Arachis ipaensis: 107646353
Help
Entry
107646353 CDS
T04301
Name
(RefSeq) uncharacterized protein LOC107646353
KO
K14861
nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1
Organism
aip
Arachis ipaensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
aip00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
aip03009
]
107646353
Ribosome biogenesis [BR:
aip03009
]
Eukaryotic type
Pre-60S particles
Other pre-60S particles
107646353
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
NopRA1
Npa1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107646353
NCBI-ProteinID:
XP_016206032
LinkDB
All DBs
Position
B01:11760479..11777962
Genome browser
AA seq
2555 aa
AA seq
DB search
MADREGAGLNLHAKVTHDAKLKELLHRITSLEIKLCSDATKEFIKILKSEDGGSLLREYL
RGSPKCSELLGAWKLRQGKQGMHYVLDLISTILNHPIGKYNHADVESVSVSKELDKFARL
IFAEYIGDVYKELSSKEVKRQKAALMLMVSVVRRGHSLASEVAKNFDFKHPEFKRIAEPK
RRNNDERSAKIGGRWLLLRKSFVGFAMSFLEVGKPGLLRWILQQREMYYGVLRGLGNDDD
ETVMFVLTTLRDRVLVKESLVPPSLRSVLFGSVTLDQLVGVCGRDGGGDSAKLAYEVLVM
VCTNPINGLMPDLERRPNPLKGNPKRIMGFMRKLRGTEIQYHRDLLLAISNARFSFGLSY
LKEFPYNIEDDTSPSWIYAISLAADLVSSVGNGLSKELVDCQSKDLQSFDKMDLHSTVKC
LFPRPFSRSIFNKGLLSTKPHVKHGALRLILELMKFLDSLFGGMSRNSSFRYKLSQNMGS
TKQEIQNYVQAFLPDPQVLISLIYPLDSCSEAQESSLKRTACDLEHVSNSRKKLKMDTSE
NDIDIVVGGISTGPDIDLASDSGAVDNDVKPDMLDDEEDLMNIMGEIWSVDLCSMGVSTL
RDAESYLKSKLLDALKYYRRTLPFTLDKSFESFKDLLKNPLELTSNLQVSLLSLLAEYIE
WCPENDIPIRTPPMLYKYLQPLLKLLMFSPVNGARDQAYRLAMAAMFSTGAFDRNPHEIE
AWFLYLPGYHKTRSPINILEVEVLQSLCSTVISFLCDAVSTIGNNLFKYWSILKNYVDGL
KGGKELSPDFSPLTVCVLEKCLRVIRSKSGTYSLPKKSLVLSYTCNTVKSLLQTQVDAEL
LSALVTADLMQRLDDNYEYDGAFPKWKPMKNLLDFLESISCQQNCSHFSKNEESVPPDGS
LGSALGDLKVLLSSTASNEMAETSMALLSSFIWGGIDDKLMNLRSHALISHDLLGVPFSL
LSSVFLLDPSVILHASKLWPVKFAVGLDMAISDLDTNSQNAPPVDTFDLTFHPDSLTCNQ
LLDSSEADVTAFSIFLKQAPFHVIFPAVMCMEGPDISKVSKVKDLLLHKLSRSMSDSSLL
HSLRLVLFWTHQIQLCYKVNPLAETEWHLNLCVILVRKILAQLLVPEGSLDCSTNSAFCS
SSYNNQEVIKIIFCHPSLLMSLSSPLGSSHNFTNVTVGNGFEVLNGLSGEEFHKFRNPIL
NILRMALDYMWSLCSSQLCASESQEVTNNIVEAFKGLQHKLFVIVRDRFELCISAKDMIP
LLPTSYALHFCIRFLSPFKLLELVDWIFKRVEVDDLPTKKSCLSIGCSLVAGAFNTLSIY
FQQPIRNRAPYDNFWEISEKNIRADVFEQIYSRVVEFSLNYETDCADKCLVEAVNALYMQ
KHMQQETFHPLLLVMCKIVMVTPVRMLFQCVQKTNAQRAKFLYILTEMSSVHSSIFGHLF
LALVNKGLYHDNIGFEGQASDLTLSEDQFLLLLPAALSYLSQSSKRFGRCNHKDLKHLPY
FYSKILLKGLSEWNKFISKDIFEEEYGEFFPASVQQLLCHMDHSLLGKSIHMLQYHFALN
GDSMKLKKRLKLFKSICQHSAARDELMDCDSQVINNYSLNQSLNFINRVVARISFCKYIN
LLVDIWQSIVKKTSLPPNQAGAGKSTNILLLYNHLEVFVLENILELTVKMHDGLIQLQSI
AFLEQLIRHAFLYRFGDFTTMKTLRLILTQLNGGSLSCDTYLQLLLAHSQFASTLYSVCK
PAGSLFKPVSSILKCLVIPSHDHRENDEKLTEKLTDLSTGPLEIVRLLRVLLWMRGHQTD
IDSGNDIGINIKELHALLCHCYGATLNQIDLEIYNLIHEIESMTGSQSLNLSDVECLWGL
ASLDPNMGHSLEQCASSNIKFDSEPIEVCSGSQNRENIPIDPDICISTVLSFPYNRSIAD
MLPAGNNIEPDTFGKQIQSPLVEVGLRYDPRFILRFSIHSLSQSRIEPVEFAGSGLLAIA
FVGMSSSDLGIRKLAYGTLDKFKSALEKCQKRKDVMGLRLLLNSIQNSIEEPWQRIPSFI
ALFAAEASCVLLDSSHDQYAAISTMLIHSSKLNMRVIPLFDNFFWSTSINFKAERCWMLR
