Algoriphagus halophilus: V8V91_09775
Help
Entry
V8V91_09775 CDS
T10878
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
Organism
ahap Algoriphagus halophilus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
CarbopepD_reg_2
TonB_dep_Rec_b-barrel
CarboxypepD_reg
CooC_C
Nod_GRP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XFE76357
LinkDB
All DBs
Position
complement(1816689..1819781)
Genome browser
AA seq
1030 aa
AA seq
DB search
MKNNYLLIKKRFLLLLFIILSTSISAFSQATNVTGTVKDETGEVVPGATVMIKGTQTGTV
TDIDGVFSIQAAPGSILVISFIGYTPTEVAVQSGQTNYDVTINTSMSDLSEVVVVGYGSQ
IKKEVTGAIQSISEDELKDMPVTTTAQKLQGKLAGVQINQTTGKPGQGMNVRIRGQLSVS
GGSDPLYVVDGFPITGDINTLNPDEIQDITILKDAASTSLYGSRAANGVVLITTKRGKVG
QTNVNLNVYTGFQKVPEQGRLEMLNAEEFAQFKKEYYEDAGQPVPAIFQNPSDFRGKTND
WYGAMLETAPITNYNLTITSNKEKVNTAIVAGVFDQKGVVRNTDYERYSIRMNTDYTVSD
KVSIGLNVAPSYIVDNTPQTDGSRGTGILFNALHTWPVMDIYDENGDLTFFNRFPAETGN
IFAYPNWLRSADEITNQTKRVNILANTYAEWRPIKGLSLKSTFNTEIRNSNYFFFNPSTA
TNRINVAIPTVAVSIRDNFRDFSWLNENIATYTNNIGDHNFEVLAGFSNQQFRRDRTRVQ
ADTYADDRLPTIQGAININRGGTISDVNEWTLTSIFSRLTYNFKGKYLFTAAVRGDGSSR
FGADNRWGVFPSTSVGWVISDEEFLNTSSSVSFLKLRASYGVTGNNNIGNYTQYALVNNT
INATFDGNVVPGAAVTSLSNTNLGWETTSQFDLGFDLGLWDDRVTFGYDYYTKNTTNLLY
AVQVPQESGFTNFNDNIGEIKFWGHEFTVNAVIAPGTFRWSVNANLSINRNEVLELADGI
DRVYGFAHITQVGQPFGQFYGLNKLGNYANAEDLANSPVIPGRSTVGSIKLEDINGDGVI
TFGGDNDDRTIIGNPFPDFVYGFTNNFKWKNWDASIVASGSQGNQLYMRHLYSTANLDGV
FNMVAKVADRFRSPENPGEGIFGTTVGGGNVTGIERDWPNSNFVWDASYFTIRNITVGYN
FTNLPKSIKAARLYASGQNMWVFTKYWGGSNPEVSMQNNGQGDGGNLSPGVDLAGYPVPR
TITFGVNITF
NT seq
3093 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaacaattatttattaataaagaagcgatttttactgcttctttttattattctt
tcaaccagcatttcggccttttctcaggctacgaatgtgaccggtactgtgaaagatgaa
acaggagaagttgtaccgggagccaccgtaatgatcaaaggtacccagacaggtaccgta
actgatattgacggtgttttttctattcaagcagccccaggaagtattttggtgattagt
tttattggatatacgcctaccgaggtggcagtccaatcgggacagacaaattacgacgtt
acgattaacacttctatgtcggatttatccgaagtagttgtagtggggtatggtagccaa
attaaaaaggaagtgacaggagctattcaatctatcagtgaagatgaattgaaagatatg
cctgttactactacggcacagaaattacaaggtaaactagcaggggttcagatcaaccag
actactggtaagcctggccaagggatgaacgtaagaattcgtggtcagctttccgtgtca
ggaggtagtgatccattatacgtagtggatggatttcctattacaggtgatattaacacc
ctgaacccggatgaaatccaagatattaccatattgaaagatgcggcttctacctcttta
tatgggtctagagcagccaatggtgtggttttgattaccactaaaagaggaaaagtaggg
caaaccaatgtaaacctaaatgtctatactggtttccagaaagttcctgagcaaggaaga
