Allocoprobacillus halotolerans: NMU03_16395
Help
Entry
NMU03_16395 CDS
T09839
Name
(GenBank) SpaA isopeptide-forming pilin-related protein
Organism
ahq
Allocoprobacillus halotolerans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SpaA
SdrD_B
CarboxypepD_reg
NOMO1-like_2nd
NOMO_3rd
TED
DUF2606
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UTY39124
UniProt:
A0ABY5I190
LinkDB
All DBs
Position
complement(2792747..2796553)
Genome browser
AA seq
1268 aa
AA seq
DB search
MISKIKKISRKLMIGAASAVLAISTLTTNAYALTGTTSSIVYPEWKMADPVTEKTDGVEG
YLMVNKEPVFCVDYHTAFHSGKTVTQGTFADAGISEPTAKRLSLIAYYGTKVPGRTSRDW
YAITQGLLWRVIHNDDSLKYIRTSITPNFASTKKAWDEILADVDRYYVKPSFASSTHEVD
SNKTLELNDTNGVLKDMAIAQNGGLDVSIQDNKLIIKGNSSVDEATIVLKKNIKDSEVGT
SIVYTAPDCQSVASFKVSNPMEVSIKVKVNRTGELLLKKFNDDKSAAIPHTTFRITGENG
FDKTLTTDENGQIHLTGLMLGDYKAVETKSASGYLINVNEFNFEIKPGETTTLEVTNDEP
KGIITVYKTNDLGDNRVNGATFDVIADEVITNKAGTKTYYQKGDTVQTLTSSSNGEYTTK
PLPLGKYKIIESKAPEGYLLNPAEQFITLKYKDQHTEVVYESLTVENKEPVGKIILYKSI
DTSQTNNLTGDAFIEGNIYQLYAKDRITNKAGTKVFYEKDQMISEKKTDKNGQIEWDDLP
LGNYYIKESKSNDSLVLNTKIIDVAIEYQGQTVSKVISQKETSDKVNMQKIRVFKSGEKD
GISGIVKGLQGAEFTFKLKSEVDHVGWDNAQTYAMITTDKDGYATTGYLPYGTYLVKETK
TPQDYITAPDFTISVTDDYSEHIDVEQIKTVNINNRPFTSQVKLVKKDKDTNQIVTLNSA
SFKIKDQDGNYVTQKVFGQKIDTFTTNSKNQITALFGDKGEVTLPLQLDAGTYTVEEIKV
PEGFLELEEPLTFTITNQYDYDVDEDDDPILEVAVKNAQPKGKIIISKTDKETGDALKGV
EYELTAKEDIINAIDGSILYKNGQVVEKGTTDENGQIIIDDLFMGRYELKETLTNEGYVL
SQTVHDIVIEQNDTTTKLYTVEVNVTNIAPMGEIHLVKTDKDTQDLLGGVTYQLTAKEDI
YSLDGRNTLIYEKGQQVSKDISEDGLYVTNELGEINISELPLGQYELKETQALEGYVKDE
TIYTIDLSYDGSDKTVYTHSMNVINQKTEIEISKKDITNGKELEGAKLTLLDKDNHVIET
WTSTNEPHIIKGLLVDEKYRLREDLAPLGYVKASDITFTVNNTTEVQKVEMIDDVIKVEI
SKQDIVTGKELPGAKLQIIDESNKVIHEWITTDKPHLFEKMPAGQYTLREITAPDGYEVA
EDIAFTVEETGKIQKVVMKDQPIKKSVVKTGDNSMIGLYACGVTIAGIGCICFIKKKKSQ
DKGESHDR
NT seq
3807 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattagtaaaataaagaaaatatcaaggaagttgatgattggtgcagcaagtgcagtg
ctagctataagcactctaacaacaaatgcttatgccttaacaggaacaacaagctcaatt
gtctatccagaatggaagatggctgatccagtgactgaaaagactgatggcgttgaagga
tatcttatggtcaataaggaaccagtattctgtgttgattaccatacggcatttcacagt
ggtaaaactgtaacacagggaacttttgctgatgctggaatcagtgagccaactgctaaa
agattaagtcttattgcttactatggaacgaaagtaccaggtagaacaagcagagactgg
tatgccattactcaagggttgttatggagagttattcataacgatgatagtttaaaatat
attcgtacaagcattacaccaaattttgcttctacaaaaaaggcatgggatgaaatctta
gctgatgttgacagatattatgtcaagccatcttttgccagttcaacacatgaagtggat
tcaaacaagacacttgaattaaatgatactaatggtgttttaaaggatatggctattgct
caaaatggaggattagatgtatctattcaagataacaagcttatcatcaaaggaaacagc
agtgttgatgaagcaacaatcgtattaaagaagaacattaaagacagcgaagtaggaaca
agtattgtttatacagctccagactgtcaaagcgttgcttcttttaaagtcagcaatcca
atggaagtcagtattaaggtaaaagtcaatagaactggcgagctgttattgaagaaattc
aatgatgataaaagtgcagcaatacctcatacgacatttagaattactggagaaaacgga
tttgataagacattgactactgatgaaaatggtcaaattcatttaacaggtcttatgttg
ggagattacaaggctgtagaaacaaagtcagctagtggataccttatcaatgtcaatgag
