KEGG   Arachis ipaensis: 107617675
Entry
107617675         CDS       T04301                                 
Name
(RefSeq) phytochrome A
  KO
K12120  phytochrome A
Organism
aip  Arachis ipaensis
Pathway
aip04712  Circadian rhythm - plant
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:aip00001]
 09150 Organismal Systems
  09159 Environmental adaptation
   04712 Circadian rhythm - plant
    107617675
SSDB
Motif
Pfam: PHY PAS PAS_2 GAF HATPase_c HisKA PAS_9 PAS_4
Other DBs
NCBI-GeneID: 107617675
NCBI-ProteinID: XP_016174979
LinkDB
Position
B09:26116018..26123257
AA seq 1125 aa
MSSSRPSQSSSNSGRSRHSARIIAQTTVDAKLHASFEESGSSFDYSSSVRASGSADGENQ
PRTDKVTTAYLHHIQKGKMIQPFGCLLALDEKTCKVIAYSENAPEMLTMASHAVPSVGDH
PALGIGTDIRTIFTAPSASALQKALGFGEVHLLNPILVHCKTSGKPFYAILHRVTGSLII
DFEPVKPYEVPMTAAGALQSYKLAAKAITRLQSLPSGSMERLCDTMVQEVFELTGYDRVM
AYKFHEDDHGEVIAELTKPGLEPYLGLHYPSTDIPQAARFLFLKNKVRMIVDCHAKHVKV
VQDEKLPFDLTLCGSTLRAPHSCHLQYMSNMDSIASLVMAVIVNDSDEDADNSDAVQPQK
RKRLWGLVVCHNTTPRFVPFPLRYACEFLTQVFAIHVNREIELEYQITEKNILRTQTLLC
DMLMRDAPLGIVSQSPNIMDLVKCDGASLLYKNKVWRLGVTPTESHIREIALWLSEHHMD
STGLSTDSLYDAGFPGALSLGDVVCGMAAVRITEKDIVFWFRSHTAAEIRWGGAKHDPGE
KDDGRRMHPRSSFKAFLEVVKSRSLPWKDYEMDAIHSLQLILRNAFKEMDSMDITTNAIN
TRLNDLRIEGMQELEAVTSEMVRLIETATVPILAVDVDGLVNGWNIKIAELTGLSVGDAI
GKHLLTLIENSSVGIVKKMLEMALKGEEEKNVQFEIKTHGSKVDCGPIRLVVNACASRDI
HDNVVGVCFVAQDITAQKTVMDKFTRIEGDYKAIVQNPNPLIPPIFGTDEFGWCCEWNAA
MTKVTGWKREEVMDKMLLGEVFGTQMACCRLKNQEAFVNFGIVLNKAMTGLETAKVAFGF
FARSGKYVECLLSVSKKLDVEGVVTGVFCFLQLASPELQQALHVQRISEQTALKRLKALT
YMKRQIRNPLSGMMFSRKMLEATELGTEQKQLLHTSAQCQCQLSKVLDDSDLDSIIDGYL
DLEMAEFTLHDVLVASLSQVMAKSNTKAIRIVNDVKEQIVTETLYGDSLRLQQAIADFLL
ISINFTPNGGQVVVTATLTKEQIGQSVHLVNLELSITHPGSGVPEALLNQMFESNGLESE
EEGISLLISRKLLKLMNGDVRYVREAGKSSFILSAELAAAHKLKD
NT seq 3378 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtcatcctcaaggcctagccaatcttctagcaattcggggagatcaagacatagcgct
aggattattgctcagaccactgtagatgcaaagctccatgctagttttgaggagtctggt
agttcctttgactactctagttcggtgcgcgcctccggctcagctgatggagaaaatcaa
ccaagaacagataaagtaacaacagcttacctccatcacatacagaaaggcaagatgatt
cagccctttgggtgcttgctggccttggatgagaaaacatgcaaggtgattgcttacagt
gagaatgcaccagagatgctgaccatggcgagtcatgctgttcccagtgttggtgaccac
cctgcccttggcattggcaccgacataagaactattttcactgctccaagtgcttcggca
ttgcagaaagcactaggatttggagaagttcatcttcttaaccccatcctagttcattgc
aagacttctgggaaacccttctatgctattctccatcgtgttactggtagtttgattatt
gactttgagcccgtcaagccttatgaagttcctatgactgcagcaggtgctctgcaatcc
tacaagcttgctgcgaaagcaatcacccgattgcagtctttgcctagtgggagcatggaa
aggctatgtgatacaatggttcaagaagtttttgaactcacgggttatgacagggtgatg
gcttataaatttcatgaggatgatcatggggaagtgattgctgagttaacaaagccagga
cttgaaccatatcttggtttgcactatccgtccactgatattccccaggctgcacgtttt
