Acinetobacter indicus: CTZ23_14780
Help
Entry
CTZ23_14780 CDS
T05342
Name
(GenBank) DEAD/DEAH box helicase
Organism
aid
Acinetobacter indicus
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
Helicase_C
SWIM
HDA2-3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AVH15415
LinkDB
All DBs
Position
complement(3046555..3049902)
Genome browser
AA seq
1115 aa
AA seq
DB search
MSLLINFLSRFSTATLQRSLSYAKHIDRETIEFFEENDDVTMYAQIEGTDYYDTAITYNP
QKDRLIDDDCTCPVGYNCKHAAALARLFFQEYRQEFQQRYAESQSPQGIAKRRWGDDQAQ
RWLNDFKRYLQQTEPEQSVKTNNYLIYLLDQSVSLKKLTVDVQKARRNKNGSIAGESYYT
QYENITRKHLTLPEQKRQLFNQIYYYAKINSDERFYQSNLDISSILLEHFKSFIQSGDVY
WKKKSHTALQWSEQGYHIELIWQQGVNKQTEHLNIELVNGDIRLDLKSNPHIQILASHPP
CYVDIQQNTVGQLYGEYTANLLYHFLQMPDLPAKLLPEFEKLTHQYSDVKNLPQPEFIQH
IDVFEGSPQPILRFGVLDKFDWKWEESVCAEIEFSYAGGRIKAGTSGDSFIGEQHGKMVR
QLRDLVQEQQSIQRLQLLVESLKWVKDLSYDQQLKLDKQRLDSMVFAFYGDWIKQLMPIN
QIELMGWQIEHLENSPFNLQYVENLNISITESEGQQDWFNIGATVQDSAGNSYNLLDALV
ALVRVNPDLLDPRTFIHLHDSQIFTVKTAVDQPDLALSARDIKPVLLHLQSILQQEERSI
DRYDASQLLELQHNLGMTWQVSDRLQQFVQKFKQGYQQQLPTPQGFQGELRPYQQQGLGW
LQFLRETQHGGILADDMGLGKTAQTLAHLLMEKQAGYLQDSPALIVAPTSLMHNWFKEAE
KFTPQLNVLLLQGPDRHQNFEQIPHYDIVLTTYPLLARDEEQLKQYEYHQLILDEAQNIK
NPRAKAAQVVRQLTARHRLCLTGTPMENHLGELWALFYFLMPGFLYSQEIFNKKYRYPIE
KRGDQQLKQKLVNRIKPFILRRLKTDVAKELPEKTTIEVNIDMNEQQSKLYEAVRATMQA
NIQKIVAEKGFKRSQIQILDALLKLRQVCCHPSLLKLDSVKTGQAYSAKLEQLMDMVVPM
VEEGRKILIFSQFTSMLELIEQQLYHAEIGYVKLTGKTKKRDEVITAFQSGQVPVFLISL
KAGGVGLNLTAADTVIHYDPWWNPAAEDQASDRAWRIGQDKPVFVYKLITNKSIEEKIIA
LQQNKAELAQSILSTDHEGEAKLTENDVMKLFEKF
NT seq
3348 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtccttattgatcaattttctatctcgctttagtaccgctactcttcagcgcagtctg
agctatgctaaacacattgatagggaaacaattgagttctttgaggaaaatgatgatgtc
acgatgtatgctcaaattgaagggacagattattacgatactgcgattacctataatccc
caaaaagaccgtttaatcgatgatgactgcacttgtccagttggatataactgtaaacat
gctgctgctttagcgcggttattctttcaagaatatcgtcaggaatttcaacagcgttat
gctgaatctcaatctccgcagggaatcgcaaaacgccgatggggggatgatcaggcgcag
cgttggttgaatgattttaaacggtatttacaacagactgaaccagagcaatctgtcaaa
acaaacaattatttaatttacctgctagatcagtcggtcagcttaaagaaattgacagtt
gatgttcagaaggccagacgcaataaaaacggctcaattgcaggggaaagttattatacc
caatatgaaaatatcaccagaaagcatctgactttacctgaacaaaaacgacaattattt
aaccagatttattattacgccaaaataaacagcgacgaacgcttttatcaaagcaatctt
gatatctcaagcattttattggagcatttcaaatcttttattcaaagtggcgatgtgtac
tggaaaaaaaagagccatactgcacttcaatggtcagaacaaggctatcacatcgaactg
atctggcaacaaggtgtaaacaaacagacagagcatttaaacattgaattggtcaatggt
gatattcgactcgatttaaaatcaaatcctcatattcagattctcgcgagccatccacca
