Pseudalgibacter alginicilyticus: APS56_12940
Help
Entry
APS56_12940 CDS
T04100
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K20276
large repetitive protein
Organism
ahz
Pseudalgibacter alginicilyticus
Pathway
ahz02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ahz00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
APS56_12940
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Ig_7
CHU_C
ChitinaseA_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALJ05981
UniProt:
A0A0P0CIG5
LinkDB
All DBs
Position
3121809..3126491
Genome browser
AA seq
1560 aa
AA seq
DB search
MKTIVSFNYVFKIGLYFSLLIWTSFMAFAQCPNITQPSSPIDIASGLVFSDLDVIASASS
DVIWYNSSTGGIVLNDNQLVYEGTFYAGDLSGTCGSRQPLIVDFAVPPSGSNLDKFFCSN
DNPIFQDYITQILQPDIPVSGSVEIYSDFELTNIIQSTDAIPTGPADYYIIFKNSSGDQS
QIEIGSVAVIASPTEPTPPTIQEFCSDQGPLTIGHLDPGTTATFRWYNNIDGFGNTLPPA
LTSGTALIDGNTYYVQLEGFCKSNPVPVTVTINSSFDAGSSANLGYCISEVATVPPFDLF
DTLGGVKDTNGSWTGPLTTTNGYQGTVDVSTLTTEGIYTFTYTVPSNGSCPGDFSTVEIT
IFETLSSGSASLITNPAIYCEKDLPTSFDLFTLLDGSEDLGGQWTQGVIPVSSTFNLSVL
VPGTTYDFTYTQNGLPNPCLEDFTTVQVIVLEDPKAGTASNLTFCENDLALNSPFDLFTA
LSGQDNNLGTWTDASNNIISNSIDITGFTEANSPYQFTYTISNGTCEDTETISFIIEPAP
ESGTPVAIFPEFCEGFAPTNYDLFDLLTDEDQSGTWYIGTDNTGSSTSNPVNLSALSVGT
HNFTYDVDAIGSCDDSLVTVSITINPLPVTGTPLLTVFCENDLVANSPLDLYSRLTGEDA
GGTWIDDDTSNALTGSSVDLTLLTTGFHNFTYSITDANGCSSSSTVTVQVEDAPESGTPV
AIFSEFCEGSAPTNYDLFDLLTDEDQSGIWYIGTDNTGSSTSNPVNLSALSVGTHNFTYD
VDAIGSCDDSLVTVSITINPLPVTGTPLPTVFCENDLVANSPLDLYSRLTGEDAGGTWID
DDTSNALTGSSVDLTLLTTGFHNFTYSITDANGCSSSSTVTVQVEDAPESGTAIAPLELC
LSEITVGKTIDLFDLLTGEDQTGTWNDDDASGNLSENILTVDGLAAGTYNFTYDVNAIGF
CDDVNITVSVIINDVIAPAALAIQEFCDNATVADLETITGTTIRWYDESTGGTALVDTTP
LLDTETYYATQTDITTGCESANRSLVTVSIYQTPNTGTPNTIAIVACNDDNSIDLFAGLD
GTEDIGGVWQDIDGTGALIDNIFDATVNGVGTYQFAYFIAGSAPCVNASTVITVTVEESL
NAGVNINPTLDICSNNGTMDLFSLLGGADSGGIWSPALASTTGVFDPLLDAQGTYTYTLS
NACGNVSNTVEVDVTQAPNAGTDNTVSICVIDGTTDLFPFLGSAQSGGTWFPALDSGTGE
FNPLVDVAGEYTYTVTALAPCNPESTAKITVIVNNTVPPTVVNPSPEYCLVNNPTVENLN
ATISATGTVIWYADAALTMPLTITEALVDGEDYYATQTNSTGCESSIAVQINVTVNDTVT
PTLDDASIEYCINDGPTINTLSQNIIEFVSADNNIIWYDAVKDGSVISSSSILTSMTYYA
ALIDAATGCESSVRLEVTPIITACGLVELPDGFSPNGDGINDTYDYDNLGVLFPKFEIEI
YNRYGSLVYRGKDQTPRFDGKSNQGRTLGSGDLPVGMYYYILKYNDGVNKPKQGNLYLSR
NT seq
4683 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaacaatagtatcatttaattatgtttttaaaatcgggctttatttttcgttactc
atatggacatcatttatggcttttgcccaatgtcctaatattacacaaccgtcatcacca
