Arachis ipaensis: 107623750
Help
Entry
107623750 CDS
T04301
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC107623750
KO
K24155
rabconnectin-3a
Organism
aip
Arachis ipaensis
Pathway
aip04142
Lysosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
aip00001
]
09140 Cellular Processes
09141 Transport and catabolism
04142 Lysosome
107623750
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
aip04131
]
107623750
Membrane trafficking [BR:
aip04131
]
Exocytosis
Small GTPases and associated proteins
Rab associated proteins
107623750
Endosome - Lysosome transport
Acidification regulators
Rabconnectin-3 complex
107623750
RAVE complex
107623750
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Rav1p_C
WD40
WD40_Prp19
WD40_WDHD1_1st
Beta-prop_EML
Beta-prop_EML_2
WD40_CDC20-Fz
WDR55
Beta-prop_IFT140_1st
ANAPC4_WD40
EIF3I
Beta-prop_TEP1_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107623750
NCBI-ProteinID:
XP_020970895
LinkDB
All DBs
Position
B02:complement(4753232..4766339)
Genome browser
AA seq
2514 aa
AA seq
DB search
MNQRNSSSINPIDHLPLQLHRSDVVPPSPSPTSAIDFLPDFAGYSWIAYAASSLLSITHF
PSPLSHKQTRIGSIFRQLFELSGDPSSFVSAVSWCPRTPSSGELAASAQNCIWVFHHRSA
TSKGSFCWSQNAVLVQQTKVEAIKWTESGDGIVSGGSEVVFWKESNKRWEIAWKFKVDQP
QTLVCTTWSIEGPSATTAHHGKGQVEGSLANQASKCVLVIQNNGQSEYSTANLRHPLPVV
MIQWRPPRRRLSNGYEGHSVRHVLLTCCLDGTARLWSEIDHGKARRNAKDTNDLKITERS
FCVVGVIEINQALNGTLGSNIFVSWGREMEGIFKIGEGVKQDFSKERFKDDVRNCEWLIG
FGPGMLLSFWAVHCLDDISPLRFPRITLWRKHEFQANDIGSTHKFDSSDFKNALLLHKVS
ILRNCLSGPPIVCSPLQLLHCNSLVWSYLRIQAIDDTVETSLDKAKTDYISNLSGGVLNL
DGHSEKILKVSIHPHICEVQFAASLDKNGLILFWSLSNISNCILKCPTLVPSWELCGKLV
TQGSCSKYTSLRWAPSVLNDNLVLFMGHARGVDCFIVNICRTEEENVECHYLCTIPFNGH
GPFKHGPSDIFAIPLNSTCNKTFHNNKIMLLAIWIGRFQALSWEVNLHSFDMSTSCCACG
IDAKIPDNGDIWAFESTFANKRYFIAVNPCSSEYPTPDDLVTSFAVVDAVTLSHRQQELG
FADDLCSGYPASIMATGCSNGSLKLWRSNCGNRSALHLPWELVGMFTAHDGPVNHICFTD
CGQKIATCCNRRDSNGVNTIHIWDAVNLISEGTFILEDRLTFESNICSLNWLTLGTGQLL
LGVCLENELQVFAQRRFDGMTLSNSVKFPKINIWINIAFAQTSLPIRDFLWGPRATAVVV
HENYFSIFGHWLFHEDRKQGSNFHFRDSKPNAANCKGEIYEDGPTVLTDCDSMQSSNINM
RDDNRSSSLCLAKKQLKSEICTNIGLWSILEVAETISRPLPTYHPDILLTNISSGNWKRA
YVAVKHFVEYLTSNNDPKIRFVSKNKGLPEMSLSYYLEGSLSEGSQDRRFQWSGDIASIT
STSHMESSISTSTKSELNGFVESIENSPELLHLTNVEKSEILAIIDLLGEVCSPHLSSAY
QSLDEPGRRFWVALRFQQLFFHRKFARAASFEELNVNSRLFVWAYHSDSLENLFGSVIPS
