Anaeromicropila herbilytica: bsdtb5_22550
Help
Entry
bsdtb5_22550 CDS
T08766
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
ahb
Anaeromicropila herbilytica
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CBM26
Big_2
Alpha-amylase
HL_N-beta
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BCN30960
UniProt:
A0A7R7ELC0
LinkDB
All DBs
Position
complement(2654785..2659242)
Genome browser
AA seq
1485 aa
AA seq
DB search
MRKKERSNKRFFRMIAYLLVLNLVFSMTTPIGWFGDLSEANTYVQAATTTSTKGADTFSW
DNANVYFLLTDRFNNGNTTNDHSYNRGLDKNGNIINYSDTSATFHGGDFVGITEKINEGY
FNDLGVNALWISAPYEQIHGYVVGSDTSNSFPHYAYHGYYALDYTQTDANFGTAEEFKTL
VDTAHEHGIRIVLDIVMNHSGYNTLYDMAEYNYGTLSPNWEDTYYRSTGINNKDYHSLID
YTSNSSDWAKWWGPDWVRSGVAGYDAGGSTNQTMSLAGLPDFKTESTKTVGIPKILQTKW
TKEGRYATESAELSSYLSSHNMAMTTTNVLTYWLQSWVREYGVDGFRCDTAKHVDLASWA
TLKKSCVEALKDWKAKNPSKALDNLDFWMTGEVWDHGVYKDDYYTTGGFDSLINFSTQGG
GILAKSTVAATYQSFANSINSDPNFNVLSYLSSHDSVLARGNSIYLGSAFLLLPGGIQTF
YGDETNRKIDDTASTNGDHEVRSDMNWSDMNETTLAHWQKVGTFRHNHIAVGAGANASLT
SSDGVAFSRTYNSNDISDKIAACIGCESNANVTIDVSSLWAEGQTLVNAYDFTTAVVTNG
SVTFNSGANGTILIEEPDGKPLVSVIGAAKFHGTQDVTIDIVDADNAKVSVDGAKEFLAE
DGDTFTIGETAYEGDNVSVTVEATNAKGTRNATYTFYKAYANEDITPKPVPEYKGIVYVK
SYDGTAPYVYAWKGSNTALTAAWPGTKMTKLNDQGYYEMDLGTTDSYNVVLSNGSGKQSS
NITNLQGGVWIDLTSSSFTYNIVKREVVPTTNPITINVKSFNDSAPYLYIWDADGNTYNG
SFPGRPLSNKTADGLYTLTIDSSSPSVNCIVSYGSNTNQSSAITGITKDATITITSANCS
TIEVVKTIVTESSLDTLKKETREIKNLTAENYTTESYTKLYSYVAPADALIALGDKADEA
ALKDMITTIQTAKANLVVAKPTVTGVTLGSTRIYGTAAYGSNVAIKIGNNEYKAVADGIT
GEYSVAVAPLVLTDRVIVSCILGNNSSSTDTYYVNNAEKVDPTSITLNSSSITVAPGSTA
RLVATVLPSNASDTSVTWKTSNSSVATVIDGTVTGIAKGTATITATTSNGLTASVVVTVS
TEDIKVTSITLNPLTATIIKGDTTTLTANVLPVNATDQKVTWTTSNSAVATVASGVITGV
SAGNVTITATTSNGLTATANITVTETQSNNYMYFEKPSTWGNTIYAYIWNSNVTYKNAVW
PGLVTTQYSNGVYMIEWPKDYTGTDLNVIFTDKTHQTADLKAIKNGYYTSSGYHHTVTPG
EFTPTSVTLDTSTASIEVGSTKAFVATVLPTTASSSVTWTSSDNSIATVSQGVVTGVAEG
TTTITATTTNGLTATTTVSVIPSTKSYMYFVKPATWGNTIYAYMWTDDGTYKNKAWPGVV
TTLQPDGKYAIEYPKGYTGLNIIFTDGSKQTADLKAVEGYTYSVN
NT seq
4458 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgtaaaaaagaaagaagtaacaaacgattctttcgaatgattgcctacttacttgta
ttaaacttagtattctcaatgactactccaattggatggtttggagatctaagtgaagca
aacacgtatgtacaggcagcgacaacaacgtctacaaaaggtgctgacacattctcttgg
gataacgcaaacgtgtactttctattaacagacagatttaataacggtaatacgactaac
gaccattcttataacaggggacttgataaaaatgggaacattataaattatagtgataca
agcgctacgtttcacggaggggatttcgtaggtatcacagagaaaattaatgaagggtat
tttaatgatctaggtgtcaatgcattatggatcagtgctccatatgagcagatccatgga
tacgtggtaggaagtgatacttccaatagttttccacattatgcatatcatggatattat
gccttagactatactcagacggatgctaattttggaaccgcagaggaatttaagacttta
gttgataccgctcacgaacatggaatcagaattgtacttgatatcgtaatgaatcattcg
ggttacaatactctttatgatatggctgagtataattatggtactctttcccctaattgg
gaggatacttactataggagtacaggaatcaataataaagattatcatagtttgattgat
tacacatcaaactcatccgattgggcaaaatggtggggaccagattgggttagaagtggt
gttgcaggttatgatgcaggaggttccacaaatcaaaccatgtcattagctggccttcca
gattttaaaacagaatcaaccaaaacggtaggaataccaaagattcttcaaacaaaatgg
acaaaagaaggacgctatgcaacggaatcagcagaactttcttcttatctatcaagccac
aatatggcgatgactactacgaatgttcttacttactggttacaatcatgggttcgcgag
tatggtgtggatggattccgttgtgatactgcaaaacacgtagatcttgcatcatgggct
accctcaaaaaatcttgtgttgaagcgttaaaagattggaaagcaaagaatccaagtaaa
gctcttgataatctagatttctggatgacaggagaagtatgggatcatggagtatataaa
gatgattactatacaacaggtggttttgactcacttattaactttagcacacaaggtggt
