KEGG   Aphis gossypii (cotton aphid): 114126930
Entry
114126930         CDS       T05869                                 
Name
(RefSeq) pre-piRNA 3'-exonuclease trimmer-like
  KO
K01148  poly(A)-specific ribonuclease [EC:3.1.13.4]
Organism
ags  Aphis gossypii (cotton aphid)
Pathway
ags03018  RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ags00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    114126930
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:ags03019]
    114126930
Enzymes [BR:ags01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.13  Exoribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
    3.1.13.4  poly(A)-specific ribonuclease
     114126930
Messenger RNA biogenesis [BR:ags03019]
 Eukaryotic type
  mRNA degradation factors
   3'-5' decay
    Other 3'-5' decay factors
     114126930
SSDB
Motif
Pfam: CAF1
Other DBs
NCBI-GeneID: 114126930
NCBI-ProteinID: XP_050057465
LinkDB
Position
2:42709486..42722405
AA seq 534 aa
MCEITSENFYSKLPVIEDAIKESAFISLDMEFSKLYDNVSKPFSFFDTTEERYKKLRQQV
SDITCIQLGLAIYVYDANNRTFGVSTYSFYTYPTTFYKSDSVVNFQTSCIEFLSKFNFDF
NKLFHSRVPYLTNEQELKIKSDMLDELFFDKYFETNLKFRTIEEELMKILKIVSEWYDTA
NYGDQTFLEINGCNEPAYIILMQYYILKKLKYILIDENQLGLNITKIKGNINSETLNSAI
TENLKLSLLNKMMGIKHLINLISKLKKPIIGHNCSLDILILYNQFFTPLPENLKDFQNFI
FNNFGPIYDTKLLCKEVKRIVSTNDKWMGSSLSEIYSYLKDGEGKRYSNTISIQLIGIEE
PQDMKLHHAGWDAYYTGYCFVKMIHIIKSFSCKNEKTNLRYTLTELFKSIEFSKNKLFTS
RSISNILDLETNEHNNQTNYLIIQNKGTFYKALDLKKLKYDLKQICNFDIKLLSSYTALV
AFPYMHSRLIYALKTNYNVENYTIYQKKKRNKQIIGFSLVMITVSVTIIKYLRK
NT seq 1605 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtgtgagattacttctgagaatttttattccaaattaccagtcatcgaagacgcaatc
aaagaatctgcttttattagcttagatatggaattttccaaactatatgacaatgtatca
aaaccatttagtttctttgatacaacagaagaacgatacaaaaaattgcgccaacaagta
tctgatataacctgtatacagttaggtttagccatttatgtttatgatgctaataacaga
acatttggcgtgagcacttactcattttatacctaccctacgacattttataaatctgat
agtgtggttaattttcaaacatcatgcattgaatttttatctaaatttaattttgatttt
aataagttgtttcatagcagagtaccatatttaactaatgaacaggaattgaaaattaaa
tcagatatgttggatgaattattttttgacaaatattttgaaactaatttaaaatttcgt
accattgaagaagaattaatgaaaatattaaaaattgtttccgaatggtatgatacagcc
aattatggagatcagacatttttagaaataaatggatgtaatgaacctgcatatattatc
ttgatgcaatattatattttgaaaaagttaaaatatatactcatagatgaaaaccaatta
ggattaaatattacaaaaattaaaggtaatattaactcagaaacattaaacagtgcaatt
accgaaaatttaaaactgagtttattaaataaaatgatgggtatcaaacatttaataaac
ctaatatcaaaattgaagaaaccaataattgggcataactgttctttagatattttaatt
ttatacaatcaatttttcacacctctacctgaaaacttaaaagattttcaaaattttata
tttaacaattttggtccaatttatgatactaaattattatgtaaggaagttaaacgcata
gtatctacaaatgataagtggatgggaagttctctatcagaaatatattcatatttaaaa
gatggagaaggcaaaagatattcaaatactataagtattcaattgattggtattgaagaa
ccgcaagatatgaaattgcatcatgctggatgggatgcctattacactggttattgtttt
gttaaaatgattcacattattaaaagcttttcttgtaaaaatgaaaaaacaaatttaaga
tataccttaacagaacttttcaaatcaatagaattttctaaaaacaagttattcacaagt
cgatcaatatcaaatattttggatttagaaaccaatgaacataataatcagacaaattat
ttaattattcagaacaaaggaactttttacaaagctttggatttaaaaaaacttaaatat
gatctcaaacaaatttgtaattttgatataaaattactttcaagctatactgcattggtt
gccttcccttacatgcatagccgtcttatttatgcactaaaaacaaactacaatgtggaa
aattatacaatttatcaaaagaaaaaaagaaacaaacaaattattgggttcagtttagtt
atgataactgttagtgtaacaattataaaatatttaaggaaataa

DBGET integrated database retrieval system