EPSWQEIRALGVGFWFDALFILNFXMEKLARAQYLKNKNPRDCALLYIALNRIQVLAGLF
KLSKDEKDKPLVAFLSRNFQDEKNKAAALKNAYVLLGKHQVELAISFFLLGGDHSSAVNI
CAKNLGDEQLALVICRLVEGHGGPLERHLITKYILPSAIEKGDYWLASLLEWEMGNYYQS
FHRMLEFSITLVAQESTVMSNCGPFLDPSVGTFCHMLATKNSLRNAVGEQNSAILLRWAT
LMTVTSLKRCGNVVEALECFSSSMSMHGTADQGSDLNVSHNVLSSPLKPLPRKSSNWLSS
DVSVHLEFHKKLNLALRYLLKLIREHPSWLETFTEPVGEASYDDECMIQYEKSVESFKQK
LCTGISLYERRFLLPPRSLISKILLFLCHHGLLYIGYDIADGCARGELSQKKSDVSDAFS
LYRCQVKPFFKTVEEISFFYSRFISACSMGYSEQSSTSIEKVASTESRSMFSDASKSHFG
GVLISLWYLRAIFKIELRSISIDHVKEHLDILDLFEYFLQFSLAWLQRNSGALLFMVEPF
LTANANGCNHYEADMVNLKNRFPKFAELLTRNSFTTNVQNLQVSECTEDGKVDDTKHSIP
EDERWKILGICLWRHMSRFMISNLNLVLDKLEDGNSSGSFHRNFAHREFTLLSVDSDSIS
LPEQIRLLSFSLCDLLTTTVTHISSYHVKQLAEYLWQKLENNSTVMTLEWLKQPRQSESS
QKQNLDILELVNGKDECSVHQLLWDHCADQKLISECFAQEKLNWSNYLDHVPTKGWNDMH
ILLTGQHKTDDMRDKESKLGIPLQTPEVQSPVKGMFQSGNASTSSNQKDISSRNISIFQT
YVYNNDTDSTFEQALCINSTDQQEAAVASNRKGIVFFRMEDGMPSSDKSSDFLWAKADWP
QDGWAGSESTPAPTCVSPGVGLGNNKGAHLGLGGATVGVGSSVWPSKDFTGGGALGVKGF
AGIGAYGLGWGIQQDFEDVVDPPATMENVTTKALSSHPMRPFFLVGSSNTHIYLWEFNKN
KAMATYGVLPAANVPPPYALASISALKFDHFGHRFASAALDGTVCTWQLEVGGRSNVHPT
ESSLCFSGHASDVAYLSSSGSIIAVAGYSSNAVNVVIWDTLAPPTTSRASILCHEGGAHS
LSVFDSHVGGGSVSPIIVTGGKGGDVGLHDFRYIATGKTKRHRRIDTMGHSPTASSTHDK
DQKTDGMLWYIPKAHSGTVTKVVTIPNTSLFLTGGTDGDVKLWDAQNTKLVHHWSRIHDK
HTFVQPSSRGFGGVVRAAVTDIQVVSQGFLSCGGDGTVKLLRLSGHLDSHGVKL
NT seq
7545 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatcaaagaaattcttcttctattaaccccatcgatcacttgccactccaactccac
cgatccgacgtcgttccaccgtcaccttcccctacttccgccatcgatttcctccccgat
ttcgccggatactcatggatcgcttacgctgcttcctctctcctttccatcactcacttc
ccttctcctctctctcacaaacagactcgcatcggttccattttccgccaactcttcgag
ctctccggcgacccttcttcctttgtctccgccgtctcatggtgcccccggaccccttcc
tccggtgaactcgctgcttcagctcaaaattgcatctgggtctttcaccatcgatctgct
acctcaaaaggttctttttgttggagccagaatgcagtgcttgtacaacaaacgaaggtg
gaggccatcaaatggacagaatcaggggatggaatagtttccggcggaagcgaggtggtt
ttctggaaagagagtaataagcgttgggaaatagcttggaagttcaaagtggatcaacct
caaactcttgtttgcacaacctggtctattgagggcccttcggcaaccacggcacatcat
ggtaaaggacaagttgaggggtcattagcaaatcaggcaagcaaatgtgtcttggtaatt
caaaacaatggacaatctgaatattcaacagccaatctacggcatcctctacctgtcgta
atgattcagtggagaccgccaagaagaaggctatcaaacggatatgaggggcattcagtt
aggcatgtattattgacctgctgcttagatggaactgcaaggctatggagcgagattgat
catgggaaggctagaaggaatgcgaaggataccaatgatctaaagatcacggaacgctct
