Anaerobacillus isosaccharinicus: AWH56_006025
Help
Entry
AWH56_006025 CDS
T06884
Name
(GenBank) S-layer homology domain-containing protein
Organism
aia
Anaerobacillus isosaccharinicus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SLH
Big_5
Big_4
CopC
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QOY37189
UniProt:
A0A1S2LZQ8
LinkDB
All DBs
Position
complement(4988592..4991927)
Genome browser
AA seq
1111 aa
AA seq
DB search
MAYQPKSYRKFLATSVAAALVATSVAPAAFAAEAKKEEVSFKDFGENHRAAKEVYTLVEE
GVIGGFPDGTFRPDAEVTRAQAALMLARSLGYVNAAGELLVEVDADAFSDLPEGHRAYNA
VAALRTNKKIGGFPDGTFRPDANITRGAMAIMVANAYELEATSETNPFTDLGASSAAAVQ
ALYDNKITTGATATTFGTNANIKRSDFSVFTYRGMVAAGLIEEKAPVAPVTELKVESVSA
NNLKEVVVTFNQEVDVLTGEDVANYTFNTTSNLEVASAVVTGNVVTLTVERTNTSVAADE
HAAQQQVADLTIQNVESAKGAELAKVTNSVRFIDVLAPEVVGIKVAGPRQVTVVFSEPLK
SNPSYKFDGGTNTVVTTDFTVGAREVTLTLGSQPTEGLHTVEVEGGSDYANFKVDKVVKE
FNFVNDTAAPVLSVKSATPTTVVLVADENFVNATNSNVQFYHTVKGSSAYRANVSVSGRE
ITLTFATPIPEGNAKVFLHYVNEEGTKIQDAWGNKVASGEFAFNLAIDRTAPTVSEDIVT
VNSTTLRVTFSEAVTNANVASNYELKDADGNILSINRIEAATQRNAYNIILNNELEGGTY
TLKVKNGIVDVAGNKLVEVVKSFFAEDKKAPTVTGTAQRINDKKVKVLFSESMDAASITN
KANYFYNSSALNSAVTITPVDNNSAVILDFTNVTGFTAFVSGDTINVGRVSDAAGNLTAR
QSTPVSIPTTVSTLSPVENGVKVVAKNRIEVTFNQIIRNYKASDFLVADNTVSSVSDRTE
NGKTTIILTLGTDLATDATPLVSSAGSDVTAENTQGIKVGFTNALSIDKLAPELALVDHD
NDPDTDTVKNIVITDSNGNGVVDTITVTFTETLETLTASSTAANYATVEGFTVARVVVSG
TTVVLTVAPKTGVDGSSAATPTVTLKNIADAQGNLITELSGNAFFVIHPGVAALAAAIAA
FNAEVARVEGLNLVEANYTAASWTALETALAYDVAGKTVAQINTATQAITNAETGLVMLI
SSFASISNLDAGQEGVNALANAAAVIAELPTTIVATLADGSTQTLDIASWNDTDGYANTE
GSYTFTATVTVPAGLDLNGQTVTAVAVVAAP
NT seq
3336 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcttatcaacctaagtcttatcgcaagtttttagctacttctgtggcagcagctttg
gtagctacatcagtagcaccagcagctttcgcagcagaggctaagaaagaagaagtaagt
tttaaagatttcggtgaaaatcaccgcgcagcaaaagaagtttacacactagttgaagaa
ggagttatcggtggtttcccagatggaacattccgtccagatgctgaagtaactcgtgct
caagctgctcttatgttagctcgttcattaggttatgttaacgcagcaggcgaacttcta
gttgaagttgatgcagatgctttctctgatcttccagaaggacaccgtgcgtataatgct
gttgcagctttacgtacaaacaaaaaaatcggtggtttcccagatggaacattccgtcca
gatgctaacatcactcgtggtgcaatggcgatcatggttgctaatgcttatgagttagaa
gcaacttcagaaactaatcctttcactgatcttggtgctagctcagcagcagcagttcaa
gcattatatgacaacaaaatcactacaggtgcaactgcaactactttcggaacaaatgct
aacatcaaacgttctgatttctcagtattcacataccgtggaatggtagctgcaggtctt
atcgaagaaaaagctcctgttgctcctgtaactgaattaaaggttgagagcgtaagtgcg
aataaccttaaagaagtagttgtaacttttaaccaagaagtagatgtgctaactggtgaa
gatgtagctaactatacatttaatactacaagcaacttagaagttgcttctgctgtagtt
acaggtaatgtagtaacattaactgtagaaagaactaatacatcagttgcggctgatgag
