KEGG   Aphis gossypii (cotton aphid): 126555261
Entry
126555261         CDS       T05869                                 
Name
(RefSeq) uncharacterized protein LOC126555261
  KO
K20191  Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein
Organism
ags  Aphis gossypii (cotton aphid)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ags00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   04131 Membrane trafficking [BR:ags04131]
    126555261
Membrane trafficking [BR:ags04131]
 Endosome - Lysosome transport
  Others
   BLOC-2 complex
    126555261
SSDB
Motif
Pfam: Beta-prop_HPS5 zf_RING_Vps8_fungal WD40_CDC20-Fz Beta-prop_EML_2 ANAPC4_WD40 Beta-prop_Vps41 zf-RING_Vps41 Beta-prop_EML Beta-prop_RIG_2nd zf-RING_5 WDR90_beta-prop_4th Beta-prop_VPS8 zf_RING_Vps8 WD40_WDHD1_1st Beta-prop_THOC3 zf-C3HC4_2 zf-RING_2
Other DBs
NCBI-GeneID: 126555261
NCBI-ProteinID: XP_050066168
LinkDB
Position
Unknown
AA seq 1146 aa
MAVLQDNTNDKIMPDHILVLNRIDIKNILNLPLKTTQRIKYTCFEVSQNFIIFGASSGGL
YVFRREPCEFIQLLPNKEGSVTQIAMSKDEDLIAFGTQKGIVCILQRNENGIGAKLINKS
TEHLGHEITTMEWTSKNQVYFGDCNGKVTSIYVSLFVRKAIFQTPPYTMIELDSKVIQID
SSDDILVISTLTRCYVCDMSKEQFKQIGQKTRDGDYGCCIVTWNEKKIFSARPGSRIWEA
ELNGIVKSTHQLKYCLAIPPTLNVCAQKPFDLSRISGKNWPPQSLNFKKLYSIWDNCLLT
YTSNSIFILDMLKVNVLLWCDGYNNIQNVKYIGDTVYIWCSNGELIAEKITPLQNYLVNC
YECEDYNTCISLIEHYYDRIINTKCIIDELYPLVNIDQKIDLPVNTNNLISKIKKTYYLK
QQFFKLPSGIYSLKNYVYVKKNYKLQRSYSLISIKSDKPVLRFKSMPNIHINLEKVKKSE
QYPSGDYSKLYNKQVFDQIYMELNIPSIPFVSLATSEVFHDTLMEIGSNVTNKIAKSSKT
LKDTLNNLTASTGKNDLVPYEISNINRPEPPPIDESEVDISNYKLDLEHREKLNLLPILK
ICKKLQNEYKLDVDCLQQLCSGVCEVKSNLENVVQIKQPIFPFQQYLKEKHLNTIKKAIN
DSFISNLVAKWADLHAKDILIVNKFDYPEFLTYYLNENDFKKDLEISELITLFGQVIEVA
NIFEFLLNGNLKCSFAIFCNILKMNSNNNGKTEEPLLMYLNSMYVFLKLDQIESFRTLGY
KRNIKPIFVFYLLMKFSDHLEPSYRNKCNAIFLSYLSHFDKSIFTDCNILYYAVYSFLTL
NQDKNYLCKCGFPLDSIDGKFKKLGQILIDYLSSADINLEQLHIILHKFTKCNVTTNSLE
DVIKCFCKQVPHFWPIVLKSALNLNSLKHTKIILAIHLGLVDQLEVHLFNKSELLFDKLF
TLNHYFKNGLCLNCGNIGEKNQGISWTDLTTLAFQYLSQEETRNLLLKHRNNIPCGDIDN
WFYQSFILTQFVGSNSKKALINTLKYHNNISMIGTENCKNTLTTLEEEIGETIQFKNLSS
KKSHWGTQIDIKNSYCIWCSLPLNSDPLIRGKNNGLISFKCGHSFHTVCIRHQTDNIQCI
VCQRKN
NT seq 3441 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggctgtgttgcaagacaataccaatgacaaaataatgccggatcatattttagtgtta
aatagaattgacattaaaaatatactaaatttacctctgaaaaccactcaaaggataaaa
tacacttgttttgaagtatctcagaactttatcatttttggggcttccagtggtgggttg
tatgtatttcgcagagagccttgtgagtttatacaactgcttccaaataaagaaggatct
gtgactcaaattgctatgtctaaagatgaagatctcattgcatttggtacacaaaaaggc
attgtatgtattttgcaaagaaatgaaaatggaattggtgcaaagttgatcaataaatct
actgaacatttaggacatgagatcactactatggaatggacttcaaagaatcaagtatat
tttggtgattgcaatggaaaagtcacttcaatttatgtatcattatttgttcgaaaggct
attttccaaaccccaccatatactatgattgaactggattctaaagtaattcaaatagat
agttctgatgatattttagtgatttcaacattaacaagatgttatgtttgtgatatgtcc
aaagaacaatttaaacaaattggacaaaaaactagggatggtgattatggttgttgcatt