ggtatcttagcaaagagtacggttgcagctacctatcagtcatttgctaattctattaat
agtgatcctaattttaatgtattgtcctatctttcatcacatgatagcgtgctagcaaga
ggtaattccatctatcttggttcagcatttttgttacttccaggtggtatacagaccttc
tatggagatgaaacaaatcgtaaaatagacgatacagcctccacaaatggtgatcatgaa
gtaagaagtgatatgaactggtctgatatgaatgagaccacactagctcattggcagaag
gttggtaccttccgtcataatcacatcgctgtaggtgctggggcaaatgcttcacttact
tctagtgatggagtagcattttcaagaacatataacagtaatgatattagtgataagatt
gcagcttgtatcggatgtgaaagtaatgcgaatgtaacgattgatgtttcttctctatgg
gctgagggacagactcttgtaaatgcgtatgattttacaacagctgtcgttacgaatgga
tcagtaacatttaatagtggtgcaaatggtaccattcttatagaagagccagatggtaag
ccattagtatcagtcatcggtgctgccaaattccatggcacacaagatgttacaatcgat
attgtagatgctgacaatgcaaaggtatccgttgatggagcgaaggaatttcttgcagaa
gatggtgatacatttacaatcggtgaaacagcatatgaaggcgataacgtgagtgttaca
gtggaagccacgaatgcaaagggaactagaaatgccacttataccttttataaagcctat
gcgaatgaggatataacaccaaaaccagttcctgaatacaaaggtatcgtatatgttaag
tcctatgatggtactgcaccttatgtatatgcatggaaaggtagtaacacagcactaact
gcagcttggcctggaactaagatgacaaaattaaatgatcaaggctattatgagatggat
cttggcactacggattcctataatgtggtactgagtaatggaagtggcaagcaaagcagt
aatattacgaatcttcaaggtggtgtatggattgatctgacatcatcaagttttacttat
aatattgtgaaaagagaagtggtgccaaccaccaatcctattacgattaatgtaaagagc
tttaatgactcggctccatatctatatatctgggatgcggacggtaatacatataatggc
tctttcccaggaagacctttatcgaataagacagcggatggtttgtatactcttacgata
gattccagctctccatcggtaaattgtattgtaagctatggaagtaacaccaatcagtca
agtgcaatcactggtattacgaaggatgctacaatcacaataacttctgcaaattgtagc
accattgaggtagtgaaaacaatagttacagaatcctctttagacactttgaaaaaagaa
acaagagaaattaagaatctaaccgcagagaattatacaacggaatcctataccaaacta
tattcttatgttgcaccagcagatgcgttaattgcattaggtgataaagctgatgaagct
gctttaaaggatatgattactacaatccagactgcgaaagccaatcttgtagttgccaaa
ccaacggtaaccggagttacattaggaagtacaagaatctatggtacagcagcatatgga
agcaatgttgcgattaagattggaaataatgaatacaaggccgtagcagatggcatcact
ggggaatattcggttgccgttgctccattagttcttacggatcgtgttattgtatcatgt
atattaggaaataactcctcaagtacagatacttattatgtaaataatgcagaaaaagtt
gatccaacgagtattacacttaatagttcaagtataacagtggctccaggaagtactgca
agattagtagcaaccgtattaccaagcaatgcttcggatacttcggttacttggaagact
agcaatagttcagtagctacagtaattgatggtactgtaactggtatagcaaaaggaact
gcaacaatcactgctacaacttctaatggattaactgcctccgtagtagttaccgtttca
acagaggatattaaagtgactagtatcactcttaatccattaacagctaccataataaaa
ggtgatacaacaactttaacagcaaatgtattaccagttaatgcaacggatcagaaagta
acttggacaacgagcaatagtgcagtagccacagtagcatctggtgttataactggtgtc
tcagctggtaacgttaccatcacagctactacatcaaatggtttaactgcaacagcaaac
atcacagtaaccgaaacacaaagtaataattatatgtattttgaaaaaccatctacttgg
ggaaataccatatatgcatacatatggaacagtaatgttacatataaaaatgcagtatgg
ccaggattagtaacaacacaatattccaatggcgtgtatatgattgaatggccaaaagat
tatacaggtacagaccttaatgtaatctttacggataaaactcatcagacagctgattta
aaagcaattaaaaatggttattacacaagtagtggatatcatcacacggttacaccagga
gagtttactccaactagtgttacattagacacatcaactgcttcgattgaagtgggaagt
acaaaagcatttgttgcaacagtattaccaacaacagcttcctcaagtgttacttggact
tcaagtgataattcgattgctacagtatcacaaggagttgtaacaggagtcgcagaagga
acaacaacgattactgcaacgacaacgaatggtcttacagcgacaactacggtttccgta
ataccatccacgaagagttatatgtattttgtaaaacctgccacttggggtaacacgatc
tatgcttatatgtggacggatgatggtacttataagaacaaagcttggccaggagttgta
actacattacaacctgatggaaagtatgcaatcgagtatcctaagggatatactggtttg
aatattatctttacggatggttctaagcagacggctgatctgaaagcagttgaagggtat
acttatagtgtgaattga
DBGET
integrated database retrieval system