Aphis gossypii (cotton aphid): 114132102
Help
Entry
114132102 CDS
T05869
Name
(RefSeq) laminin subunit alpha-1
KO
K05637
laminin, alpha 1/2
Organism
ags
Aphis gossypii (cotton aphid)
Pathway
ags04512
ECM-receptor interaction
ags04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ags00001
]
09130 Environmental Information Processing
09133 Signaling molecules and interaction
04512 ECM-receptor interaction
114132102
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
114132102
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Laminin_EGF
Laminin_G_2
Laminin_G_1
Laminin_N
Laminin_B
Laminin_G_3
F5_F8_type_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
114132102
NCBI-ProteinID:
XP_027853294
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
3249 aa
AA seq
DB search
MSSAEGAPAVRARFRPKSALATALLMVLLSVVPPAEMVSATTDGGGGGGIKPVHPQIFNL
ASRAVVTANATCGETENGPEVYCKFGSAGQQCGVCDSRSGDPAKTHGPANAIDNATAGTW
WQSPSLHNGDQYQYVTFTIDLRQIYQVSYIIMKFGISSRPGNWILERSTDGGVKYTPWQY
FAINGEECVQKYNVQPAFNKDKIVQIHQNATCITSFSRFKPHENAEIHINLLKGHNSMNL
SSTEILDFSAARHIRLRMQKIILPNDKMAMLDNSFKRKLFYSIKDIFIGGRCICNGHAKK
CKQTSENAEPSCDCLHNTCGPNCDRCCPMFNQRQWKSGPVMCEKCQCYGHATECQYDSIV
DEEKSSLDIYGTYSGGGICINCSKHTMGTNCEVCEIGWYRPLNVEPDDPEPCLSCDCHPD
GSDGNVCIPDKETGIALCNCLKGYGGAKCNECAPGYNGFPNCKPCACDERGIKTAPLSCE
SRCDCKEHVTGDNCDECKTGYFNLQSTNPNGCEKCFCSGVSSICKAATNLKTTRINETEG
WLITDLKLTKTIFPSTDSSTGIASISSFDIPVDVDSFYWLSPIQFTGNKLSSYGSSLYFS
ISWVIMRGDSSGKQMLDPDVIIIAKENILIAYGGKNLRSTNNISGNVNLTENDWFYMTRD
FKNLETPIDNTEVSRDEFLSILSDIKHILIKAKYHTNQVESNLINAYMDIGDINGSGQII
NGIESCTCPIGYSGLSCETCDYGYVKQIDPFSTNIICKKCNCHNHSPECDQISSHCSICE
HNTTGPQCNECAIGFYGNAIEGTPNDCKKCACPLNESTNNFSPTCKPNNVGGYICTECPE
GYSGDHCEICAPSYFGNPLVIGSTCKPCDCNEAPCDNLTGQCINCLGNTIGWNCKECKPG
HFGNPIISDCRPCDCNAIGSVITDSCNVDTGQCQCKENFTGRTCDRCVDGLGNITADCVE
CNCNHIGSISDLCDPRSGLCPCKKGVSGVNCDSCSEGFHFFSNQGCTECQCNKTGSINNI
CDPITGQCDCRSNVIGTQCDTCNDGFWNISETGCQKCSCDKIGAINDLCDAETGQCTCKL
GIGNKNCDQCLPNYYGFSILGCLECEVCEKPGHICDMDTGRCVCPQLTEGPNCSLCTANA
FRWEVNKGCQECHCDSFGAFNGLCNNETGSCVCRTGYDGPKCDKCSFGYYGYPRCRPCAC
NYAGSEPSKCNETMCGCDEFGQCECKINVYGKRCDQCKDGTFGLHPINSDGCIPCFCFGR
SNSCTAAGLTWNQIRLSQTRTLSINYDTNNNTLYREGDYPVNTQEICYINLANPDSTGLK
PNKDERNQLNVTNNLRVIPGTISNVEIGVKYLFDTPVYWQLPKRFCGDKVLSYGGYIRFT
IDAEGGNTLFPQSILTSYPLIQIQGNDHIILEHFPETINVGTSHQVRLHESLWQVKNNPS
AKVSREILMLALQNIKYIFIRATDSVDFTTATLKDVTLDTATLSQKKTNYLTASQIVEVC
DCPPEYNSSSCQDPSLGYFRYYNTSVSSTIIVQTVGEARQCECNGRSSVCNVDTGICSNC
