Aphis gossypii (cotton aphid): 114126979
Help
Entry
114126979 CDS
T05869
Name
(RefSeq) nuclear pore complex protein Nup98-Nup96
KO
K14297
nuclear pore complex protein Nup98-Nup96
Organism
ags
Aphis gossypii (cotton aphid)
Pathway
ags03013
Nucleocytoplasmic transport
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ags00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03013 Nucleocytoplasmic transport
114126979
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
ags03019
]
114126979
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
ags03036
]
114126979
Messenger RNA biogenesis [BR:
ags03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Nuclear pore complex
114126979
Chromosome and associated proteins [BR:
ags03036
]
Eukaryotic type
Centrosome formation proteins
Spindle formation proteins
114126979
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Nup96
Nucleoporin2
Nup98_GLEBS
Nucleoporin_FG
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
114126979
NCBI-ProteinID:
XP_027846851
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(42805374..42817714)
Genome browser
AA seq
1788 aa
AA seq
DB search
MFGSGSGAFSGGAGNTSGFGQSAFGKPAAPAVFGQTNTSLFNQTTQPNTGLFGSTAAAPA
FGQTPTAQPTFGGFNTGGTSLFGTPTATPASTGGLFGQQNASMGGNTGGGLFGSNNPNTS
FGQSKPVGTGFSFGTPVAQPTGNIFGTPQTSTAGTGMFGASTTGAFGATSGFGTASTGGT
TIKFNPVTGTDTMVRNGVNQTINTRHQSITVMKEYENKIFEELRFEDYSANRKVGQQGAV
GGGMFGSPKTLFSSTTTTSTGLFGANDNKPLFGATSTTPALGGFGNTGTSNVFGAQNSLF
GKPQQTTPAFGTQPSTQAFGMNTAQPNIFGSNTAQTAKPFGVAAPQTNIFGSTAPSTFGT
QTTGFGQTSFGQPNQNNLFGQNKPAFGLGSTQTTTGFGFGTNTSTSANGLFGSKPANTGF
QMTTPAFGTNNAFGATSTAQPATGGLFGSNAFNKAPTTSLFNQPTNQQTGVFNNAAKPGG
LFGQGTQGTGLFGSSNSSNFGSGGTSFFGSNQSSGIGLFGNSNNVQLSTNQVSQSNQMQL
QLDTLKAMPYGDSPLFKRFYKDVSKVDDSSLVRSQSVSLEKFGSYKVSPIPTPKRIPQIR
RNFPQFNRKSLFDGLEESPPTMKCRDKVGDNSLLFNASSPRSSCKKLNLKKDYNDCSKLN
NGNSMVMHTKPLAKLELYFSNKQVSPDDSSNTVNLSLIEENNTISQLKSSKQINLNTSKG
TEAYETSRNNITDTVIDNQEPSIESNAPEAEDHPTGIKLRRVGYYTIPPMNELAELVDDD
GSCFVDGFTIGRYDYGNVYFPDRFNVAGLDLDTIVHIRHREIIIYQDDEFKPPLGEGLNR
KATVTLDRVWPNDKTTKQPITNPDRIAATNFVVKLQRACAKLSTQFVDYRADTGSWVFNV
EHFSKYALIDSDDEDEEIIVDRSVESKNLPKPILQKPKTIKSTENISPKQNVMKPLLDLS
VGLDRAQLPHQYLLKPNFQLSAVNELTNDSHIMHYYDINKENSINVTAQLSQHMNLQASK
IQCMKASFDDIFYNEIEMMEQDDDTYGLKDKFEDKLEKILETIPEGLISPKTQDNISKSK
SIITPVDNHVSPKFLITKQKNKVVQAVELLKPVLTAPLQAQRFNLIYDSNVRLPFEVELN
NACESSKLSLLNTLSMKVPWSGNLTFITLNTKSKGSCLPKKGLDIGNLSTELSGRRKNDY
SPTILQKLQIITPDQTETFIELLTEHLEICMMNSNCDSNESNIPYFNPQFGVDALHSHCY
LLTHFSELPEEEHYAHVWDLIKALWGDPENLYTKDYPQEHVYNMARRQAVSDWLENVLEK
TVDSNNTNESVSQRILNLVSVHKIMEACDLAISNNEFNLAMLLAQLGSENSVRCCIQRQL
WQWFNSKADLFIDIDHLKLYTMISGQPLFDSNQGIINVCENLNWIRAFAIHMWYIQPPSS
TIGDVLDAYQNAFESDDSYAFKPYKTYDGIIDIDDKFATYDVCYHLMKLYTDSAYQMDKI
INPFTHTRDPMDFNFSWLLYNTLQSLGYTQMSETYANQLHINFASQLVSHGLWQWAVFVL
MHIKDEQLRENLVEEVIGRNVELPVCNSNDIILSDKETFVIEKLNVKEVIIYNAKAILAV
TQKKYLEATICYLKAEQWQEAHNILTNHLFANYLLQKNGQKTLKHLLSWLIDGSKVDGSI