ttttgtgttgttggtgtaattgagattaatcaagccttgaatggaaccctaggttcaaat
atatttgtatcatggggaagagaaatggagggaatatttaaaatcggtgaaggagtgaag
caagatttctccaaagaaagattcaaggacgatgttagaaattgtgaatggctaataggt
tttggtcctggaatgttgctaagcttttgggctgtccactgtcttgatgacatttcgcca
cttagatttcctcgaattacattatggaggaaacatgaattccaggccaatgacatagga
agcactcataagtttgattcatctgattttaaaaatgcattacttctgcataaagtcagt
atattgaggaactgcttgtctggtccacctatagtctgctctccactccagttattacat
tgcaattctttagtttggtcatatttgcgtattcaagcaatagacgatactgttgagacc
tcccttgataaagccaaaacggattacatctccaatttgagtggtggagttttaaactta
gatggtcacagtgagaaaattttaaaggtttcaattcatcctcatatatgcgaagttcaa
tttgctgcttctcttgataagaatgggctgattcttttttggtcactttctaacatttca
aactgcattttgaaatgtccaactttggttccttcttgggaactttgtgggaagcttgta
actcaaggctcatgctcgaagtatacaagtttgaggtgggcaccttcagtacttaatgac
aacctggttttatttatgggacatgccaggggggttgattgcttcatagtcaatatttgt
cgaactgaagaagaaaatgtagaatgccactacttatgcactattccttttaatggtcat
ggtccttttaagcatggcccatctgatatatttgcaattcctttgaactcgacttgtaat
aaaacgtttcataataataaaattatgctattggcaatttggatagggagattccaggcc
ttatcatgggaagttaacttacactcattcgatatgtcaacaagctgttgtgcatgtggt
attgatgctaaaatccccgataatggtgatatttgggcatttgaaagtacatttgctaat
aaaagatatttcattgctgtaaatccttgttcttctgagtatccaacgcctgatgatcta
gttaccagctttgctgtggttgatgcagtcactctaagccacagacagcaggagttaggc
tttgcagatgatctatgtagtggttatcctgcatctattatggccacgggttgttccaat
ggtagcttgaaactttggagaagtaactgtggcaaccgatcagctctgcacttgccatgg
gagcttgtgggtatgtttactgcacatgatggtccggtcaatcatatatgtttcactgat
tgtggtcagaagatagctacttgctgcaacagaagagattcaaatggcgtcaataccatt
catatatgggatgctgtaaacctgatcagtgaagggacttttattttggaagacaggcta
acttttgaaagtaatatttgtagtctaaattggttaactttaggtactggtcagttgctg
cttggagtttgcttggaaaatgaattacaagtttttgcgcagaggcgttttgatggtatg
actttgtcaaactctgtaaagtttccgaagattaatatatggattaatattgcatttgct
cagacttcccttccaattcgtgatttcttgtggggtcccagagctacagcagtggtagtt
catgaaaattactttagtatatttggtcactggttgtttcacgaggatagaaaacaaggg
agtaattttcatttccgtgattccaagccaaatgccgctaattgcaagggtgaaatatat
gaagacggacctacagttcttaccgattgtgactccatgcagtcctccaatattaatatg
agggatgataaccgatcaagtagcttatgtctggccaagaagcaattgaagtctgaaatt
tgcacgaacattggcttatggagcatcttagaagtagctgagacaattagtaggcctttg
cctacatatcaccccgatattctcctcactaatataagttcaggaaattggaaacgtgct
tatgtagctgtgaaacattttgttgaatatttgacttctaataatgatcctaaaataagg