THNTGGTHCEICAEGYYGDPFTNGCEPCPCPSVTKNYAQSCEIDFDGKLICRCKQGYKGS
MCDQCEYGWFGYPREEGGKCEPCQCNKFGIVSDECHEETGQCNCMPNITGRDCSICQDKH
VLTSKGCTPCEDKCIDTLLDHVFKRIKMLNETTLHLAEGMISPPWSQLSSVKENVSFLDN
IINTSSQENLKLINVSDEVDQNLKKKFKYAFVKAKKLLKSSQTNENEIQPLHDLAENKLA
NSIALEREVDELVNSLQSYSFEDRSHVNIISTMREAKNYLSKINSIDFGPSIDPKAILKT
CSDAMQNLQLNTGSQAQTINLRHKFETLLNQVKDFDSILMNLSDTSEITVQLKQQNFHSL
NELNKMIEDINHLDLTFSTIHGDTKELLKEARENYFSSLNKLEELLLIKPKLENIKRNIN
KGKDFNPGFDDDQFLVNSAEIHANFLLQTAQKYAELFKPIRHDANIALKASNAYLNIVDS
LQLARNAAINASILADTSFKTAYPGVYQESLIDKAKTAEELSKMTYKSTSDIKNIVDSIQ
SDFDIQVDEIETVKNNMKQIVKNDNINSKQITELEQSEGMNMELNNREDIDPLVIASNNV
ETKIKNIQDNIDNKLRPILSQLNEEGEPSLSIAQDRIDETEEHGKKAIDMLSRIVKTSED
FSKKVAAWNHSMNAKLDALRNKITKAHQIADGIRISISGQENGTENACIRTYQPKFLEPS
TRNTIVLSYAISSNERDALLFYLASKTTGDFVAIEMVNRKIRFVWDVGGGIGEITHPMHI
QTASDLNNDQHWYRIEAERIHNLGKLLIRPQVVPNGSSLAMGSPHTNMSSAGMGRLDINS
DDQIWIGGIDKAPLPPYLHSRQHGLIGCLHQVWLDGRPVGLWNFKSQPSGTCSACIEGAE
DLVDDGSYRFFGDGYAVLHYDTTTTYNKYLFSVSLSFKTFDERSLLFLVEGSQPDQFIEI
RIHDGKVVFRVSYSGYSLLEISSTSRYNTGSWTKLEATRYFDRKKKLEKGVLKVDGESKE
GVPSPPPNQNDIPDLSESEYMVGGVSPGFKSINGLPKSFLGCMSDIQIAQQGYNPMRGIS
WGVQPTCSDKPLTVVGFYGNGYLELVSHTLKKKASFGFMFATLQQDVLLMLSTTESLISG
VTNTSDNIEEINNNIDQENKQNYYSVSLRRGQVDIRINAGRGEVRLASEGFEFGDGKYHS
IMVTKNGKKLELRIDDVLHSSSSLPEGSNIVKASGIAGGLFLGGLPIEINTTGKAVSSVP
LIGTIKDAIFNDQLLFFDSPIEFEHAAIGQIGPVPQKDNNVFSEIASMTSSEKSLGCMKE
GSFSLEPGAVKFGDNPHSYVHVMFGKRHNMQKNFKMDFRFRSFYPNGLIFMLIGTRGKQT
NYLLMHLYNGRVQLVLKTRKRVEISTQAVFNDGIWHKIQLVKENKTLNFVIDSIPQEKLN
LTKKLSIGNTMYVGGIPEKDIQLPESLNVQVFRGCMQGFSINHQEEELVSEKAIRHKVGQ
CFPQVEKGSFFPGDAFAIYKNKFYVGALLELSLELRTTQSTAVLLSVSEPEGYPALSLEL
NQGKVIISGDMGDRRPFRVEQSFQSEYAICDNKWHQIQAFYVEDKLTLKVDQFEQKYWLL
DNGHITGARTHSPLYIGGLPDAASSGTLGTRENFKGCIRNLVIGGERTDWTNMAGLHNIL
LGSCPLIVH
NT seq
9750 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcatcggctgagggagcacccgcggtccgcgcccggttccggccgaagtcggcgctg
gcgacggcgcttctgatggtcctgctgtcggtggtgccaccggccgagatggtctccgcc
actacagatggcggcggcggcggtggtatcaaacccgttcatccacaaatattcaacctt
gcatcccgggccgtggtgacggcgaacgcaacctgtggcgagacggaaaacggaccggaa
gtgtactgcaagttcggctcagcgggacagcagtgcggagtttgcgactcccggtccggt
gacccggccaagacacacggccctgctaacgcgatagacaacgccacggcgggcacatgg
tggcagagcccgtctctgcacaacggtgatcagtaccagtacgtgacgttcacgatcgac
ctgagacagatttatcaagtgtcgtacattataatgaaatttggtatttcatcaagacct
ggcaattggattcttgagaggtcaacagacggtggcgtaaaatacacaccgtggcagtat
