Aphis gossypii (cotton aphid): 114128285
Help
Entry
114128285 CDS
T05869
Name
(RefSeq) low-density lipoprotein receptor-related protein 6-like
KO
K03068
low density lipoprotein receptor-related protein 5/6
Organism
ags
Aphis gossypii (cotton aphid)
Pathway
ags04150
mTOR signaling pathway
ags04310
Wnt signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ags00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04310 Wnt signaling pathway
114128285
04150 mTOR signaling pathway
114128285
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
ags04131
]
114128285
Membrane trafficking [BR:
ags04131
]
Endocytosis
Clathrin-mediated endocytosis
Low-density lipoprotein receptor (LDLR) family proteins
114128285
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Ldl_recept_b
FXa_inhibition
SGL
EGF_LRP2
Vgb_lyase
Asp
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
114128285
NCBI-ProteinID:
XP_050063504
LinkDB
All DBs
Position
X:10585538..10596593
Genome browser
AA seq
1669 aa
AA seq
DB search
MPTTTPDARRRSVGRVADQSPPPHRRRCATRPLSRRTTARREPCAVAAAAAAAAAAVATT
AAVITDRNASTDARSTIATVLPETSWTPVTGKGARMTSSWIFMTLWCCTAMMSFVNAYPN
LIYTTSKDIRMANMSKMTRINVIVKDLIEGSALDFYYKGSLICWADHGQESIQCVSYNGT
HASNKVAILNTGIITPDGLACDWLTKKIYWTDGDTNRIEVASLDGKYRKVLYWEDIDQPR
AIALVPMDGIMFWTDWGEVPKIERAGMNGDLSTRKVIVSDNIFWPNGLTIDFYTKHIYWV
DGKLGFIDIMDYDGRNRKTILEKGIPYPYGIALYQDRLYWTDWKTWSIHVVNRVGGGNSR
EIIHSNNVPMDIRVWNSARQPEKITLCDKNNGGCSDLCLLSPNSPGYSCACSTGIKLIDY
HNCAEGVQEVLFLVQKTDICQISLDSPDHTIMSIPLTGLAHAIAIDYDPVDGYIYWTDDE
IKMIQRAKMNGSNQGVVISNEIYHPDGVAIDWVARNIYWTDTGTDRIEVARLNGKHRRVI
VANDLVEPRGVAVAPELGWLFWSDWYDKRPKIERSNLDGNDRVVLLKDDLGWPNGITLDI
KARTLYFCDAKTDRIEVVGMNGEDRRELVSENLPHVFGLTQLGDYLYWTDWQRRTIDRVN
KNTGSDRKIIIDQLPNLMGVKAVNLKEPLNDNPCGDNNGNCSQFCFYKPKGYYICACEID
YELAMDGKTCILSESFLIFTRSDHIGILSTENSHYSDIIPIAGIKEASAVDVDIKNKRVY
WTDIKLKTINRVYLNGSMAERIITFGLQSPEGLAVDWIGGNLYWCDSGTKRIEVSRLDGT
MRKVLLWNDIKNPKNLLLDPKKGFMYWSELDGITGSIHKASMNGEGKHCLINKIGRVISI
TSDYDSGLIYWTTLTPNSGSIESIDFNGKRQSKIVSIHFGGYLSAITYYRGSLYWLDWSN
GTYFQVHIESGTILKQTKINLDHVTDLITFDKASQTGTNPCAINNGGCQQLCLVKGSSRD
HEPLSYHCSCETHFTLFKNNTCSAPNSFLIVAQKTTFYRVVMDIDDSSDSSLPVIGLKHV
KAVEYDPISHMIYWIDGRTQMIKRCHENGSNPNMFIGNNGYAYNLYDLALDPYNRLLFWT
CTVTDTINVTRLTNNSFQGSIFKSFDGEKPRNLAIHPEKGYIYWTDLGSQHRVIRSRIDG
HNRVIIASDLLSLEALTVDRVQNMVYFSYSSKVDVCDLHGYQRKTLISFDGALITNIAVL
GPYLYWIDKEKQAIERVNKSTGVVSEGSIVMNQNPHLVDIISIYIPTPEILASHPCSAMN
KHGMCSHLCIVTGVNESTSSSHQCSCPLGLIMSDRQCVNVPVCGPEQFVCNSLSPECLPL
IWRCDGQTDCHDGSDEVNCSECNKLQFKCLDGHCIDKNWVCDGTKQCSDGSDESRCCESG
LLSNDRYQCISNGACIPVKEVCDGWKHCIDGSDETYLACSLIRNVGHTTSPASDKSFKGT
LFFTIIFFVLVFSLLLVIIYRCAKSDLDHSPSLTSNNIVTYTAIPIPRQYSSTSAYTAMQ
NGTHIDLISPSNCSPLNPPPSPTTTLTMQTNDYIRTNQYLRYDDRYEPPCPTLCSQTDLP
