Aphis gossypii (cotton aphid): 114126247
Help
Entry
114126247 CDS
T05869
Name
(RefSeq) chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1-like isoform X1
KO
K11367
chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1 [EC:5.6.2.-]
Organism
ags
Aphis gossypii (cotton aphid)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ags00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
ags03021
]
114126247
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
ags03036
]
114126247
Transcription machinery [BR:
ags03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase II system
Coactivators
SAGA/TFTC/STAGA complex
114126247
Chromosome and associated proteins [BR:
ags03036
]
Eukaryotic type
Histone modification proteins
HAT complexes
SAGA complex
114126247
SLIK complex
114126247
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
HTH_Hrp3
CDH1_2_SANT_HL1
Helicase_C
CHD1-like_C
Chromo
ResIII
HDA2-3
DEAD
Chromo_MIT1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
114126247
NCBI-ProteinID:
XP_050053315
LinkDB
All DBs
Position
1:43701108..43713453
Genome browser
AA seq
1810 aa
AA seq
DB search
MRFVGLTAIYCGGNRRFFNMVPQIGQVWPQQRVLYIKINHRCCGSVTYYWQPIKRIATYS
APRHNIVGWFDHLVAGTMLPSMYSKGFKLQNVSEEESSDSDNSNELNSDGSTSSSSSESQ
SDASQEANSSEQSTDEYSPSERSKRVIKPSLKPSESDNSSDYSSRVTINKKWKNDSSDYD
SETDKEEIPRSKSLAALRRQKQPTRRPTTKLNLRLNKRKNNSYSANSDDEDASKSRNLRR
RLQTVNYKEESEKSDSDNYDSETDKEEIPLSKSLAALQPQKQPTRRPTIKLNPRFNKRKN
DSYSINSNDEDASKSRNTRQRLQTVSYKEESEKSDSDDYLEREEVEEKEELSDTYETIEK
VLARRQGKIGAVGNITTIYAIEENGDPNIDCDPNEKETQFLIKWKGWSHIHNTWESMNSL
LDQEIKGLKKIDNFVIRENSIGAWCNQMTPEDSEYYECQLELQQDLLKSYNIVERIIGES
KIPTQEEYYVKWQSLPYSDASWEVASLIERKWPQKIKEFRDREGSKTTPSIACRALKYRP
KFVQLSKEPEYFGGYDEKLILRDYQLHGVNWLIHSWCKDNSVILADEMGLGKTIQTICFL
NYLFHNYQMHGPFLVVVPLSTMPSWQREFSLWAPDINIVTYIGDVKSRNIIRETEWCYES
SKRLKFNAILTTYEIVLKDSSLLNSLSWAVLLVDEAHRLKNDDSLLYKALQSFDTNQRLL
ITGTPLQNNLKELWALLHFIMPAKFDNWEEFEHMHDNAASKGYTKLHRQLEPYILRRVKK
DVEKSLPAKVEQILSVEMTPVQRKYYKWILTKNFNALRNESKGSLTTFLNIMIELKKCCN
HALLTKPQENENTADANLQSLLRGSGKLMLLDKLLVRLKETGHRVLIFSQMVRMLDILAE
YLSYRRLPFQRLDGSIKGDVRRQAVEHFNAEGSQDFCFLLSTRAGGLGINLATADTVIIF
DSDWNPQNDLQAQARAHRIGQKSQVNIYRLVTKGSIEENIVERAKQKMVLDHLVIQRMDT
TGHTVLDKKAKNASIPFNKDELTAILKFGAEELFKDDPGADEEPLCDIDEILRRAETRDE
TSTTVGNELLSAFKIASFTFNEEKDIVDKSPKTQNEQKNKEWEEIIPESLRKKVEDEEKA
KEIGDRYLPPRSTKTLQKLNQEGKRKKDESDDDSDEDRPRKRVRPHVETKEVVKKPFTDA
EIQKLIKSCKRFPNPMKRIDAVADDADLQKKPKSELKKIIQVLYDRCNEACNSEHTEKES
DATNDDGIKKKIRGPLIKLGGVTVNAKNVLACSEELDILDDIIPSDEEERSKFTLDLKYV
KSANFDFDWDITDDSKLLIGIYLYGLGSWEAIKIDTALGLSDKILSNEDKKPQAKHLLTR
SEYLLKMLKKTQVVIKGESTPKKARKVKEGKLRKIIDDNSTGNINKKKIDSATNHDENLK
SKKDLINDLIKSGLTGSPPKEKKPKIATKTGPMHFTANSESKAVNVDDIVELPKEKFLEC
KEKMRPVKKVLKALDDPEEKKNELHYINHMQECLIEIGSHIGKCLEKYKDPDKIREWRRN
LWFFVSKFTEFDSKKLLKVYQRGLHVIEKLEKDNKVKDRSKNKDKIRDKSKEDKKLRKNM
ETKDSLPLLKRKSRDSDDLEKKSKKQKTSNSNSGALSTIPTTPPSSSNSSNAISSYGQSS
NQCDANYNHHRNRNTPYFRSDNRSGTRNDNRRFSSSRDSNVRFERYDNNYYSCPAFRGRA
