Arachis ipaensis: 107618058
Help
Entry
107618058 CDS
T04301
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
aip
Arachis ipaensis
Pathway
aip03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
aip00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
107618058
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
aip03019
]
107618058
Messenger RNA biogenesis [BR:
aip03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
107618058
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
RRM_5
RRM_PARP14_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107618058
NCBI-ProteinID:
XP_016175470
LinkDB
All DBs
Position
B09:complement(121251882..121255744)
Genome browser
AA seq
470 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWDTNEDKLKDHFCNYGDVTNASVMRDKNTGKPRGFAFVEFADPSVL
DRVLQDKHVIDGRTVDAKRALSREDQQVSVTSRGGNSHSGWNSGGNGGNTRTKKIFVGGL
PPTLTEEKFRQYFESYGHVTDVVVMFDQNTGRPRGFGFISFDNEEAVDRVLHKTFHDLYG
KQVEVKRALPKDANPGSTGRGGGGGAGGYQGYGSSGGSQNAYDGRMDSSRYIQPPSAAGG
FPTYGSAGYSAPGYGYGPANNGIGYGAYGSYGGVAAGYGGAGGAAYGNPNVANAAYTGGA
PGGPRSSWPAQAASGYGSMGYGNTAAWGAPGGVAGSGGSGPGSATAGQSPGGAAGYGNQG
YGYGGYGSDSSYGNPSGYGAVGGRTGGTPNSNSSNAGGNELQGSGGSGSYMGSGYGDANG
HSGYGNAGWRSEQTQRSGNYGTPQGNGSHGGQVGYGGGYAGAQSRQAQQQ
NT seq
1413 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcggatcaggggaagctattcatcggagggatttcgtgggacaccaatgaggac
aagttgaaggaccatttctgcaactatggtgacgtcaccaacgcctccgtcatgagggac
aagaacaccggcaagcccagaggcttcgcctttgttgaattcgccgatccctctgttctc
gatagggtcctccaagataagcatgtcattgatggcagaacggttgatgctaagagggcc
ttatcaagagaggatcaacaagtttctgtcacttcaagaggtggaaattctcattctggt
tggaattctggtggaaatggtggaaacacgaggaccaagaagatatttgttggagggttg
cctcccacactgacagaagaaaaatttcgtcaatactttgagtcatatggtcatgtaact
gatgtagtagttatgtttgaccagaatactggacgaccacgtggatttggttttatttca
tttgacaatgaggaggcagttgatagggttttgcataagacatttcatgatttatatggt
aagcaagtagaggtgaagcgtgcacttcctaaagatgccaatcctggttcaactggccgt
ggtggaggtggtggcgcaggagggtatcaagggtatggatcatctggtggcagccagaat
gcttatgatggtcgtatggattctagtaggtatattcagcctccaagtgctgctggggga
ttcccaacttatggttctgctggctatagtgcacctgggtatggttatggtccagccaat
aatggcattggctacggtgcatatggaagttatggtggtgttgctgctgggtatggtgga
gctggcggtgcagcttatgggaatccaaatgttgctaatgctgcttacactggtggtgca
cctggtggcccaaggagttcatggcctgctcaggctgcttctggctatgggtctatgggc
tatgggaacactgctgcgtggggtgctccaggtggcgttgctggatctggcggcagtggt
cctggttcagcaactgcaggtcaatctcctggcggagctgctggctacgggaatcaagga
tatggatatggtgggtatggtagtgatagttcttatgggaatcccagcggatatggtgct
gttggagggcgtactgggggtaccccaaatagtaattctagcaatgctggtgggaatgaa
ctacaaggtagtggtggcagtgggagctatatgggaagtggttatggggatgcaaatgga
cattcaggttatggaaatgctggttggagatctgaacaaactcaacggtctggaaactat
gggactcctcagggaaatggctctcatggtgggcaagttggttatggtggtgggtatgct
ggtgctcagtcacgacaagctcaacaacagtaa
DBGET
integrated database retrieval system