gttacatggaatgagaaaaaaatcttttctgctcgaccaggttctaggatttgggaagca
gagttaaatggtattgtaaaaagtacccatcaactgaaatactgtttagctataccacca
acacttaatgtttgcgcacaaaaaccgtttgatttatcaagaatttctggtaaaaattgg
ccaccacagtctctgaattttaaaaaattgtattcaatttgggataattgtttacttaca
tatacatcaaatagtatatttatactagacatgttaaaagtaaatgttttattgtggtgt
gacggatataataatatacaaaatgtcaagtacattggagatactgtatatatatggtgt
tcaaatggtgagcttattgctgaaaaaatcactcctcttcaaaattatttggttaattgc
tatgaatgtgaagattacaatacttgcatttcattgatagaacattattatgatagaata
ataaatacaaaatgcattattgatgaattatatccacttgtcaatatagatcaaaagata
gacttaccagttaatacaaacaatctgatctcaaaaattaaaaaaacttattatttaaaa
cagcaattttttaagttaccatctggaatttattctttaaaaaattatgtatatgttaaa
aaaaactataaattacaacgaagttatagcttaatttctataaagtctgataaacctgta
ttacgtttcaaatctatgcctaacatacatataaatctagaaaaagttaaaaagtctgaa
cagtatccatctggtgattattccaagttatacaataaacaagtttttgatcagatatat
atggagttaaatattccttcaattccatttgtttcattggctacttctgaagtatttcac
gacactctaatggaaatagggtcaaacgttactaataaaattgcaaaaagtagtaaaact
ctcaaagatacattaaataatctaactgctagtacaggtaaaaatgatttggtgccatat
gaaatttcaaatattaatcggccagaaccgccacctattgatgagagtgaagtagatatt
tccaattataaattggatcttgaacaccgcgagaaactcaatttacttcctattctaaaa
atatgtaaaaagcttcaaaatgaatataaattagatgtagactgtttacaacagttatgt
agtggtgtatgtgaagtgaaatctaatttggaaaatgttgtacaaataaaacagccaata
tttccatttcaacaatacttgaaagaaaaacatttaaacactattaagaaagcaataaat
gatagtttcattagcaatttagtagcaaaatgggctgatttacatgcaaaagatatcttg
attgtgaataaatttgactaccctgaatttctaacttactatttaaatgaaaatgatttt
aaaaaagatctggaaatcagtgagttaattacattatttggtcaagttatagaagtagct
aatatttttgaatttttgctcaatggtaatttgaaatgttcttttgctatattttgtaat
attttgaaaatgaattccaataataatggaaagaccgaagaaccattattaatgtattta
aattcaatgtatgtatttttgaaattggaccaaattgaatcgtttcgtactcttggatac
aaaagaaacatcaaaccgatatttgtattttatttattaatgaagttttcagatcattta
gagccaagttatcgcaacaaatgcaatgctatatttttatcttatttatcacactttgat
aaaagcattttcacagattgtaacattttgtattatgctgtttatagttttttgacatta
aatcaagataaaaactatttatgtaaatgtggattccctttggatagtattgatggcaaa
ttcaaaaagcttggacaaatactcattgattatttatctagtgctgatataaatttggaa
caattacatataattttacataaattcacaaaatgtaatgtaaccacaaactctttggaa
gatgtaattaaatgtttttgtaaacaagtgcctcatttttggcccattgttttaaaatcg
gctttaaatctaaatagtttgaaacacacaaaaattattcttgctatccatttgggttta
gtggatcagttagaagtacatttgttcaacaaaagtgaattgttatttgacaaacttttt
acattaaatcattattttaaaaatggcctttgtttgaattgcggcaatattggagaaaaa
aatcaaggaatttcatggactgatttaacaactttggcatttcaatatttaagtcaagaa
gaaactagaaatctactcttaaaacatagaaataatataccatgtggagatattgataat
tggttttatcaaagttttattttgactcagtttgttggttcaaattcaaaaaaagctttg
atcaatacactaaaatatcataataatatatcaatgataggcacagagaactgtaaaaat
acattaacaactttggaagaagaaataggtgaaactattcagtttaaaaatctatcatca
aaaaaatcacactggggtacgcaaattgatataaaaaatagttattgtatttggtgttca
ttaccattaaactctgatccactaattagaggtaagaataatggacttatatcatttaaa
tgtggacattcttttcatactgtttgtattcgtcatcaaactgataatattcaatgtatt
gtatgccaaagaaaaaattaa

DBGET integrated database retrieval system