Arachis ipaensis: 107646645
Help
Entry
107646645 CDS
T04301
Name
(RefSeq) transcription initiation factor TFIID subunit 15b isoform X1
KO
K13098
RNA-binding protein FUS
Organism
aip
Arachis ipaensis
Pathway
aip03015
mRNA surveillance pathway
aip03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
aip00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
107646645
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
107646645
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
aip03041
]
107646645
Spliceosome [BR:
aip03041
]
Complex A
Other components
Complex A specific factors
107646645
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107646645
NCBI-ProteinID:
XP_016206327
LinkDB
All DBs
Position
B01:complement(3685076..3689120)
Genome browser
AA seq
470 aa
AA seq
DB search
MSGAYGQEGGGGSAPPSYGATGGYGASGGYGGGGNFGGGGYGGGGSGGGGYGGGGDGGGG
YGGKGSGGGGGYGSGDGDGGRSGGYGGNDGGGYGGRGGGGGGYGGRGGGGGYGGRGGGGG
YQGGGDRGGRGGGRGGRGGGGSGGGGGGGGGYNRGGGGGGYSNNRGGRSGNYDGGRGNDY
TGGRGSNNDGRGGGGSRGGSYGGNQGREDGGYGQVPPPAAQTYGGSAGGNYPPSYNSYDG
NSNYGTDAGPPPTSYTGGPTSYPPSYGGNTGGYGGDNVADSRGGGRSGPPGGYDSGYNAG
AGGGGRGGYGGAPAEPAAPVKQCDENCDDTCDNSRIYISNLPPDVTTEELRELFGGIGQV
GRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDENGNNKGDACLAYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYKISV
AMAEKSAPRPAYNHGGNRGGYGGDRRRDNYRDNSGPDRREHYGGNRSRPY
NT seq
1413 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctggagcgtacggtcaagaaggcggcggcggctctgcgccaccgtcatatggagct
acaggaggctacggtgcctccggtggttatggaggcggtggtaatttcggaggtggaggc
tatggaggaggcggctccggtggagggggttatggtggaggtggtgatggcggaggggga
tacggagggaaaggcagcggtggagggggtggatatggcagtggtgatggcgatggtgga
aggagcggaggatatggtggaaacgatggcggaggttatggtggaaggggaggcggcggt
ggtggttatggtggtcggggaggaggtggaggctatggtggtcgaggaggtggtggtgga
tatcaaggtggtggagatcgcggtggacgaggtggtggtcgtggcggccgcggtggcggt
ggtagtggcggcggcggtggtggtgggggtgggtataacagaggaggaggcggtgggggg
tatagtaataacagagggggtagatctggtaactatgatggaggcaggggtaatgactat
actggtggtaggggtagtaataatgatggtagaggtggaggtggaagtagaggtggttct
tatggtggtaatcaggggagagaggacggtggctatggtcaagttccccctcctgcagcc
caaacttatggtggttctgctggtggtaactacccaccctcctataattcttatgatgga
aattcaaattatggaacagatgctggtcccccacctacaagctatactggtggacctact
tcatatcctccatcttatggaggtaacacgggtggttatggtggcgataatgtagccgat
tcacgtgggggtggtagaagtgggcccccaggaggatatgacagtggttataatgctggc
gctggcggtggtggtcgaggtgggtatggtggtgctcctgctgagcctgcagctccggtg
aagcagtgtgatgagaattgtgatgatacctgtgacaactctagaatctacatttccaac
ctaccaccagatgtgactactgaagaattgagagaactttttggaggcattggtcaagtt
ggtagaataaagcagaagaggggttataaggatcagtggccctggaatataaaaatatac
actgatgagaatgggaataacaagggtgatgcctgccttgcttatgaagatccctctgca
gcacactcagccggcggtttctacaataattacgatttgaggggttataaaatcagtgtt
gcaatggcagaaaaatctgcaccacggcctgcatataatcatgggggcaatagaggtggc
tatggtggagataggcgcagagacaattatagagataattctgggcctgatagacgtgag
cattatggtgggaaccggtcacgaccctactga
DBGET
integrated database retrieval system