LLYAGLNSDDDAIIYIKHSILESLMSFYVSPLMDVESKDLIIEVIKKSVRFHKIARHLVK
QCSLLSWFSSIISVNRERLNGEEKRVFLKHVSVILKAVNDVISLGSISKWLQSYGLEQLM
ELSSILLNSLLQDVTFANETLGFINPFLKMIASMFKLSQKRKIYQPHFTLSIEGLYQIYQ
AGSTEATKGINQEAALEAILMNAPPISIFLMKQERLESFLIWAITTALQSDSSRRMRANK
SHIFHTNNYREESHERSLLSKLLRWLTASVIIAKLYQKPNDMDSAFVETHDLNSLHSLLV
QAGNANGQRHDIGIGCGKLLASVIFCLQLLHDIDPEVLPSTVSALCLLTFGASNFAVGRG
DLLKEYSTLISSHCSRVRCPPEANPAWRWSFYHPWKDCSPELTDSQKMDEYHSCLTLLVV
VSNVLGEKKLELASFSPLDIERSGLFQWEKSLLEN
NT seq
7668 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcggatcgcgaaggtgctggcctaaacctgcacgcaaaggtcacacacgacgcgaag
ctcaaagaactgctccacaggatcacctcgctggagataaagctatgctccgacgccaca
aaagagttcatcaagatccttaaatccgaagacggaggatcgttgctgcgcgagtacctt
cgcggttcaccgaagtgttctgagttattgggagcatggaagctaaggcaaggaaaacag
ggaatgcactatgtattggacttaatttccaccatccttaaccaccctatcggaaaatac
aatcatgctgacgtggaaagtgtgagtgttagcaaagaactcgacaagttcgcgaggttg
atttttgctgagtatataggtgatgtttataaggagttgagtagtaaggaagtgaagcgc
cagaaggctgcacttatgctcatggtttcggtggttcggcggggacatagtttggcctct
gaggttgccaagaatttcgattttaagcacccggaattcaagcgaattgcggagcctaag
aggaggaacaatgacgagaggagtgccaagattggggggaggtggttattattgagaaag
tcgtttgttgggttcgctatgtcttttttggaggttgggaagcctggcctactcagatgg
attctgcagcagagggagatgtattatggcgtgcttcgtggattgggaaacgacgatgat
gagacagttatgtttgttttgacgaccctgcgggacagggttcttgtgaaggagtcgttg
gtgccaccgagtctgaggagtgtgttgtttgggagtgtgacgctggatcagctggttggt
gtttgtggaagggatggtggtggtgattctgctaagttggcgtatgaggttcttgttatg
gtttgtactaatccgattaatgggttgatgccggacttggaaaggcgtccgaatccgttg
aagggtaatccgaagaggatcatggggttcatgagaaagctgagggggactgagattcaa
taccacagagatttgcttttggcgatttctaatgccagattttcttttggcttgtcatat
ttgaaagagtttccatacaacattgaagatgatacatcaccttcatggatatatgcaata
tctctggcagctgatttggtttcatcagtggggaatggcctttccaaggaactggttgat
tgtcaatcaaaggatctgcaatcatttgacaaaatggatttacacagtaccgtgaagtgt
ttgtttcctcgtccattcagcaggtcaatttttaataagggattgcttagtactaaacct
catgtgaaacatggcgctctaaggcttatcctggagttaatgaaatttctagattctctc
tttggtggtatgagccgcaattcgagttttagatataaattatcacaaaatatggggtct
accaagcaggagattcagaattatgttcaggcatttcttcctgatcctcaagttttaata
tctctgatttaccctttagattcctgttcagaagcacaagagtcaagtttgaagagaact
gcatgtgatcttgaacatgtcagcaacagcagaaagaagttaaaaatggatacatcagag
aatgacatagatatagttgttggtgggattagtacaggtccagatattgatttggccagc
gacagtggagcagttgacaatgatgtaaaacctgatatgttggacgatgaagaggatctc
atgaatattatgggggaaatttggagtgtggatctctgttccatgggtgtcagcacattg
agggatgcagaatcatacttaaagtctaaactgcttgatgctctcaaatactatcgccga
actttgcctttcactctggataaatcttttgagtctttcaaggatcttctcaaaaaccca
ttggagttaacaagtaatctgcaggtctcattgttgtctttgctagcggaatatattgaa
tggtgtccggaaaatgatattccaataagaactcctcccatgttgtacaaatatctccag
ccgttacttaagttgttaatgttttcaccagtcaatggtgcaagggatcaggcatatagg
ctggctatggcagctatgtttagtactggtgcttttgacaggaaccctcatgaaatagaa
gcatggtttttatatttaccaggttatcacaaaacgagatcccccatcaatatcctggag
