Arcobacter iocasae: LXN10_10040
Help
Entry
LXN10_10040 CDS
T11121
Name
(GenBank) DNA mismatch repair protein
KO
K03555
DNA mismatch repair protein MutS
Organism
aie Arcobacter iocasae
Pathway
aie03430
Mismatch repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
aie00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03430 Mismatch repair
LXN10_10040
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
aie03400
]
LXN10_10040
DNA repair and recombination proteins [BR:
aie03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
Mismatch and loop recognition factors
LXN10_10040
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MutS_V
MutS_III
MutS_I
DUF968
HNH_2
HNHc_6
DUF863
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XHE60501
LinkDB
All DBs
Position
1998005..2000968
Genome browser
AA seq
987 aa
AA seq
DB search
MVNAELNELLQDKKELLTITYFKLQKKFEEKYGVNTVVLMEIGTFFEVYEVNNEEEQIGK
AKEIAELLNIQLTRKNKAILENSKENPIMAGVPAISLEKHLARIIGEQKYTVVLIRQKGL
PPKVSRYIDTVVSPGTNFDFVIDQDENNITSLTIDCNKGIFSVGYSAIDVTTGKCYYNEV
HGTSEDKNFALDECFNYMNMHKTNEVVVSFCDKGINQKEIIEYLELSHKTFHISSFRPKI
VYQNELFKNVFNIESLLTSIEHLDMERVPLATESLAVLIDFVIGHDAKIIQKLSFPQKLD
ISRYIYLGNNALEQLNIIETSHNPSLIKIINNTSTAMGKRLLKERLTHPVKDEKELLRRF
ALSKELYDYHTPIESELANIYDIERLTRRIKLSRLHPFELNYLYDSLLSIKEVVAFMENY
KFFTAPCSSAELQMFIDSIDSTFDLSISGKYMLKDVEANMICEGINTKIDELTNENKKLV
DKLDILRVHILGFLKSNDQNFVSIQRLDKEGFYLGLTKSRFNLMREELLNSHLIIDDELL
LFKDFKIKVQTNSVKITCKLTEDISDKYVHNLRKIIELNKLVFKDKLVEFEKNFAVLLEE
LVQFIAEIDLTVSNIKTAKKHNYSPPKIVKTKDNESFIELIDLRHPIIEHGEEQGIYVPN
DVILGELSLASDEYKNNVIIKNSNPINMFNNKMHGVLLYGINSSGKSSLMKSIGIAVILA
QAGFYVPCKSMRFSIFDAVFTRISGADNIAKGLSSFAVEMLELKNIFNRATKNSLVLGDE
ISHSTETMSGVSIVASAILKLAKLESIFMFATHLHQLPELPEIEKLKNIICLHLSVMYED
SEDKLIFNRKLQYGSGSSMYGLEYAKSLHMDKEFLRMANDIRKKLTDDYEPIERISQRKT
SKYNKDLIVSTCVICGKNVDDVHHIKEQARANKDGFIGHVNANHKYNLIPLCKEHHKMVH
EGKINVNGFIATSKGLELHYTMVDEEK
NT seq
2964 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtggtaaacgctgagcttaatgaacttttacaagataaaaaagaacttctaacaataact
tattttaagcttcaaaaaaagtttgaagaaaaatatggagtaaatactgtagttcttatg
gaaatagggacattttttgaagtttatgaagtaaataatgaagaagaacaaataggtaaa
gcaaaagagattgctgagcttttaaatatacaattgacaagaaaaaacaaggcaatttta
gaaaactctaaagagaatccaatcatggcaggtgtccctgcaatttcactagaaaaacat
cttgctagaataattggtgaacaaaaatatacagttgtattaataagacaaaaaggtctt
cctcctaaagttagcaggtatattgatacagttgtaagtcctgggacaaactttgatttt
gtgattgatcaagatgaaaataatattacttctcttacaattgattgtaataagggaatc
ttttctgttggttatagtgccattgatgttacaactggaaaatgttattacaatgaagtt