attgatattgcttctggtcttgtgttttctgatttagatgtcattgcatcagctagtagt
gatgttatttggtataatagttctacaggaggtattgtacttaatgataaccaattggta
tacgaaggcacattttatgctggcgatttatcaggtacttgtggtagtaggcaaccatta
attgtagattttgcagttcctccttcagggtcaaatctagataagtttttttgtagtaat
gataatcctatatttcaagattatattactcaaattttacaaccagatattcctgtaagt
ggttcagtagaaatttattcagattttgaattaacaaatattattcagtctacagatgct
attcctacaggtcctgcagattattatattatatttaaaaatagttcaggagatcaaagt
caaattgaaatagggagtgttgctgttatagctagtccaacagaaccaactccgccaact
attcaggagttttgttctgatcaagggcctttaacaattggtcatttagaccctggcact
acggctacttttcgttggtataataatatagatggatttgggaatacattgcctcctgca
ctaacatcagggaccgctttaatagatggtaatacatattatgttcaattagaaggattt
tgtaaaagtaatcccgtaccagttacagtaacgataaattcatcttttgatgctggcagc
tcagcaaatttagggtattgtataagtgaagttgcaactgtacctccttttgacttattt
gatacattaggtggtgtaaaagacactaacggaagttggacggggcctttgacaacaaca
aatggatatcagggtacagtagatgtttcaacattaacaacggaaggaatatatactttt
acctatacagtgccaagtaatggttcatgtcctggagatttttctactgtagagattact
atttttgaaacactaagttcagggagtgcttctttaataactaatccagcaatttattgt
gaaaaagatttacctacatcatttgacttgtttaccttattagatggcagtgaagattta
ggaggacaatggacacaaggagtgattccagtgtcgtcaactttcaatttatcagtttta
gtacctggtacaacttatgattttacatatacccaaaatgggttgccaaatccatgttta
gaagattttacaacggtacaagttatagttttagaagatcccaaagcaggaacagcaagt
aatctaacattttgtgaaaatgacttagctttaaattcaccttttgatttattcactgct
ttaagtggtcaagataataatttgggtacttggacagatgcaagtaataacataatatca
aattctattgatattacaggttttacagaagctaatagtccgtatcaatttacttatacc
atttccaacggcacctgtgaggacacggaaacaatttcttttattattgaaccagcacca
gaatcaggaacaccagttgcaatctttccagaattttgtgaaggttttgcaccaactaat
tacgatttgtttgatttattaacagatgaagatcaatcaggaacatggtatataggtaca
gataatacaggctcatcaacttccaatccagtcaatttatcagctttatcagtaggaact
cataattttacttatgatgtagatgctattggttcttgtgatgattctttagttaccgtt
tcaataacgataaacccactaccagtaacaggaacaccattactaacagttttttgtgaa
aatgatttagtagcaaattcaccattagatttatatagtagattaaccggagaagatgct
ggaggtacttggatagatgatgatacatcaaatgccttaacaggaagcagtgtcgattta
accttattgactacaggattccataatttcacatatagcattaccgatgctaatggatgc
tcaagtagttcaaccgtaacagttcaagttgaagatgcaccagaatcaggaacaccagtt
gcaatcttttcagaattttgtgaaggttctgcaccaactaattacgatttgtttgattta
ttaacagatgaagatcaatcaggaatatggtatataggtacagataatacaggctcatca
acttccaatccagtcaatttatcagctttatcagtaggaactcataattttacttatgat
gtagatgctattggttcttgtgatgattctttagttaccgtttcaataacgataaatcca