REIDSDMRMHDKIRYQQDAYTAYRQAAAASFYAPELYSRSGSASYLRLPQYSVSSDWHTP
VSEYRRDYGS
NT seq
5433 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgttttgtcggtttgaccgctatatattgcggtgggaaccggcggttttttaatatg
gttccgcaaatcggccaagtctggccccaacaacgcgttttatatattaaaattaatcat
agatgttgcggatcggttacgtattattggcaaccgataaaacgtatagctacgtatagt
gcaccacgccataatatagttggttggtttgatcacttggtagccggtaccatgttacca
tccatgtatagtaagggatttaaactgcagaatgtatcagaagaagaatcatcagactcg
gataatagtaatgaacttaattctgatggttcaacatcatcatcaagttctgaaagccaa
tctgatgcatctcaagaagctaacagctctgaacaatcaactgatgaatatagtccttct
gagcgatccaaacgcgtaattaaaccatcattaaaacctagtgagagtgacaattcaagt
gattacagttctcgagtcactataaataaaaagtggaaaaatgatagctcagattatgat
tctgaaactgacaaagaagaaatacctcgtagtaaatcattagctgcattacgacgtcaa
aaacaacctacaagacgtcctacaaccaaattaaatctacgtttaaataaaagaaaaaat
aatagttatagtgccaacagtgatgatgaagatgctagtaaatctagaaacttacgtcga
agactacaaacagttaattataaagaagaaagtgaaaagagtgatagtgataattatgat
tctgaaactgacaaggaagaaatacctctcagtaaatcattagctgcattacagcctcaa
aaacagcctacaagacgtcctacaatcaaactaaatccacgttttaataaaagaaaaaat
gatagttatagtattaacagtaatgatgaagatgctagtaaatctagaaatacacgtcaa
agactacaaacagttagttataaagaagaaagtgaaaagagtgatagtgatgattatttg
gaaagagaggaggttgaagaaaaagaagaactatctgatacttatgaaacaattgaaaaa
gttttggctcgaagacaaggcaaaataggtgctgtaggaaatataacaactatttatgca
attgaggagaatggcgatcctaatattgactgtgatcctaatgaaaaagagactcagttt
ctgatcaaatggaagggttggtcacatattcataacacttgggagtctatgaattcgctt
ttggatcaagaaattaaagggcttaagaaaattgataattttgtgatacgtgaaaactct
atcggtgcatggtgtaatcaaatgactcctgaagattctgaatattatgagtgtcaactt
gaacttcaacaagatttattaaaaagctacaatattgttgaaagaataataggagaatct
aaaattccaacacaagaagaatattatgtaaagtggcaatctttgccttatagtgatgca
tcatgggaagtagcttccttaatagaacgtaagtggcctcaaaaaataaaagaattcaga
gatcgcgagggctcaaaaacaacaccatctatagcatgtagagctttaaaatatcgtcca
aagtttgttcaactttctaaagaacctgaatattttggtggttatgatgagaaactgata
cttcgagattaccaattacatggtgtgaattggcttattcattcatggtgcaaagacaat
tctgtaattcttgctgatgaaatgggcctcggaaaaactattcaaaccatatgttttctt
aattatttatttcacaactatcaaatgcatggtccattcctagttgttgttcctttatca
actatgccttcatggcaacgagagtttagtttatgggctcctgatataaacattgtaaca
tatattggagatgttaaatctcgtaacataatacgtgaaacagaatggtgttatgagagc
tctaaaagattaaaatttaatgctattcttactacatatgaaattgttcttaaagatagt
tcacttttaaatagtcttagttgggctgttttactagttgatgaagcacatcgtttaaaa
aatgatgattccctattatacaaagctcttcaaagttttgacactaatcagagattactt
ataacaggaacacctttgcaaaacaatttaaaagaactgtgggcattgttgcatttcatt
atgcctgcaaaatttgataactgggaagagtttgagcatatgcatgacaatgcagcaagt
aaaggttatacaaaacttcatagacaacttgaaccatatatattacgccgtgttaaaaaa
gatgtagaaaagtcattaccagccaaagttgaacaaatattaagtgtagaaatgactcct
gtacagagaaaatattacaaatggattttaaccaaaaattttaatgctttaagaaatgaa
tccaaaggatcgttaacaacattcttaaatattatgatagaattaaaaaaatgctgtaat
catgctcttttgactaaacctcaagagaatgaaaacacagcagatgccaatcttcagagt
ttattacgaggatctggaaaacttatgctacttgataagttattagtacgtctgaaagaa