PTNLQDSLTILEYLNLNKTLSKMSNEKSIPIIATLCDRVSCLPETTVKEKMIKTELSSFL
TRKIGQIVSKVETSNYKIFKPLVLPLNKLTTTEDYTTEELILSLSNYI
NT seq
5367 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttggttctggatcaggagcattttctggtggggccggaaacacgtcaggatttggt
cagtcagcatttggtaagcccgcagcacctgcagtgtttggtcaaacaaatacctcactt
tttaatcagactacacaacctaatacgggattgtttggatccactgctgccgcgcctgca
ttcggtcaaacaccgaccgctcaaccaacatttggaggtttcaatactggtggaacttca
ttgtttggaactcctacagcaacacctgcgtcaacaggagggttatttggtcagcaaaat
gcttcgatgggaggaaatactggaggtggattatttggttctaataatcctaatacttca
tttggacaatctaaaccagttggaacaggattctcttttggaacaccagtggcacagcct
actggtaatatattcggtacacctcaaacaagtactgcgggcactggaatgtttggtgcc
tctactactggtgcctttggtgctacatcaggatttggaacagcatccactggtggaaca
actataaaatttaatcctgtgactggcactgatactatggtcagaaatggtgtgaatcaa
acaatcaataccagacatcaatcaattactgttatgaaagaatatgaaaataaaatattt
gaggaactaagatttgaagattattctgcaaaccgcaaagttggacaacagggtgctgtt
ggtggcgggatgtttgggtctcctaaaactttgtttagttctacaacaactacaagtaca
ggtttatttggagcaaatgataataaaccactttttggtgcaacttcaacaacacctgca
cttggtggatttggaaatactggtacttcaaacgtttttggtgctcagaatagcttattt
ggtaaacctcaacaaacaacaccagcatttggtactcaaccatctactcaagcatttggc
atgaatacagctcagccgaatatttttggatcaaatacagctcaaacagctaaaccattt
ggagttgctgctcctcagacaaatatatttggaagtacagctccttctacttttggtact
caaactacaggatttggtcaaacgagttttggacaacctaatcagaacaacctatttggt
caaaataaaccagcatttggtcttggatcaacacaaacgacaactggttttggttttgga
actaatacatctactagtgcaaatggtctttttggaagtaaacctgctaataccggtttt
caaatgactactccagcttttggtacaaacaatgcttttggagctacatcaacagctcaa
ccagctactggtggtttatttggttctaatgcttttaataaggcaccaactacatcatta
tttaaccaaccaacaaatcaacaaacaggtgtatttaataatgctgcaaaaccgggaggg
ttatttggacaaggaacacaaggaactggactttttggatcatctaactctagtaatttt
ggttcaggcggaacatcattttttggtagtaaccaatctagtgggattggactctttgga
aattcaaataatgttcagctatctaccaatcaagtatcacaaagtaatcaaatgcaatta
caattagatacattaaaagcaatgccatatggagattctcctttgtttaaaagattttat
aaggatgtatcaaaagtagatgattcatctctcgtgcgatcacaaagtgtatcacttgag
aaatttggtagctataaagtttctccgataccaacaccaaaaagaatacctcaaattcgt
agaaatttcccacaatttaatcgtaagtccttatttgacggacttgaagaatctccacca
acaatgaaatgcagagataaagtaggtgataattcactactgtttaatgcttcttctcca
agatcaagctgtaagaaattaaatttaaaaaaagactacaatgactgtagtaaattgaac
aatggaaatagtatggttatgcatacaaaaccacttgctaaattagagctatatttttct
aataaacaagtctcaccagatgatagttcgaatacggttaatttatctttaattgaagaa
aacaatacaatttctcaattaaaaagcagtaaacaaatcaatttaaatacttcaaaagga
acagaagcttatgaaacttctcgaaataatattactgatactgttattgataaccaagaa
ccttcaattgaatccaatgctcctgaagcagaagatcatcctactgggataaaattaaga
cgtgttggatattatactattccacccatgaatgaattggcagaattagtagatgacgat
ggatcatgttttgtagatggtttcacaattggacgctatgattacggaaatgtatatttt
cctgatcgttttaatgttgcaggtctagatttagatactatagtacatataagacataga
gaaattataatttatcaagatgatgaatttaaacccccactaggagaaggattaaataga
aaggctactgttactttagatagagtctggcctaatgataaaacaacaaaacaaccaatc
actaaccctgatcgtattgcagctacaaattttgttgtgaaacttcaaagggcatgtgcc