tttgccattaacggcgaagaatgcgttcaaaaatataacgtccagccagcatttaacaag
gacaaaatagtgcaaatccaccaaaacgcaacatgcattacgtcattttcgcgtttcaaa
cctcacgaaaacgctgaaattcatatcaatctgctaaaaggacacaatagcatgaactta
tcgtctactgaaattttagacttctctgcggctcgacatatacgactgagaatgcaaaaa
ataattttacccaacgacaaaatggcaatgttggataattcatttaaacgaaagcttttc
tattcgatcaaagatatattcattgggggtaggtgcatttgtaatggacatgcaaaaaaa
tgcaagcaaacttcagagaatgccgagccgagttgtgattgccttcataacacctgtggc
ccaaattgtgacagatgttgtccgatgttcaatcagcgtcagtggaaatcaggtccggta
atgtgtgagaaatgtcaatgttacggtcacgccactgagtgtcaatacgactcgattgtt
gacgaagaaaagtctagtctggacatctacggaacgtattcaggtggtggaatttgtata
aactgttcaaaacatacaatgggtacgaattgcgaagtgtgtgagattgggtggtatcgg
ccattaaacgtcgaacccgatgatcctgaaccatgtttatcgtgcgattgtcatcctgac
gggtctgatggcaacgtgtgtattcccgataaagaaacgggaattgcactatgtaactgt
ttaaaaggatatggtggtgccaaatgtaatgagtgtgcacctggttataacgggtttcct
aactgtaagccatgcgcttgcgatgaacgtggaattaaaacagcgcctttatcctgtgaa
agtcgatgcgattgcaaagaacatgtaacgggagataattgcgacgaatgtaagacaggc
tattttaatttacaatccacgaacccaaatggctgtgaaaagtgtttttgctcaggcgta
tcgtctatatgcaaggctgctacaaatttaaaaactaccaggatcaacgaaaccgaagga
tggttaataactgatttaaaattaactaaaacaatatttccatcaaccgactcgagtaca
ggaatcgcgtcaataagtagttttgatataccagttgatgttgatagcttttattggctc
tctcctattcagttcactggtaataaactgtcttcttatggttcaagtttatacttcagt
atttcatgggtcataatgcgaggcgattctagtggcaaacaaatgcttgatccagatgta
ataattattgcaaaggaaaatattctaattgcatacggaggtaaaaatttgagatcaacc
aataatatttctggtaatgtgaatttgactgaaaatgattggttttatatgaccagggat
tttaaaaatctcgaaacacctattgataacactgaagtatcacgtgatgaatttttatcg
atcttgtctgatatcaagcatatactcatcaaagcaaagtatcacaccaatcaagtagaa
tcaaatttgataaatgcgtatatggatataggagatataaatggaagtggacaaattatt
aatggaatagagagttgtacatgtccaataggatattcgggactatcgtgtgagacttgt
gattatggttatgttaaacaaattgatccgttttccactaatataatttgtaaaaaatgc
aactgccacaaccattcaccagagtgtgaccaaatatctagtcattgttcgatttgtgaa
cataatacaactggaccgcaatgtaacgaatgcgctattggtttctatggaaatgcaatt
gaaggcacaccaaatgattgtaaaaaatgcgcttgtcctctgaatgagagtacgaacaat
tttagtcctacttgcaaaccaaataatgttggaggttatatttgcactgaatgtcccgag
ggatactctggagatcattgcgaaatatgtgctccttcatatttcggaaatccattagta
attggttctacttgtaaaccttgtgattgtaatgaagctccttgtgataacctcactgga
caatgcattaattgtcttggaaacaccattgggtggaactgtaaagaatgtaaacctggt
cattttggaaatcccattatttctgactgcagaccatgcgattgtaatgctatcggatcc
gttatcacagattcgtgtaatgtagacactggccaatgtcagtgtaaagaaaatttcacc
ggtagaacatgtgatcgttgtgtggatggtttgggtaatattacagcagattgtgtggaa