catgcagcacaacaacaagtggctgacttaacgattcaaaatgttgaatctgcaaaaggt
gcagagttggctaaagttactaattctgtaagatttattgatgttctggctccagaagtt
gtaggtattaaagttgcaggtccaagacaagtaactgtagtattttctgaaccgttaaaa
tcaaatccttcttataaatttgatggtggtacaaacacagttgtaactactgacttcact
gttggtgctagagaagtgacgttaacactaggatctcaaccaactgaaggcctacacaca
gttgaagttgaaggcggaagtgattacgctaactttaaagtagataaagttgtaaaagaa
ttcaactttgtaaatgatactgctgctcctgtattatcagttaaatctgctactccaaca
acggttgtgttagtggctgatgagaactttgttaatgcaacaaacagtaacgttcaattt
tatcatactgtaaaaggttctagtgcttacagagcaaacgtttcagtaagtggtagagaa
attactttaacttttgctactccgattcctgaaggaaatgcaaaagtcttcttacactat
gtgaatgaagaaggaactaaaattcaagatgcttggggcaataaagttgcttctggtgaa
tttgcattcaatttagcaatcgacagaactgctccaacagtatcagaagatattgttact
gttaattcaactactttaagagtaacatttagtgaagctgttacaaatgcaaatgttgca
tctaactatgagttaaaagatgctgatggaaacatcctttctatcaacagaattgaagct
gctacacaaagaaatgcttacaatattatcctaaacaatgaacttgaaggcggtacgtat
acccttaaagtgaaaaatggtattgttgatgtagcaggcaacaaactagttgaagtagta
aaatctttcttcgctgaagacaaaaaagctccaactgttactggaactgcacagcgtatt
aatgataaaaaagtaaaagtattattctcagagtctatggatgctgcttctattacaaat
aaagcaaactacttctataacagttctgcattgaatagtgctgtaactattactcctgtt
gataacaatagtgcagtaattttagattttacaaatgttactggatttacggcttttgtt
tctggtgatactattaatgtaggtcgtgttagcgatgcagctgggaacttaactgctaga
caaagtacaccagtttcaatccctactactgtttctacactttcaccagtagaaaatgga
gtgaaagttgtagctaaaaacagaattgaagttacatttaatcagattatccgtaactat
aaagcttcagatttcttagtagctgataatacagtatccagtgtttctgatagaactgaa
aatggaaaaacaactataatccttactttaggaactgatttagctactgatgcaactcca
ttagtttcatctgctggaagtgatgttacagctgaaaatacacaaggaattaaagttggt
ttcactaacgctttatctatcgataagcttgctcctgaacttgctttagtagaccatgac
aatgacccagatactgatactgttaaaaatatagttattactgatagtaatggcaacggt
gtagtagatactattacggttacatttactgaaacattagaaacgttaactgctagctca
actgctgctaactacgcaactgttgaaggtttcactgtagctagagttgtagtttcaggt
actactgtagtattaacagtcgctccaaaaacaggtgttgatggaagctcagctgctact
ccaacagtaacacttaagaatattgcagatgctcaagggaacttaatcactgaacttagt
ggaaatgcattctttgtaattcatccgggtgttgcagcattagcagctgctattgcagca
tttaatgcagaagtggcacgagttgaaggattaaacttagttgaagctaactacacagct
gcttcttggactgctcttgaaactgcattagcttacgatgtagctggtaaaactgttgct
caaattaatactgcaacacaagcaatcactaatgctgaaactggattagttatgttaatt
tcaagctttgcttcaatttctaatttagatgctgggcaagagggtgttaatgctttagca
aacgctgcggcagttattgctgaattgccaacaactattgtagctactttagctgatggt
tctactcaaacattagatatcgcatcttggaatgatactgatggatatgctaatactgaa
ggaagctatacatttactgcaacagtaacagtaccggcaggattagatcttaatggtcaa
actgttacagctgtagcagttgtagctgctccttaa
DBGET
integrated database retrieval system