TDIYDDSDFAMPLEPCPPPPTPRSHSPSSSTYFSPNAPPPSPNSCKRLC
NT seq
5010 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccgacgacgacgccggacgcgcgacggcgatccgtcggccgagttgctgatcagtcg
cctcctccacatcgaagacgatgcgcaacacgaccattgtcccgtcggacgaccgcccgt
cgtgaaccttgtgccgtcgctgctgctgctgctgctgctgccgccgccgttgccactacc
gccgccgtcattaccgatcgtaacgccagcacggacgctcggagcacgatcgccactgtt
ttacccgagacgtcctggacaccggtcaccggcaaaggcgccaggatgacgtcgtcatgg
atttttatgactttgtggtgctgcaccgcgatgatgtcgttcgtgaacgcttatccaaat
ttgatatacacaacatctaaagatatccgaatggctaatatgtcaaaaatgaccaggatt
aatgttattgttaaagatctcatcgaaggaagcgcacttgatttttattataaaggatct
ttgatatgttgggctgatcacggtcaagaatctattcaatgtgtttcttacaacgggact
cacgctagtaacaaagtagcaatattgaacactggtattattacaccagatggtttagct
tgtgattggcttacaaaaaaaatatattggactgatggagatactaatagaattgaagtt
gcatcattagatggcaaatatagaaaagtactttattgggaagatatagatcaaccacgt
gctatagctttagttcctatggatggtataatgttttggaccgattggggtgaagttcca
aaaattgaacgtgcaggaatgaatggagatttatctacacgaaaagtcatagttagtgat
aacatattttggccaaatggtttaactatagatttttataccaaacacatttactgggtt
gatggaaaacttggttttattgatataatggattatgatgggagaaatagaaagactatt
cttgaaaaaggaataccatatccatatggtattgctttataccaagatagattatattgg
actgattggaagacatggtcaattcatgtagtaaatcgtgttggaggtggaaatagccgt
gaaataattcatagtaataatgtacctatggatattcgtgtgtggaactcagctcgacag
ccagaaaaaattaccctctgtgataagaataatggtggttgttcagatttgtgtcttctt
tctccaaattctccaggatattcatgtgcttgttccacaggaataaagcttatagattat
cataattgtgcagaaggtgtccaagaagttttatttcttgtacaaaaaactgatatctgt
caaatatcattagattctccagatcatactattatgtctatacctcttactggtttggct
catgctattgccatagattatgaccctgttgatgggtatatttattggactgacgatgaa
ataaaaatgattcaacgagcaaaaatgaatggtagtaatcaaggagttgtcatttctaat
gaaatataccatccagatggagttgccattgactgggttgcaagaaacatatattggaca
gacactggaacagatagaattgaagttgcaagattaaatgggaaacacagaagagttata
gttgctaatgatttagttgaacctagaggtgtagctgtagcacctgaattaggttggcta
ttttggtctgattggtatgacaaaagacccaaaattgaacgttccaatttagatggaaat
gatagagttgttttacttaaagatgatttagggtggccaaatggaataactttggatatt
aaagcaagaactctttatttttgtgatgcaaaaactgatagaatagaagttgttggtatg
aatggagaagaccgtagagaacttgtgagcgaaaatttgccgcatgtatttggtttgact
caattgggtgattacctttattggacagattggcagcgtcgcacaattgaccgagtgaat
aaaaatactggatctgaccgtaaaatcataatagatcaattaccaaatttaatgggtgta
aaagctgtaaacttaaaagagcctcttaatgacaatccatgtggtgataataatggaaat
tgtagtcaattttgtttttataaacctaaaggctactacatttgtgcttgtgaaatagat
tatgaattggctatggatggaaaaacttgcattttatctgaatcgtttctaatatttact
cgatctgaccatattggaatattaagtactgaaaatagtcattattcagatattattcct
atagctggaataaaagaagccagtgctgttgatgttgacatcaagaataaacgagtatat
tggactgatattaaattaaaaacaattaatagagtttatttaaatgggtcaatggcagaa
agaattattacatttggcctacaatctccagaaggattagccgttgattggattggtggt