tgtaattgtaatcacattggttctatatctgatttgtgtgatcctagatcgggattatgc
ccatgtaaaaaaggagtttctggagtaaattgtgattcatgtagtgaaggtttccatttt
ttttcaaatcaaggttgcactgaatgccaatgtaacaaaacaggaagcatcaataatata
tgtgaccctattactggtcagtgtgattgtcgatcaaacgtcattggaactcaatgtgat
acttgcaacgatggtttttggaacatttctgaaacaggatgtcagaaatgtagttgtgac
aaaataggtgctattaatgatttatgtgatgcagaaaccggacagtgtacttgtaagctt
ggcataggaaacaaaaactgcgatcaatgtctaccaaattactatggattttcaatattg
ggttgcttagaatgtgaagtatgtgaaaaacctggacatatatgcgatatggatactggc
aggtgcgtgtgtcctcaactaaccgaaggaccaaattgtagtttatgtacagccaatgct
tttagatgggaagtcaataaaggatgtcaagaatgccactgtgattcatttggtgctttt
aatgggttatgcaataatgaaaccggatcttgtgtttgtcgaactggctatgacggtcca
aaatgtgataaatgttcctttggatactacgggtatcctagatgtcgaccatgtgcctgt
aactatgctggaagtgaaccaagtaaatgcaacgaaactatgtgtggttgtgatgaattt
gggcagtgtgaatgcaagattaatgtttacggaaaacgatgtgatcaatgcaaagatgga
acttttggacttcatcctataaattcggatggatgtataccttgtttttgttttgggaga
agcaactcatgcacagcagcaggcttaacatggaatcaaatcagattatcacaaacgcgt
actttatccataaactatgatacgaataataatactctatatagagagggtgattatcca
gttaacactcaagaaatatgttacattaatctagcaaatccggatagtacaggattaaaa
cctaacaaagatgaacgaaatcaacttaatgtaactaataatcttagggttatacctgga
actattagtaatgttgagattggagtaaaatatttgtttgatacacctgtttattggcag
cttcctaaacgtttttgtggtgataaggtactttcgtatggtggttacatacgattcacc
atagatgccgaaggcggaaacactctattccctcaatctattctaacttcatacccactg
attcaaatccaaggtaatgatcatataatattagaacattttcctgaaaccatcaatgtg
ggaacaagccatcaagtaaggttacacgagtctttatggcaagtcaaaaacaatcctagc
gctaaagtcagccgtgaaatactaatgcttgcgctacaaaatataaaatatatatttatc
agagctactgattcggttgatttcactacagcaactttaaaagatgttaccttagacact
gctacattgtctcaaaaaaaaactaactacttaactgcttctcaaattgttgaagtttgc
gattgtccaccagaatataattcttcatcttgtcaagacccaagtttgggatattttcgt
tactacaacacttcagtaagttctacaataatagtacaaactgttggtgaagctcgacaa
tgtgaatgtaatggaaggtcatctgtctgtaatgttgatactggaatttgtagtaattgt
acgcataacactggtggtacccattgtgaaatttgcgcggagggttattacggagaccca
tttaccaatggctgcgaaccatgtccctgtccgtctgttacaaaaaattatgctcaatct
tgtgaaattgattttgatggaaaactaatttgtcgttgtaaacaaggttataaaggaagc
atgtgcgatcaatgtgaatatggatggtttggatacccacgggaagaaggaggaaaatgt
gaaccatgccaatgtaataaatttggaatagtaagtgatgaatgccatgaagagacagga
caatgtaactgtatgccaaatataactggtagagattgttcgatttgtcaagataaacat
gttttgactagtaaaggatgcacaccttgtgaagataaatgtattgacacattattagat
catgtgttcaaacgaattaaaatgttgaatgaaacaactcttcatcttgctgaaggaatg