aaattaagcactcaatttgtagattatcgtgcagacacaggatcttgggtgtttaatgta
gaacatttctcaaaatatgctcttatagattccgatgatgaagatgaagaaattatagtg
gatcgtagtgttgaatccaaaaatcttcctaaaccaattttacaaaaacctaaaactatt
aaatcaaccgaaaacattagcccaaaacaaaatgttatgaaaccattactagatctttct
gttggtcttgatagagctcaattaccgcatcagtatttattaaaacccaactttcaactt
tctgctgtgaatgaactaactaatgattcacatattatgcattattatgatataaacaaa
gaaaatagcattaatgtaactgctcagctatcacaacatatgaatttacaggcatcaaaa
atacaatgcatgaaagcttcatttgatgatattttttataatgagatagaaatgatggaa
caagatgatgatacttatggactaaaagataaatttgaagacaagttggaaaaaatcttg
gaaacaattcctgaaggtttaattagccctaaaactcaagataatatttccaagtcaaaa
tctataataactccagtagacaatcatgtgtctccaaagtttctcatcacgaaacaaaaa
aataaagttgttcaagctgtcgaattattaaaaccagttttaactgctccacttcaagct
cagcggttcaatttaatatacgattctaatgttcggttaccatttgaagtagaacttaat
aatgcatgcgagtctagtaaactgtcattgttaaataccttatcaatgaaagttccttgg
tcaggcaatttaacatttattacactaaataccaaatctaaaggaagttgtttaccaaaa
aaaggactggatattggtaatttatcaacagagttgtctggacgtagaaaaaatgattat
tctcctacaattttacagaagttgcaaattataacacctgatcaaacagagacattcatt
gaattattgactgaacatttagaaatttgtatgatgaatagtaactgtgattctaatgaa
agcaacattccatattttaatccacaatttggagttgatgcattacattctcattgttat
ttattaactcacttttctgaacttcctgaagaagaacactatgctcatgtttgggatttg
attaaagcattatggggagatccagaaaatctgtatacgaaagactatcctcaagaacat
gtatacaatatggctagacgtcaggcagtgtctgattggctagaaaatgtattagaaaag
acagtagattctaataatactaatgaaagtgtctctcaaagaatattaaatctagtttca
gttcataaaatcatggaagcatgtgatttagcaatttctaataatgaattcaatttagca
atgttattagcacaattaggaagtgaaaattctgtcagatgttgcattcaacgacaactt
tggcaatggttcaatagcaaagctgatttgttcatagatattgatcacctcaaattgtat
accatgatttcaggtcaacctttatttgattcaaatcaaggaataattaatgtttgtgaa
aatttaaactggataagagcttttgctatacacatgtggtacattcaacctccatctagt
actattggagatgtactagatgcatatcaaaatgcatttgaaagtgatgactcgtatgct
ttcaaaccatataagacatatgacggcattattgacattgatgataaatttgctacttat
gatgtttgttatcatttaatgaaactttacactgattcagcttaccaaatggacaaaatt
ataaatccttttacacacacacgggatccaatggattttaattttagttggctcttgtat
aatacattacaatctcttggctatacacaaatgtctgaaacatatgccaatcaattacat
ataaattttgcttcgcagttggtatcacatggactgtggcaatgggccgtatttgttctt
atgcacataaaagacgaacaattgagagaaaatttagttgaagaggttattggaagaaat
gtcgaactacctgtttgcaatagcaatgatatcattctttctgataaagaaacttttgta
atagaaaagttaaatgtgaaagaagtaataatatataatgcaaaggctattttggctgtt
actcaaaagaaatatttggaagcaaccatttgttacttaaaagctgaacaatggcaagaa
gctcacaatatacttacaaatcacttatttgcaaactatttgcttcaaaaaaatggccaa
aaaactttaaaacatttgcttagttggttgatagatggttcaaaagtagatggatcaata
ccaacaaacttgcaagatagtttaactattttagaatatttaaatttaaataaaacatta
agtaaaatgtctaatgaaaaatcgataccaatcattgctacattatgtgatcgagtgtca
tgtttacctgaaaccacagttaaagaaaagatgataaaaactgaattgtctagtttttta
actcggaaaattggacaaatagtatcaaaagttgaaacatcaaattataagatttttaaa
cccctagtactacctttgaataagttaacaacaacggaagattacacaacagaagaatta
attctcagcttatcaaattatatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