ttcgtctccaaaaataagggtcttccagagatgagtttgtcatactatctagaaggaagc
ctgtcagaaggttcccaagacaggagattccaatggagtggagatattgcgtcaatcacg
tcaacttctcacatggaaagtagcatttctacctcaacaaagtctgagcttaatggcttt
gttgaatccattgagaattcgcccgagttattgcatttgaccaatgtagagaagtcagag
attcttgcaatcattgatttgcttggcgaagtttgtagtccacacttgtcttctgcatac
caaagtcttgatgaacctggcaggaggttctgggttgcgttgaggtttcagcaactgttt
tttcaccgaaagtttgctagagctgcgtctttcgaagaattgaatgttaattcaaggttg
tttgtgtgggcttaccactctgattccctagaaaatttatttggttctgtcatacccagt
gaaccatcatggcaagaaatccgtgctttgggtgtgggcttttggtttgatgctttattt
attcttaatttttagatggagaaattggcaagagctcaatatttgaaaaacaagaatcct
agggattgtgcactgctatatattgcactaaaccgaattcaagttttggctggccttttc
aaactcagtaaggatgagaaagacaagcctttagtggcctttctttcgcgtaattttcag
gatgagaaaaataaagctgctgctttgaaaaatgcatatgtgttgttgggaaagcatcag
gtggaattagctatctcgttttttttgctcggaggtgatcattcttctgctgtaaatatt
tgtgctaagaaccttggggatgaacaacttgcactagttatttgtcgccttgttgagggc
catggtggaccattggagcgtcacttaataacaaagtatatacttccttctgcaattgaa
aagggagactactggcttgcaagccttctggagtgggaaatgggtaattattatcaatct
tttcatagaatgctagagttttcaataactctggtggctcaggagtccactgtcatgtcc
aattgtggtccttttctggatccaagtgttggtactttttgccatatgttagcaacaaag
aatagcctcaggaatgctgtcggggagcaaaattcagcaattcttttaagatgggctact
ttgatgacagttacttccctaaaacgatgtggcaatgttgttgaggcattggaatgtttc
tcatcttcaatgagcatgcatgggacagcagatcaagggagcgatttgaatgtcagccat
aatgtgctttccagtccattaaagcctttgccaagaaaatcttctaactggttgtcctcc
gatgtgtctgttcatctggagttccataagaaattgaatttggcactacgctacttactg
aaattgataagagagcatccaagttggcttgagactttcactgaacctgttggggaagct
tcttatgatgatgaatgtatgatacaatatgagaaatcagttgaaagttttaagcaaaag
ttatgcacagggatttctctatatgaacggaggtttttgttgcctcctaggtctcttatc
agtaagattttactctttctatgccatcatggattattgtacattgggtatgatatcgcc
gatggatgcgctcgaggagaactatctcaaaagaagagtgatgtgtctgatgctttcagt
ttatatcgctgtcaggttaaacccttctttaagactgtagaagaaatctcctttttctac
tcaagattcatttctgcctgcagcatgggatattctgaacaaagttctacttctattgag
aaagttgcatctacggagagtcgatctatgttttctgatgcttcgaagtctcactttgga
ggtgttctgatttcattatggtatttaagagccattttcaagatcgaattgcggtccatc
agcatagatcatgtcaaagaacatctagatatccttgatttatttgagtactttttacag
ttttccttagcttggcttcaaagaaactcaggagcacttttatttatggtggaaccattc
ttgactgcaaatgctaatggttgtaatcattatgaggctgatatggtgaatctgaagaac
cgttttcccaaatttgcagagttgttgactcgaaattcattcacaacaaatgtacaaaac