actggccacagagtattgattttctctcagatggtccgtatgttagatattcttgctgaa
tatctaagttatcgacgtttgccatttcaaagacttgatggtagcatcaaaggtgatgta
agaagacaagcagtagaacattttaatgctgagggatctcaagatttttgttttctatta
tcaactcgagctggtggacttggtattaatttagctactgcagatacagttattatattt
gattcagactggaatcctcaaaatgatttacaagcccaagcacgtgctcacaggattgga
cagaaaagtcaagttaatatttatcgactggtcacaaaaggatcaattgaagaaaatatt
gtagaaagagcaaagcaaaaaatggttttggatcatttggtaattcaaagaatggatact
actggtcatactgttttagacaaaaaagcaaaaaatgcatcaattccttttaacaaagat
gaacttacagctatattaaaatttggtgcagaagaactatttaaagatgatcctggtgct
gacgaagaacctttatgtgatattgatgaaattttgagaagagctgaaacacgagatgaa
acatcaacaactgttggcaatgaacttttatctgcctttaagatagctagttttactttt
aacgaagaaaaagatattgttgacaagtcacctaagactcaaaatgaacaaaaaaataaa
gaatgggaggaaataatacctgaatcattaagaaaaaaagtcgaggatgaagaaaaggct
aaagaaataggagatcgttatttaccgcccagaagtacaaaaacattacaaaaactgaat
caagaagggaaaagaaagaaagatgaatctgatgatgacagtgatgaagatcgacctaga
aaacgtgtaagaccacatgttgaaactaaagaagtagttaaaaaaccgttcactgatgca
gaaattcaaaaattaattaaaagttgtaaacgttttcccaatcctatgaaacgcattgat
gctgtagctgatgatgctgatcttcaaaaaaaacctaaatcagaattaaaaaaaataatt
caagtattgtatgaccgttgtaatgaagcatgtaatagtgagcatacagaaaaagaatct
gatgctactaatgatgatggtattaagaaaaaaattagaggacctttaataaaacttggt
ggtgtgacagtaaatgctaaaaatgtattagcttgtagtgaagaattggatattttggat
gatataataccatcagatgaagaagaaagatcaaagttcactttagatttgaaatatgtc
aaatcagctaattttgattttgactgggatataactgatgattcaaaattgttaatagga
atttatctttatggcttaggttcatgggaagctattaaaattgatactgcattaggcctt
agtgacaaaatcttatccaatgaagataagaaaccgcaagctaaacatttattaactcgt
tctgagtatctactaaagatgttgaaaaaaactcaagtagtaattaaaggtgaatcaaca
cctaagaaggcacgtaaggtaaaagaaggaaaattaagaaaaataattgatgacaatagt
actggtaatataaacaaaaaaaaaattgatagtgctactaatcacgatgaaaacttaaaa
tcaaaaaaagatttaataaatgatttaatcaaatctggattgacaggttcccccccaaaa
gaaaaaaaacctaaaatagccactaaaacaggtccaatgcatttcactgctaatagtgaa
tcaaaggctgtaaatgtagatgatattgttgagttgccaaaagaaaaatttttagagtgt
aaagaaaaaatgagaccagtgaagaaagtattaaaagctttagatgatccagaagaaaag
aaaaatgaattacattatataaatcatatgcaagaatgtttaatagaaataggttcacac
attggtaaatgcttagaaaaatataaggaccctgataaaataagagaatggagaagaaat
ttgtggtttttcgtctcaaagtttaccgaatttgattctaaaaaacttttaaaagtttat
caacgaggattacatgtaattgaaaaactagaaaaagataacaaagtaaaagatagaagt
aaaaacaaagataaaattagagataaatctaaagaagataaaaaactcagaaaaaatatg
gaaactaaagattcattaccactattaaaacgaaaatcgcgtgatagtgatgatttagaa
aaaaaaagtaaaaaacaaaaaacttcaaatagtaattcaggcgctttgtcaactattcca
actacgcctccaagttctagtaattcctcgaatgctattagttcatacggtcaaagcagt
aatcaatgtgatgcaaattacaatcatcatagaaataggaatacaccttattttaggagt
gataatcgaagtggtactcgaaatgataatagaaggttttcgtcaagtagagattctaat
gttagatttgaaaggtatgacaataattattatagttgtcctgcattcaggggaagagca
agggaaatcgattctgatatgcgaatgcatgacaaaattagatatcaacaagacgcctac
actgcttatagacaagctgctgcagctagtttctatgctcccgaattgtatagtcgctca
ggctcagcatcctatttgaggttacctcaatatagtgtttcttctgattggcacactcct
gtatcagaatacaggagagactatggatcttga
DBGET
integrated database retrieval system