Aphis gossypii (cotton aphid): 114131667
Help
Entry
114131667 CDS
T05869
Name
(RefSeq) DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2
KO
K03002
DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2 [EC:
2.7.7.6
]
Organism
ags
Aphis gossypii (cotton aphid)
Pathway
ags03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ags00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
114131667
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
ags03021
]
114131667
Enzymes [BR:
ags01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
114131667
Transcription machinery [BR:
ags03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase I system
RNA polymerase I
Core subunits
114131667
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb2_6
RNA_pol_Rpb2_1
RNA_pol_Rpb2_3
RNA_pol_Rpa2_4
RNA_pol_Rpb2_7
RNA_pol_Rpb2_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
114131667
NCBI-ProteinID:
XP_027852759
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(1268771..1276864)
Genome browser
AA seq
1121 aa
AA seq
DB search
MYEPTLKNLTNVDYGKPPDSQNPILQELGTPHIDSFNYMIEEGLKLAISDLLPVEFDTKG
KYRVKLTLLDATIHQPRVPTGSLGVKAHSIYPLECRQRHGTYSGRLEIKLRWSINDVEQI
VIDRDIGQVPIMLKSKLCHLEKMSPKQLVKLGEHQDEWGGYFIVKGKERLVRLLLGTRRN
FPTAVQRNTWKNKDQYFSDIGIMIRCVKDDLTTVTNNLHYLTNGTAKLMIPIKKRIYFAP
IILIMKCLTNSSDEFIFRHIIKGHEDDLYFIRSVMEMMRSLHESNIHCQEDAKEYVGVLF
KPRFYELPEWKTNKEVCDHMLRNYVLIHLNTDFDKFKLLVFMLQKLFSVAQNKCLVEGAD
GIMMQELMLGGHLYLKILKEKLQMWLNLVKINLLKVDQGGQPSIGDMMTALRRCDMIEHS
LTNFFATGNLHSQSGLGMQQDKGLTILVENISRMRYMAHFRAVHRGAIFESMRTTEPRRL
LPDAWGFICPVHTPDGTPCGLLNHLTKSCIVTKSVSRKVLRDIPKVLVSLGMCEASYKPQ
DINIGFVYNVILDGRIIGYIPETLTALFIKKLRTLKVIGKQIPETTEIVWLQKKGENILG
QFPGLFLFTGNARMMRPVFNLDLEQIELIGTFEQVYLDISISEDEIRPNITSYREVTKTD
FLSHLACLIPLPDYNQSPRNMYQCQMGKQTMGTACHNWHLQSETKLYRIQTPASPLFRPV
HYDALSMDDFAMGTNAVIAVISYTGYDMEDAMIINKMALDRGFAHGSIFKTELIETKPHT
YFMRDPFKEGLSDSLGLDGLPHIGLKLSKGTPYYSYFDEQIQGFIIAKYLSNEEVIVDSV
RQCGDFTTGRKIPNKATITVRVQRNPTVGDKFASRAGQKGIFSKGWPSEDLPFTESGMVP
DIVFNPHGFPSRMTIAMMIECMAGKSAAVHGVVHDATPFKYSEEDTAIDFFGKLLEAGGY
NYFGTEQMYSGVDGRAMKASIFFGVVHYQRLRHMVSDKWQVRSTGPVDAVTKQPVKGRKR
GGGGRVGEMERDALISHGTPFLMQDRFMDCSDKSTALLCLKCHTILSSLINFKEDSYSSK
IVKCRTCDSTQVQEIGIPNVFRYLCSELAAINIKLQLNIEV
NT seq
3366 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtacgaaccaacacttaaaaatttaacaaatgtagattatggtaaaccccccgattcc
caaaatccaattcttcaagaattgggtactccacacatagattcgtttaattatatgatt
gaagaaggattgaaattagctatttccgatttattacctgttgaatttgatacaaaagga
aagtatcgtgtaaaactcaccttactggatgcgaccattcatcaacctcgagttcctaca
ggatcacttggtgttaaagcacatagtatatatccattagaatgtcgacaacgtcatggt
acttattcaggaagattagaaataaaactcaggtggagcattaatgatgttgaacagata
gtaattgacagagatattggccaagtgccaataatgttaaagtctaaattatgtcatttg
gaaaaaatgtctccaaaacaattagttaagttaggagaacatcaagatgaatggggtgga
tattttatagttaaaggcaaagaacgtttagtacggcttttgcttggaacaaggaggaat
tttcctactgcagttcaaagaaatacttggaaaaacaaagatcaatatttttcagatatt