aatttatattggtgtgattctggcactaaacgaattgaagtgtctagactagatggaact
atgcgtaaagttttactttggaatgatattaaaaatccaaaaaatttattacttgatccc
aaaaaaggatttatgtattggagtgaattagatggcattactggatcaattcataaagca
tccatgaatggcgaaggaaaacattgtttaataaataagattggtagagtcataagtata
acttcagattatgatagtggcttgatttattggacaacattaacaccaaatagtggatcc
attgaaagcattgattttaatggaaaacgtcaaagtaaaattgtgtctattcattttggc
ggttatctttctgccataacatattacaggggttctttatattggttggattggtcaaat
ggaacttatttccaagtccatattgaaagcggtacaattttaaagcagactaaaataaat
ttagatcatgttacggatttgataacctttgataaagcaagtcaaactggaacaaatcca
tgtgctataaataatggaggatgtcaacagttgtgtcttgtaaaaggatcatcaagagat
catgaaccattatcgtatcattgttcatgtgaaacacatttcacattatttaaaaataac
acttgctcagcaccaaatagtttcttgatagtggcacagaaaacaacattttatagagta
gtaatggatatagatgattcttctgattcttcactccctgtcattggattgaaacatgta
aaagctgttgaatatgatccaatatcacatatgatttattggattgatggtagaacacaa
atgattaaacgttgccacgagaatggttcaaatccgaatatgtttattggaaataatggc
tatgcatacaatttatatgatctcgctttggatccatataatagattattgttttggaca
tgtacagtaacagataccataaacgttactcgcttaacaaataacagcttccaaggatct
atatttaaaagttttgatggagaaaaaccaagaaatttagcaatacatcctgagaaaggt
tatatttattggactgatttgggaagtcaacacagagtaataagatctcgtattgatggt
cataacagagttatcattgcctctgatttgttatctctcgaagcacttactgttgacagg
gtacaaaatatggtttatttttcctattcaagtaaagtagatgtttgtgatcttcatggt
taccaaaggaaaacattgatttcatttgatggtgcactaatcactaatatagctgttctt
ggaccatatttgtattggattgataaagaaaaacaggcaatagaaagagttaataaatct
actggtgttgttagtgaaggaagcattgtcatgaatcaaaatccgcatttagtagacata
atttcaatatacatccctactcctgagattttagcatcacatccatgtagtgcaatgaac
aagcacggtatgtgttcacacttgtgcattgtcactggagtcaatgagagtacatccagc
agccatcaatgctcttgtcctctaggtctaataatgagtgatcgccaatgtgtgaatgta
cctgtttgtggccccgaacaatttgtatgcaattcactgagtcctgaatgtttgcctctg
atatggcgctgtgatggccaaacagattgtcatgatggttcagatgaagttaattgttca
gagtgtaataaacttcaattcaaatgtttagacggccattgtatagataaaaactgggtg
tgtgatggtactaaacaatgttctgatggttctgatgaatctcggtgctgtgaatctgga
ttactttcaaatgatagatatcaatgcatttctaatggcgcatgtataccggttaaagaa
gtctgtgatggttggaaacattgcatcgatggatctgatgaaacttatttggcttgctcg
ttgattagaaacgtggggcacaccacaagtcccgcaagtgataaatcattcaaaggcact
ttgtttttcacaataattttctttgtattagtattcagtttattattggtcattatatat
cgttgtgctaaaagtgatctagatcatagtccaagtctgactagcaataatatagttaca
tacactgctataccaattcccagacaatattcttcaacatctgcttatacagctatgcaa
aatggaacccatattgatttaatttcaccatcaaactgtagccccctgaatccaccaccg
agtcctacaaccacactaacaatgcaaacaaatgattacatcagaacaaatcaatacctg
cgatatgatgatcgttacgaacctccttgccccacattgtgttcacaaactgatttgccc
accgatatttatgatgattctgattttgcaatgcctcttgaaccttgtcccccacctcct
actcctcgttcacattcgccatcctcaagcacttattttagcccaaatgcaccaccgcca
tcacctaatagctgtaaaaggctttgttga
DBGET
integrated database retrieval system