tttaactttgaaataaagccaggtgaaacaacaacattggaagtcacaaatgatgagcct
aaaggaattatcactgtttataagacaaatgatttaggtgacaacagagttaatggtgcg
acatttgatgttattgctgatgaagtaattacaaacaaggcaggaacaaagacttattat
caaaaaggtgatactgttcaaacattaacttcatcatctaatggtgaatatacaacaaaa
ccattgccacttggaaaatataaaattatagaaagcaaggctcctgaaggatatctatta
aatccagcagaacagtttatcactttaaaatataaagatcagcatacagaagtcgtttat
gaatcattgactgtagaaaataaagaaccagttggcaagattatattgtataaatcaatt
gataccagtcaaacgaacaatcttactggtgatgcctttattgaaggaaatatctatcag
ttatatgcaaaagatagaattaccaacaaagcaggtacaaaggttttctatgaaaaggat
caaatgatttcagaaaagaaaacagataaaaatggtcaaattgaatgggatgatcttcca
ttaggaaattattatatcaaggaatcaaaaagtaatgattcacttgtgttaaatacaaaa
attattgatgttgctattgaatatcagggacaaactgtttcgaaagtaatcagtcaaaaa
gagacttcagacaaagtcaacatgcaaaaaatcagagtctttaaaagcggtgaaaaagat
ggtatcagtggtatcgtcaaaggattacagggtgcagagtttactttcaagttaaaaagt
gaagtcgatcatgtaggatgggataatgctcaaacttacgctatgattacaactgataag
gatggctatgcaacaactggatacttgccatacggaacttatcttgttaaggaaacaaaa
acacctcaggattatataacagcaccagatttcactatttcagtaacagatgattatagt
gaacatattgatgttgaacaaattaaaactgttaatattaacaatcgtccatttacttct
caagtgaagctagtgaaaaaggataaggacacaaatcaaatagttactcttaattcagca
agctttaaaatcaaagatcaagatggaaactatgtaacacaaaaagtctttggacaaaaa
attgatacgtttactaccaattcaaaaaatcaaataacagcattgtttggtgataagggt
gaagtgactttacctttacagctagatgctggaacttatactgttgaagaaattaaagta
ccggaaggcttccttgaattagaggaaccattaactttcacaataactaatcagtatgat
tatgatgttgatgaagatgatgatccaattttagaagtagcagtaaaaaatgctcagcct
aaaggaaagattattatttctaagacagataaggaaacaggagatgcacttaaaggtgta
gaatatgaattaactgcaaaagaagatattatcaatgccattgatggttcaattctttat
aaaaatggtcaagtagttgaaaaaggaacaactgatgaaaatggtcaaatcatcattgat
gatttgtttatgggtcgttatgagttaaaggaaaccttaacaaatgaaggctatgttctt
tctcaaacagttcatgatattgtcattgaacaaaatgatacaactacaaagctatatact
gttgaagtcaatgtaactaatattgctccaatgggtgaaattcatcttgtcaagacagat
aaagatactcaagatttattaggaggtgtcacttatcagttaactgctaaagaagatatc
tatagcttggatggaagaaatactttaatctatgaaaaaggtcaacaagtttcaaaagac
atcagtgaagatggattgtatgtcactaatgaacttggtgaaattaatatttctgaattg
ccattaggtcaatatgaactaaaggaaacgcaggcattagaaggatatgttaaagatgaa
acaatctatacgattgatttatcttatgatggcagtgataaaacagtttacactcattca
atgaatgtaatcaatcaaaaaactgaaattgaaatttcaaagaaagatatcactaatgga
aaagagctagaaggtgctaagttaactttattggataaagataatcacgttattgaaacg
tggacttcaacaaatgaacctcatatcatcaaaggattattagttgatgaaaaatataga
cttcgtgaggaccttgcaccacttggatatgtcaaggcatcagatattacttttactgtc
aacaacactacagaagtacaaaaggttgaaatgattgacgatgtcattaaagtagagatt
tctaaacaggatattgtaactggtaaggaattacctggtgctaaattacagattatagat
gaaagcaataaagtgattcatgaatggataacaactgataaaccacatctatttgaaaaa
atgccagcaggacaatatacattaagagaaataacagctcctgatggttatgaagttgct
gaagatattgcatttacagttgaagaaactgggaaaattcaaaaggttgtcatgaaagat
caaccaatcaagaaatcagtggttaaaactggtgataattcaatgattggattgtatgca
tgtggtgttactattgcaggtataggatgtatctgttttatcaaaaagaagaaatctcaa
gataaaggtgaatcacatgatagataa
DBGET
integrated database retrieval system