaactgacgattcttcaaattatcattactcgccaaatgta
tttagacctatagtagaagtacaacaagagagtaatttacggtcagaaaatgcattgtcg
tttaacaatagagtacaaagacgaaaagtatctgatagtagtgctgaatctaatactaat
aaatttgttggttcccctgatgatgtcccatcaactagaactgaaacaggattaaatgta
tctagatctgcattttctatggcgtccacttctagtgaacaaactcctactggaccaccc
aaactttctcatagaccacaaccatcatctagtcaagaagcttcagtcgatgatggtgat
acaaatatgggtttacatatgagttcttgtagtttatcatctacaactagtagcagtggc
agcagtctgggagctaaacccaaacctatgttgatgaatggttcagttgtaacaatgaaa
actaataccaatgcagtggcaattaatacaaaaatgggaaataatggaaatttaatcact
aaaagtataagttttgataaaacagcagaacgtggtgatagagaaggatatgatgatgat
agtaaaaataaaagagggtttttcaaaaactttaaaatttcttttaaaaatcgtcgagga
aaatggtacagaaatgatgaattaggctatgatccattacaaggttgtagtaatagcagt
ggaaatgaattaatattgaataataatttatctgaaaatcttcttcttgatgaatcttct
gaagacatattggccaagtaccgtaaaaagcccagcaatatattgaatacaaatgaaaag
atttctagtcaaaaatcaggaactgcaaaaaacgatgaagattctgtgttagagcttaac
caaaacattgattttgaaaaatactcatttgatgatgcaaaaaagaaattgcgacttgtg
ctgagtactgtggacatacaatatgtaccctggtgtaatgaaactgagtctaaacctatg
ttaaatacgtggcgagataaggataacgaaattgttggcttgttacaatatcaacttgca
gaagctaccaatcttaacgatcattttatatcagctagacttcatgaaacaattaggtgc
atgaaaatgtttgatacacacagttgtcaaaaattaattggtgcattaaaagaagactat
aaatccagagcaccctatattacatatcttgtgaaatgtagaaaaacattattaactagt
atagcccagttaaacagactgttggaacaaatcaaatgtgatcgtgaagtatgccatcaa
tttttaattacaaaatgtgtgcagatatttttagaacaaaaaaatcaattggttttggag
tttattgatgaatttgaacaaagcaagttagccgatgagaaaaatcaacatctaaataga
tttttgtcgacacttgaaattgaaatgaaacgcaacaatatttggaaaaatgctagtttt
gatcaaattgatgatgcaaaattgactattgaacgagcgattattagtagagtgtacaca
ttagcaatgtaccctaatggtgatgcagacttttgtagggatcaagttttacgagaacat
atgtctaatttgtccaagaatttagtacctacccacaatgatctacgtatacctaaaaaa
tttcattttgaatgtccttggccttctgctcaagctgagatttcagcaatttcagcgtat
aagacaccaaaagacaaactgcaatgtgtatttcgatgcactactactcttttaaatctg
atgtcaatggccggtgaacatggaaatatgcatccagctgctgatgatatagttccagtg
ctcgtttacgttctaataaaagcgaatcccccttcgttgctatcaactgttcagtatata
aatagtttttatggggatcgtttggaaggcgaagaacattattggtggatacagttttgt
gctgcgatagaatttattaaaactatgaactaa
DBGET
integrated database retrieval system