Aphis gossypii (cotton aphid): 114123741
Help
Entry
114123741 CDS
T05869
Name
(RefSeq) probable ATP-dependent RNA helicase kurz
KO
K14780
ATP-dependent RNA helicase DHX37/DHR1 [EC:
5.6.2.6
]
Organism
ags
Aphis gossypii (cotton aphid)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ags00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
ags03009
]
114123741
Enzymes [BR:
ags01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.6 RNA 3'-5' helicase
114123741
Ribosome biogenesis [BR:
ags03009
]
Eukaryotic type
90S particles
Helicases
114123741
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DHX37_C
OB_NTP_bind
DEAD
Helicase_C
HA2_N
HA2_C
AAA_22
ResIII
AAA_19
ATPase
nSTAND3
AAA_30
PhoH
T2SSE
SRP54
AAA_16
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
114123741
NCBI-ProteinID:
XP_027842612
LinkDB
All DBs
Position
3:6553052..6558757
Genome browser
AA seq
898 aa
AA seq
DB search
MSGEIKSAAKKQPVPINRTSEIIKSRSKLPIIGEEQVIMEAISENDVIIVVGETGSGKTT
QVPQFLYEAGYSNGNKLIGVTEPRRIAAISVSQRVAEELNETSDIVSYLIRFEGNAGPNT
KIKFMTDGVLLKEIQNDFLLKNYSAIILDEAHERRVFSDILIGILSRIVRLRQKRANPLK
LIIMSATLKVDDFSKNQKLFPQPPPIIELSSRQFPVTIHFNKKTPHDYLDEAYKKIYKIH
SNLPAGAILVFLTGKLEVKQLVSKLRKAFPYRETDSKIGVNTKCKAEKKNEIGKPLPEIN
LDDYDIEMHSEDELILSENSSADEDDDDDDEVPSKIMKFSSSPLWVLPLYSMLPAHKQSK
IFEPPPPGCRMCVVSTNVAELSLTIPNVKYVVDCGKTKIREYDPLTSVSRFSVVWESKAS
ANQRAGRAGRTSPGHCYRLFSSALFNDEFPEWNLPEIQTTPIDNVILQMKSMKIDKITSF
PFPTPPDKQTILGAEKRLVTLGALEVDKNVAEINNITPLGKSMAAFPLSPHYAKMLCLSK
DRSLLQYMLFIISAMSVQEYLPGDNVEAWKKTKLSWANKGEFLLLGDLMVILRSMGGASH
AMKKSGLGGLQDYCTKTGLHQKSILEAWKLNNQLINQLNINVPSLKLNTDLDMTPPTPIQ
VKQIRQIVLAGMLDRVARRLTTNELNRNGIRPNKAAYYASNLTEIVYIHNSSVLKKSKPE
WLIYQEIFQVQDKMYIKGLTAIEPEWLPVYANRLCKTLKVLDDPTPRYDEETEKMFCTVN
ATYGQAGWSLPQAEIEFPDIEKKYCWLAFFILSGNVFPQLKDFRQHLLSEPDLIVKPWLK
FLKESFYLLTQTLIKNRDDSPKKIKEHWLKKPTYLLEEYLTWLPQSAHKEVKLIWPPL
NT seq
2697 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtggagaaataaagtctgctgctaaaaagcagccagtaccaatcaatcggacatca
gaaattataaaatcacgttcaaaattaccaattattggtgaagaacaagtcattatggaa
gcaatcagtgaaaatgatgtcatcattgtggttggtgaaacaggtagtggaaaaactaca
caagtacctcagtttttatatgaagccggctactcaaatgggaataaattaattggtgtc
acagaacctaggcgtatcgctgcaatatctgtatctcaacgagtagctgaagagttaaat
gaaacatccgatattgtatcatatttaataagatttgaaggaaatgcaggacctaataca
aaaataaagtttatgactgatggtgtattgttaaaagagatccaaaatgattttttgcta
aaaaactattcagcaattatattagatgaggctcatgagagacgagtattttctgatata
ctgattggtatcttatcccgtattgttcgactgcgtcaaaaaagagctaatccattgaag
ttaatcattatgtctgctactcttaaagttgacgatttttcaaaaaatcaaaaacttttt
cctcaaccaccacctattattgaactaagttcaagacagtttccagtgacaattcatttc
aacaagaaaacaccacatgattatttagatgaagcttataaaaaaatctataaaatccat
tctaatttaccagctggtgctattttagtatttttaactggtaaattagaagtaaaacaa
ttggtatcaaagcttcgtaaagcttttccatatcgagaaacagattctaaaataggtgtt
aataccaaatgtaaggctgaaaagaaaaatgaaattggaaaacctttgcctgaaattaat
ttagatgattatgacattgaaatgcattcagaagatgagttaattctttcggaaaattca
agtgccgatgaagatgatgatgatgatgatgaagtaccaagtaaaatcatgaaatttagt
tcttcgccgctatgggtacttcctctctattcaatgttacctgcccataaacaatcaaag
atatttgaaccacctcctcctggttgccgtatgtgtgttgtaagtaccaatgtagcagaa
ctctctttaactatacctaatgtcaaatatgttgttgattgtggaaaaactaaaattcga
gaatatgatccattaactagtgtttcgagattctcagtcgtttgggaaagtaaagcttca
gcaaatcaaagagctggtagagctggaagaacttcacctggacactgttatcgtttattt
tcatctgctctattcaatgacgagtttccagaatggaatttacccgaaattcaaacaaca
cctattgataatgttattttacaaatgaaatcaatgaaaattgataaaataactagtttt
ccatttcctacaccaccagataaacaaaccattttaggagcagaaaaaagattagttaca
ctaggtgctttagaagttgacaaaaatgttgccgaaatcaacaatattacacctctggga
aagagtatggctgcttttccattatctcctcactatgctaagatgttgtgtttgagtaaa
gaccgtagtttattacaatatatgctattcataatttctgcaatgtctgttcaagaatat
ttacctggtgacaatgttgaagcttggaaaaaaaccaaactttcatgggcaaataaaggc
gaatttttactcttaggggatctaatggtaatattacgatccatgggaggtgcaagtcat
gcaatgaaaaaatcggggttaggaggtctacaagattattgcaccaaaacaggattacat
caaaaatcaattttagaagcttggaaattgaacaatcaattaattaatcaactcaacata
aatgtgccatcattaaaattaaataccgatttagacatgacaccgcccacaccaatacaa
gtaaagcaaataagacaaattgtattagctggcatgttagatagagttgcaaggcgatta
accaccaatgaattaaatagaaatggaataaggccaaataaggctgcttattatgcatca
aatttaacagaaatagtatacatacacaacagtagtgttttaaaaaaaagtaaaccagaa
tggttaatttatcaggagatatttcaagtacaagacaaaatgtatattaaaggtcttact
gcaattgaaccggaatggttacccgtgtatgctaatagattatgtaaaacattaaaagta
ttggatgaccctacacccaggtatgatgaagaaactgaaaaaatgttctgtacagttaat
gcgacttatggtcaagctggatggtcattaccacaagctgagattgaatttccagatatt
gaaaaaaaatattgttggttagcattttttatactgagtggaaacgtttttccacagttg
aaagattttagacaacatttgttgtccgaacccgatctcatagtaaaaccttggctaaaa
ttcctaaaagaatcattttatttgcttacacaaacattaatcaaaaaccgcgatgattca
ccaaaaaaaattaaagaacattggttaaaaaagccaacatatttgttggaagaatattta
acatggttaccacaatcagctcataaagaagtaaaattgatatggccaccattgtaa
DBGET
integrated database retrieval system