ctccaagtctctgaatgtacagaagatggaaaagttgatgacacaaagcattcaattcca
gaagatgaaagatggaagattctagggatctgcttgtggcgacatatgtctagatttatg
atatctaatttaaatttggttcttgataaacttgaagatggtaacagttcaggttctttc
cacagaaattttgctcatagggagttcacgctcttaagtgttgattccgatagcatcagc
ttgcctgaacagattcgattactctcgtttagcttatgtgatttactgacaacaacagtt
acccacatttcttcttaccatgtcaagcaacttgcagaatatttgtggcagaaattggag
aataattcgactgtgatgactcttgaatggctgaaacaaccacgtcaatcagaatccagt
caaaaacaaaacctggacatcttggaactggtgaatgggaaagatgaatgttcagttcat
cagttactgtgggaccactgtgccgatcaaaaattaatatcggaatgctttgctcaggaa
aaactcaattggtcaaattatttggatcatgtgcctactaaaggatggaacgacatgcat
atacttctgacagggcaacataaaactgatgacatgcgtgataaagaatctaaacttggc
attccattacaaactcctgaagttcaatctcctgttaaaggaatgttccaaagtggcaat
gcttcgacaagttccaaccagaaagatatatctagtaggaacatttcaattttccaaacc
tatgtgtataataacgacaccgattctacatttgaacaggcattgtgtataaactctact
gatcaacaggaagctgcagttgctagcaaccggaagggtatagtattcttccgtatggaa
gatgggatgccttcaagtgataagtcatcagacttcttgtgggccaaggctgattggcca
caagatgggtgggcaggttcggaatctactcctgctcctacatgtgtttcgcctggtgtt
ggtcttggcaacaacaaaggcgcacaccttgggctcggtggagcaactgttggcgtaggt
tcttcagtttggcctagcaaagactttactggtggtggagcattaggagttaaaggtttt
gctggtattggtgcctatggattaggttggggaattcaacaagattttgaagatgttgtt
gatccacctgcgactatggagaacgtaactacgaaggctttgtctagtcatccgatgaga
cctttcttcttggttggctcaagcaatacacacatttatttgtgggagttcaataagaac
aaagctatggctacatatggagtgctacccgccgccaatgtacctccaccttatgccctt
gcatcaatatcagctttgaagtttgatcacttcggacatcggttcgctagtgctgcatta
gatggaactgtctgtacgtggcaattggaggtaggaggaaggagcaatgttcatccaaca
gaatcatcactctgctttagcggtcatgcgtcggatgtcgcctacttgtcttcaagtgga
tcaattatagctgtagctgggtatagctctaatgctgttaatgtggttatatgggacact
ttagctccaccaacaacttcccgtgcttcgattctatgtcatgaaggtggtgcgcactcc
ctttctgttttcgatagccatgtaggcggcggttctgtttccccaattatcgtgactggt
ggtaaaggtggtgatgttggtctccacgacttccgctatatagcgactggaaagacgaaa
aggcacaggcgtattgatactatggggcatagccctactgcgtcttcgactcatgataag
gaccagaaaacagatggtatgctttggtatattccaaaggctcactcagggactgttaca
aaagtcgttaccatcccgaatacaagtttgtttctaactggaggcacagatggagatgtc
aaactctgggatgctcagaacacaaagttagtacatcattggtccaggatacatgataag
cacaccttcgtgcagccgagttcccgtggatttggtggtgttgttcgggctgctgttacg
gatatacaagttgtttcgcaaggtttcctctcgtgtggtggggatggaactgtgaagttg
ctacggctcagcggtcaccttgatagccatggagtcaaactatga
DBGET
integrated database retrieval system