atatctccaccatggtcgcaactttcttctgtaaaagaaaacgtatcatttttggataac
ataataaacacatcaagtcaggaaaatttaaaattaattaatgtatctgatgaagttgac
caaaatcttaaaaagaaatttaagtacgcttttgttaaggccaaaaaattgttaaagtca
tctcaaaccaatgaaaatgaaatacaaccacttcatgatttagctgaaaacaaattagct
aatagcatcgctctagaaagagaagtagatgaattagttaacagtttgcagagttatagt
tttgaagatagatctcatgtaaatataataagcactatgagagaagcaaaaaactatctg
agcaaaataaatagtattgattttggcccttcgatcgatccaaaggcgatactcaaaact
tgctctgatgcaatgcagaatttacagttgaataccggaagccaagctcaaaccataaat
cttcgtcataaatttgaaactttattaaatcaagtgaaggacttcgatagtatattaatg
aatctttcagatacttcagaaataacagtgcagttgaaacaacaaaattttcattcactt
aatgagcttaataagatgatagaagatataaatcatctcgatttaacctttagtacaata
cacggagatacaaaagaactgctgaaagaagccagagaaaactatttctcatctttaaat
aaacttgaagaattattattaatcaaaccaaaattagaaaacatcaagagaaatataaat
aaaggaaaagactttaatcctggatttgatgacgatcaatttttagttaattcagctgaa
atacatgctaattttcttttgcagactgctcaaaaatacgcagagctatttaaaccaatt
agacatgatgctaatattgctcttaaggccagcaatgcatatttaaatattgtcgattct
cttcaattagctcgtaatgcagcgattaatgctagtatattagctgatacgtcgttcaaa
acggcatacccaggggtttatcaagaatcattaattgataaagcaaaaacagctgaagag
ttatccaaaatgacttataaaagtacgtccgatatcaagaatatcgttgactccattcag
tcggattttgatatacaagttgacgaaatcgaaaccgttaaaaataacatgaaacaaatc
gtgaaaaatgataacataaattcaaaacaaataacagaacttgaacaatccgaaggaatg
aatatggaactaaacaatagagaagacattgatccgttagtaatagcttcaaataacgtt
gagacaaaaatcaaaaatattcaagataacattgataacaaattacgtcccattttatct
caattaaatgaagaaggagaaccgagtttatcgatcgcacaagataggattgatgaaact
gaagaacacgggaaaaaagccattgatatgcttagtagaattgtcaaaacatctgaagat
tttagtaagaaagtagctgcttggaatcattccatgaatgctaagcttgatgctctacga
aataaaattacaaaagctcatcaaatcgccgatggtattcgaatatcaatatctggccaa
gagaacggtactgaaaatgcatgtattcgtacatatcagccaaagttcttggagcctagt
acaagaaatacaattgtattatcgtatgctataagttctaacgaaagagatgctttgtta
ttttacctcgcaagtaaaactacgggtgatttcgtggcaatcgaaatggtgaaccgtaag
atacgtttcgtttgggatgtgggtggtggaattggcgagattacacatccaatgcatata
cagactgctagtgatctaaacaatgaccaacactggtatagaatcgaagctgaaagaata
cacaacttgggtaaattgctgatcagaccacaagtagtgccaaatggatcatctttagcc
atgggttctccacacacaaatatgtctagtgcagggatgggacgattggatataaattct
gatgatcaaatatggataggagggatagacaaggcacctctaccaccatacttacactct
agacaacatggcctaataggatgtttacaccaagtttggcttgatggtcgaccagtcggt
ctttggaatttcaaatcacaaccatcagggacttgttccgcctgtattgaaggtgcagaa
gatttggttgatgatggttcctatagatttttcggggatggctacgctgtattacactac
gatactacaactacgtacaataagtatttattcagcgtttctctgagtttcaaaactttt