catggaacaagtgaagacaaaaactttgcccttgatgagtgtttcaattatatgaatatg
cataaaacaaacgaggtagttgtctcattttgtgataaaggaattaatcaaaaagagata
atagaataccttgaattatctcacaaaacctttcatataagttcatttagaccaaaaatt
gtttatcaaaatgaactatttaaaaatgtatttaatatagaatcacttctaacttcaata
gaacatcttgatatggaaagagtacctttagctactgaatcactagcggtgttgattgat
tttgtgattggacatgatgcgaagattattcaaaaactatctttccctcaaaaactagat
attagtagatatatttatcttggaaataatgccctagagcaattaaatataatagaaact
tcacataatccatctttaataaaaatcataaacaatacttcaactgctatgggaaaaaga
cttttaaaagagagactcactcatcctgttaaagatgaaaaagagttgttaagacgattt
gctttatcaaaagagttgtatgattatcacactccaattgagagcgagttagcaaatatt
tatgatatagaaagattaactagaagaattaaactctcaagacttcatccctttgaatta
aactacttatatgactctcttcttagtattaaagaagtagtggctttcatggaaaactat
aagtttttcacagcaccttgctcatctgctgagttacagatgtttattgattctattgat
tctacttttgatttatctattagtggtaagtatatgctaaaagatgtggaagcaaatatg
atttgtgaaggaatcaatacaaaaattgatgagcttacaaatgaaaataaaaaattagta
gataaattagatattttaagagtgcatatattaggattcttaaaatcaaatgatcaaaac
tttgttagtattcaaagacttgataaagaaggtttttatttaggacttacaaaaagtaga
tttaatcttatgagagaagagcttttaaattcacatttaataattgatgatgagctactt
ttatttaaagattttaaaataaaagttcaaacaaactctgtaaaaataacttgtaaacta
acagaggatatctcagataaatatgttcataatttaagaaaaatcattgagctaaataaa
cttgtttttaaagataaacttgtggaatttgagaaaaatttcgcagttttattagaagaa
ttagttcaatttattgctgaaattgatttaacagtatcaaatataaaaacagcaaaaaaa
cataattattcacctcctaaaatagtaaaaacaaaagataatgagagttttattgaactt
atagatttaagacatccaataattgagcatggagaagagcagggaatttatgtacctaat
gatgttattttaggggagcttagtcttgcaagtgatgaatacaaaaataatgtaatcatc
aaaaactcaaatccaataaatatgttcaataataaaatgcatggtgttttactttatgga
ataaattcaagtggaaaatcttcacttatgaaatcaataggaattgcagtaattttggca
caagctggattttatgtaccgtgtaaatcaatgagattctctatttttgatgcagtattt
acaagaatttctggggctgataatattgcaaaaggtttatcttcttttgcagttgagatg
ttagaacttaaaaatatatttaatcgagctacaaaaaattctttagttttaggtgatgag
ataagtcatagtactgaaactatgagtggagttagtattgtggcaagtgccatattaaaa
ttagcaaaattagaatcgatttttatgtttgctacacatttacatcaactacctgaactt
ccagaaatagaaaaactaaaaaatataatatgtctacatttatcagttatgtacgaagat
agtgaagataaacttatatttaatagaaaacttcaatatggaagtggaagtagtatgtat
ggtttagagtatgctaaatcacttcatatggataaagagtttcttagaatggcaaatgat
ataagaaaaaaactaaccgatgattatgaaccaattgaaagaatctcacaaagaaaaact
tcaaaatacaataaagaccttattgtttctacttgtgtaatatgtggaaaaaatgttgac
gatgttcaccatataaaagagcaagcaagggcaaataaagatggctttataggtcatgta
aatgcaaatcataaatataatttaattcctctatgtaaagaacatcataaaatggtacat
gagggtaaaataaatgtaaatggatttatagctacttcaaaaggtttggaattgcattat
acgatggtagatgaagaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system