ttagaaatgttaaatgctgaggaatttgcccagttcaaaaaagaatattacgaagatgca
ggacagcctgttccggctattttccaaaacccatctgatttcagaggtaaaactaatgat
tggtatggagccatgttggaaactgccccaattactaattacaatttaaccatcacctct
aataaagagaaggtaaatacggcgattgttgcgggtgtgtttgatcaaaaaggagtggtt
agaaataccgattatgaaagatattctatcagaatgaatactgattacacggtttcagat
aaggtatctatcgggttgaatgtggctccaagctatattgttgataatactcctcaaaca
gatggttccagaggtactggtattttgtttaacgctttgcatacttggccagtgatggac
atttatgatgagaatggagatcttaccttctttaatagattcccagcagagacaggtaat
atctttgcttatcctaactggttaagatcagcagatgaaattaccaaccaaaccaagagg
gtaaatatcttggctaatacctatgcagaatggagaccgattaaaggactttccttaaag
tcaacctttaatactgaaatcagaaattcaaattatttcttctttaatccttccactgcg
acgaatagaattaacgttgctattccgacggtggcagtctctatcagagataatttccgt
gatttttcatggttgaatgaaaatattgcgacctataccaataatatcggagatcataat
tttgaggttttggcaggtttttctaaccaacagtttagaagagatcgaaccagagtacaa
gctgatacctatgctgatgatcgactaccaacgatccaaggtgcgatcaatatcaacaga
ggtggaacaatttccgatgtgaatgaatggaccctgacttccattttctcaagattgacc
tataattttaaaggaaagtacctgtttactgcagcagtaagaggtgatggttcttcaaga
ttcggtgccgataaccgttggggtgtattcccatctacttcggtaggttgggtgatttct
gacgaagagtttttaaacactagttcatctgtctctttcttgaaattgagagcaagttat
ggtgtgactggaaacaataatatcggtaactacacccaatatgcattagtgaataatact
attaatgcgacatttgacggtaatgtggtgcctggtgctgcggttacttcgcttagcaat
accaacttagggtgggaaactacctcacagttcgacttaggatttgaccttggtttatgg
gatgatcgagtgacctttggttatgattattacaccaagaacactactaatttattgtat
gcggttcaggtgcctcaagaatctggatttacaaacttcaacgataatattggtgagatc
aagttctggggtcatgagtttactgtcaacgcagttattgctcctggaacgttcagatgg
tctgtcaatgcgaacttatccattaatagaaatgaagtattggagttagcagatggaatt
gaccgagtatatgggtttgcacacattacccaagttggacagccttttggccagttttat
ggattaaataaactaggtaattatgcaaatgctgaagatttggcaaattccccagtgatt
ccaggaagatctacagtaggaagtattaaactggaagatatcaatggagatggtgtaatt
acgtttggaggtgataacgatgatcgaactatcatcggtaatccttttcctgattttgtg
tatggtttcaccaacaatttcaaatggaaaaattgggatgctagcattgtagcttctggt
tctcaaggtaatcagttgtatatgagacacctttattctacagccaatttggatggggtg
ttcaacatggttgcgaaagtggctgatcgtttcagatctccagaaaatccaggtgaagga
atctttggaactaccgtgggtggtggtaacgtaaccggaattgagagagactggccaaac
agtaatttcgtgtgggatgcttcttactttactattagaaacatcacagtagggtataac
ttcacaaatctacctaagtcaattaaggcggcacgtttgtatgcttccggacaaaatatg
tgggtttttaccaagtattggggagggtctaacccagaggttagtatgcagaacaatggt
caaggagatggaggaaacctaagtccaggagttgatttggcgggttatccggttccacgt
acaatcacatttggtgtaaacatcaccttttga
DBGET
integrated database retrieval system