gatgaaagatctctactgtttcttgtcgaagggtctcagccggatcaatttatagaaata
cgaatacacgatggtaaggtcgtattccgagttagttactctggatattctcttctcgaa
atatcttcaacaagccgttacaatacaggaagctggactaaactagaagctactcgatac
tttgatagaaaaaaaaagctagaaaaaggtgttttaaaagtggacggagaatcaaaagaa
ggtgtgccatctccaccaccaaatcaaaatgacataccagatttatcagaatcagaatat
atggttggtggcgtttctccgggttttaaatctataaatggtttgcctaaatcgtttttg
ggatgtatgtcagacatacaaattgctcagcaaggatacaacccaatgagaggaatatca
tggggcgtccagccaacttgttcggataaacctttaactgttgtgggattctatggaaat
ggttatttggaacttgtatcacatacactcaaaaagaaagcatcatttggcttcatgttt
gccactctacaacaagatgtgttattaatgttatctactactgagtcattaatttctgga
gtaactaacacaagtgacaacatcgaagaaataaataataatatcgatcaagagaataag
caaaactactactccgttagtttaagacgagggcaagtagatattcgaataaatgctgga
cgtggagaggttagacttgctagtgaaggatttgaatttggcgatggtaaatatcactcc
attatggtgaccaaaaatggaaagaagttagaactacgcatcgatgacgttctacattca
tcctcatcattaccagaagggtcaaatatcgtaaaagcatctggtatagctggaggacta
tttttaggagggttgccaatagaaataaatactactggaaaagcggtttccagtgttcca
ttgattggcactattaaagatgctattttcaatgaccaacttttgtttttcgattcaccg
atcgaatttgaacacgctgctattggccaaatcggaccagtgccacaaaaagataataat
gttttcagcgagattgcctcaatgacatcgtctgaaaaatcattagggtgtatgaaagaa
ggaagcttttcactagaacctggtgcggttaaatttggagataatccacatagctatgtg
cacgttatgtttggtaaacgccacaacatgcagaaaaactttaaaatggacttcagattt
aggagcttctatccaaatgggctcatattcatgttgattggaacacgagggaagcagaca
aattatttgttgatgcacttgtataatggacgtgtacaattagtcttaaagacaagaaaa
agagttgaaatatccacccaagctgtatttaacgatggaatttggcataagattcaattg
gtaaaagagaataagacgttaaatttcgtgattgattcaattccacaagagaaattaaat
ttgactaaaaaattaagtataggcaatactatgtacgtaggtggtattccagaaaaagat
attcagctaccagaatcactgaacgttcaagtgttcagagggtgcatgcaaggcttttca
ataaatcaccaagaagaagaattggtaagcgaaaaagcaatacgtcacaaagttggtcaa
tgctttcctcaagttgaaaaaggttcatttttccctggcgatgcatttgccatttacaaa
aacaaattttatgttggcgcattgttggagttatcgctggagctaaggacgacgcagtct
actgccgtacttttgtccgtgtccgagccggaaggctatccagcattatcattggaactt
aaccaaggtaaagtaattatatctggcgatatgggtgaccgcagaccattccgcgtcgaa
caaagttttcaatcggagtacgcaatttgtgataataaatggcatcagattcaagcattc
tacgtcgaggataaacttacactgaaagttgatcagtttgagcaaaaatattggctcctt
gataacggacacataactggagctcgaacgcacagtcctctgtacatcggtggattacca
gacgctgcatcaagtggtaccttaggaaccagagaaaactttaaaggctgcatacgaaac
ctcgttattggtggcgaacgtaccgactggacaaacatggctggtctgcacaacatactt
ttgggttcttgtccattgatcgtccactaa
DBGET
integrated database retrieval system