ctaccagtaacaggaacaccattaccaacagttttttgtgaaaatgatttagtagcaaat
tcaccattagatttatatagtagattaaccggagaagatgctggaggtacttggatagat
gatgatacatcaaatgccttaacaggaagcagtgtcgatttaaccttattgactacagga
ttccataatttcacatatagcattaccgacgctaatggatgctcaagtagttcaaccgta
acagttcaagttgaagatgcaccagaatcaggaacagcaattgcaccattagagttgtgt
ctttctgaaattacggtaggaaaaacaattgatttatttgatttattaacaggtgaagac
caaacaggaacttggaatgatgacgatgcttcaggaaatttatcagaaaatattcttact
gtagatggattagcagctgggacttataatttcacatatgatgtaaatgctattggtttt
tgcgatgatgtaaatataactgtgagtgtcattattaatgatgtaattgccccagcagct
ttagcaattcaagaattttgtgataatgctacagttgccgatttagagacaattacagga
acaactattagatggtatgatgaatctacgggaggaactgctttagtcgatacaacacct
ttgctagatactgaaacatattatgctactcaaacagatataacaacaggttgtgaatct
gctaacagaagcttagtcactgtaagtatttaccaaacaccaaatacaggaacaccaaat
acaatagcaattgtagcatgtaatgatgataatagtattgacctttttgctggtttggat
ggtactgaagatattggtggtgtatggcaagatattgacggtacaggagctttaatagat
aatatttttgatgccacagtgaatggtgtaggaacctatcagtttgcatattttatagca
ggttcagcaccttgtgttaatgctagcacagttataacagttactgttgaggagtcttta
aatgctggagtaaacataaatcctactttagatatttgtagcaacaacggaacaatggat
ttgttttcgcttttaggtggggcagattcaggaggtatatggtcaccagctttggcaagt
acaacaggtgtttttgaccctttgcttgatgctcaaggcacttacacctatactttatct
aatgcttgtggaaatgtaagcaacactgtagaagttgatgtaacccaagcaccaaatgca
ggaacagataatacagtttctatttgtgtgattgatggtacaacagatttatttcccttt
ttaggttcggcacaatcaggtggaacctggtttcctgctttagatagtggaactggtgaa
tttaatcctttggttgacgttgcgggagaatatacgtatacagtaacagcattagcacct
tgtaatccagagtcaacagcaaaaataactgtaatagttaataatacggttccaccaacg
gtagtaaatccaagtccagaatattgtttggtaaacaatccaacagtagaaaatttgaat
gctactattagcgcaacaggtactgttatttggtatgcagatgcggcattaacaatgcca
ctaactattacagaagcacttgttgatggggaagattattacgcaacacaaacaaatagt
acggggtgtgaatcttcaatagcagttcaaataaatgttacagttaacgatactgtcact
ccaactttagatgatgcttcaatagaatattgtattaatgatggaccaactatcaatact
ttatcacagaatataatcgaatttgtttctgctgataataatattatttggtatgatgct
gtaaaggatggttcagttatttcaagtagttctatattaacaagcatgacatattatgcg
gctttgattgatgctgctactggatgtgaaagtagtgttcgattagaagtaacaccaatc
attacagcatgtggtttagtggaattaccagatggtttttcgccaaatggagatggtatt
aacgatacatatgattatgataatttaggtgtcctatttccaaaatttgaaatagagatt
tacaatcgctatggaagtttagtttataggggtaaagatcaaacaccgcgttttgacggc
aaatcaaatcaaggacgtacccttggaagtggcgatttacctgtaggtatgtattattat
attctcaaatataatgatggtgtaaataaaccgaaacaaggaaacttatacttaagcaga
taa
DBGET
integrated database retrieval system