ggtattatgattagatgtgttaaagatgatttaacaactgttacaaataatttacattat
ttgacaaatggtactgctaaattaatgatcccaattaagaagagaatatattttgcaccc
ataattttaataatgaagtgtctaaccaacagttcagatgaatttatatttagacatatt
attaaaggacatgaagatgatttatacttcatcagatctgtaatggaaatgatgcgttcc
ttacatgaaagtaatatacattgtcaagaagatgcaaaagaatatgttggtgtcctgttt
aaacctagattttatgaattgcctgaatggaaaactaataaagaagtttgtgatcatatg
ctcaggaactatgttttaatccatttgaataccgatttcgataaatttaaacttttagtt
tttatgttacaaaagttattttcagtggctcaaaataaatgtttagttgaaggtgctgat
ggaattatgatgcaagaattaatgcttggtggtcatctttatcttaaaattctcaaggaa
aagttgcaaatgtggttgaatttggttaaaatcaacttgcttaaagttgaccaaggtggt
caaccatctatcggtgatatgatgactgctttaagaagatgtgatatgattgagcactcg
ttgacaaatttttttgctactggtaatcttcacagtcaatctggtctaggaatgcagcaa
gataaaggacttacaattttggttgaaaacataagtcgaatgcgttatatggctcatttc
cgtgcagtacatcgtggtgctatttttgagtctatgagaacaactgaacctcgaaggttg
ctgccagatgcttggggttttatatgtccagttcatactcctgatggaactccttgtgga
cttcttaaccatttaaccaaatcatgtatagtcactaaatcagtcagtagaaaagtactg
cgtgacattccaaaggtattagtatcccttggtatgtgtgaagcatcatataaacctcag
gacatcaatattggatttgtgtacaatgtaattctcgatggtcgtataattggatatata
cctgaaacattgacagcactttttatcaaaaagctccgtaccttgaaagtgataggaaaa
caaataccagagactactgaaattgtttggcttcaaaagaaaggagaaaatattttgggt
caatttcctggtctttttttgtttactggaaacgcaagaatgatgagaccagtttttaat
ttagatttagaacaaatagagttgattggaacttttgaacaagtttatttagatataagt
atttcagaagatgaaattagacctaatataacttcatatagagaagttacaaaaacagat
tttcttagtcatttagcatgtttaatccctttgccggactacaaccaaagtcctcgtaat
atgtatcaatgtcaaatggggaaacaaacaatgggaaccgcttgtcataattggcattta
cagtctgagactaaattatataggatacaaacaccagcatcaccattgtttagacctgtt
cattatgatgcattatcaatggatgattttgcaatgggtacaaatgctgttatagctgta
atttcgtatacgggttatgacatggaagatgccatgataatcaataaaatggcattagat
cgaggttttgctcatggctctatatttaaaactgaattaattgaaactaaaccacatact
tattttatgcgtgatccatttaaagaaggtctttctgattctttgggtttagatggtctt
ccacatattggtttaaaactatctaaaggaacaccgtattatagctattttgatgaacaa
atacaaggatttataatagctaagtatttaagtaatgaagaagttattgttgattcagtt
cgtcaatgtggggattttacaactggccgaaaaatacctaataaagctacaatcactgtg
agagttcaaagaaatccaacagttggagataaatttgctagtcgtgctggacaaaagggg
atatttagtaaaggctggccttcagaggacttgccatttacagaaagtggaatggttccc
gatattgttttcaaccctcatggttttccttcaagaatgactatcgctatgatgatagaa
tgtatggcaggcaaatctgcagcagtgcatggtgtagtacatgatgccacaccttttaag
tatagtgaagaagatactgcaattgatttctttgggaaactcttagaagcaggtggatac
aattattttggaacagaacaaatgtatagtggtgtagatggccgagcaatgaaggcatct
atattttttggtgttgtacattatcagcgattgaggcatatggtgtcagataagtggcag
gtacgaagtactggcccagttgatgctgttacaaaacaacctgttaaaggccgtaaaaga
ggtggtggtggtcgtgttggtgaaatggaaagagatgcacttatatcacatggaactcca
tttttaatgcaagatcgattcatggattgttcagataaatcaacagctctgttgtgtttg
aaatgccatacaatactatcttcattaattaactttaaagaagatagttattcaagtaaa
attgttaaatgtagaacttgcgactccactcaagtacaagaaattggaatacctaatgtg
tttcgatatttatgttctgaacttgcagcaatcaatattaaattacaattaaatattgaa
gtataa
DBGET
integrated database retrieval system