gtagaagtattgcagagtttgtgctcaactgtcatatcattcttgtgtgatgctgtttct
acaattgggaataatttattcaaatattggagtattcttaagaactatgtcgatggtttg
aaaggtggaaaagagttatcacctgattttagccctttgactgtatgtgtgctggagaaa
tgtctgagggtgatcagatctaaatcaggaacctattcgctgcctaaaaaatcattggta
ttatcatacacttgcaatacagtcaagtctctcttgcaaacacaggtcgatgctgaattg
ttatctgctttagttactgcagacttaatgcagagacttgatgacaattatgaatatgac
ggagcatttcccaagtggaagccaatgaagaatttgttggattttctggagagcatatca
tgccaacaaaattgctcacatttctctaagaatgaggaatctgtgcctcctgatggctcc
ttaggaagtgcacttggtgatttaaaagtattattaagtagcactgctagcaatgagatg
gctgaaacatccatggctctcctatcctcctttatttggggaggaattgatgataaattg
atgaatctgcgatcacatgcactcatttcacatgacttacttggagttcctttctcactt
ttgtcatcagtatttcttcttgatcctagtgttattctccatgcttccaagctgtggcct
gtaaagtttgctgttggcttggacatggccatatcagatcttgatactaatagtcaaaat
gctcctcctgttgatacttttgatcttacttttcatcctgactccctaacatgcaaccaa
cttttggattcttctgaagctgatgtaactgcattcagtatctttctaaaacaggcacct
ttccatgtgatatttcctgcagtgatgtgtatggaaggccctgatatatcaaaggtatct
aaagtgaaagacctgcttctgcataaattatctaggtccatgagtgattcctcccttctt
cactctctgagacttgtgctcttctggactcaccagattcagttgtgttataaagttaat
ccgttagctgaaactgaatggcatttgaatctatgtgtcattcttgtaaggaagatacta
gcacaattgttggttccagaaggttctttggactgctctacaaactctgctttttgttct
tcaagctataacaatcaagaagtgattaaaataatcttttgtcatccttctcttttgatg
tcattatcctctccattgggaagtagtcacaactttacaaatgtcactgtagggaatggc
tttgaggtgctcaacggattatccggagaggagtttcacaaatttaggaatccaatttta
aatatattgagaatggctctagactacatgtggtccttatgtagttcccaactttgtgca
tcagaatcccaagaagttaccaataatattgtggaagcctttaaaggtcttcaacacaag
ctatttgtaattgttagagacagatttgagctgtgtatttctgctaaagatatgatacct
ctccttccaacatcatatgcattgcatttttgcattcggtttttatctccttttaagctc
cttgaattagtagactggatattcaaaagagtcgaggtggatgatttgccaactaagaaa
tcctgtttgtctattggatgttccttggttgccggtgcttttaatactttgtccatttat
tttcaacagccaatcaggaaccgagcaccctatgataacttttgggagatatctgaaaag
aatatcagagctgatgttttcgagcagatctacagcagggtagttgaattttctctaaat
tatgaaacagattgtgcggataaatgcttagttgaagctgtgaatgctttgtatatgcag
aaacacatgcaacaagaaacatttcatcctttgctgttggtcatgtgcaaaatcgtaatg
gttactcctgtgagaatgctttttcaatgtgttcagaaaacaaatgcacagagagcaaaa
ttcctgtatatcctcactgaaatgagctctgttcactcgtcaatctttgggcatttattt
ttggctttggtgaataagggtttatatcatgataatattggattcgagggacaagcctct
gatcttactctttcagaggatcagtttttgctgcttcttcctgctgctttgtcttatttg
agccaaagctctaagagatttgggaggtgcaatcacaaagatcttaaacatttaccatac
ttttactccaagattcttttgaaaggtcttagtgagtggaacaaatttatttcaaaagac
atatttgaggaagaatatggagaattctttccagcatctgtgcaacaactactgtgtcat
atggatcatagtcttcttggaaaatcaatccatatgttgcagtaccactttgctcttaat
ggagattcaatgaaattgaagaagcgtctaaagctgttcaaatccatttgccaacattct
gctgcacgtgatgaactgatggactgtgatagtcaagttattaataattattcattgaac
cagtctctcaacttcattaatcgtgttgttgcaaggatatcattttgcaaatatataaac
ttgttggtggatatttggcagtcaattgttaagaaaacatctttgcctcctaatcaggct
ggagctggaaaaagcacaaacattttgttgctatataatcacttggaggtctttgtgtta