tgttatgtggatattcaacagaacacggtgggccagttatatggtgaatatacggcaaat
cttctgtaccattttttacagatgcctgatcttccagctaagctcttgccagagtttgag
aaactgactcatcaatattcagatgtgaaaaatctgcctcaacccgagtttattcagcat
attgatgtctttgagggtagtccccagccaattttacgcttcggtgttttagataaattt
gattggaaatgggaagagtctgtttgtgctgaaattgaattctcctatgcaggtgggcga
attaaagcaggtacatcaggtgacagttttattggtgaacagcatggcaaaatggtgcga
cagcttcgggacttagttcaggaacaacagtcaatccagcgtttacagctattggtcgaa
tcactgaagtgggtgaaagatcttagttatgaccagcaattaaaactggataaacaacgt
cttgattctatggtttttgctttctatggagactggatcaaacagctcatgcccatcaat
caaattgagttgatgggctggcagatagagcatctggaaaacagcccctttaacctgcaa
tatgtcgaaaatttaaatatttctatcactgaatctgaaggtcagcaggactggttcaat
atcggggcgacggttcaagacagtgcaggtaattcttataatttgcttgatgcgctcgta
gctttggtgcgagtaaatcctgatttacttgatccgcggacgtttattcatctgcatgac
agtcaaattttcaccgtgaaaactgcagttgatcaacctgatttggctctatccgctagg
gatattaagccggtattgttacatctgcagagcattttacagcaagaagagcgcagtatt
gatcgctatgatgcgagtcaattattagaattgcagcataatcttgggatgacatggcag
gtcagtgatcgcctgcagcaatttgtacagaaattcaaacaaggctatcagcaacaactg
ccgacaccacaaggttttcagggggagttgcgtccataccagcagcagggcttaggctgg
ttacagtttttaagggaaacccagcatggcgggattctggcagatgatatgggcttgggg
aaaacagcacaaactttagcccatttactcatggaaaagcaggctggatatttgcaggac
agtcccgccttaattgttgcacccacatcgctgatgcataactggttcaaagaagcggag
aaatttacccctcagctgaatgtattgctgctacaggggcccgaccgccatcagaatttt
gagcagattccgcactatgatattgtgttaaccacctatccgcttctagcgagagatgaa
gagcaactgaagcaatatgaatatcatcaactcattctggatgaagcgcagaatattaaa
aatccgcgtgccaaagctgcacaggtagtacggcaattaacagcgcgacatcgtctatgt
ctaactggtacacctatggaaaatcatttgggtgagctgtgggcactattttattttcta
atgccaggatttttatattcacaagaaatctttaataaaaagtaccgctatcctattgaa
aaacgcggtgatcagcagttaaagcaaaagctggtcaaccggattaagcccttcatttta
cgtcgcttgaaaactgacgtagccaaagagttgccagaaaaaaccacgattgaagtcaat
attgacatgaatgagcagcaatccaagctatacgaggctgttcgcgccacgatgcaggca
aatattcagaaaattgtggcagaaaaaggctttaagcgtagtcaaatccaaattttagat
gccttgctgaagctgcgtcaggtctgttgtcatcctagcttgctgaaactggattcagtt
aaaaccgggcaggcgtattctgccaaacttgaacagttgatggatatggttgttccaatg
gtggaagagggacgaaaaattcttattttctctcagtttacctcaatgttggaactgatt
gaacaacagctctatcacgcagaaattggctatgtgaagctgactggaaagaccaaaaag
cgagatgaagtcattacagcatttcagtctggacaagtgccggtatttttaatcagtctg
aaagcaggaggggtcggtctgaatctaactgccgcagatacggtcattcactatgatcca
tggtggaaccctgctgctgaagatcaagcttcagatcgtgcatggcggattggacaggac
aagccggtatttgtgtataagctgattaccaataaaagcatagaagaaaaaattattgcc
ttgcagcagaataaagcagaactggcacagtctattctaagcacagatcatgagggcgaa
gcgaaactgacggaaaatgatgtgatgaaattgtttgagaaattttag
DBGET
integrated database retrieval system