ttgttcttgaagaacaaggtccgtatgattgttgattgtcatgcaaaacatgtaaaggtt
gttcaagatgagaagctgccattcgatttgactttgtgtggttcaaccttaagagctcct
catagttgccatttgcaatacatgtcaaacatggattcaattgcttccctagttatggca
gttatagtcaatgacagcgatgaagatgcggacaactctgatgctgttcagccacaaaag
agaaagcgactctggggcttagttgtttgtcataacactactcccaggtttgttcctttt
cctctaaggtatgcttgtgagtttctgacacaagtatttgccatccatgtcaacagagaa
atagagttagaatatcagattactgaaaagaatatccttcgcactcagacgctcttgtgt
gatatgctgatgcgagatgcacccctaggaattgtatcacaaagccctaatataatggac
ctagttaaatgtgatggggcttccctcttgtataaaaacaaggtatggagattaggagta
acacctactgaatctcatataagagagatagctttgtggttgtctgagcaccatatggat
tccacaggtcttagtacagatagcttgtatgatgccgggttcccaggggctctgtctctt
ggtgatgtagtatgtggaatggcagcggttagaataactgagaaagacatagttttctgg
tttcgatcacacacagctgcagaaatcagatggggcggtgcaaagcatgaccctggtgaa
aaggacgacggcaggaggatgcatccacggtcatctttcaaggctttccttgaagttgtt
aagtcaaggagcttaccgtggaaagactacgagatggatgctattcattcattgcagcta
atactcagaaatgcattcaaagagatggatagtatggacataaccacaaatgcaataaat
acaaggctgaatgatttgaggattgaagggatgcaggaactggaagccgtgacgagtgag
atggttagattaattgaaactgcaacagtacctattctggctgtagatgttgatgggctg
gttaatggatggaatataaagattgccgaattgactggcctttcggttggtgatgctata
gggaagcatcttctcacgctcattgagaactcttcagttggtatagtcaagaagatgctt
gagatggcattgaaaggtgaagaagagaaaaacgtccaatttgagatcaaaacacatggg
tctaaagttgattgtggtcctattagattggtagttaatgcttgcgcaagccgggatatt
catgataatgttgtgggggtttgttttgtggcccaagacatcacagctcagaagactgtc
atggataaatttacccgaattgaaggtgattacaaggcgattgtacagaatcccaaccca
ttgatccccccaatatttggaactgatgaatttggctggtgttgtgagtggaatgcagct
atgacaaaggtgaccggatggaagagagaagaggtgatggataaaatgcttttaggagag
gtttttgggactcagatggcttgttgtcgtcttaagaaccaagaagcttttgttaatttt
ggtattgtacttaataaagccatgaccggtttggagacagcaaaggttgcttttggtttc
tttgctcgtagtgggaagtatgtagaatgcctgctttcggtgagtaaaaaattggacgtc
gaaggtgtagttactggggtcttctgcttcttgcagctagctagtccagagctgcaacaa
gcattgcatgttcagcgaatatctgaacaaactgccttgaagagactgaaagctttaact
tatatgaagaggcagatcaggaatcctttatccgggatgatgttttcgcggaaaatgttg
gaggccactgagttgggaacggaacaaaagcaactcctacacaccagtgctcagtgccag
tgccagcttagcaaagttcttgatgactcagatcttgacagcatcattgatggttacttg
gatcttgagatggctgaattcactctgcatgatgtattggttgcttcccttagtcaagta
atggcaaagagtaacaccaaagctatccgaatagtcaacgatgtcaaagagcaaattgtg
acagaaaccttatacggtgatagtcttaggcttcagcaggccatagctgacttcttattg
atttccataaacttcacacccaatggaggtcaagttgtagtaacagccactctgaccaaa
gaacaaatagggcaatctgtccatcttgttaatttggagctcagcataacacatcctggt
agtggggtgccggaagcactgctgaaccagatgtttgagagcaatgggcttgaatcagag
gaagaaggtataagccttctcataagcagaaaacttctaaagctgatgaatggagatgtg
cgttatgtaagggaagcaggcaaatcatcttttatcctatctgctgaacttgccgcagct
cataagttgaaagattag

DBGET integrated database retrieval system