gaaaatattcttgagttaacagtaaagatgcatgatggtcttatccagttgcagtccatt
gctttcctagagcaattaatcagacatgcttttctatatagatttggtgattttacaaca
atgaagaccctccgtcttatattaactcagcttaatgggggcagcctatcatgtgataca
tatcttcagttgttacttgcccactctcagtttgcctccactctttattcagtgtgcaaa
ccagcaggttccttattcaagccagtatccagcattctgaaatgtcttgtcatcccttct
catgaccatcgtgaaaatgatgagaagctcactgagaaattgactgatctttctacagga
ccattggaaattgttagattgcttcgggtactcttatggatgaggggtcatcaaactgat
atagattctggaaatgatattggtataaatataaaagaattgcatgcactactatgtcat
tgttatggtgcaacactcaatcagattgatttggagatatataatctgattcatgaaatt
gagtctatgactggatcacagtctttgaacttatctgatgtggagtgcctatggggactt
gcttctttggaccccaacatgggccattctcttgaacagtgtgcatcttctaatatcaag
tttgattcagaaccaattgaagtatgctctggaagccaaaatagagagaacattccaatt
gatcctgacatatgcatttcaacagttctcagttttccctacaatagaagtattgccgat
atgctaccagcaggaaacaatattgaaccagatacttttggtaaacagatacaatctcct
cttgttgaagtcggactacgttatgatccacgatttatcttgcgtttctcaattcatagc
ctgtcacagtcacgtatagagcctgtggagtttgctgggtcagggttgcttgcaattgca
tttgttggcatgtcatcatcagaccttgggataagaaaattggcttatggtactcttgat
aaatttaagagtgcattagagaagtgccaaaagaggaaggatgtcatgggacttcggctt
ctattaaattctattcagaatagcatagaagagccatggcaaagaatcccttcgtttatt
gcgcttttcgctgctgaggcatcctgcgtattgttagattcttcacacgatcaatatgct
gctataagtacaatgttgatacactcttctaaactgaacatgagggttatacctttgttt
gataactttttttggagtacatctataaatttcaaagctgaaaggtgttggatgcttagg
ctactttatgctggcctgaactcagatgatgatgccatcatatatatcaagcactctatc
cttgagagtctaatgagcttttatgtctctcctcttatggatgttgagtcaaaggaccta
atcattgaggttataaagaagtctgttagatttcataagattgctcgacatctagtgaaa
caatgttctctactttcatggttttcatctattatctctgttaatagggagaggctcaac
ggagaagaaaagagagtattcttgaagcatgtgtcggtaatattgaaggctgtcaatgat
gtcatttcattgggaagcatctccaagtggctgcaaagttatggccttgagcagcttatg
gagctttcgtctattctattgaattccttactacaggatgttacatttgctaatgaaact
ttaggatttataaatccttttctaaaaatgatagcatcaatgtttaaattatctcagaaa
aggaaaatatatcagccacattttacactatcaattgagggcttatatcagatatatcag
gctggtagtactgaagcaacaaaaggtattaatcaggaggctgctttggaagccatactt
atgaatgcacctcctatctcaatcttccttatgaaacaggaaaggcttgaaagctttctt
atttgggcaattacaactgctttacagtctgattcctcacgaaggatgagagcgaataag
tctcacatctttcacacaaataattacagggaagagtctcacgagcgttcgttactgtca
aaattattacgttggttaacagcatcagtaatcattgcgaaactctatcagaaacccaat
gatatggattcggcatttgttgaaacacatgatttaaattcccttcattctttactggta
caagctggaaatgccaatggacaaagacatgatattggaattggctgtgggaagttactg
gcttctgtgattttctgtctgcaacttcttcatgacatagaccctgaggtgctaccatca
actgtctccgctctctgtcttctaacctttggtgcttccaactttgcagttggcagaggt
gatttattgaaagaatacagcactttgatatcatcacactgttcaagggtgcggtgccct
cctgaagctaatccagcttggagatggtccttttaccatccatggaaggattgttcaccg
gagttaactgattcccagaagatggatgaatatcattcttgtctgactttgttagtggtt
gtctcaaatgttcttggcgaaaagaaattagagttggcgagtttctctccattagatata
gagagatctggcttattccaatgggaaaaaagtttactagaaaattga
DBGET
integrated database retrieval system
